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気相中で標的分子を特異的に認識するDNAアプタマーの開発

研究課題

研究課題/領域番号 19K22955
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分90:人間医工学およびその関連分野
研究機関東京農工大学

研究代表者

池袋 一典  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 卓越教授 (70251494)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
キーワード気相中の分子認識 / アプタマー / 水晶振動子 / ガス検出 / 水滴中の蛋白質の気相での検出 / DNAアプタマー
研究開始時の研究の概要

本研究は、気相中で分子認識できるDNAアプタマーを設計・開発することを目的とする。気相中でのアプタマーによるガス分子認識を、水晶振動子や電界効果トランジスタ(FET)等で検出する。例えば、水晶振動子の表面にジニトロフェノールに結合するDNAアプタマーを固定化し、水晶振動子に交流電圧を印加すると、規則正しく振動する。DNAアプタマーにパーミエーターによりガス状にした標的分子が結合すると、振動数が変化する。

研究成果の概要

本研究は、気相中で分子認識できるDNAアプタマーを設計・開発することを目的とした。現在、金属酸化物センサー等が、気相中のガス分子検出に用いられているが、特定のガス分子を特異的に検知できない。DNAは気相中でも水中での構造を維持している可能性があり、優れた分子認識能を持つDNAアプタマーは、気相中でも3次元構造を維持し、標的分子を認識できる可能性がある。そこで、気相中でのアプタマーによるガス分子認識を、アプタマーを固定化した水晶振動子で検出した。インドールが結合すると、振動数が変化し、メチル基一つを余分に有するスカトールに対しては振動数の変化を観察できなかった。特異的な検出に成功したといえる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ガス分子を特異的に検出することができれば、疾病の早期診断や覚醒剤検知やテロ対策に極めて有効である。しかし現在、異なるガスをパターン解析により区別するシステムは開発されているが、特定のガス分子を、気相中で特異的かつ高感度に検出できるセンシングシステムは開発されていない。本研究では気相中で分子認識できると予想されるDNAアプタマーを水晶振動子に固定化して、香料として汎用されている、インドール、スカトールの検出を試み、構造が類似しており、わずかメチル基一つの差しかない両者を明確に区別できる水晶振動子の振動数変化を観察した。まだ報告例のない、気相中の分子認識の最初の例として意義は大きい。

報告書

(3件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件) 図書 (2件)

  • [国際共同研究] UNC at Chapel Hill/UC Riverside/NCSU(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] UNC at Chapel Hill(米国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] G-quadruplex: Flexible conformational changes by cations, pH, crowding and its applications to biosensing.2021

    • 著者名/発表者名
      Nishio M, Tsukakoshi K, Ikebukuro K
    • 雑誌名

      Biosens Bioelectron

      巻: 178 ページ: 113030-113030

    • DOI

      10.1016/j.bios.2021.113030

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ethanol Detection at the Parts per Billion Level with Single‐Stranded‐DNA‐Modified Graphene Field‐Effect Transistors2019

    • 著者名/発表者名
      Nozaki Ryo、Ikuta Takashi、Ueno Kinuko、Tsukakoshi Kaori、Ikebukuro Kazunori、Maehashi Kenzo
    • 雑誌名

      physica status solidi (b)

      巻: 257 号: 2 ページ: 1900376-1900376

    • DOI

      10.1002/pssb.201900376

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Electrochemical Aptasensor Employing Enzyme-Aptamer One-to-One Complex Showing Quasi-Direct Electron Transfer Ability2020

    • 著者名/発表者名
      Hatano Y, Lee JH, Kim SH, Ikebukuro K, Asano R, Gu MB, Sode K
    • 学会等名
      ECS Meeting
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] Advances in Synthetic Biology2020

    • 著者名/発表者名
      Ueno K, Tsukakoshi K, Ikebukuro K
    • 総ページ数
      349
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9789811500817
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] "Aptameric sensors utilizing its property as DNA", in "Chemical, Gas, and Biosensors for Internet of Things and Related Applications"2019

    • 著者名/発表者名
      Kinuko Ueno, Kaori Tsukakoshi, Kazunori Ikebukuro
    • 出版者
      Elsevier
    • ISBN
      9780128154090
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2024-12-25  

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