細胞性粘菌を用いた多細胞体制成立のゲノム基盤に関する研究

• 研究課題/領域番号: 20017004
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 漆原 秀子 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (00150087)
• 研究分担者: 桑山 秀一 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 講師 (40397659)
• 連携研究者: 川田 健文 東邦大学, 理学部, 准教授 (30221899)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 16,000千円 (直接経費: 16,000千円); 2009年度: 8,000千円 (直接経費: 8,000千円); 2008年度: 8,000千円 (直接経費: 8,000千円)
• キーワード: 微生物ゲノム / ゲノム進化 / 比較ゲノム / 発生分化 / 細胞性粘菌 / 多細胞体制 / 細胞分化 / ゲノム解析 / データベース / cDNA解析 / 進化 / 遺伝子モデル

研究概要

柄細胞が分化しない細胞性粘菌Acytostelium subglobosumのゲノム解を行い、13,400個の遺伝子モデルを構築した。すでにゲノム解析の終了している代表種Dictyostelium discoideumと比較したところ、細胞分化に関与する遺伝子のほぼすべてについてオーソログが存在していること、一方、多重遺伝子ファミリーの構成は両者でかなり異なっていることが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] The cellular slime mold: eukaryotic model microorganism. (2009)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Exp. Anim. 58 ページ: 977-104
  • NAID: 10024838149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Switching direction in electric signal-induced cell migration by cGMP and phosphatydylinositol signaling. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, MJ. Kuwayama, H., van Egmond, WN., Takayama, ALK, Takagi, H., van Haastert, PJM., Yanagida, T., Ueda, M.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. 106 ページ: 6667-6672
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differentiation-Inducing Factor-1 and -2 function also as Modulators for Dictyostelium Chemotaxis. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H., Kubohara, Y.
  • 雑誌名: PLoS One 4
  • NAID: 120007131231
  • 査読あり
• [雑誌論文] The cellular slime mold : eukaryotic model microorganism (2009)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Exp.Anim. 58 ページ: 977-104
  • NAID: 10024838149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differentiation-inducing factor-1 and -2 function also as modulators for Dictyostelium chemotaxis (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H.
  • 雑誌名: PLoS One 4
  • NAID: 120007131231
  • 査読あり
• [雑誌論文] Developmental biology of the social amoeba: history, current knowledge and prospects. (2008)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Dev Growth Differ. 50Suppl1
  • NAID: 10024400567
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary linkage between cytokinesis and chloroplast division by dynamin proteins. (2008)
  • 著者名/発表者名: Miyagishima, H., Kuwayama, H., Urushihara, H., Nakanishi, H.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. 105 ページ: 15202-15207
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA oligonucleotide-assisted genetic manipulation increases transformation and homologous recombination efficiencies ; evidence from gene targeting of Dictyoste-lium discoideum (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H
  • 雑誌名: J. Bacteriol 133 ページ: 418-423
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of ammonia homeostasis by the ammonium transporter AmtA in Dictyostelium discoideum (2008)
  • 著者名/発表者名: Yoshino, R
  • 雑誌名: Eukaryot Cell 6 ページ: 2419-2428
  • 査読あり
• [雑誌論文] Developmental biology of the social amoeba : History, current know-ledge and prospects (2008)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H
  • 雑誌名: Develop. Growth Differ 50
  • NAID: 10024400567
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary linkage between cytokinesis and chloroplast division by dynamin proteins (2008)
  • 著者名/発表者名: Miyagishima, H
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105 ページ: 15202-15207
  • 査読あり
• [学会発表] 非分化性の社会性アメーバ、Acytosteliumの遺伝子解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子、桑山秀一、鹿児島浩、新井理、大石加寿子、伊藤武彦、谷口丈晃、豊田敦、野口英樹、内今日子、黒木陽子、畑敬士、磯辺拓海、小原雄治、藤山秋佐夫
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] 細胞性粘菌Dictyostelium discoideumにおいて生活環周期を調節する新規rabGAPの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 桑山秀一、上田昌宏、漆原秀子
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] 非分化性の社会性アメーバ、Acytostelium の遺伝子解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] 細胞性粘菌 Dictyostelium discoideum において生活環周期を調節する新規rabGAPの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 桑山秀一
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] Gene repertoir of Acytostelium subglobosum, a group2 species without stalk-cell differentiation (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2009
  • 発表場所: Denver, USA
  • 年月日: 2009-08-25
• [学会発表] Gene repertoire of Acytostelium subglobosum, a group 2 species without stalk-cell differentiation (2009)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H., Kuwayama, H., Kagoshima, H., Shin-I, T., Itoh, T., Taniguchi, T., Uchi, K., Kuroki, Y., Kohara, Y., Fujiyama, A.
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2009
  • 発表場所: Denver, USA
  • 年月日: 2009-08-24
• [学会発表] Cell-differentiation related genes in a non-differentiating cellular slime mould revealed by its genome analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H., Uchi K., Kagoshima, H., Shin-I, T., Ohishi, K., Itoh, T, Taniguchi, T., Kuroki, Y., Kohara, Y., Fujiyama, A., Urushihara, H.
  • 学会等名: 第42回日本発生生物学会年会
  • 発表場所: 新潟トキメッセ
  • 年月日: 2009-05-30
• [学会発表] Analysis of a cell-differentiation related gene in a non-differentiating cellular slime mould (2009)
  • 著者名/発表者名: Tohyama T., Kuwayama, H., Urushihara, H.
  • 学会等名: 第42回日本発生生物学会年会
  • 発表場所: 新潟トキメッセ
  • 年月日: 2009-05-29
• [学会発表] Analysis of a cell-differentiation related gene in a non-differentiating cellular slime mould (2009)
  • 著者名/発表者名: Tohyama, T.
  • 学会等名: 第42回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 新潟県トキメッセ
  • 年月日: 2009-05-29
• [学会発表] Cell-differentiation related genes in a non-differentiating cellular slime mould revealed by its genome analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: 桑山秀一
  • 学会等名: 第42回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 新潟県トキメッセ
  • 年月日: 2009-05-29
• [学会発表] Acytostelium属細胞性粘菌のゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子、桑山秀一、鹿児島浩、新井理、大石加寿子、伊藤武彦、谷口丈晃、内今日子、黒木陽子、小原雄治、藤山秋佐夫
  • 学会等名: 第3回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス
  • 年月日: 2009-03-05
• [学会発表] Acytostelium属細胞性粘菌のゲノム・cDNA解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原 秀子
  • 学会等名: 第3回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 中央大学
  • 年月日: 2009-03-05
• [学会発表] Two resource sites from Japan. (2008)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 学会等名: InternationalDictyostelium Conference 2008 (Workshop)
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-20
• [学会発表] Acytostelium subglobosum genome analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-20
• [学会発表] Developmental genes in Acytostelium subglobosum, a group 2 species without cell- type differentiation (2008)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H., Kuwayama, H., Uchi, K., Kohara, Y., Kagoshima, H., Shin-I, T., Ohishi, K., Itoh, T., Taniguchi, T., Fujiyama, A.
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-18
• [学会発表] Developmental inhibitor secreted by Acytostelium subglobosum, a primitive social amoeba without cell differentiation (2008)
  • 著者名/発表者名: Uchi, K., Kuwayama, H., Yoshino, R., Urushihara, H.
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-18
• [学会発表] Functional analysis of rasX group genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Furuya, Y., Kunitani, M., Muramoto, T., Kuwayama, H., Urushihara, H.
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-18
• [学会発表] Differential gene expression between sexually mature and immature cells of Dictyostelium discoideum (2008)
  • 著者名/発表者名: Saeki, K., Satoh, T., Muramoto, T., Skeleton, J., Kay, RR., Kuwayama, H., Urushihara, H.
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-18
• [学会発表] Developmental inhibitor of Acytostelium subglobosum that forms fruiting bodies without cell differentiation (2008)
  • 著者名/発表者名: Uchi, K
  • 学会等名: International Dictyostelium Conference 2008
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
  • 年月日: 2008-09-16
• [学会発表] Comparative genomic analysis of the cellular slime moulds to reveal how cell differentiation was established during evolution (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H
  • 学会等名: 第41回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 徳島県郷土文化会館
  • 年月日: 2008-05-28
• [学会発表] Genome-wide search for cell-fusion related genes based on DNA mcroarray analysis in Dictyostelium (2008)
  • 著者名/発表者名: Saeki, K
  • 学会等名: 第41回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 徳島県郷土文化会館
  • 年月日: 2008-05-27
• [学会発表] Functional analysis of newly identified Dictyostelium Ras genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Kunitani, M
  • 学会等名: 第41回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 徳島県郷土文化会館
  • 年月日: 2008-05-27
• [学会発表] Developmental inhibitor secreted by Acytostelium subglobosum, aprimitive social amoeba without cell differentiation (2008)
  • 著者名/発表者名: Uchi, K
  • 学会等名: 第41回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 徳島県郷土文化会館
  • 年月日: 2008-05-27
• [図書] 「dictyBase-社会性アメーバ『細胞性粘菌』の総合データベース-」細胞工学別冊「バイオリソース&データベース活用術」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 出版者: 秀潤社
• [図書] 「研究をささえるモデル生物-実験室いきものガイド」第10章「単細胞と多細胞の架け橋-細胞性粘菌がわかる10. 1概論」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 「研究をささえるモデル生物-実験室いきものガイド」第10章「単細胞と多細胞の架け橋-細胞性粘菌がわかる」10. 2最新研究「細胞性粘菌の多細胞化のしくみにゲノム科学で迫る」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 研究をささえるモデル生物(第10章) (2009)
  • 著者名/発表者名: 漆原秀子
  • 総ページ数: 262
  • 出版者: 化学同人
• [備考] Acytostelium gene database (AcytoDB)・公開版
  • URL: http://acyto.sequence.info/
• [備考] ・開発版:(近日公開)
  • URL: http://gbas201002.www2.sequence.info/
• [備考] 研究室ホームページ
  • URL: http://nenkin.gene.tsukuba.ac.jp/
• [備考] Acytostelium gene database
  • URL: http://acyto.sequence.info/
• [備考]
  • URL: http://acyto.sequence.info/