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森林資源保全のための樹木遺伝子バーコードの基盤構築と有効性に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 20248017
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 森林科学
研究機関独立行政法人森林総合研究所

研究代表者

吉丸 博志  独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 園長 (20353914)

研究分担者 鈴木 三男  東北大学, 植物園, 教授 (80111483)
伊藤 元己 (伊藤 元巳)  東京大学, 総合文化研究科, 教授 (00193524)
舘田 英典  九州大学, 理学研究院, 教授 (70216985)
津村 義彦  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 領域長 (20353774)
藤井 智之  独立行政法人森林総合研究所, 関西支所, 支所長 (60353835)
能城 修一  独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, チーム長 (30343792)
河原 孝行  独立行政法人森林総合研究所, 北海道支所, グループ長 (70353654)
吉村 研介  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, チーム長 (30353915)
連携研究者 神保 宇嗣  東京大学, 総合文化研究科, 特任研究員 (10568281)
鈴木 節子  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 研究員 (70456622)
勝木 俊雄  独立行政法人森林総合研究所, 多摩森林科学園, 主任研究員 (10353640)
大谷 雅人  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター遺伝資源部, 研究員 (50582756)
田中 孝尚  東北大学, 植物園 (40463773)
研究期間 (年度) 2008 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
46,800千円 (直接経費: 36,000千円、間接経費: 10,800千円)
2011年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
2010年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
2009年度: 11,830千円 (直接経費: 9,100千円、間接経費: 2,730千円)
2008年度: 13,130千円 (直接経費: 10,100千円、間接経費: 3,030千円)
キーワードDNAバーコード / 日本産樹木 / 種識別 / 葉緑体DNA / 塩基配列情報 / バーコード / 塩基配列情
研究概要

日本産樹木は1, 100種以上あるが、このうち約1, 000種、約7, 000個体の標本を収集した。これらの標本について葉緑体DNA上の3領域の塩基配列情報を解析し、それらを用いるDNAバーコーディングにより約75%の樹種の同定が可能となった。樹木の個体のどの組織も同じDNAを持っているので、根、材、種子や葉の断片など、形態だけでは識別しにくい材料の同定など幅広い応用が考えられる。

報告書

(6件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書   自己評価報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2012 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (19件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] 日本産樹木DNAバーコーディングの現状20102012

    • 著者名/発表者名
      吉村研介・鈴木節子・田中孝尚・鈴木三男・神保宇嗣・伊藤元己・舘田英典・大谷雅人・勝木俊雄・津村義彦・藤井智之・能城修一・河原孝行・吉丸博志
    • 雑誌名

      関東森林研究

      巻: (印刷中掲載確定) ページ: 63-63

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産樹木DNAバーコーディングの現状20102012

    • 著者名/発表者名
      吉村研介、鈴木節子, 他
    • 雑誌名

      関東森林研究

      巻: 63(印刷中)(掲載確定)

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産樹木DNAバーコーディングの現状20092011

    • 著者名/発表者名
      吉村研介・鈴木節子・田中孝尚・鈴木三男・神保宇嗣・伊藤元己・舘田英典・大谷雅人・勝木俊雄・津村義彦・藤井智之・能城修一・河原孝行・吉丸博志
    • 雑誌名

      関東森林研究

      巻: 62 ページ: 79-82

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産樹木DNAバーコーディングの現状(2009)2011

    • 著者名/発表者名
      吉村研介, 鈴木節子, 他12名
    • 雑誌名

      関東森林研究 62

      ページ: 79-82

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Current progress in DNA barcoding and future implications for entomology2011

    • 著者名/発表者名
      Jinbo U
    • 雑誌名

      Entomological Science

      巻: 14 ページ: 107-124

    • NAID

      10030579458

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic structure and putative selective sweep in pioneer tree Zanthoxylum ailanthides2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T, Nagai H, Yahara T, Tachida H
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 123 ページ: 607-616

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic structure and putative selective sweep in pioneer tree, Zanthoxylum ailanthides.2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T, Nagai H, Yahara T, Tachida H
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 123

      ページ: 607-616

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic structure and putative selective sweep in pioneer tree, Zanthoxylum ailanthoides.2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 123 ページ: 607-616

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Plant diversity on Lombok Island, Indonesia : An approach using DNA barcodes.2010

    • 著者名/発表者名
      Tobe H
    • 雑誌名

      Acta.Phytotax.Geobot.

      巻: 61 ページ: 93-108

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本産樹木DNAバーコーディングの現状(2008)2010

    • 著者名/発表者名
      吉村研介
    • 雑誌名

      関東森林研究

      巻: 61 ページ: 79-82

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development and characterization of microsatellite markers in Zanthoxylum ailanthoides (Rutaceae)2009

    • 著者名/発表者名
      Nagai H
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Resource 9

      ページ: 667-669

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNAバーコーディングによる同定支援システムとJBOLI構想2008

    • 著者名/発表者名
      神保宇嗣・吉武啓・伊藤元己
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 58 ページ: 123-130

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNAバーコーディングによる同定支援システムとJBOLI構想2008

    • 著者名/発表者名
      神保宇嗣・吉武啓・伊藤元己
    • 雑誌名

      日本生態学会誌 58

      ページ: 123-130

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNAバーコーディングによる同定支援システムとJBOLI構想2008

    • 著者名/発表者名
      神保宇嗣
    • 雑誌名

      日本生態学会誌 58

      ページ: 123-130

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 日本産樹木DNAバーコーディング-2010年度rbcLとmatK-2012

    • 著者名/発表者名
      吉村研介, 他
    • 学会等名
      第123回日本森林学会大会
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮)
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNA barcoding of woody plants in Japan-Focus on some taxonomic groups2011

    • 著者名/発表者名
      Setsuko S. Yoshimura K, Katsuki T, Ohtani M, Noshiro S, Fujii T, Suzuki M, Tanaka T, Tachida H, Ito M, Jinbo U, Kawahara T, Tsumura Y, Yoshimaru H
    • 学会等名
      Fourth International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      University of Adelaide(Adelaide, Australia)
    • 年月日
      2011-12-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Possiblity of identification at species and population levels for the genus Daphne(Thymelaeaceae) by DNA barcoding2011

    • 著者名/発表者名
      Kawahara T, Yoshimura K, Yamashita N, Miyaura T, Lei T, Yoshimaru H
    • 学会等名
      Fourth International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      University of Adelaide(Adelaide, Australia)
    • 年月日
      2011-12-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Current status of the Japanese Barcode of Life Initiative(JBOLI)2011

    • 著者名/発表者名
      Jinbo U, Ito M
    • 学会等名
      Fourth International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      University of Adelaide(Adelaide, Australia)
    • 年月日
      2011-12-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular phylogeny and ecological evolution on Daphne(Thyelaeaceae)2011

    • 著者名/発表者名
      Kawahara T, Yamashita N, Lei T, Miyaura T, Ohi-Toma T, Murata J
    • 学会等名
      XVIII International Botanical Congress
    • 発表場所
      University of Melbourne(Melbourne, Australia)
    • 年月日
      2011-07-24
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular phylogeny and ecological evolution on Dphne (Tymelaeaceae)2011

    • 著者名/発表者名
      Kawahara T., et al
    • 学会等名
      XVIII International Botanical Congress
    • 発表場所
      Univ.Melbourne (Melbourne)
    • 年月日
      2011-07-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNA barcoding of woody plants in Japan-Focus on some taxonomic groups2011

    • 著者名/発表者名
      Setsuko S., et al
    • 学会等名
      Fourth International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      Univ.Adelaide (Adelaide)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Possibility of identification at species and population levels for the genus Daphne (Thymelaeaceae) by DNA barcoding2011

    • 著者名/発表者名
      Kawahara T., et al
    • 学会等名
      Fourth International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      Univ.Adelaide (Adelaide)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Current status of the Japanese Barcode of Life Initiative (JBOLI)2011

    • 著者名/発表者名
      Jinbo U., et al
    • 学会等名
      Fourth International Brcode of Life Conference
    • 発表場所
      Univ.Adelaide (Adelaide)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNA barcoding of Japanese woody plants2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura K, Ohtani M, Suzuki S, Katsuki T, Suzuki M, Tanaka T, Noshiro S, Fujii T, Tachida H, Ito M, Jinbo U, Tsumura Y, Kawahara T, Yoshimaru H
    • 学会等名
      ISBDS2010 International Symposium on Biodiversity "Genome, Evolution and Environment"
    • 発表場所
      Nagoya Municipal University(Nagoya, JAPAN)
    • 年月日
      2010-08-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA barcoding of Japanese woody plants2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura K., et al.
    • 学会等名
      ISBDS2010 International Symposium on Biodiversity "Genome, Evolution and Environment"
    • 発表場所
      Nagoya、Japan
    • 年月日
      2010-08-01
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Progress of DNA barcoding on woody plants in Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru H, Ohtani M, Yoshimura K, Noshiro S, Fujii T, Katsuki T, Setsuko S, Tsumura Y, Kawahara T, Suzuki M, Tanaka T, Tachida H, Ito M, Jinbo U
    • 学会等名
      The tree Barcode of Life and Cullman Symposia
    • 発表場所
      The New York Botanical Garden(NewYork, USA)
    • 年月日
      2010-04-16
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Progress of DNA barcoding on woody plants in Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru H., et al
    • 学会等名
      The tree Barcode of Life and Cullman Symposia
    • 発表場所
      NewYork, USA
    • 年月日
      2010-04-16
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Progress of DNA barcoding on woody plants in Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru H
    • 学会等名
      The tree Barcode of Life and Cullman Symposia
    • 発表場所
      The New York Botanical Barden (New York, USA)
    • 年月日
      2010-04-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 樹木識別あるいは系統解析におけるバーコード情報の可能性2010

    • 著者名/発表者名
      舘田英典
    • 学会等名
      日本森林学会大会発表データベース、121:B11
    • 発表場所
      筑波大学
    • 年月日
      2010-04-04
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 樹木DNAバーコードデータベースの構築2010

    • 著者名/発表者名
      神保宇嗣・伊藤元己
    • 学会等名
      日本森林学会大会発表データベース、121:B06
    • 発表場所
      筑波大学
    • 年月日
      2010-04-04
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] DNA barcoding on woody plants in Japan2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru H, Ohtani M, Yoshimura K, Suzuki M, Tanaka T, Noshiro S, Fujii T, Tachida H, Nagai H, Ito M, Jinbo U, Tsumura Y, Kawahara T
    • 学会等名
      Third International Barcode of Life Congress
    • 発表場所
      Mexican Academy of Science(Mexico City, Mexico)
    • 年月日
      2009-11-10
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産樹木DNAバーコーディング-2008年度進捗状況-2009

    • 著者名/発表者名
      吉村研介
    • 学会等名
      日本森林学会大会、120:Pb1-31
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2009-03-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNA barcoding on woody plants in Japan2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru H., et al
    • 学会等名
      Third International Barcode of Life Congress
    • 発表場所
      Mexico City, Mexico
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書 2009 実績報告書
  • [備考] (1)データベースBOLD SYSTEMS(Barcode of Life Data System)の中に、JWP(Japanese Woody Plants、日本産樹木)プロジェクトのページを立ち上げ、収集した日本産樹種の個体別の標本情報、DNA塩基配列情報を収録している。現在は未公開であるが、約2年後に公開を予定している

    • URL

      http://www.boldsystems.org/index.php/Login/page

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [備考] (2)シンポジウム「樹木のDNAバーコーディングの進捗と今後の展開に向けて」コーディネータ:吉丸博志、第121回日本森林学会大会テーマ別シンポジウム、2010.04.04

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [備考] パンフレット「DNAバーコーディング-生物の同定と種の多様性管理のための新しいツール-」2010.12.29(発行:日本バーコードオブライフイニシアチブ、伊藤元己研究室)

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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