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人工知能による遺伝子発現プロファイル解析に基づいた子宮内膜症の新規治療標的の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19K22688
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野
研究機関山口大学

研究代表者

杉野 法広  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (10263782)

研究分担者 浅井 義之  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (00415639)
研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2019年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード子宮内膜症 / 卵巣チョコレート嚢胞 / 遺伝子ネットワーク / バイオインフォマティクス / ブーリアンネットワーク / マスター遺伝子 / HOXC8 / TGF-β / マスターレギュレータ遺伝子 / TGF-beta / Smad経路 / Rho-ROCK経路 / 数理モデル / 人工知能
研究開始時の研究の概要

近年のシステムバイオロジーの概念から、子宮内膜症の病態をマスター遺伝子の異常による遺伝子ネットワークの異常として捉えることができる。本研究では、公表されている遺伝子相互作用ネットワークと申請者が有する正常子宮内膜と子宮内膜症の遺伝子発現データを組み込んだ遺伝子制御ネットワークの数理モデルを作成することで、正常状態から疾患(子宮内膜症)を引き起こすマスター遺伝子の組み合せを人工知能を用いたシミュレーションにより同定し、また逆に、疾患から正常状態にネットワークを遷移させる遺伝子群をシミュレーションで同定することによって治療標的となるマスター遺伝子群を同定する。

研究成果の概要

卵巣チョコレート嚢胞の発症と病因に関与する上流制御因子であるマスター遺伝子を同定した。
卵巣チョコレート嚢胞の間質細胞および正所性の子宮内膜間質細胞のtranscriptomeデータと、公的データベースから入手した遺伝子発現制御ネットワークデータを用いた解析(SMITE法)から12候補遺伝子を抽出した後、Boolean network simulationを行いマスター遺伝子としての妥当性を確認した。この中のHOXC8については、同遺伝子を過剰発現する細胞株を樹立して、実際に細胞増殖、癒着、線維化、TGFβシグナル経路の活性化などの卵巣チョコレート嚢胞の特徴を誘導できることを示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

子宮内膜症(卵巣チョコレート嚢胞)の発症において鍵となるマスター遺伝子を同定することができ、将来的にそれらを標的とした分子標的治療の開発に役立つ可能性がある。また、バイオインフォマティクスと数理モデルを用いた本研究の研究手法は、疾患における複雑な発現制御ネットワークを明らかにする上で、今後、更に重要となる研究手法である。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] The essential glucose transporter GLUT1 is epigenetically upregulated by C/EBPβ and WT1 during decidualization of the endometrium2021

    • 著者名/発表者名
      Tamura Isao、Fujimura Taishi、Doi-Tanaka Yumiko、Takagi Haruka、Shirafuta Yuichiro、Kajimura Takuya、Mihara Yumiko、Maekawa Ryo、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 297 号: 4 ページ: 101150-101150

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101150

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long-term melatonin treatment attenuates body weight gain with aging in female mice2021

    • 著者名/発表者名
      Tamura Isao、Tamura Hiroshi、Kawamoto-Jozaki Mai、Doi-Tanaka Yumiko、Takagi Haruka、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Maekawa Ryo、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Journal of Endocrinology

      巻: 251 号: 1 ページ: 15-25

    • DOI

      10.1530/joe-20-0462

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrated Analysis of Transcriptome and Histone Modifications in Granulosa Cells During Ovulation in Female Mice2021

    • 著者名/発表者名
      Shirafuta Yuichiro、Tamura Isao、Ohkawa Yasuyuki、Maekawa Ryo、Doi-Tanaka Yumiko、Takagi Haruka、Mihara Yumiko、Shinagawa Masahiro、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Endocrinology

      巻: 162 号: 9 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1210/endocr/bqab128

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Relationship between follicular size and developmental capacity of oocytes under controlled ovarian hyperstimulation in assisted reproductive technologies2021

    • 著者名/発表者名
      Tamura Isao、Kawamoto‐Jozaki Mai、Fujimura Taishi、Doi‐Tanaka Yumiko、Takagi Haruka、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Taketani Toshiaki、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Reproductive Medicine and Biology

      巻: 20 号: 3 ページ: 299-304

    • DOI

      10.1002/rmb2.12382

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcription factor C/EBPβ induces genome-wide H3K27ac and upregulates gene expression during decidualization of human endometrial stromal cells2021

    • 著者名/発表者名
      Tamura Isao、Maekawa Ryo、Jozaki Kosuke、Ohkawa Yasuyuki、Takagi Haruka、Doi-Tanaka Yumiko、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Endocrinology

      巻: 520 ページ: 111085-111085

    • DOI

      10.1016/j.mce.2020.111085

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An Integrated Genomic Approach Identifies HOXC8 as an Upstream Regulator in Ovarian Endometrioma2020

    • 著者名/発表者名
      Yumiko Mihara, Ryo Maekawa, Shun Sato, Natsuko Shimizu, Yumiko Doi-Tanaka, Haruka Takagi, Yuichiro Shirafuta, Masahiro Shinagawa, Isao Tamura, Toshiaki Taketani, Hiroshi Tamura, Takeshi Abe, Yoshiyuki Asai, Norihiro Sugino
    • 雑誌名

      The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism

      巻: 105 号: 12 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1210/clinem/dgaa618

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Wilms tumor 1 regulates lipid accumulation in human endometrial stromal cells during decidualization2020

    • 著者名/発表者名
      Tamura Isao、Takagi Haruka、Doi-Tanaka Yumiko、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Shinagawa Masahiro、Maekawa Ryo、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: in press 号: 14 ページ: 4673-4683

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.012841

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Importance of Melatonin in Assisted Reproductive Technology and Ovarian Aging2020

    • 著者名/発表者名
      Tamura Hiroshi、Jozaki Mai、Tanabe Manabu、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Shinagawa Masahiro、Tamura Isao、Maekawa Ryo、Sato Shun、Taketani Toshiaki、Takasaki Akihisa、Reiter Russel J.、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 21 号: 3 ページ: 1135-1135

    • DOI

      10.3390/ijms21031135

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SATB2 and NGR1: potential upstream regulatory factors in uterine leiomyomas.2020

    • 著者名/発表者名
      Shun Sato , Ryo Maekawa , Isao Tamura , Yuichiro Shirafuta , Masahiro Shinagawa , Hiromi Asada , Toshiaki Taketani , Hiroshi Tamura , Norihiro Sugino
    • 雑誌名

      Journal of assisted reproduction and genetics

      巻: 36 号: 11 ページ: 2385-2397

    • DOI

      10.1007/s10815-019-01582-y

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The clinical outcome of Dienogest treatment followed by in vitro fertilization and embryo transfer in infertile women with endometriosis2019

    • 著者名/発表者名
      Tamura H, Yoshida H, Kikuchi H, Josaki M, Mihara Y, Shirafuta Y, Shinagawa M, Tamura I, Taketani T, Takasaki A, Sugino N
    • 雑誌名

      Journal of Ovarian Research

      巻: 12 号: 1

    • DOI

      10.1186/s13048-019-0597-y

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide DNA methylation analysis revealed stable DNA methylation status during decidualization in human endometrial stromal cells2019

    • 著者名/発表者名
      Maekawa Ryo、Tamura Isao、Shinagawa Masahiro、Mihara Yumiko、Sato Shun、Okada Maki、Taketani Toshiaki、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 20 号: 1 ページ: 324-324

    • DOI

      10.1186/s12864-019-5695-0

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Glucose regulates the histone acetylation of gene promoters in decidualizing stromal cells2019

    • 著者名/発表者名
      Jozaki Kosuke、Tamura Isao、Takagi Haruka、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Shinagawa Masahiro、Maekawa Ryo、Taketani Toshiaki、Asada Hiromi、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Reproduction

      巻: 157 号: 5 ページ: 457-464

    • DOI

      10.1530/rep-18-0393

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aberrant DNA methylation suppresses expression of estrogen receptor 1 (ESR1) in ovarian endometrioma2019

    • 著者名/発表者名
      Maekawa Ryo、Mihara Yumiko、Sato Shun、Okada Maki、Tamura Isao、Shinagawa Masahiro、Shirafuta Yuichiro、Takagi Haruka、Taketani Toshiaki、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Journal of Ovarian Research

      巻: 12 号: 1

    • DOI

      10.1186/s13048-019-0489-1

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] C/EBPβ regulates Vegf gene expression in granulosa cells undergoing luteinization during ovulation in female rats2019

    • 著者名/発表者名
      Shinagawa Masahiro、Tamura Isao、Maekawa Ryo、Sato Shun、Shirafuta Yuichiro、Mihara Yumiko、Okada - Matsumoto Maki、Taketani Toshiaki、Asada Hiromi、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41598-018-36566-y

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Anti-aging effects on melatonin on follicle development.2021

    • 著者名/発表者名
      Sugino N
    • 学会等名
      The 10th Congress of the Asia Pacific Initiative on Reproduction (ASPIRE 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 子宮内膜間質細胞の脱落膜化に伴う遺伝子発現調節機構2021

    • 著者名/発表者名
      杉野法広
    • 学会等名
      第39回日本受精着床学会学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 子宮内膜脱落膜化とエピジェネティクス(特別講演)2020

    • 著者名/発表者名
      杉野法広
    • 学会等名
      第4回 ART JAPAN 生殖医療研究会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 子宮内膜の発育とその異常(特別講演)2020

    • 著者名/発表者名
      杉野法広
    • 学会等名
      令和2年度岡山産科婦人科学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA methylation and uterine fibroids.2019

    • 著者名/発表者名
      Sugino N
    • 学会等名
      The 8th Asian Conference on Endometriosis
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] 標準産科婦人科学 第5版 綾部琢哉、板倉敦夫 編集「ホルモン療法」2021

    • 著者名/発表者名
      杉野法広
    • 総ページ数
      697
    • 出版者
      医学書院
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] 生殖と周産期のリエゾン 編集:池田智明、苛原稔、吉村泰典2020

    • 著者名/発表者名
      前川 亮 杉野法広
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      診断と治療社
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2023-01-30  

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