• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

中間径フィラメント捕縛による転写制御の定量的解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K22092
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分27:化学工学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

中村 史  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 連携研究室付 (40357661)

研究分担者 山岸 彩奈  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (00778293)
研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2021年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2020年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード中間径フィラメント / AFM / ナノニードル / 転写制御 / 転写因子 / 細胞 / ビメンチン / 原子間力顕微鏡
研究開始時の研究の概要

組織や発生段階によって異なる中間径フィラメント(IF)が発現するため、IFは細胞種判定のマーカーとして用いられるが、そのIFこそが細胞種を決定する上流の因子である可能性がある。IFは特定の転写因子やヒストン修飾酵素を核外でトラップし、遺伝子の発現を促進・抑制することで、細胞機能を規定する。この仮説を立証するために本研究では、ビメンチン繊維に捕縛される転写抑制因子を標的として、申請者が独自に開発してきたナノニードルと原子間力顕微鏡を用いて、細胞内の捕縛分子と自由分子の存在量を決定するセンシング手法を開発し、IFによる転写制御機構を解明することを目指す。

研究成果の概要

中間径フィラメント(IF)は、細胞質で様々なタンパク質と結合し、機能調節を行うことが近年報告されている。我々は、IFが転写に関連する因子を捕縛する足場として機能し、核移行を妨げることで遺伝子発現を制御すると推察している。本研究では、細胞内のIF捕縛分子を検出する手法を開発し、IFによる転写制御機構を解明することを目的とした。転写関連タンパク質PHB2がIFであるビメンチンに結合することに注目し研究を起こった結果、抗PHB2抗体を修飾したナノニードルと原子間力顕微鏡を用いることで、生細胞内でビメンチン繊維に捕縛されたPHB2を力学的に検出することに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で開発した技術により、さまざまな細胞骨格に結合するタンパク質を力学的に検出可能であると考えられ、非標識の生きた細胞に対してこれを適用することで、転写関連因子の捕縛・放出のダイナミックな細胞内の変化を解析する手法になる。これにより、細胞骨格タンパク質が支配する細胞機能調節機構を明らかにできると期待される。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Mechanical detection of interactions between proteins related to intermediate filament and transcriptional regulation in living cells2022

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi Ayana、Mizusawa Mei、Uchida Koki、Iijima Masumi、Kuroda Shun’ichi、Fukazawa Kyoko、Ishihara Kazuhiko、Nakamura Chikashi
    • 雑誌名

      Biosensors and Bioelectronics

      巻: 216 ページ: 114603-114603

    • DOI

      10.1016/j.bios.2022.114603

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 中間径フィラメントにおけるテール領域内共通βシート構造の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      内田幸希、山岸彩奈、上田太郎、長崎晃、中村史
    • 学会等名
      日本化学会 第103春季年会 (2023)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 中間径フィラメントのテール領域における二次構造とアクチン結合の関係2022

    • 著者名/発表者名
      内田幸希、山岸彩奈、上田太郎、長崎晃、中村史
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] アクチン相互作用部位を欠失した中間径フィラメントの繊維構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      内田幸希・山岸彩奈・中村 史
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会 (2022)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] アミノ酸一次配列を用いたAI予測に基づくアクチン-ビメンチン相互作用部位の同定2021

    • 著者名/発表者名
      内田幸希・山岸彩奈・似田優太・三宅 淳・中村 史
    • 学会等名
      第73回 日本生物工学会大会(2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ビメンチン-転写関連タンパク質PHB2相互作用のin cell力学解析2021

    • 著者名/発表者名
      水澤愛衣・山岸彩奈・中村 史
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会 (2021)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 抗体修飾ナノニードルを用いた中間径フィラメント結合タンパク質の力学検出2020

    • 著者名/発表者名
      水澤愛衣・山岸彩奈・中村 史
    • 学会等名
      第14回バイオ関連化学シンポジウム2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 国立研究開発法人 産業技術総合研究所

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/chikashi-nakamura/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2019-07-04   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi