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新しい脊椎動物モデル・キンギョの変異体の表現型多様性を作り上げる分子機構の理解

研究課題

研究課題/領域番号 19K22426
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
研究機関長浜バイオ大学

研究代表者

大森 義裕  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 (90469651)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2019年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードゲノム進化 / 脊椎動物 / 形態形成 / ゲノムワイド関連解析 / 脊椎動物モデル / キンギョ / 家畜化 / 全ゲノム重複 / モデル動物
研究開始時の研究の概要

キンギョはフナを原種とし、約1000年前の中国で育種が始まった。キンギョはその育種の歴史の中で様々な品種が作出され、形態的な表現型の多様性やウロコや体色の変化を含む様々な表現型が見られる変異体であり相互に交配が可能である。キンギョ変異体の表現型の中には、ゼブラフィッシュやメダカでは見られない表現型が多く存在し、その分子メカニズムを解明することで脊椎動物に共通する形態や体色の発生の分子メカニズムが明らかになることが期待される。本研究では、キンギョ品種のもつ表現型の原因遺伝子の同定と分子メカニズムの解明を行う。

研究成果の概要

キンギョはフナを原種とし、約1000年前の中国で育種が始まった。キンギョはその育種の歴史の中で様々な品種が作出され、形態的な表現型の多様性やウロコや体色の変化を含む様々な表現型が見られる変異体であり相互に交配が可能である。キンギョ変異体の表現型の中には、ゼブラフィッシュやメダカでは見られない表現型が多く存在し、その分子メカニズムを解明することで脊椎動物に共通する形態や体色の発生の分子メカニズムが明らかになることが期待される。本研究では、キンギョ品種のもつ表現型の原因遺伝子の同定と分子メカニズムの解明を行う。

研究成果の学術的意義や社会的意義

多用なキンギョ品種に見られる変異体の分子メカニズムを解明することで、私たちヒトや哺乳類一般を含む脊椎動物に共通する形態や体色の発生の分子メカニズムが明らかになることが期待される。また、硬骨魚類の進化の研究に貢献すると考えられる。例えば、キンギョではヒレの過剰な伸長を持つ品種があるが、これはソードテールという種では、一般的に見られる形質である。これら硬骨魚類の形態形成を制御するメカニズムの解明に繋がり比較ゲノムの観点からも意義深い。さらに、キンギョは全ゲノム重複を約1400万年前に経験しており、全ゲノム重複後の進化という点からも興味が持たれる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 4件、 招待講演 6件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] NIH(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] NIH(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] INRA(フランス)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] NIH(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 連載講座 生命科学を拓く新しい実験動物モデル−20 キンギョの多様な表現型と全ゲノム重複-疾患モデル動物としての展開2020

    • 著者名/発表者名
      大森 義裕
    • 雑誌名

      生体の科学

      巻: 71 号: 1 ページ: 68-73

    • DOI

      10.11477/mf.2425201122

    • ISSN
      0370-9531, 1883-5503
    • 年月日
      2020-02-15
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Sex chromosome and sex locus characterization in goldfish, Carassius auratus (Linnaeus, 1758)2020

    • 著者名/発表者名
      Wen Ming、Feron Romain、Pan Qiaowei、Guguin Justine、Jouanno Elodie、Herpin Amaury、Klopp Christophe、Cabau Cedric、Zahm Margot、Parrinello Hugues、Journot Laurent、Burgess Shawn M.、Omori Yoshihiro、Postlethwait John H.、Schartl Manfred、Guiguen Yann
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 21 号: 1 ページ: 552-564

    • DOI

      10.1186/s12864-020-06959-3

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The Genetic Basis of Morphological Diversity in Domesticated Goldfish2020

    • 著者名/発表者名
      Kon Tetsuo、Omori Yoshihiro、Fukuta Kentaro、Wada Hironori、Watanabe Masakatsu、Chen Zelin、Iwasaki Miki、Mishina Tappei、Matsuzaki Shin-ichiro S.、Yoshihara Daiki、Arakawa Jumpei、Kawakami Koichi、Toyoda Atsushi、Burgess Shawn M.、Noguchi Hideki、Furukawa Takahisa
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 30 号: 12 ページ: 2260-2274.e6

    • DOI

      10.1016/j.cub.2020.04.034

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] キンギョの遺伝子は普通の魚の約2倍!キンギョが様々な形や色を持つ理由2020

    • 著者名/発表者名
      大森義裕
    • 雑誌名

      月刊アクアライフ増刊、きんぎょ生活

      巻: 6 ページ: 60-62

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] De novo assembly of the goldfish (Carassius auratus) genome and the evolution of genes after whole-genome duplication2019

    • 著者名/発表者名
      Chen Zelin、Omori Yoshihiro、Koren Sergey、Shirokiya Takuya、Kuroda Takuo、Miyamoto Atsushi、Wada Hironori、Fujiyama Asao、Toyoda Atsushi、Zhang Suiyuan、Wolfsberg Tyra G.、Kawakami Koichi、Phillippy Adam M.、Mullikin James C.、Burgess Shawn M.、NISC Comparative Sequencing Program
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 5 号: 6

    • DOI

      10.1126/sciadv.aav0547

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Diversity of morphological phenotypes in domesticated goldfish strains and their whole genome analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Omori,Tetsuo Kon, Kentaro Fukuta, Atsushi Toyoda, Hideki Noguchi,
    • 学会等名
      The 2nd AsiaEvo Conference 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] キンギョ(Carassius auratus)とその近縁種、そして全ゲノム重複後の進化2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Omori,Tetsuo Kon, Kentaro Fukuta, Mari Nishino, Natsuki Noda, Atsushi Toyoda, Hideki Noguchi
    • 学会等名
      第44回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 公開講演会「今!キンギョがおもしろい」2021

    • 著者名/発表者名
      大森義裕
    • 学会等名
      日本動物学会 中部支部会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Understanding of molecular mechanisms underlying on morphological diversity of goldfish (Carassius auratus) strains2020

    • 著者名/発表者名
      今鉄男、大森義裕
    • 学会等名
      2020年 日本分子生物学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A data-scientific approach toward understanding of the goldfish genome and morphological diversity2020

    • 著者名/発表者名
      今鉄男、大森義裕
    • 学会等名
      International Symposium: Global Collaboration on Data beyond Disciplines
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Goldfish genome resequencing and the phenotypic variations of domesticated strains2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Omori, Tetsuo Kon, Kentaro Fukuta, Hironori Wada, Masakatsu Watanabe, Zelin Chen, Koichi Kawakami, Takahisa Furukawa, Atsushi Toyoda, Shawn Burgess, Hideki Noguchi
    • 学会等名
      The 14th International Zebrafish Conference
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] キンギョの全ゲノム配列決定と品種に見られる多様な表現型を規定する遺伝子の探索2019

    • 著者名/発表者名
      YOSHIHIRO OMORI, Tetsuo Kon, Kentaro Fukuta, Zelin Chen, Hironori Wada, Masakatsu Watanabe, Hideki Noguchi, Asao Fujiyama, Atsushi Toyoda, Koichi Kawakami, Shawn Burgess, Takahisa Furukawa
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] キンギョ品種の形態形成を制御するメカニズムの解析2019

    • 著者名/発表者名
      YOSHIHIRO OMORI, Tetsuo Kon, Kentaro Fukuta, Hironori Wada, Masakatsu Watanabe, Zelin Chen, Koichi Kawakami, Takahisa Furukawa, Hideki Noguchi, Shawn Burgess, Atsushi Toyoda
    • 学会等名
      第52回 日本発生生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] zebrafish: The genetics and genome analysis of domesticated goldfish strains with a wide variety of phenotypes2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Omori
    • 総ページ数
      17
    • 出版者
      Springer Protocols
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 長浜バイオ大学大学院 大森研究室

    • URL

      https://yoshihiroomori.web.fc2.com

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 長浜バイオ大学大学院 ゲノム機能科学研究室(大森研)のホームページ

    • URL

      https://yoshihiroomori.web.fc2.com/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 長浜バイオ大学大学院 大森研究室ホームページ

    • URL

      https://yoshihiroomori.web.fc2.com/

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2023-01-30  

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