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中部アフリカにおける野生動物保有病原体の次世代シークエンサーを用いた網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K19411
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
研究機関長崎大学

研究代表者

阿部 遥  長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (90554353)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2019年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードアフリカ / ガボン / 野生動物 / ブッシュミート / ウイルス / メタゲノム解析 / 次世代シークエンサー / 病原体
研究開始時の研究の概要

ガボン共和国は中部アフリカ沿岸に位置する赤道直下の国で、ブッシュミート(野生動物の食肉)の消費量が多い国の一つである。ガボン共和国では過去にエボラ出血熱の発生を始め野生動物由来の感染症が問題となっており、ブッシュミートを介して感染症が一般市民へ拡大してしまうリスクが常に存在している。
本研究では、現地研究機関の協力の下で、野生動物の保有病原体について次世代シークエンサーを用いて網羅的に解析し、中部アフリカの野生動物が保有する病原体の感染リスクを明らかにすることを目的としている。

研究成果の概要

本研究では、中部アフリカのガボン共和国においてブッシュミートとして入手可能な野生動物(ヤマアラシ、ブルーダイカー等)や小型野生動物(げっ歯類、食虫類等)を合計395検体採取し、次世代シークエンサーを用いた網羅的なメタゲノム解析を行った結果、肝炎ウイルス・ロタウイルス・アストロウイルス等のヒト感染を起こし得るウイルスを多数検出した。また、検出したウイルスゲノム配列を用いて系統樹解析を行ったところ、ガボン共和国特有の系統に属するウイルスを多く見出した。以上から、野生動物を介した人獣共通ウイルス感染症の感染リスクを明らかにしたとともに、ウイルスが中部アフリカで独自に進化していることも明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

中部アフリカに位置するガボン共和国は国土の80%以上が熱帯雨林であり、野生動物が現地民の住環境の比較的近辺にまで存在している。また、ガボンではブッシュミート(野生動物の食肉)の消費量がアフリカの中でも多く、野生動物からの病原体感染リスクが高いにもかかわらず野生動物を対象とする研究は進んでいない。本研究では野生動物に存在しヒト感染を起こし得る病原ウイルスを多数明らかにすることで、現地での野生動物を介したウイルス感染に対する注意喚起するとともに、現地の医療機関における適切な診断や治療にも貢献することが期待できる。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [国際共同研究] ランバレネ医療研究センター/熱帯生態学研究所(ガボン)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ランバレネ医療研究センター/熱帯生態学研究所(ガボン)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Re-emergence of dengue virus serotype 3 infections in Gabon in 2016-2017, and evidence for the risk of repeated dengue virus infections2020

    • 著者名/発表者名
      Abe Haruka、Ushijima Yuri、Loembe Marguerite M.、Bikangui Rodrigue、Nguema-Ondo Georgelin、Mpingabo Patrick I.、Zadeh Vahid R.、Pemba Christelle M.、Kurosaki Yohei、Igasaki Yui、de Vries Sophia G.、Grobusch Martin P.、Agnandji Selidji T.、Lell Bertrand、Yasuda Jiro
    • 雑誌名

      International Journal of Infectious Diseases

      巻: 91 ページ: 129-136

    • DOI

      10.1016/j.ijid.2019.12.002

    • NAID

      120006988335

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ongoing evolution of hepatitis B virus during viremia in febrile patients in Central Africa2019

    • 著者名/発表者名
      Abe Haruka、Ushijima Yuri、Bikangui Rodrigue、Loembe Marguerite M.、Agnandji Selidji T.、Vries Sophia G.、Grobusch Martin P.、Lell Bertrand、Yasuda Jiro
    • 雑誌名

      Journal of Medical Virology

      巻: 92 号: 2 ページ: 251-256

    • DOI

      10.1002/jmv.25598

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Development of a rapid detection system for arboviruses and dengue virus detection in Gabon2019

    • 著者名/発表者名
      Haruka Abe, Yuri Ushijima, Rodrigue Bikangui, Marguerite M. Loembe, Selidgi T. Agnandji, Bertrand Lell, Jiro Yasuda
    • 学会等名
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2022-01-27  

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