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マイクロアレイによる肺癌のメチル化網羅的解析と診断・治療のターゲットの検討

研究課題

研究課題/領域番号 20012009
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関群馬大学

研究代表者

畑田 出穂  群馬大学, 生体調節研究所, 准教授 (50212147)

研究分担者 堀居 拓郎  群馬大学, 生体調節研究所, 助教 (00361387)
堀井 明  東北大学, 医学研究科, 教授 (40249983)
落谷 孝広  国立がんセンター, 研究所, 室長 (60192530)
研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
11,200千円 (直接経費: 11,200千円)
2009年度: 5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
2008年度: 5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
キーワードエピジェネティクス / メチル化 / マイクロアレイ / miRNA / DNAメチル化
研究概要

DNAメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化は、癌化において癌抑制遺伝子の不活性化などをとおし重要な働きをしている。申請者らはこれまでにマイクロアレイを用いたDNAメチル化の網羅的解析技術を用いて肺癌でメチル化の変化を示す遺伝子をみいだしてきている。これらにはmiR-29などをはじめmicroRNA(miRNA)がコードされる領域が多く含まれている。miRNAと癌との関連は近年、重要な話題のひとつであるとともに、それが小分子であることから治療への可能性を秘めた注目すべき研究対象である。しかしながら逆に不安定な小分子のRNAであるがゆえ臨床サンプルを用いた研究、診断の対象としてむつかしい。そこで本研究ではmiRNA自体ではなく、それをコードする安定なDNAのメチル化を対象として網羅的解析をおこなった。miRNAコード領域の上流25kbを含むアレイを用いて解析をおこなったところmiR-29をはじめ多くの領域で癌においてメチル化の変化がおこっていていることがわかり、癌におけるmiRNA解析の有用なツールとなることがわかった。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (3件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Epigenetic Regulation of Adipocyte Differentiation by a Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor, WGEF2009

    • 著者名/発表者名
      Horii T, Morita S, Kimura M, Hatada I.
    • 雑誌名

      PLoS ONE 4

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Methyl-CpG targeted recruitment of p300 reactivates tumor suppressor genes in human cancer cells2009

    • 著者名/発表者名
      Fukushige S, Kondo E, Horii A.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 379

      ページ: 1021-1026

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dicer is required for maintaining adult pancreas2009

    • 著者名/発表者名
      Morita S, Hara A, Kojima I, Horii T, Kimura M, Kitamura T, Ochiya T, Nakanishi K, Matoba R, Matsubara K, Hatada I
    • 雑誌名

      PLoS ONE 4

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Astrocytespecific genes are generally demethylated in neural precursor cells prior to astrocytic differentiation2008

    • 著者名/発表者名
      Hatada I, Namihira M, Morita S, Kimura M, Horii T, Nakashima K
    • 雑誌名

      PLoS ONE 3

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A comparative analysis of the transcriptome and signal pathways in hepatic differentiation of human adipose mesenchymal stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Y, Banas A, Murata S, Ishikawa M, Lim CR, Teratani T, Hatada I, Matsubara K, Kato T, Ochiya T.
    • 雑誌名

      FEBS J 275

      ページ: 1260-1273

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mecp-2 dependent repression of an imprinted miR-184 released by depolarization2008

    • 著者名/発表者名
      Nomura T, Kimura lvi, Horii T, Morita S, Soejima H, Kudo S & Hatada I
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet 17

      ページ: 1192-1199

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of Genomic Imprinting in Mouse Parthenogenetic Embryonic Stem Cells2008

    • 著者名/発表者名
      Horii T, Kimura M, Morita S, Naeao Y & Hatada I
    • 雑誌名

      Stem cells 26

      ページ: 79-88

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Geome-wide demethylation during neural differentiation of P19 embryonal carcinoma cells2008

    • 著者名/発表者名
      Hatada I, Morita S, Kimura M, Horii T, Yamashita R & Nakai K.
    • 雑誌名

      J. Hum Genet 53

      ページ: 185-191

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Development of genome-wide DNA methylation analysis method and applications2009

    • 著者名/発表者名
      Hatada I
    • 学会等名
      68^<th> Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Profiling and characterization of DNA methylation targets2009

    • 著者名/発表者名
      Hatada I
    • 学会等名
      Japan-Denmark Joint Workshop on "Molecular Cancer Research"
    • 発表場所
      Tokyo
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Profiling of DNA methylation targets2008

    • 著者名/発表者名
      Hatada I
    • 学会等名
      Decoding Epigenetic Code
    • 発表場所
      Tokyo
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] The epigenomics of cancer. In Omics perspective of cancer Cho, William C.S.(Ed.)2010

    • 著者名/発表者名
      Hatada I
    • 総ページ数
      269
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] Genomic-wide DNA Methylation Profiling. Methods-From RLGS to MIAMI. In Progress in DNA Methylation Research2008

    • 著者名/発表者名
      Hatada I
    • 総ページ数
      256
    • 出版者
      Nova Publishes
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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