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イオンチャネル詳細構造解明に向けた単粒子解析技術の開発と複合体の構造解明

研究課題

研究課題/領域番号 20051028
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人産業技術総合研究所

研究代表者

三尾 和弘  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディシナル情報研究センター, 主任研究員 (40470041)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
7,000千円 (直接経費: 7,000千円)
2009年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2008年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
キーワードタンパク質 / 3次元構造 / 電子顕微鏡 / イオンチャネル / 画像情報処理 / 単粒子構造解析 / ナノテクノロジー / クライオ電顕 / 単粒子解析
研究概要

イオンチャネルやトランスポーター等の膜タンパク質の構造情報を得ることは、神経伝達や筋収縮、心拍のペースメーキング等に関する機構を理解し、関連疾病に対する画期的新薬を開発する上で不可欠である。我々は難結晶性タンパク質の構造解明に向けて、精製タンパク質の電子顕微鏡画像から情報学的に3次元構造を再構築する単粒子解析法の技術開発と構造解析を推進してきた。
単粒子解析法を用いて、Ca^<2+>放出活性化Ca^<2+>(CRAC)チャネルの本体として近年同定されたOrai1陽イオンチャネルの構造解析を行った。動物細胞発現系を用いてOrai1タンパク質を発現・精製し、生化学検討から生理機能単位が四量体であることを突き止めた。電顕画像を元に三次元構造を21Å分解能で再構成し、高さ150Å、幅95Åの水滴形構造を持ち、小胞体膜上でCa^<2+>枯渇を感受するSTIM1と相互作用可能な細長い細胞質ドメインが示された。更に、細胞内で酸化ストレスセンサーとして働くKeap-1の構造解析を行い、サクランボ形の2つの房にβ・プロペラの数Å径の穴に相当する小さな貫通部分が見出された。周囲に存在するSH基で酸化ストレスを感知する機構が推察された。
またタンパク質構造解析にもとづく薬物の作用機序解明も重要である。我々は喘息治療薬として開発が進められていたピラゾール化合物をリードにTRPC3チャネルを特異的に抑制する誘導体を見出し、その作用機序を電子顕微鏡を用いて検討した。光架橋と金粒子ラベルを組み合わせてTRPC3に結合したピラゾール誘導体を観察することで、単分子レベルでの薬物結合の可視化に成功し、細胞膜直下部を標的としていることを証明した。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] Single particle reconstruction of membrane proteins : A tool for understanding the 3D structure of disease-related macromolecules.2010

    • 著者名/発表者名
      Mio, K.
    • 雑誌名

      Prog.Biophys.Mol.Biol. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Keapl is a forked-stem dimer structure with two large spheres enclosing the intervening, double glycine repeat, and C-terminal domains.2010

    • 著者名/発表者名
      Ogura, T.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 107

      ページ: 2842-2847

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Atmospheric scanning electron microscope observes cells and tissues in open medium through silicon nitride film.2010

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, H.
    • 雑誌名

      J Struct.Biol. 169

      ページ: 438-449

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Baseplate Wedges of Bacteriophage T4 Spontaneously Assembleinto Hubless Baseplate-like Structure In Vitro.2010

    • 著者名/発表者名
      Yap, ML.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 395

      ページ: 349-360

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective and direct inhibition of TRPC3 channels underlies biological activities of a pyrazole compound.2009

    • 著者名/発表者名
      Kiyonaka, S.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106

      ページ: 5400-5405

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tetrameric Orail is a teardrop-shaped molecule with a long, tapered cytoplasmic domain.2009

    • 著者名/発表者名
      Maruyama, Y.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 284

      ページ: 13676-13685

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 結晶を用いない電子顕微鏡画像からの3次元構造決定:単粒子解析法2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 雑誌名

      化学と生物 47

      ページ: 711-717

    • NAID

      10026436693

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] 単粒子解析法によるセンサーチャネルタンパク質の解析2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 51

      ページ: 71-72

    • NAID

      10024820382

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] 単粒子解析法による膜タンパク質の電子顕微鏡構造解析-酸化ストレス感受や聴覚増幅などに働くセンサー分子を例として-2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 雑誌名

      生物物理 49

      ページ: 143-146

    • NAID

      10025975685

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Reconstruction of the P2X2 receptor revealed a vase-shaped structure with lateral tunnels above the membrane.2009

    • 著者名/発表者名
      Mio. K.
    • 雑誌名

      Structure 17

      ページ: 266-275

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RECK forms cowbell-shaped dimers and inhibits MMP -catalyzed cleavage of fibronectin.2009

    • 著者名/発表者名
      Omura. A
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 284

      ページ: 3461-3469

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensional reconstruction of human CFTR chloride channel revealed an ellipsoidal structure with orifices beneath the putative transmembrane domain.2008

    • 著者名/発表者名
      Mio. K.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 30300-30310

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of six-transmembrane cation channels revealed by sinerle-Tiarticle analvsis from electron mierosootric images.2008

    • 著者名/発表者名
      Mio. K.
    • 雑誌名

      J. Synchrotron Radiat. 15

      ページ: 211-214

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ORF334 in Vibrio phage KVP40 plays the role of gp27 in T4 phage to form a hetero-hexameric complex.2008

    • 著者名/発表者名
      Nemoto. M.
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. 190

      ページ: 3606-3612

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 電顕画像からの全自動3次元再構成法の開発とTRPチャンネルの構造2008

    • 著者名/発表者名
      小椋俊彦
    • 雑誌名

      顕微鏡 43

      ページ: 40-45

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] CFTRチャネルの単粒子構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Three-dimensional structures of ion channels revealed by electron microscopy : sodium, TRP, CFTR and Orail channels2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤主税
    • 学会等名
      Neuroscience 2009
    • 発表場所
      シカゴ
    • 年月日
      2009-10-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Single particle analysis of ion channels and the sensor molecules2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 学会等名
      12th International Symposium on Molecular Medicine
    • 発表場所
      ギリシャ,ルートラキ
    • 年月日
      2009-10-15
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Electron microscopy as a tool for determining protein 3D structure related to channel diseases and metastasis2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤主税
    • 学会等名
      12th International Symposium on Molecular Medicine
    • 発表場所
      ギリシャ,ルートラキ
    • 年月日
      2009-10-15
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Reconstruction of the P2X2 receptor revealed a vase-shaped structure with lateral tunnels above the membrane2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 学会等名
      39th International Union of Physiological Sciences (IUPS)
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2009-07-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Orailチャネル三次元構造の解明2009

    • 著者名/発表者名
      丸山雄介
    • 学会等名
      第5回TRPチャネル研究会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2009-06-05
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] センサータンパク質TRPチャネル群の単粒子構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      三尾和弘
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第65回学術講演会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2009-05-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 雷子顕微鏡による膜蛋白質やその複合体等の構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤主税
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第65回学術講演会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2009-05-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Three dimensional structures of ion channels revealed by electronmicroscopy: Na channel, IPS receptor, TRP channels and eramma-secretase2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤 主税
    • 学会等名
      IUPS2009 International Conference of Physiological Sciences
    • 発表場所
      釜山
    • 年月日
      2009-01-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] センサー膜タンパク質の構造解明12009

    • 著者名/発表者名
      三尾 和弘
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会 生体構造解析分科会
    • 発表場所
      別府
    • 年月日
      2009-01-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] センサー膜タンパク質の構造解明22009

    • 著者名/発表者名
      佐藤主税
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会 生体構造解析分科会
    • 発表場所
      別府
    • 年月日
      2009-01-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 電圧感受型モータータンパク質プレスチンの電子顕微鏡を用いた構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      三尾 和弘
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] モータータンパク質プレスチンの電子顕微鏡構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      三尾 和弘
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Ion channel structures by single particle analysis using EM: Sodium and TRP channels, IPS receptor2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤 主税
    • 学会等名
      IUCr2008
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2008-08-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] TRPM2 channelの単粒子解析による構造解明2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤 主税
    • 学会等名
      第4回TRPチャネル研究会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2008-06-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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