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マイクロ化学チップを用いた単一細胞内単一DNA分子分析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20245016
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分析化学
研究機関東京大学

研究代表者

北森 武彦  東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (60214821)

研究分担者 馬渡 和真  東京大学, 大学院・工学系研究科, 講師 (60415974)
田中 陽  東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教 (40532271)
佐藤 香枝  日本女子大学, 理学部・物質生物科学科, 准教授 (40373310)
加藤 大  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 准教授 (30332943)
研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
36,400千円 (直接経費: 28,000千円、間接経費: 8,400千円)
2009年度: 18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円)
2008年度: 17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
キーワードマイクロ化学チップ / 単一DNA / RCA
研究概要

病原性とそうでない細菌の検出、また、医療診断、たとえばがん診断、敗血症診断などでは、単に単一DNAの分析のみならず、単一細胞内のDNAをin situ解析する高度な要求がある。現状は、単一細胞を扱うことが困難なため、複数の細胞を使っている上、長時間にわたる煩雑な酵素反応等の操作で行っているが、診断法として満足な方法は未だに開発されていない。一方、細胞操作をマイクロ化学チップに集積化することで、実験のプロセス効率化や単一細胞分析が可能になる。そこで、申請者は、マイクロ化学チップの持つフロー反応システムと特異的DNAプローブとDNA増幅反応(Padlock/RCA法)を併せて、従来にない全く新しい、高速、高精度に単一細胞内の単一DNA分子を検出するための革新的分析法を創出することを研究目的とした。
昨年度は白血球の固定化からDNAの検出までのすべての化学プロセスをマイクロ化学チップに集積化することに成功して、1万分子程度の検出性能を実証した。しかし、この手法ではDNAが捕捉される領域が5mm程度と長く、またビーズ上での検出で光学測定が困難であり、検出性能向上に限界があった。そこで、今年度はマイクロ流路内壁のガラス表面を利用してRCAを行うためのDNA部分的固定化法を開発した。光リンカーを独自に開発して、光照射部(数100μm)のみにDNAを固定化することに成功した。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2008

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] MICROCHIP INTEGRATED ROLLING CIRCLE AMPLIFICATION FOR SINGLE DNA MOLE CULE DETECTION IN MINUTE SAMPLE VOLUMES2008

    • 著者名/発表者名
      A Tachihara, K.Sato, B.Renberg, Y.Tanaka, J.Jarvius, M.Nilsson, T.Kitamori
    • 雑誌名

      Proceedings of μTAS2008 1

      ページ: 426-428

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MITOCHONDRIAL AND GENOMIC DNA DAMAGE ANALYSIS IN MICROFLUIDIC CHIPS2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Tanaka, H.Johansson, C.Larsson, S.Henriksson, T.Kitamori, M.Nilsson
    • 雑誌名

      Proceedings of μTAS2008 1

      ページ: 874-876

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マイクロチップRCA法による単一DNA分子検出法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      立原淳貴・佐藤香枝・田中有希・Jonas Jarvius・Mats Nilsson・北森武彦
    • 学会等名
      第18回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2008-12-07
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] MICROCHIP INTEGRATED ROLLING CIRCLE AMPLIFICATION FOR SINGLE DNA MOLE CULE DETECTION IN MINUTE SAMPLE VOLUMES2008

    • 著者名/発表者名
      A Tachihara, K.Sato, B.Renberg, Y.Tanaka, J.Jarvius, M.Nilsson, T.Kitamori
    • 学会等名
      μTAS2008
    • 発表場所
      アメリカ・サンディエゴ
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] MITOCHONDRIAL AND GENOMIC DNA DAMAGE ANALYSIS IN MICROFLUIDIC CHIPS2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Tanaka, H.Johansson, C.Larsson, S.Henriksson, T.Kitamori, M.Nilsson
    • 学会等名
      μTAS2008
    • 発表場所
      アメリカ・サンディエゴ
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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