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融合プロテオミクスによるがん診断の新戦略

研究課題

研究課題/領域番号 20014021
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関熊本大学

研究代表者

荒木 令江  熊本大学, 大学院・生命科学研究部, 准教授 (80253722)

研究分担者 倉津 純一  熊本大学, 大学院・生命科学研究部, 教授 (20145296)
研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
12,200千円 (直接経費: 12,200千円)
2009年度: 6,200千円 (直接経費: 6,200千円)
2008年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
キーワードプロテオミクス / 脳腫瘍 / 差異解析 / データベース / 抗がん剤感受性 / iTRAQ / 2D-DIGE / DNA array / proteomics / glioma / differential display / LC-MS-shotgun法 / cholangiocarcinoma / iTRAQ法 / Pheochromocytoma
研究概要

がん研究におけるプロテオミクス解析の最も有効なストラテジーを構築するため、最先端の高感度・分解能・解析速度をもつプロテオミクス解析技術のがん研究への応用と方法論の確立を行っている。本年度は脳神経系腫瘍の薬剤治療標的となりうる分子シグナルを検索するため、病態組織細胞サンプルを用いた統合プロテオミクスの方法論確立を試みた。分子発現差異解析法であるiTRAQ(8Plex)法、2D-DIGE法、およびDNA arrayを融合的に用いて同一サンプル群を同時に解析し、得られたすべての情報を統合マイニングすることによって、病態において異常に制御されたシグナル伝達経路を特異的に抽出する方法論を検討した。全てのデータを統合マイニングし、重要分子シグナル群を抽出するための統合マイニング解析プログラム[MANGO (Mol.Cell.Proteomics 2009), iPEACH(特願2010-81525)]を考案し、さらに抽出重要分子群の迅速検証法、siRNA、阻害剤、活性化剤等を用いた生物学的機能解析法などを検討することによって、スタンダードとなりうる一連の統合的方法論の開発を行った。特に悪性グリオーマの薬剤感受性に関わる分子群の解析、および検証に応用し、新規の抗がん剤感受性低下に関わるシグナルVimentin activation loopを見出した(特願2010-81524)。又、如何に融合技術によって大量に得られたプロテオームデータを迅速に処理し、重要機能分子群を抽出して検証する方法論が重要かつ有用であるか、創薬の観点から考察した。これらの方法論はすべての疾患・病態の解析はもとより、細胞生物学における基礎的な分子メカニズム情報を得るためのアプローチにも応用でき、蓄積されたデータベースを活用することによって、新しい病態メカニズムの解明や診断や治療のマーカー・創薬開発に重要な基礎情報を得る方法論として有用であると考えられる。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (21件) 産業財産権 (3件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] The Contribution of BCR-ABL-independent Activation of ERK1/2 to Imatinib Resistance.2010

    • 著者名/発表者名
      Nambu T, Araki N^*, Nakagawa A, Kuniyasu A, Kawaguchi T, Hamadal A, Saito H.
    • 雑誌名

      Cancer Science 101(1)

      ページ: 137-42

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Silver Ion Unusually Stabilizes the Structure of Parallel-motif DNA Triplex2009

    • 著者名/発表者名
      Ihara T^*, Ishii T, Araki N, Wilson A, Jyo A
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Sic 131(11)

      ページ: 3826-7

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An integrated approach of differential MS and gene ontology analysis identified novel proteins regulating neuronal differentiation and survival.2009

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi D, Kumagai J, Morikawa T, Wilson-M M, Wilson A, Irie A, Araki N
    • 雑誌名

      Mol.Cell.Proteomics 8(10)

      ページ: 2350-67

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppression of galectin-3 expression enhances apoptosis and chemosensitivity in liver fluke associated cholangiocarcinoma.2009

    • 著者名/発表者名
      Wongkham, S., Junking, M., Wongkham, C., Sripa, B., Chur-in, S., Araki. N^*
    • 雑誌名

      Cancer Science 100(11)

      ページ: 2077-84

    • NAID

      10027196830

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Involvement of PI3K-Aid-Bad pathway in apoptosis induced by 2,6-di-O-methyl-beta-cyclodextrin, not 2,6-di-O-methyl-alpha-cyclodextrin, through cholesterol depletion from lipid rafts on plasma membranes in cells2009

    • 著者名/発表者名
      Motoyama K, Kameyama K, Onodeta R, Araki N. Hirayama F, Uekama K, Arima H^*.
    • 雑誌名

      Eur J Pharm Sci 38(3)

      ページ: 249-61

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Silver Ion Unusually Stabilizes the Structure of Parallel-motif DNA Triplex2009

    • 著者名/発表者名
      Ihara, T., et.al.
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society 131(11)

      ページ: 3826-3827

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An integrated approach of differential mass spectrometry and gene ontology analysis identified novel proteins regulating neuronal differentiation and survival2009

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, D., et.al.
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomic (in press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neurofibromatosis Type 1 Tumor Suppressor, Neurofibromin, Regulates the Neuronal Differentiation of PC12 Cells via Its Associating Protein, CRMP-22008

    • 著者名/発表者名
      Patrakitkomjyorn, S., et.al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem 283(14)

      ページ: 9399-413

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aurora A overexpression induces cellular senescence in mammary gland hyperplastic tumors developed in p53-deficient mice2008

    • 著者名/発表者名
      Zhang D, et.al.
    • 雑誌名

      Oncogene (In press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Decreased expression of galectin-3 associated with metastatic potential of liver fluke-associated cholangiocarcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Junking M., et.al.
    • 雑誌名

      Eur. J. Cancer 44(4)

      ページ: 619-26

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mass spectrometric analysis of microtubule co-sedimented proteins from rat brain2008

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto T, et.al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 13(4)

      ページ: 295-312

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 生命のナゾ解きで病気を治す2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      文部科学省女子中高生の理系進路選択支援事業2009「サイエンスプロジェクトfor九州ガールズ】女性研究者による講演会第三回
    • 発表場所
      北九州市明治学園中学高等学校
    • 年月日
      2009-11-14
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 融合プロテオミクスによるがん研究の最前線とその応用2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      同仁化学研究所特別講演会
    • 発表場所
      熊本県益城町同仁化学
    • 年月日
      2009-09-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 生命のナゾ解きで病気を治す2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      文部科学省女子中高生の理系進路選択支援事業2009「サイエンスプロジェクトfor九州ガールズ」女性研究者による講演会第一回
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2009-06-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 最新プロテオーム解析技術の健康科学への応用2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      言本農芸化学会2009年度大会シンポジウム
    • 発表場所
      福岡市、マリンメッセ福岡(招待講演)
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 拠点B : プロテオミクスを基盤とした病態システムズバイオロジー教育研究拠点の構築2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      平成20年度・大学院FD講演会
    • 発表場所
      熊本市、熊本大学医学部附属病院山崎記念会館1階研修ホール
    • 年月日
      2009-03-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] プロテオミクスによる疾患メカニズム解析と治療標的分子検索への戦略2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      大分大学平成20年度先端医工学研究センターセミナー
    • 発表場所
      大分市、大分大学医学部(招待講演)
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] プロテオミクスによる疾患メカニズム解析と治療標的分子検索への戦略2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      大分大学平成20年度先端医工学研究センターセミナー
    • 発表場所
      大分大学卒後臨床研修センターセミナー室
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A standard framework of sequential proteomics for cancer research2009

    • 著者名/発表者名
      Node Araki
    • 学会等名
      The 2nd BMB Conference
    • 発表場所
      Khon Kaen, Thailand
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 融合プロテオミクスによる細胞内疾患関連シグナルの解析2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全白空ホテルニュースカイ
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 神経線維腫症1の分子病態2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第51回日本小児神経学会総会
    • 発表場所
      米子コンベニミヨンセニター
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 融合プロテオミクスによる腫瘍の化学療法耐性メカニズムの解析2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      日本ヒトプロテオーム学会/日本ヒトプロテオーム機構第7回大会(JHUPO)
    • 発表場所
      東京白金北里大学
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 抗体カクテルとnatural protein chipを用いた簡便な病態関連分子群解析法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第82回日本生化学会
    • 発表場所
      神戸ポートマイラニド
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] p53を介した虚血ストレスによる神経細胞死メカニズムの機能プロテオミクス2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会ワークショップ
    • 発表場所
      神戸市、神戸国際会議場
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Assembled Proteomics on Brain Tumors2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      日台シンポジウム
    • 発表場所
      台湾台北市、台北中央研究院(招待講演)
    • 年月日
      2008-12-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 最先端融合プロテオミクスによる疾患の病態解析への応用2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第54回言本病理学会秋季総会
    • 発表場所
      松山市、松山市総合コミュニティーセンター(招待講演)
    • 年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Systematic Proteomics for the functional study of tumor related geneproducts2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      グローバルCOEリエゾンラボセミナー
    • 発表場所
      熊本市、熊本大学発生医学研究センター(招待講演)
    • 年月日
      2008-11-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of neuronal cellular differentuiation via NFI tumor suppressor gene product, neurofibromin2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第67回日本癌学会学術総会ワークショップ
    • 発表場所
      名古屋市、名古屋国際会議場
    • 年月日
      2008-10-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the specific proteins related to chemotherapy sensitivetise in gliomas by assembled proteomic strategies2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      MPSA2008(国際タンパク質構造解析シンポジウム)
    • 発表場所
      札幌市、北海道大学学術交流会館(招待講演)
    • 年月日
      2008-08-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 疾患プロテオーム解析の新技術2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      MPSA2008(国際タンパク質構造解析シンポジウム)プレファンファレンス
    • 発表場所
      札幌市、北海道大学学術交流会館(招待講演)
    • 年月日
      2008-08-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 融合プロテオミクスによるがんのシステムバイオロジーへのアプローチ2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      岡山大学大学院自然科学研究科バイオサイエンスセミナー
    • 発表場所
      岡山市、岡山大学(招待講演)
    • 年月日
      2008-06-27
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 融合プロテオミクスによるデータベースの腫瘍研究への応用2008

    • 著者名/発表者名
      荒木令江
    • 学会等名
      第56回質量分析学会シンポジウム
    • 発表場所
      つくば市、つくば国際会議場(招待講演)
    • 年月日
      2008-05-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] 胆管がん特異的糖鎖エプトープを認識するモノクローナル抗体2010

    • 発明者名
      荒木令江, 他3名
    • 権利者名
      熊本大学株式会社トランスジェニック
    • 産業財産権番号
      2009-025607
    • 出願年月日
      2010-02-06
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] 融合プロテオミクス解析による疾患原因タンパク質群の同定方法および薬剤効果検出方法2010

    • 発明者名
      荒木令江, 他4名
    • 権利者名
      熊本大学
    • 産業財産権番号
      2010-081524
    • 出願年月日
      2010-03-31
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [産業財産権] 統合プロテオミクス解析用データ群の生成方法及び同生成方法にて生成した統合プロテオミクス解析用データ群を用いる統合プロテオミクス解析方法2010

    • 発明者名
      荒木令江, 他4
    • 権利者名
      熊本大学
    • 産業財産権番号
      2010-081525
    • 出願年月日
      2010-03-31
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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