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構造生物学的アプローチによる小胞体関連分解装置の分子認識と作動機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20059030
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(共通施設)

研究代表者

加藤 晃一  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (20211849)

研究分担者 水島 恒裕  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)
栗本 英治  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 講師 (90234575)
研究期間 (年度) 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2008年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
キーワードNMR / 結晶構造解析 / ERAD / 糖鎖 / 細胞内レクチン / ユビキチン
研究概要

小胞体関連分解(ERAD)は、小胞体内で不要となったタンパク質を選別・除去する機構である。このシステムの中核をなすのは、小胞体膜上に集合した多数のタンパク質から構成される精緻な分子装置(ERADマシーナリー)である。本研究では、ERADマシーナリーを構成する要素タンパク質の間の相互作用のネットワークならびに標的分子との動的な相互作用を明らかにすることを通じて、本分子装置の動作メカニズムを解明することを目的とした。
本年度の主な成果は、糖鎖およびポリユビキチン鎖ライブラリーの構築・拡張と、ERADマシーナリーの要素タンパク質である細胞内レクチンの分子認識を明らかにしたことである。
(1)酵母の各種変異体から種々の高マンノース型糖鎖を精製し高マンノース型糖鎖ライブラリーの構築を行った。得られたライブラリーを利用して、レクチン様タンパク質OS-9との相互作用をフロンタルアフィニティークロマトグラフィーにより解析した。その結果、OS-9は3本鎖糖鎖のD3アームと呼ばれる枝を特異的に認識することが明らかとなった。このことと我々のこれまでの研究成果と考え合わせることにより、分子シャペロン、積荷受容体、分解レクチンなどとして機能している一連の細胞内レクチンが、高マンノース型糖鎖の異なる部位を特異的に認識しており、小胞体からゴルジ体にいたる過程で現れる糖鎖のプロセシング中間体を捕捉することを通じて担体タンパク質の運命を決定していることが明らかとなった。
(2)酵素的および化学的反応を駆使して様々な鎖長のポリユビキチン鎖を構築し、ライブラリー化することに成功した。さらに、特定の位置のサブユニットを同位体標識したポリユビキチン鎖にも成功した。これによりX線結晶解析およびNMRを用いてdi-ubiqutin、tri-ubiquitinの構造解析を動的な部分を含めて行うための基盤が整った。

報告書

(1件)
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (9件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] 糖鎖認識を介した糖タンパク質の細胞内運命の決定機構2009

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、加藤晃一
    • 雑誌名

      生物物理 (印刷中)

    • NAID

      10025975440

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Defining the glycan destruction signal for endoplasmic reticulum-associated degradation2008

    • 著者名/発表者名
      Quan, E. M., Kamiya, Y., Kamiya, D., Denic, V., Weibezahn, J., Kato, K., and Weissman, J. S.
    • 雑誌名

      Mol. Cell 32

      ページ: 870-877

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 構造糖鎖生物学と糖鎖創薬 : オーバービュー2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53

      ページ: 1661-1661

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 細胞内レクチンによる糖蛋白質の輸送と品質管理の構造基盤2008

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子、加藤晃一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53

      ページ: 1662-1669

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A ^<13>C-detection NMR approach for large glycoproteins

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, Y., Walchli, M., Nagano, M., and Kato, K.
    • 雑誌名

      Carbohyd. Res. (印刷中)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 翻訳後に多様化するタンパク質へのNMRアプローチ2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      タンパク質NMRの最前線立命館大学理工学研究所シンポジウム
    • 発表場所
      草津
    • 年月日
      2008-11-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structure basis for recognition of glycosylated substrates by SCF^<Fbs1> ubiquitin ligase2008

    • 著者名/発表者名
      Kato, K.
    • 学会等名
      ZOMES V
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2008-11-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 構造グライコミクスの体系的アプローチ-糖鎖プロファイリングから抗体医薬の立体構造解析まで-2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第67回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-10-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Medical applications of structural glycobiology : From glycosylation profiling to biomolecular engineering2008

    • 著者名/発表者名
      Kato, K.
    • 学会等名
      BioJapan 2008-World Business Forum-
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2008-10-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] NMRと糖鎖ライブラリーを利用した構造グライコミクス2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      日本化学会第2回関東支部大会
    • 発表場所
      群馬
    • 年月日
      2008-09-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural views of glycoprotein-fate determination in cells2008

    • 著者名/発表者名
      Kato, K.
    • 学会等名
      23^<rd> International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Molecular and structural basis of the mechanisms underlying the glycoprotein-fate determination by the intracellular lectins2008

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y, Kamiya, D., Nishio, M., and Kato, K.
    • 学会等名
      INTERLEC 23
    • 発表場所
      Edinburg, Scotland
    • 年月日
      2008-07-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質の細胞内運命決定の構造的基盤2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一、神谷由紀子
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      船堀
    • 年月日
      2008-06-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 超高磁場NMRを利用したタンパク質・複合糖質の構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一、笹川拡明、神谷由紀子、中野路子、杉原隆広、内海真穂、山口芳樹
    • 学会等名
      高分子学会08-1NMR研究会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-05-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] Glycobiology Research Trends2009

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, Y., Kamiya, D. Urade, R., Suzuki. T., and Kato, K.
    • 出版者
      NOVA Publishers (New York)(印刷中)
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] Experimental Glycoscience : Glycochemistry2008

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, Y. and Kato, K.
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      Springer (The Netherlands)
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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