耐熱性周期骨格DNAアレイを用いた大規模二次元非周期パターンの構築

• 研究課題/領域番号: 20241029
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ナノ材料・ナノバイオサイエンス
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 陶山 明 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (90163063)
• 研究分担者: 藤本 健造 北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (90293894)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 50,310千円 (直接経費: 38,700千円、間接経費: 11,610千円); 2010年度: 8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円); 2009年度: 8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円); 2008年度: 34,190千円 (直接経費: 26,300千円、間接経費: 7,890千円)
• キーワード: DNAナノテクノロジー / DNAデバイス / DNAアレイ / セルフアセンブリ / ナノテクノロジー / ナノデバイス / ボトムアップ / DNA光クロスリンク / フォトライゲーション

研究概要

DNA分子の鎖を自己集合させて構築したDNAナノ構造体は、ナノデバイスや機能性材料をつくるために、非常に小さな部品をナノスケールの精度で制御して配置するための足場として期待されている。我々は、耐熱性周期構造をもつDNAタイルアレイの上に大規模な二次元非周期のアドレス空間パターンを備えたDNAナノ構造体の足場をプログラマブルに構築する方法の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Rigid DNA scaffolds stabilized by photo-cross-linking reaction. (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Tagawa, K.Shoda, K.Fujimoto, A.Suyama
  • 雑誌名: Small (to be submitted)
  • 査読あり
• [雑誌論文] AFM imaging on DNA double strands in DNA nanostructures (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Tanaka, M.Tagawa, K.Suzuki, S.Kitamura, A.Suyama
  • 雑誌名: Nano Letter (to be submitted)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photoreversible DNA end capping for the formation of hairpin structures (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshimura, H.Okada, K.Fujimoto
  • 雑誌名: Organic & Biomolecular Chemistry Vol.8 ページ: 1523-1526
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photoreversible DNA end capping for the formation of hairpin structures (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshimura, H.Okada, K.Fujimoto
  • 雑誌名: Organic & Biomolecular Chemistry 8 ページ: 1523-1526
  • 査読あり
• [雑誌論文] A new approach for reversible RNA Photoctosslinking reaction application to sequence-specific RNA selection (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshimura, H.Okada, K.Fujimoto
  • 雑誌名: ChemBioChem Vol.8 ページ: 1473-1476
  • 査読あり
• [雑誌論文] A new approach for reversible RNA photocrosslinking reaction : application to sequence-specific RNA selection (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshimura, T.Ohtake, H.Okada, K.Fujimoto
  • 雑誌名: ChemBioChem 10 ページ: 1473-1476
  • 査読あり
• [雑誌論文] Programmable self-assembly for the construction of aperiodic address space on heat-resistant periodic DNA array (2008)
  • 著者名/発表者名: M.Tagawa, K.Shohda, A.Suyama
  • 雑誌名: Proceeding of The 5^<th> Annual Conference on Foundation of Nanoscience : Self-assembled Architectures and Devices ページ: 152-153
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrafast reversible photo-cross-linking reaction : Toward in situ DNA manipulation (2008)
  • 著者名/発表者名: Y.Yoshimura, K.Fujimoto
  • 雑誌名: Organic Letters Vol.10 ページ: 3227-3230
  • 査読あり
• [雑誌論文] Programmable self-assembly for the construction of aperiodic address space on heat-resistant periodic DNA array. (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Tagawa, K. Shoda, and A. Suyama
  • 雑誌名: Proceeding of The 5th Annual Conference on Foundations of Nanoscience: Self-assembled Architectures and Devices ページ: 152-153
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrafast reversible photo-cross-linking reaction: Toward in situ DNA manipulation (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Yoshimura and K. Fujimoto
  • 雑誌名: Organic Letters 10 ページ: 3227-3230
  • 査読あり
• [学会発表] AFM Imaging on Double Stranded Structures of Algorithmically Assembled DNA Tiles in Liquid (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Tanaka, M.Tagawa, K.Suzuki, S.Kitamura, A.Suyama
  • 学会等名: 18th International Colloquium on Scanning ProbeMicroscopy
  • 発表場所: 伊豆熱川
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] AFM Imaging on Double Stranded Structures of Algorithmically Assembled DNA Tiles in Liquid (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Tanaka, M.Tagawa, K.Suzuki, S.Kitamura, A.Suyama
  • 学会等名: 18th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy
  • 発表場所: 伊豆熱川(熱ッハイツ)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Non-periodic and large-scale two-dimensional nano-patterns constructed on periodic DNA tile arrays (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Ara, M.Tagawa, K.Shoda, K.Fujimoto, A.Suyama
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] Non periodic and large-scale two-dimensional nano-patterns constructed on periodic DNA file arrays. (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Ara, M.Tagawa, K.Shoda, K;Fujimoto, A.Suyama
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台(東北大学)
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] Autonomous molecular computer with DNA and RNA put in the right place (2010)
  • 著者名/発表者名: 陶山明
  • 学会等名: 16th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming
  • 発表場所: Hong Kong, China
  • 年月日: 2010-06-16
• [学会発表] Autonomous molecular computer with DNA and RNA put in the right place. (2010)
  • 著者名/発表者名: A.Suyama
  • 学会等名: 16th International Conference on DNA Computingand Molecular Programming
  • 発表場所: Hong Kong, China
  • 年月日: 2010-06-16
• [学会発表] 光応答能を有する核酸誘導体によるプログラマブルなナノシステムの創製 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤本健造
  • 学会等名: 高分子討論会2009
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] 光応答能を有する核酸誘導体によるプログラマブルなナノシステムの創製 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤本健造
  • 学会等名: 高分子討論会2009
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] Autonomous DNA computer and its application to genetic diagnosis, gene network (2009)
  • 著者名/発表者名: 陶山明
  • 学会等名: Ecole de Physique des Houches-Physics od DNA Assembly
  • 発表場所: Les Houches, France
• [学会発表] Autonomous DNA computer and its application to genetic diagnosis, gene networl (2009)
  • 著者名/発表者名: Akira Suyama
  • 学会等名: Ecole de Physique des Houches-Physics of DNA Assembly
  • 発表場所: Les Houches, France
• [学会発表] ナノ部品のプログラム可能なセルフアセンブリのための二次元DNAアレイの構築 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田川美穂、大谷直、庄田耕一郎、陶山明
  • 学会等名: 第46回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2008-12-03
• [学会発表] ナノ部品のプログラム可能なセルフアセンブリのための二次元DNAアレイの構築 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田川美穂,大谷直,庄田耕一郎,陶山明
  • 学会等名: 第46回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2008-12-03
• [学会発表] Nanodevice gene (2008)
  • 著者名/発表者名: 陶山明
  • 学会等名: 4^<th> Handai Nanoscience and Nanotechnology International Symposium
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-09-30
• [学会発表] Nanodevice gene (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira Suyama
  • 学会等名: 4th Handai Nanoscience and Nanotechnology International Symposium
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 2008-09-30