天然変性タンパク質の動的構造と機能制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 20227009
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 西村 善文 横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 教授 (70107390)
• 研究分担者: 明石 知子 横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (10280728) ; 長土居 有隆 横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 助教 (50336591)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 124,800千円 (直接経費: 96,000千円、間接経費: 28,800千円); 2012年度: 31,200千円 (直接経費: 24,000千円、間接経費: 7,200千円); 2011年度: 31,200千円 (直接経費: 24,000千円、間接経費: 7,200千円); 2010年度: 31,200千円 (直接経費: 24,000千円、間接経費: 7,200千円); 2009年度: 31,200千円 (直接経費: 24,000千円、間接経費: 7,200千円)
• キーワード: NMR / 転写因子 / クロマチン / 動的構造 / 天然変性状態

研究概要

ヘテロクロマチン形成因子のChp1とSwi6のクロモドメインの溶液中の構造をNMRで解析した。Chp1のクロモドメインのN末の天然変性領域はヒストンH3の9番目のリシンのメチル化体と複合体を形成してヘリックスを誘導し、その部位がセントロメアのncRNAと相互作用をすることを見出した。 またヒストンH2A/H2Bへテロ2量体を含むヒストン多量体について天然変性状態のヒストンテイル構造についてMSとMDで解析し、更にヒストンH2A/H2Bへテロ2量体の単独の溶液構造とヒストンシャペロンNAP1のC末の天然変性状態の酸性ドメインとの相互作用構造をNMRで解析した。

評価記号

検証結果 (区分)

B

研究成果

• [雑誌論文] Isoform-independent and -dependent phosphorylation of microtubule-associated protein tau in mouse brain during postnatal development. (2017)
  • 著者名/発表者名: K. Yamano, M. Kuroyanagi-Hasegawa, M. Esaki, M. Yokota, and T. Endo
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 283 ページ: 10084-10096
  • DOI: 10.1074/jbc
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The BRCA1/BARD1-interacting protein OLA1 functions in centrosome (2014)
  • 著者名/発表者名: Mayumi Ishida, Hideaki Shimojo, Aki Hayashi, Rika Kawaguchi, Yasuko Ohtani, Koichi Uegaki, Yoshifumi Nishimura, Jun-ichi Nakayama.
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 47 ページ: 101-14
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] Virtual states introduced for overcoming entropic barriers in conformational space (2013)
  • 著者名/発表者名: Saikusa K, Fuchigami S, Takahashi K, Asano Y, Nagadoi A, Tachiwana H, Kurumizaka H, Ikeguchi M, Nishimura Y, Akashi S
  • 雑誌名: Biophys 巻: 85 ページ: 139-144
  • DOI: 10.1021/ac400395j
  • NAID: 130002061588
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5#8211;Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering (2013)
  • 著者名/発表者名: Saikusa K, Kuwabara N, Kokabu Y, Inoue Y, Sato M, Iwasaki H, Shimizu T, Ikeguchi M, Akashi S
  • 雑誌名: The Analyst 巻: 138 ページ: 1141-1149
  • DOI: 10.1039/c2an35878f
  • NAID: 120006557136
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of penicillin-binding protein 3 (PBP3) from methicillin-resistant Staphylococcus aureus in the apo and cefotaxime-bound forms. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida H, Kawai F, Obayashi E, Akashi S, Roper DI, Tame JR, Park SY
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 423 ページ: 351-364
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2012.07.012
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsic Nucleic Acid-Binding Activity of Chp1 Chromodomain Is Required for Heterochromatic Gene Silencing. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishida M, Shimojo H, Hayashi A, Kawaguchi R, Ohtani Y, Uegaki K, Nishimura Y, Nakayama J
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 47 ページ: 228241-228241
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.05.017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Function of homo- and hetero-oligomers of human nucleoplasmin/nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2, and NPM3 during sperm chromatin remodeling. (2012)
  • 著者名/発表者名: Okuwaki M, Sumi A, Hisaoka M, Saotome-Nakamura A, Akashi S, Nishimura Y, Nagata K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 ページ: 4861-4878
  • DOI: 10.1093/nar/gks162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Impact of limited oxidation on protein ion mobility and structure of importance to footprinting by radical probe mass spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Downard KM, Maleknia SD, Akashi S
  • 雑誌名: Rapid Commun Mass Spectrom 巻: 26 ページ: 226-230
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biological characteristics of two lysines on human serum albumin in the high-affinity binding of 4Z,15Z-bilirubin-IXα revealed by phage display (2012)
  • 著者名/発表者名: Downard KM, Kokabu Y, Ikeguchi M, Akashi S
  • 雑誌名: FEBS.J 巻: 278 ページ: 2387-2394
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Free-energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-atom Computations (2011)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi N, Tachiwana H, Saito K, Osakabe A, Sato M, Yamada M, Akashi S, Nishimura Y, Kagawa W, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 巻: 67 ページ: 10448-10458
  • DOI: 10.1107/s0907444910051711
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Free-Energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-Atom Computations. (2011)
  • 著者名/発表者名: Higo J, Nishimura Y, Nakamura H
  • 雑誌名: Journal of American Chemical Society 巻: 133 ページ: 10448-10458
  • DOI: 10.1021/ja110338e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fission yeast Swi5-Sfr1 protein complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated dogleg-shaped structure. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
  • 雑誌名: The Journal of biological chemistry 巻: 286 ページ: 43569-43576
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.303339
  • 査読あり
• [雑誌論文] バンド生物学とインパクトファクター (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 雑誌名: 生化学 巻: 83 ページ: 809-809
  • NAID: 10029737637
  • 査読あり
• [雑誌論文] 「バンド生物学」とインパクトファクター (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 雑誌名: 生化学 巻: 83 ページ: 809-809
  • NAID: 10029737637
• [雑誌論文] Structural and bioche mical analyses of thehuman PAD4 var iant encoded by a functional haplot ype gene. (2011)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi, N., Tachiwana, H., Saito, K., Osakabe, A., Sato, M., Yamada, M., Akashi, S., Nishimura, Y., Kagawa, W., Kurumizaka, H.
  • 雑誌名: Acta Crystal.D 67 ページ: 112-118
• [雑誌論文] Deimination stabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed by electrospray ionization mass spectrometry (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimoyama S, Nagadoi A, Tachiwana H, Yamada M, Sato M, Kurumizaka H, Nishimura Y, Akashi S.
  • 雑誌名: J. Mass Spectrom 巻: 45 ページ: 900-908
  • DOI: 10.1002/jms.1778
  • 査読あり
• [雑誌論文] Side-chain conformational changes of transcription factor PhoB upon DNA binding: a population-shift mechanism (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamane T, Okamura H, Nishimura Y,Kidera A, Ikeguchi M
  • 雑誌名: J Am Chem Soc 巻: 132 ページ: 12653-12659
  • DOI: 10.1021/ja103218x
  • 査読あり
• [雑誌論文] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications (2010)
  • 著者名/発表者名: Oda T, Hashimoto H, Kuwabara N, Akashi S, Hayashi K, Kojima C, Wong HL, Kawasaki T, Shimamoto K, Sato M, Shimizu T
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 285 ページ: 1435-1445
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guidelines for reporting the use of capillary electrophoresis in proteomics. (2010)
  • 著者名/発表者名: Domann PJ, Akashi S, Barbas C, Huang L, Lau W, Legido-Quigley C, McClean S, Neususs C, Perrett D, Quaglia M, Rapp E, Smallshaw L, Smith NW, Smyth WF, Taylor CF
  • 雑誌名: Nat. Biotechnol. 巻: 28 ページ: 654-655
  • DOI: 10.1038/nbt0710-654b
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deiminatio nstabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed byelectrospray ionizati on mass spectrometry. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimoyama, S.Nagadoi, A., Tachiwana, H., Yamada, M., Sato, M., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., Akashi, S.
  • 雑誌名: J.Mass.Spectrom 45 ページ: 900-908
• [雑誌論文] Side-chain conformational changes of transcription factor PhoB upon DNA binding : a population-shift mechanism (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamane T, Okamura H, Nishimura Y, Kidera A, Ikeguchi M
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 132 ページ: 12653-12659
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deimination stabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed by electrospray ionization mass spectrometry (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimoyama S., Nagadoi A., Tachiwana H., Yamada M., Sato M., Kurumizaka H., Akashi S., Nishimura Y.
  • 雑誌名: Journal of Mass Spectrometry 巻: 22 ページ: 900-908
  • 査読あり
• [雑誌論文] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications (2010)
  • 著者名/発表者名: Oda, T., Hashimoto, H., Kuwabara, N., Akashi, S., Hayashi, K., Kojima, C., Wong, H.L., Kawasaki, T., Shimamoto, K., Sato, M., Shimizu, T.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 285 ページ: 1435-1445
  • 査読あり
• [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment (2009)
  • 著者名/発表者名: Hara K, Shimizu T, Unzai S, Akashi S, Sato M, Hashimoto H
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 巻: 65 ページ: 1302-1305
  • DOI: 10.1107/s1744309109046181
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Self-Assembled Protein Nanotube with High Aspect Ratio (2009)
  • 著者名/発表者名: Miranda FF, Iwasaki K, Akashi S, Sumitomo K, Kobayashi M, Yamashita I, Tame JR, Heddle JG
  • 雑誌名: Small 巻: 5 ページ: 2077-2084
  • DOI: 10.1002/smll.200900667
  • 査読あり
• [雑誌論文] The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex (2009)
  • 著者名/発表者名: Watanabe M, Heddle JG, Kikuchi K, Unzai S, Akashi S, Park SY, Tame JR
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 106 ページ: 2176-2181
  • DOI: 10.1073/pnas.0801032106
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA and protein complexes of TRAP characterized by mass spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Akashi S, Watanabe M, Heddle JG, Unzai S, Park SY, Tame JR
  • 雑誌名: Anal Chem 巻: 81 ページ: 2218-2226
  • DOI: 10.1021/ac802354j
  • 査読あり
• [雑誌論文] 巨大タンパク質の質量分析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 雑誌名: ぶんせき ページ: 422-427
• [雑誌論文] A Self-Assembled Protein Nanotube with High Aspect Ratio (2009)
  • 著者名/発表者名: Miranda, F.F., Iwasaki, K., Akashi.S., Sumitomo, K., Kobayashi, M., Yamashita, I., Tame, J.R., Heddle, J.G.
  • 雑誌名: Small 5 ページ: 2077-2084
  • 査読あり
• [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment (2009)
  • 著者名/発表者名: Hara, K., Shimizu, T., Unzai, S., Akashi, S., Sato, M., Hashimoto, H.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun F65 ページ: 1302-1305
  • 査読あり
• [雑誌論文] 巨大タンパク質の質量分析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 雑誌名: ぶんせき 55 ページ: 422-427
• [雑誌論文] Crystal Structures of the Clock Protein EA4 from the Silkworm Bombyx mori (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiraki T, Shibayama N, Akashi S, Park SY
  • 雑誌名: J Mol Biol 巻: 377 ページ: 630-635
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2008.01.020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Water-mediated interaction between DNA and PhoB DNA-binding/transactivation domain: NMR-restrained molecular dynamics in explicit water environment (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamane T, Okamura H, Ikeguchi M,Nishimura Y, Kidera A
  • 雑誌名: Proteins 巻: 71 ページ: 1970-1983
  • DOI: 10.1002/prot.21874
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural insight into the FIIE-TFIIH interaction: TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda M, Tanaka A, Satoh M, Mizuta S, Takazawa M, Ohkuma Y, Nishimura Y.
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 27 ページ: 1161-1171
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution (2008)
  • 著者名/発表者名: Akashi S, Nagakura S, Yamamoto S, Okuda M, Ohkuma Y, Nishimura Y.
  • 雑誌名: Protein Sci 巻: 17 ページ: 389-400
  • DOI: 10.1110/ps.073258108
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Mass Spectrometric Approach to the Study of DNA-Bonding Proteins: Interaction of Human TRF2 with Telomeric DNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Sperry JB, Shi X, Rempel DL, Nishimura Y, Akashi S, Gross ML
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 47 ページ: 1797-1807
  • DOI: 10.1021/bi702037p
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel Structural and Functional Mode of a Knot Essential for RNA Binding Activity of the Esa1 Presumed Chromodomain (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimojo H, Sano N, Moriwaki Y, Okuda M, Horikoshi M, Nishimura Y
  • 雑誌名: J Mol Biol 巻: 378 ページ: 987-1001
  • 査読あり
• [雑誌論文] レーザースプレー質量分析が可能にした生体高分子複合体の結合親和性の定量的な解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 明石知子、史向国、高見澤淳、 西村善文、平岡賢三
  • 雑誌名: J. MassSpectrom. Soc. Jpn 巻: 22 ページ: 155-161
  • NAID: 10021086963
• [雑誌論文] 転写・翻訳 真核生物の転写系を中心に (2008)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 雑誌名: 蛋白質・核酸・酵素 巻: 5 ページ: 620-623
• [雑誌論文] 基本転写因子TFIIE の構造と TFIIH との相互作用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 西村善文、奥田昌彦
  • 雑誌名: 生化学 巻: 80 ページ: 501-510
  • NAID: 10021192114
• [雑誌論文] Novel Structural and Functional Mode of a Knot Essential for RNA Binding Activity of the Esa1 Presumed Chromodomain. (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 378 ページ: 987-1001
• [雑誌論文] Structural insight into the TFIIE/TFIIH interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH. (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 1161-1171
• [雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution. (2008)
  • 著者名/発表者名: Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: Protein Sci. 17 ページ: 389-400
• [学会発表] Characterization of IDPs by Mass Spectrometry and MD simulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] 質量分析による構造生物学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 中性子連携研究会（第4 回中性子小角散乱解析法研究会）
  • 発表場所: 京都大学東京オフィス(東京都)
  • 招待講演
• [学会発表] Behavior of Intrinsically Disordered Regions within a Protein Complex of Swi5-Sfr1 Characterized by Ion Mobility Mass Spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Naoyuki Kuwabara, Yuichi Kokabu, Mamoru Sato, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi, Toshiyuki Shimizu, and Satoko Akashi
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics.
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
• [学会発表] Application of Homology Modelling, Ion Mobility and Protein Footprinting in Unison to Characterize Protein Bimolecular Complexes (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Satoko Akashi, Kevin Downard
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
• [学会発表] Impact of Protein Oxidation on their Ion Mobility for Protein Footprinting Applications (2012)
  • 著者名/発表者名: Simin Maleknia, Satoko Akashi, Kevin Downard
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
• [学会発表] What happens on the histone multimers in the gas phase? (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Sotaro Fuchigami, Kyohei Takahashi, Yuuki Asano, Aritaka Nagadoi, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi.
  • 学会等名: 19th International Mass Spectrometry Conference.
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] Behavior of intrinsically disordered regions within a protein complex ofSwi5-Sfr1 characterized by IM-MS and SAXS (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Naoyuki Kuwabara, Yuichi Kokabu, Mamoru Sato, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi, Toshiyuki Shimizu, Satoko Akashi
  • 学会等名: 19th International Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] Structure of a Beta-Crystallin Heterodimer by Ion Mobility and Radical Probe Mass Spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Kevin Downard, Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Satoko Akashi
  • 学会等名: 19th International Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] Characterization of histone multimers in the gas phase by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Sotaro Fuchigami, Kyohei Takahashi, Yuuki Asano, Aritaka Nagadoi, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi.
  • 学会等名: 第50回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学(愛知県)
• [学会発表] Dynamics of nuclear proteins. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura.
  • 学会等名: Yokohama NMR The 3rd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1αセリンリン酸化クロモドメインのNMR構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口あゆみ、下條秀朗、濱田京子、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] ヘテロクロマチン構造形成因子Swi6クロモドメインとヒストンH3K9me3ペプチドの複合体の構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村紗里、下條秀朗、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] テロメアDNAとhTRF2塩基性ドメインの相互作用解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓介、下條秀朗、岩沢佳尚、村井元気、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] Chp1クロモドメインの立体構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗、石田真由美、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] ヒストンシャペロン hNap1のＣ末酸性ドメインとヒストンH2A/H2Bの相互作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、奥脇暢、永田恭介、戸所泰人、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] 固体NMRを用いたヌクレオソームおけるヒストンH2Aの構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 戸所泰人、森脇義仁、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
• [学会発表] ラマン分光法とNMRによる構造生物学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 平成24年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンシャペロン hNap1のＣ末酸性ドメインとヒストンH2A/H2Bの相互作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、奥脇暢、永田恭介、戸所泰人、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] 固体NMRを用いたクロマチン構造におけるヒストンの構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 戸所泰人、森脇義仁、長土居有隆、立和名博昭、須賀則之、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] ヘテロクロマチン形成因子HP1αセリンリン酸化クロモドメインのNMR構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口あゆみ、下條秀朗、濱田京子、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] 出芽酵母ミニ染色体においてヒトテロメア配列およびテロメア結合因子がヌクレオソーム形成に及ぼす影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 市川雄一、諸橋伸行、半田圭汰、西村善文、胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] 出芽酵母のUme6のactivatorとrepressorとしての機能に関する天然変性領域の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、大島えりか、大島綾子、牧野紋子、市川雄一、胡桃坂仁志、福地佐斗志、西村善文、清水光弘
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] ヘテロクロマチン構造形成因子Swi6クロモドメインとヒストンH3K9me3ペプチドの複合体の構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村紗里、下條秀朗、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] 質量分析を用いたヌクレオソームのアセチル化に伴う構造変化の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 畔上奈々子、七種和美、神蔵祐典、戸所泰人、立和名博昭、長土居有隆、胡桃坂仁、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
• [学会発表] NMRによるエピゲノム関連天然変性タンパク質の構造解析と結合化合物スクリーニング (2012)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会一般シンポジウム「創薬を目指す核磁気共鳴(NME):現況と展望」"NMR aim at Drug Discovery : Present and Future"
  • 発表場所: 北海道大学札幌キャンパス(北海道)
• [学会発表] Structural analysis of Chip1 chromodomain required for heterochromatin assembly (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: 韓国・Structural Research Center for Innovative Drug Development
  • 年月日: 2012-07-06
• [学会発表] Eaf3クロモドメインのヒストンH3K36me3に対するpH依存的な結合能の調節Mechanism of binding of Eaf3 Chromo domain to trimethylated lysine 36 of histone H3 in a pH-dependent way (2011)
  • 著者名/発表者名: 細野枝里菜、奥田昌彦、野口修平、西村善文、堀越正美
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] The effect of human telomeric repeat sequences on nucleosome positioning in yeast cells (2011)
  • 著者名/発表者名: 市川雄一、諸橋伸行、西村善文、胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第34向日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] 出芽酵母Ume6による転写抑制に関与する天然変性領域の機能解析Functional analysis of intrinsically disordered regions for transcriptional repression by Ume6, an activator/repressor protein of early meiotic genes in S.cerevisiae (2011)
  • 著者名/発表者名: 大島えりか、諸橋伸行、大島綾子、福地佐斗志、西村善文、Aaron P.Mitchell、清水光弘
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] Functional analysis of intrinsically disordered regions for transcriptional activation by Ume6, an activator/repressor protein of early meiotic genes in S.cerevisiae (2011)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、大島綾子、大島えりか、松本あずさ、福地佐斗志、西村善文、Aaron R.Mitchell、清水光弘
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] Eaf3 chromodomain is a novel histone methyllysine binder depending on pH (2011)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、細野枝里菜、野口修平、堀越正美、西村善文
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies on Chromatin-related Proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] Solid-state NMR analysis of H+-ATP synthase subunit c-ring from Thermophilic Bacillus (2011)
  • 著者名/発表者名: Su-Jin Kang, Suyeon Bak, Yasuto Todokoro, Ikuko Yumen, Iku Iwasaki, Toshiharu Suzuki, Toshimichi Fujiwara, Masasuke Yoshida, Hdeo Akutsu
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] A telomeric repeat-binding factor TRF2 binds to a parallel G quadruplex structure via its Myb domain (2011)
  • 著者名/発表者名: Yuuka Hirao, Shin Morita, Kazuki Oinishi, Hideaki Shimojo, Shingo Hanaoka, Hideyuki Okamura, Tadateru Nishikawa, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR structure of the HP1-α chromodomain phosphorylated at N-terminal serine residues (2011)
  • 著者名/発表者名: Ayumi Kawaguchi, Hideaki Shimojo, Kyoko Hamada, Jun-Ichi Nakayama, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] The interaction analysis of CENP-S/X and CENP-T/W by NMR (2011)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Takahashi, Aritaka Nagadoi, Tatsuya Nishino, Tatsuo Fukagawa, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR study on the basic domain of telomeric protein TRF2 bound to Holliday junction (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshinao Iwasawa, Hideaki Shimojo, Motoki Murai, Ryo Kanno, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies on the histone H2A/H2B hetero dimer and histone chaper ones, NAP1 and NAP2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshihito Moriwaki, Mitsuru Okuwaki, Kyosuke Nagata, Masahiko Sato, Aritaka Nagadoi, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] Structural analysis for 85 kDa protein complex, general transcription factor TFIIE by NMR spectroscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: Masahiko Okuda, Yoshihito Moriwaki, Masayuki Kataoka, Aritaka Nagadoi, Aki Tanaka, Yoshiaki Ohkuma, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNME2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies on the Chp1 chromodomain (2011)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Shimojo, Mayumi Ishida, Jun-Ichi Nakayama, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNMR2011第50回NMR討論会記念国際シンポジウム
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県)
• [学会発表] Structural biology on Chromatin-related proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura, Hideaki Shimojo, Ayumi Kawaguchi, Masahiko Okuda, Yoshihito Moriwaki, Katsuya Iizumi, Aritaka Nagadoi
  • 学会等名: The 4th Asia-Pacific NMR Symposium (The 4th APNMR Symposium)アジア・太平洋NMEシンポジウム
  • 発表場所: Beijing Central Garden Hotel(中国北京)中国北京
• [学会発表] クロマチン関連タンパク質の構造生物学 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文、森脇義仁、飯泉勝也、下條秀朗、奥田昌彦、長土居有隆
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] ヘテロクロマチン形成因子HP1αセリンリン酸化クロモドメインの構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 川口あゆみ、下條秀朗、浜田京子、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析法による生体超分子の構造解析(その1)DNAとDNA結合タンパク質のイオンモビリティ質量分析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗、廣瀬賢治、川瀬泰司、押方基二、西村善文
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析法による生体超分子の構造解析(その2)基本転写因子TFIIEαイオンモビリティ質量分析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、廣瀬賢治、川瀬泰司、押方基二、西村善文
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] 全原子シミュレーションによる天然変性蛋白質の自由エネルギー地形 (2011)
  • 著者名/発表者名: 肥後順一、西村善文、中村春木
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学(兵庫県)
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析とX線小角散乱による基本転写因子TFIIEの構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 七種和美、小田隆、奥田昌彦、池口満徳、佐藤衛、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第59回質量分析総合討論会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
• [学会発表] Structural biology on chromatin-related proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: Structural Research Center for Innovative Drug Development(ソウル国立大学)(ソウル韓国)
• [学会発表] 天然変成蛋白質NRSFとそのパートナー蛋白質mSin3の結合/折れ畳みの詳細な自由エネルギー地形 (2011)
  • 著者名/発表者名: 肥後順一、西村善文、中村春木
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
• [学会発表] Characterization of histone multimers by ESI-MS (2011)
  • 著者名/発表者名: Singo Shimoyama, Yuki Asano, Kyohei Takahashi, Hiroaki Tachiwana, Aritaka Nagadoi, Hitoshi Kurumizaka, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: 59th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: コロラドコンベンションセンターデンバー・コロラド州(アメリカ)
• [学会発表] Eukaryotic nuclear IUPs(真核生物の核内天然変性タンパク質) (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 2010 KRIBB Conference on Structural Bioinformatics (2nd Asia-Pacific symposium on Intrinsically Unfolded Proteins)
  • 発表場所: 大田(KRIBB)(韓国)
• [学会発表] Structural biology on Chromatin - related proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Shimojo H, Kawaguchi A, Okuda M, Moriwaki Y, Iizumi K, Nagadoi A
  • 学会等名: The 4th Asia-Pacific NMR Symposium (The 4th APNMR Symposium) アジア-太平洋 NMR シンポジウム
  • 発表場所: 中国・Beijing Central Garden Hotel
  • 年月日: 2011-10-19
• [学会発表] Eukaryotic nuclear IUPs (真核生物の核内天然変性タンパク質) (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 2010 KRIBB Conference on Structural Bioinformatics(2nd Asia-Pacific symposium on Intrinsically Unfolded Proteins)
  • 発表場所: 韓国・大田(KRIBB)
  • 年月日: 2011-01-15
• [学会発表] 質量分析を用いたヒストンH2A-H2Bのシトルリン化の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 浅野裕輝、下山真吾、長土居有隆、立和名博昭、山田道之、佐藤衛、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] 基本転写因子TFIIE-TFIIHの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田華那、田中亜紀、水田翔子、高澤学、吉國達也、奥田昌彦、西村善文、大熊芳明
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] ヒストンH3-H4と相互作用する分裂酵母クロマチン関連因子Mlo2の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 飯泉勝也、長土居有隆、伊縫美妃、田上英明、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] テロメアDNA結合タンパク質hTRF2の塩基性ドメインとテロメアDNAとの相互作用解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 村井元気、下條秀朗、菅野良、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] クロマチン関連因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] Structural study of the specific interaction of hTRF1 and hTRF2 with G-quadruplex structures (2010)
  • 著者名/発表者名: Shin Morita, Yuuka Hirao, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNAC2010第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: はまぎんホール・ヴィアマーレ(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies of the basic domain of a telomeric DNA-binding protein, TRF2 (2010)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Shimojo, Motoki Murai, Ryo Kanno, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: ISNAC2010第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: はまぎんホール・ヴィアマーレ(神奈川県)
• [学会発表] Mass spectrometry of DNA G-quadruplex bound to a human telomeric protein, hTRF2 (2010)
  • 著者名/発表者名: Naohiro Kodama, Yuuka Hirao, Noriyuki Iwasaki, Yoshiyuki Itoh, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: ISNAC2010第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: はまぎんホール・ヴィアマーレ(神奈川県)
• [学会発表] Disordered proteins and NMR screening of drug candidates (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies on the Six domain of Six3 (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Shimojo, H.Okamura, A.Nagadoi, K.Ikeda, K.Kawakami, Y.Nishimura
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア)
• [学会発表] NMR structure of general transcription factor TF II E (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Nishimura, M.Okuda
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア)
• [学会発表] Intrinsically disordered proteins and NMR screening of drug candidates (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: ソウル(韓国)
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins : intrinsic disordered states and drug screening (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting(KMRS:韓国磁気共鳴学会)
  • 発表場所: 釜山(韓国)
• [学会発表] 翻訳後修飾にともなうタンパク質の構造変化-H2A/H2Bのシトルリン化- (2010)
  • 著者名/発表者名: 下山真吾、長土居有隆、立和名博昭、浅野裕輝、山田道之、佐藤衛、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第58回質量分析総合討論会・第1回アジア・オセアニア質量分析会議
  • 発表場所: つくば国際会議場エポカル(茨城県)
• [学会発表] 天然変性タンパク質の認識機構の多様性と創薬への道 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文、平尾優佳、長土居有隆
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(札幌)
• [学会発表] NMR Experiments on Drug Candidates for the Sin3 Corepressor Bound to the Neural Repressor NRSF/REST Related to Meduloblastoma (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: PepCon2010
  • 発表場所: 北京(中国)
• [学会発表] 転写制御因子、ピストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] Polymorphism of chromodomains (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 構造エピゲノム研究会第2回ワークショップ
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2010-11-08
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins: intrinsic disordered states and drug screening (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村 善文
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting(KMRS:韓国磁気共鳴学会)
  • 発表場所: 韓国・釜山
  • 年月日: 2010-06-23
• [学会発表] 転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム(東京都)
  • 年月日: 2010-03-05
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム(東京都)
  • 年月日: 2010-03-05
• [学会発表] 転写関連因子の天然変性状態 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京大学山上会館(東京都)
  • 年月日: 2010-03-04
• [学会発表] 天然変性タンパク質による転写調節機構(ワークショップテーマ) (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会(MBSJ)
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁, 佐藤昌彦, 長土居有隆, 西村善文
  • 学会等名: 平成21年度 日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼ Esa1のクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 平成21年度 日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
• [学会発表] ヒト基本転写因子TFIIE alhpa 酸性ドメインの動的構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小松正史, 奥田昌彦, 長土居有隆, 菅瀬謙治, 西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁, 佐藤昌彦, 長土居有隆, 西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼ Esa1のクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] Intrinsically Disordered Transcription-related Proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦, 長土居有隆, 小松正史, 西村善文
  • 学会等名: 第3回アジア-太平洋NMRシンポジウム(APNMR)
  • 発表場所: Ramada Plaza Jeju Hotel(韓国)
• [学会発表] シトルリン化によるヒストンH2A/HBの構造変化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下山真吾, 長土居有隆, 立和名博昭, 山田道之, 佐藤衛, 胡桃坂仁志, 西村善文, 明石知子
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] 天然変性転写関連タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁, 佐藤昌彦, 長土居有隆, 西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼ Esa1のクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク全体交流会
  • 発表場所: ウエスティン都ホテル京都(京都府)
• [学会発表] 核内天然変性タンパク質の分子認識機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本県)
• [学会発表] 生命のメカニズムに迫るESI-MS -X線結晶構造解析との collaboration で見えてくる生体超分子の構造- (2009)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第57回質量分析総合討論会
  • 発表場所: 大阪国際交流センター(大阪府)
• [学会発表] 核内タンパク質の構造的柔軟性と機能発現 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第36回構造生物応用研究会
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル(静岡県)
• [学会発表] NMR Studies on Nuclear Proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会 第39回ワークショップ「RNAの構造生物学」
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2009-11-12
• [学会発表] Intrinsically Disordered Transcription-related Proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: Okuda M, Nagadoi A, Komatsu M, Nishimura Y
  • 学会等名: 第3回ア ジア - 太平洋 NMR シン ポジ ウム(APNMR)
  • 発表場所: 韓国・ Ramada Plaza Jeju Hotel
  • 年月日: 2009-10-28
• [学会発表] 天然変性タンパク質と結合化合物のスクリーニング (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村義文
  • 学会等名: サントリー生有研フォーラム
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2009-08-20
• [学会発表] ヒストンアセチル化酵素Esa1のRNA認識 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会 第37回ワークショップ「RNAの構造生物学」
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2009-07-24
• [学会発表] 遺伝子のスイッチに働くタンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: サタデーサイエンス～高校生のための「生命科学シンポジウム」
  • 発表場所: 横浜サイエンスフロンティア高校(神奈川県)
  • 年月日: 2009-05-16
• [学会発表] Structural biology on chromatin - related proteins,Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins (2007)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y
  • 学会等名: Structural Research Center for Innovative Drug Development
  • 発表場所: 韓国・ソウル国立大学
  • 年月日: 2007-07-10
• [学会発表] Structural analysis of Chip1 chromodomain required for heterochromatin assembly.
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura.
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins.
  • 発表場所: Structural Research Center for Innovative Drug Development（ソウル韓国）
  • 招待講演
• [学会発表] NMR Studies on Chromatin-Related Proteins.
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura.
  • 学会等名: International Workshop on Pharmaceutical NMR.
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府)
• [学会発表] 高分子としてのタンパク質構造解析：様々の手法のシンクロナイゼーション －質量分析の立場から－
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第6回ソフトマター中性子散乱研究会
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] NMRによるエピゲノム関連タンパク質の機能解析
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会第46回ワークショップ
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins : intrinsic disordered states and drug screening
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting開会講演
• [図書] “現代質量分析学”、高山光男、早川滋雄、瀧浪欣彦、和田芳直編 第26章 生体超分子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 出版者: 化学同人
• [図書] “試料分析講座 タンパク質分析”、日本分析化学会編 5.3 タンパク質複合体のネイティブ質量分析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 出版者: 丸善出版
• [備考] よこはま NMR 構造生物学研究会
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ynmr/
• [備考] 構造エピゲノム研究会
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/segc/
• [備考] よこはまNMR構造生物学研究会
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ynmr/
• [備考] よこはまバイオマス研究会
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ybiomass/
• [備考] 構造エピゲノム研究会
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/segc/
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/stbiol/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ynmr/
• [備考]
  • URL: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/segc/
• [産業財産権] 線維筋痛症の予防または治療薬 (2012)
  • 発明者名: 西村善文、植田弘師
  • 権利者名: 公立大学法人横浜市立大学、公国立大学法人長崎大学、PRISM BioLab株式会社
  • 出願年月日: 2012-12-06
  • 出願年: 2012
• [産業財産権] 神経選択的転写抑制因子 NRSF に特異的に結合する mSin3B に結合する化合物の利用 (2011)
  • 発明者名: 西村善文、長土居有隆、平尾優佳、五嶋良郎、山下直也、植田弘師、宮田直樹、鈴木孝禎、平石龍大
  • 権利者名: 公立大学法人横浜市立大学、公立大学法人名古屋市立大学、国立大学法人長崎大学
  • 出願年月日: 2011-02-09
  • 出願年: 2011
  • 外国
• [産業財産権] 神経選択的転写抑制因子NRSFに特異的に結合するmSin3Bに結合する化合物の利用 (2011)
  • 発明者名: 西村善文, 長土居有隆, 平尾優佳, 五嶋良郎, 山下直也, 植田弘師, 宮田直樹, 鈴木孝禎, 平石龍大
  • 権利者名: 公立大学法人横浜市立大学, 公立大学法人名古屋市立大学, 国立大学法人長崎大学
  • 出願年月日: 2011-02-09
  • 出願年: 2011
  • 外国