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偏性細胞内寄生菌(リケッチア)における接合伝達系の解析と遺伝子操作技術への応用

研究課題

研究課題/領域番号 19K22536
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分49:病理病態学、感染・免疫学およびその関連分野
研究機関九州大学

研究代表者

林 哲也  九州大学, 医学研究院, 教授 (10173014)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2020年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2019年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワードリケッチア / ゲノム解析 / プラスミド / ICE / 接合伝達 / 遺伝子改変系 / トランスポゾン / 遺伝解析系 / 必須遺伝子 / 遺伝子改変技術 / 偏性細胞内寄生菌
研究開始時の研究の概要

他の偏性細胞内寄生菌と同様に、リケッチアの解析は取扱いの煩雑さ等のために大きく遅れている。本研究では、日本紅斑熱リケッチアの非病原性近縁種に接合伝達系をコードするプラスミド(pLON)が存在するという我々自身の発見に基づいて、偏性細胞内寄生菌にもプラスミド接合伝達系が存在することを証明し、pLON接合伝達能を活かしたトランスポゾン(Tn)挿入変異導入系の開発を試みる。この変異導入系が確立できれば、リケッチアの細胞内増殖に必要な遺伝子の網羅的探索が可能となり、「大規模なゲノム縮小が生じている偏性細胞内寄生菌で、どの程度の遺伝子が実際に必須であるのか」という大きな学問的な問いに挑むことができる。

研究成果の概要

本研究では、新規リケッチア菌種(Ca. Rickettsia longicornis)とそのプラスミド(pRlon)を解析対象として、偏性細胞内寄生菌でのプラスミド接合伝達系の存在の証明、pLON接合伝達能を活かした遺伝子改変系の開発とこれを用いた細胞内増殖必須遺伝子の網羅的な同定を試みた。その結果、染色体上RAGE(ICEの一種)にもpRlonと異なる接合伝達系が存在することが明らかになったが、他のリケッチアのRAGEやプラスミドとの比較解析の結果、pRlonを含む全ての接合伝達系には複数の偽遺伝子化が認められ、現存するリケッチアの接合伝達系は機能を失っていることが明らかになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、偏性細胞内寄生菌であるリケッチアの新菌種のゲノム解析によって見出したプラスミドに着目し、これまでに報告の無い偏性細胞内寄生菌での接合による遺伝子伝達系の存在の証明、さらにこのプラスミドの接合系を利用したリケッチアでの遺伝子改変系の開発とこれを用いた増殖必須遺伝子の網羅的同定に挑戦した。染色体上のRAGEと呼ばれる遺伝因子上にも新たな接合伝達系を同定できたが、既知のリケッチアのRAGEやプラスミドと比較解析を行った結果、解析した全ての接合系には複数の偽遺伝子(失活した遺伝子)が存在することが明らかとなった。この知見は、現存するリケッチアの接合伝達系は機能を失っていることを示唆する。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Genomic Features of Rickettsia heilongjiangensis Revealed by Intraspecies Comparison and Detailed Comparison With Rickettsia japonica2019

    • 著者名/発表者名
      Kasama K, Fujita H, Yamamoto S, Ooka T, Gotoh Y, Ogura Y, Ando S, Hayashi T.
    • 雑誌名

      Front Microbiol

      巻: 6

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.02787

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 次世代シーケンサの活用によって広がる細菌のゲノム研究2021

    • 著者名/発表者名
      林哲也
    • 学会等名
      第94回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Genome analysis of “Candidatus Rickettsia longicornii” revealed unique mobile genetic elements2021

    • 著者名/発表者名
      笠間健太郎、後藤恭宏、藤田博己、山本正悟、小椋義俊、安藤秀二、林哲也
    • 学会等名
      第94回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 比較ゲノム解析による極東紅斑熱リケッチア日本分離株のゲノム特性の解明2020

    • 著者名/発表者名
      笠間健太郎、藤田博己、山本正悟、大岡唯祐、後藤恭宏、小椋義俊、安藤秀二、林哲也
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 比較ゲノム解析による極東紅斑熱リケッチア日本分離株のゲノム特性の解明2020

    • 著者名/発表者名
      笠間健太郎, 藤田博己, 山本正悟, 大岡唯祐. 後藤恭宏, 小椋義俊,安藤秀二, 林哲也
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 1.Low genomic diversity of Rickettsia heilongjiangensis revealed by genomic comparison of Japanese and Chinese isolates2019

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Kasama, Hiromi Fujita, Tadasuke Ooka, Yasuhiro Gotoh, Shuji Ando, Tetsuya Hayashi
    • 学会等名
      APRC2 (2nd Asia-Pacific Rickettsia Conference)
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2022-01-27  

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