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X線結晶構造解析による26Sプロテアソーム蛋白質分解酵素複合体の構造及び機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20051010
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

水島 恒裕  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
6,100千円 (直接経費: 6,100千円)
2009年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2008年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードプロテアソーム / 超分子複合体 / X線結晶構造解析 / 蛋白質分解 / 制御因子PA700 / シャペロン / 四次構造形成
研究概要

26Sプロテアソームは分子量250万、総サブユニット約70(約35種類)の巨大なプロテアーゼ複合体である。本酵素はタンパク質分解活性を持つ20Sプロテアソームの両端に、ユビキチン鎖の認識、タンパク質のアンフォールディング、ユビキチン鎖の除去などの役割を有する19S制御タンパク質複合体(Rpt1-6, Rpn1-3, 5-13, 15)が2分子会合した状態で存在し高度な機能を獲得している。超分子複合体を形成することにより獲得されたプロテアソームの高度な機能の理解を目指し、プロテアソーム及び関与するタンパク質群のX線結晶構造解析および機能解析を行った。
26Sプロテアソームの結晶化では酵母を用いた発現系及び結晶化条件の検討により微結晶の作製に成功した。また、プロテアソーム四次構造形成において、特異的に働く専用シャペロンタンパク質の存在が報告されており、機能解明を目的としてシャペロンタンパク質のX線結晶構造解析を行った。解析は19S制御タンパク質複合体シャペロンであるRpn14の結晶化を行い単独状態の立体構造を決定した。その結果、Rpn14はβプロペラ構造を形成していた。また、決定した立体構造をもとにシャペロンタンパク質によるRptタンパク質認識機構の解析を行い、Rpn14の酸性表面とRpt6の塩基性表面の相補的な電荷分布が複合体の形成に重要であることを、変異体を作製した解析により明らかにした。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray characxterization of the SKp1-Fbg3 complex.2010

    • 著者名/発表者名
      Kumanomidou T, Nakagawa, T, Mizushima T, Suzuki A< Tokunaga F, Iwai K, Yoshida Y, Tanaka K, Yamane T
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F 66

      ページ: 95-98

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Stucture of Yeast Rpn14, a Chaperone of the 19S Regulatory Particle of the Proteasome.2010

    • 著者名/発表者名
      Kim S, Saeki Y, Fukunaga K, Suzuki A< Takagi K, Yamane T, Tanaka K, Mizushima T, Kato K
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the deubiquitinating enzyme UCH37 (human UCH-L5) catalytic domain.2009

    • 著者名/発表者名
      Nishio K, Kim SW, Kawai K, Mizushima T, Yamane T, Hamazaki J, Murata S, Tanaka K, Morimoto
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 390

      ページ: 855-860

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of D-amino-acid amidase complexed with L-phenylalanine with L-phenylalanine amide : insight into D-stereospecificity of D-amino-acid amidase from Ochrobacterum anthropi SV32008

    • 著者名/発表者名
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • 雑誌名

      Acta Cryst : D 64

      ページ: 331-334

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy2008

    • 著者名/発表者名
      Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, Mizushima, T, Ezaki, J, Ueno T, Kominami F Yamane T Tanaka K. Komatsu M
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem 283

      ページ: 22847-22857

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The novel structure of a pyridoxal 5'-phosphate-dependent fold-type Iracemase, alpha-amino-epsilon-caprolactam racemase from Achromobacter obae2008

    • 著者名/発表者名
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Kawano T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 941-950

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 出芽酵母20Sプロテアソーム形成に関わるシャペロン複合体Dmp1/Dmp2の立体構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      八代田英樹、水島恒裕
    • 雑誌名

      細胞工学 27

      ページ: 474-475

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] コビキチンリガーゼによる糖タンパク質品質管理における糖鎖認識機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、熊埜御堂太一、鈴木淳巨、山根隆、加藤晃
    • 学会等名
      糖鎖科学名古屋拠点 第7回「若手の力」フォーラムおよび拠点共同研究報告会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-09-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 鎖認識ユビキチンリガーゼFbsファミリーの構造と反応機構2009

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕
    • 学会等名
      第4回プロテオミクス・構造生物学講演会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2009-01-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] プロテアソーム制御因子複合体形成シャペロンのX線結晶構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、金相佑、佐伯泰、田中啓二、加藤晃一
    • 学会等名
      特定領域研究 超分子構造 第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] STRUCTURE BASIS FOR RECOGNITION OF GLYCOSYLAT ED SUBSTRATES BY SCFFbsi UBIQUITIN LIGASE2008

    • 著者名/発表者名
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Yamaguchi, T. Yamane, K. Tanaka, K. Kato
    • 学会等名
      ZOMES V
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2008-11-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] X-ray Structure of the Skpl-Fbsi glycoprotein complex2008

    • 著者名/発表者名
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Hasegawa, A. Suzuki, T. Yamane, K. Tanaka
    • 学会等名
      FEBS Congress & IUBMB Conference
    • 発表場所
      Athens, Greece
    • 年月日
      2008-06-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] プロテアソームシャペロンDmp1-Dmp2複合体による20Sプロテアソーム分子集合機構2008

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、八代田英樹、田中啓二
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-06-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 酵母20Sプロテアソーム構造形成に関与するシャペロンDmp1-Dmp2の役割2008

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、高木賢治、八代田英樹、栗本英治、田中啓二、加藤晃一
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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