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バクテリアのバイオフィルム形成現象から切り拓く超サバイバルシステムの革新的設計論

研究課題

研究課題/領域番号 19KK0103
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

配分区分基金
審査区分 中区分21:電気電子工学およびその関連分野
研究機関東北大学

研究代表者

加納 剛史  東北大学, 電気通信研究所, 准教授 (80513069)

研究分担者 福原 洸  東北大学, 電気通信研究所, 助教 (10827611)
石黒 章夫  東北大学, 電気通信研究所, 教授 (90232280)
安井 浩太郎  東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (70876739)
研究期間 (年度) 2019-10-07 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円)
2022年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2021年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2020年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2019年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワード自律分散制御 / バイオフィルム / サバイバビリティ / イトミミズ / チスイコウモリ / COVID-19 / 蝋燭振動子 / バクテリア / 自律分散システム
研究開始時の研究の概要

本研究では,環境への適応戦略を自律的に創出し,過酷な環境下でも機能する「サバイバビリティ」の高い人工物システムの革新的設計論構築を目指す.目的達成のため,複数のバクテリアの相互作用により自己組織的に形成された構造体であるバイオフィルムに着目する.バクテリアを用いた生物実験と数理モデリングによりサバイバル戦略を創発可能なシステムの設計論を構築し,さらにその設計論を用いて過酷な環境に耐え得る人工物を実世界実現する.

研究成果の概要

環境への適応戦略を自律的に創出し,過酷な環境下でも機能する「サバイバビリティ」の高い人工物システムの設計論構築を目指す.目的達成のため,バクテリアのバイオフィルムが示す環境適応戦略の発現原理を英国の浅利とともに探った.当初予定していたバクテリアの進化実験は断念したが,個体群各細胞が一時的に栄養を摂取制限することで全体の細胞を共存させるという利他的な戦略の本質を数理モデルで抽出し,シミュレーションで振る舞いを再現できた.また,イトミミズやチスイコウモリ,COVID-19流行などの生命・社会システムにおけるサバイバビリティの発現メカニズムを探り,体系的な設計論構築へと道を切り拓いた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

従来の人工物は想定環境下で優れた機能を発揮できるものの,予期せぬ事態が起こりうる環境下で機能し続けるのは困難であった.本研究は,環境への適応戦略を自律的に創出し,過酷な環境下でも機能する「サバイバビリティ」の高い人工物システムの構築につながるものである.バクテリアは原初的な生物であるにもかかわらず,飢餓状態にある他の細胞を助けるために自身の餌摂取を控えるという利他的な戦略をとっており,その枠組みを数理で抽出できたことは意義深い.また,バクテリア以外のシステムのサバイバビリティ実現戦略も明らかにしており,異なるシステムをつなぐ原理の抽出は今後の人工物の適応能力の飛躍的向上につながると期待される.

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 6件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Designing Decentralized Systems with High Survivability Inspired by Altruistic Social Interactions of Vampire Bats2024

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kano, Shokichi Kawamura, Taishi Mikami, Daiki Wakita, Akio Ishiguro
    • 雑誌名

      Journal of Robotics and Mechatronics (accepted)

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Elongating, entwining, and dragging: mechanism for adaptive locomotion of tubificine worm blobs in a confined environment2023

    • 著者名/発表者名
      Mikami Taishi、Wakita Daiki、Kobayashi Ryo、Ishiguro Akio、Kano Takeshi
    • 雑誌名

      Frontiers in Neurorobotics

      巻: 17 ページ: 1207374-1207374

    • DOI

      10.3389/fnbot.2023.1207374

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An agent-based model of the interrelation between the COVID-19 outbreak and economic activities2021

    • 著者名/発表者名
      T. Kano, K. Yasui, T. Mikami, M. Asally, and A. Ishiguro
    • 雑誌名

      Proceedings of the Royal Society A

      巻: 477 号: 2245 ページ: 20200604-20200604

    • DOI

      10.1098/rspa.2020.0604

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Decoding essential mechanism for adaptive locomotion of tubificine worm blobs on confined environment2023

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kano, Taishi Mikami, Daiki Wakita, Ryo Kobayashi, Akio Ishiguro
    • 学会等名
      6th Yamada Symposium on "Diversity of Biological Patterns and Forms in Nature: toward a Comprehensive Understanding"
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] チスイコウモリのコミュニティ形成から学ぶサバイバビリティの高い自律分散システムの設計論2023

    • 著者名/発表者名
      川村松吉, 脇田大輝, 三上大志, 石黒章夫, 加納剛史
    • 学会等名
      第35回自律分散システム・シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] イトミミズ塊が示す不整地を活用した集団移動に内在する自律分散制御則2023

    • 著者名/発表者名
      三上大志, 脇田大輝, 小林亮, 石黒章夫, 加納剛史
    • 学会等名
      第35回自律分散システム・シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Toward Realization of Highly Survivable Engineering Systems: A Simple Mathematical Model of Social Interactions among Vampire Bats2022

    • 著者名/発表者名
      T. Kano, S. Kawamura, T. Mikami, A. Ishiguro
    • 学会等名
      The 2022 Conference on Artificial Life, ABMHuB 2022 workshop
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 「絡まり,ほどけ,そして動き回る」:イトミミズ塊に学ぶ 超不定形群ロボットの設計方策2022

    • 著者名/発表者名
      三上大志, 加納剛史, 小林亮, 石黒章夫
    • 学会等名
      ロボティクス・メカトロニクス講演会2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新たな自律分散制御の枠組みの構築を目指して~理学・工学の垣根を超えたアプローチ~2022

    • 著者名/発表者名
      加納剛史
    • 学会等名
      第2回 トータルバイオミメティクス研究グループ 合同シンポジウム,「バイオミメティクスと群知能」
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 自律分散制御のあり方を問う2022

    • 著者名/発表者名
      加納剛史
    • 学会等名
      新学術領域研究「細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御」第4回若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Simple mathematical model for COVID-19 outbreak considering economic activities2021

    • 著者名/発表者名
      T. Kano, K. Yasui, T. Mikami, M. Asally, A. Ishiguro
    • 学会等名
      The 15th International Symposium on Distributed Autonomous Robotic Systems 2021 The 4th International Symposium on Swarm Behavior and Bio-Inspired Robotics 2021 (DARS-SWARM2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Mitigation of COVID-19 outbreak while continuing economic activities2021

    • 著者名/発表者名
      T. Kano, K. Yasui, T. Mikami, M. Asally, A. Ishiguro
    • 学会等名
      The 2021 conference on Artificial Life, ABMHuB 2021 workshop
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] How to Mitigate the COVID-19 Outbreak While Maintaining Economic Activities?2021

    • 著者名/発表者名
      T. Kano, K. Yasui, T. Mikami, M. Asally, A. Ishiguro
    • 学会等名
      The Conference on Complex Systems 2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] バイオフィルムの振動的拡大現象を再現するシンプルな反応拡散モデル2021

    • 著者名/発表者名
      三上大志,浅利宗弘,加納剛史,石黒章夫
    • 学会等名
      数理生物学会年会・企画シンポジウム「生物学・数理科学・ロボット工学の融合」
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] One-dimensional reaction-diffusion model for intra- and inter- biofilm oscillatory dynamics2020

    • 著者名/発表者名
      T. Mikami, M. Asally, T. Kano, A. Ishiguro
    • 学会等名
      The 2020 Conference on Artificial Life
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 経済活動を考慮したCOVID-19流行の数理モデル2020

    • 著者名/発表者名
      加納剛史,安井浩太郎,三上大志,浅利宗弘,石黒章夫
    • 学会等名
      日本数理生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] バイオフィルムのパターン形成を予測する反応拡散モデル2020

    • 著者名/発表者名
      三上大志,浅利宗弘,加納剛史,石黒章夫
    • 学会等名
      日本数理生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2019-10-10   更新日: 2025-01-30  

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