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口腔・歯周病フローラのメタゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 20249082
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 歯周治療系歯学
研究機関愛知学院大学

研究代表者

野口 俊英  愛知学院大学, 歯学部, 教授 (50014262)

研究分担者 小島 俊男 (小島 利男)  浜松医科大学, 実験実習器機センター, 准教授 (00311340)
森田 英利  麻布大学, 獣医学部, 准教授 (70257294)
林 潤一郎  愛知学院大学, 歯学部, 講師 (30350937)
連携研究者 福田 光男  愛知学院大学, 歯学部, 教授 (40156790)
石原 裕一  愛知学院大学, 歯学部, 准教授 (50261011)
亀井 英彦  愛知学院大学, 歯学部, 助教 (50421243)
服部 正平  東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (70175537)
藤 英博  理化学研究所, 計算生命科学研究センター, 研究員 (10353468)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
48,360千円 (直接経費: 37,200千円、間接経費: 11,160千円)
2010年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2009年度: 15,860千円 (直接経費: 12,200千円、間接経費: 3,660千円)
2008年度: 23,920千円 (直接経費: 18,400千円、間接経費: 5,520千円)
キーワードメタゲノム解析 / 口腔細菌叢 / 歯周病関連細菌 / 歯周炎 / ゲノムDNA抽出 / 歯肉縁上プラーク / 歯肉縁下プラーク / 16SrRNA遺伝子解析
研究概要

歯周組織健常者および歯周病患者のプラーク細菌叢についてメタゲノム解析を行った。合計7サンプルのメタゲノムDNAシークエンスデータをもとに細菌叢の系統解析を行ったところ、合計で996菌種を検出し、従来の報告よりも複雑なプラーク細菌叢の多様性が示唆された。また、機能プロファイル解析では、腸内細菌叢など他の環境細菌叢との比較で、防御機構に関する遺伝子、糖代謝に関する遺伝子が多いなど、プラークに特徴的な機能特性が観察された。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (5件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Bifidobacterium kashiwanohense sp.nov., isolated from healthy infant faeces.2010

    • 著者名/発表者名
      Morita H, Nakano A, Onoda H, Toh H, Oshima K, Takami H, Murakami M, Fukuda S, Takizawa T, Kuwahara T, Ohno H, Tanabe S, Hattori M.
    • 雑誌名

      Int.J.Syst.Evol.Microbiol.(電子版)

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of horizontal X-ray beam angulation on the detection of furcation defects of mandibular first molars in intraoral radiology.2010

    • 著者名/発表者名
      Hishikawa T, Izumi M, Naitoh M, Furukawa M, Yoshinari N, Kawase H, Matsuoka M, Noguchi T, Ariji E.
    • 雑誌名

      Dentomaxillofac Radiol. 39

      ページ: 85-90

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MiR-148a attenuates paclitaxel-resistance of hormone-refractory, drug-resistant prostate cancer PC3 cells by regulating MSK1 expression.2010

    • 著者名/発表者名
      Fujita Y, Kojima K, Ohhashi R, Hamada N, Nozawa Y, Kitamoto A, Sato A, Kondo S, Kojima T, Deguchi T, Ito M.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 285

      ページ: 19076-84

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lactobacillus equicursoris sp.nov.isolated from the faeces of a thoroughbred racehorse.2010

    • 著者名/発表者名
      Morita H, Shimazu M, Shiono H, Toh H, Nakajima F, Akita H, Takagi M, Takami, H, Murakami M, Masaoka T, Tanabe S., Hattori M.
    • 雑誌名

      Int.J.Syst.Evol.Microbiol. 60

      ページ: 109-112

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lactobacillus equicursoris sp.nov.isolated from the faeces of a thoroughbred racehorse2010

    • 著者名/発表者名
      Morita, H.
    • 雑誌名

      Int.J.Syst.Evol.Microbiol.

      巻: 60 ページ: 109-112

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bifidobacterium kashiwanohense sp.nov., isolated from healthy infant faeces2010

    • 著者名/発表者名
      Morita, H.
    • 雑誌名

      Int.J.Syst.Evol.Microbiol.

      巻: (電子版)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of horizontal X-ray beam angulation on the detection of furcation defects of mandibular first molars in intraoral radiology.2010

    • 著者名/発表者名
      Hishikawa, T.Noguchi, T.
    • 雑誌名

      Dentomaxillofac Radiol

      巻: 39 ページ: 85-90

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MiR-148a attenuates paclitaxel-resistance of hormone-refractory, drug-resistant prostate cancer PC3 cells by regulating MSK 1 expression.2010

    • 著者名/発表者名
      Fujita, Y.Kojima, T.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 19076-84

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103.2009

    • 著者名/発表者名
      Morita H, Toh H, Oshima K, Murakami M, Taylor TD, Igimi S, Hattori M.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 191

      ページ: 7630-7631

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution analysis of aberrant regions in autosomal chromosomes in human leukemia THP-1 cell line.2009

    • 著者名/発表者名
      Adati N, Huang MC, Suzuki T, Suzuki H, Kojima T.
    • 雑誌名

      BMC research notes 2

      ページ: 153-159

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Degradation of vascular endothelial thrombomodulin by arginine-and lysin-specific cysteine proteases from Porphyromonas gingivalis.2009

    • 著者名/発表者名
      Inomata M, Ishihara Y, Matsuyama T, Murayama I, Noguchi T, Matsushita K.
    • 雑誌名

      J.Periodontol. 8

      ページ: 1511-1517

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of probiotic Lactobacillus rhamnosus ATCC 531032009

    • 著者名/発表者名
      Morita H, Toh H, Oshima K, Murakami M, Taylor TD, Igimi S, Hattori M
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 191

      ページ: 7630-7631

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution analysis of aberrant regions in autosomal chromosomes in human leukemia THP-1 cell line2009

    • 著者名/発表者名
      Adati N, Huang MC, Suzuki T, Suzuki H, Kojima T.
    • 雑誌名

      BMC research notes 2

      ページ: 153-159

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Degradation of vascular endothelial thrombomodulin by arginine-and lysin-specific cysteine proteases from Porphyromonas gingivalis2009

    • 著者名/発表者名
      Inomata M, Ishihara Y, Matsuyama T, Murayama I, Noguchi T, Matsushita K
    • 雑誌名

      J.Periodontol. 80

      ページ: 1511-1517

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ヒト歯周病細菌叢のメタゲノム解析2011

    • 著者名/発表者名
      林潤一郎,近藤伸二、亀井英彦、森田英利、足立直樹、福田光男、Todd D Taylor、石原裕一、小島俊男、野口俊英
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2011-03-14
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Metagenomic analysis of the dental plaque2010

    • 著者名/発表者名
      Hayashi J, Kondo S, Morita H, Kamei H, Fukuda M, Ishihara Y, Kojima T, Noguchi T
    • 学会等名
      96^<th> American Academy of Periodotology Annual Meeting
    • 発表場所
      Honolulu, USA
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] METAGENOMIC ANALYSIS OF THE DENTAL PLAQUE2010

    • 著者名/発表者名
      林潤一郎
    • 学会等名
      96^<th> American Academy of Periodotology Annual Meeting
    • 発表場所
      Honolulu, USA
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 腸内細菌叢のメタゲノム解析における細菌DNA抽出法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      上野真理子,菊池真美,森田英利,服部正平, 他
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 腸内細菌叢のメタゲノム解析における細菌DNA抽出法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      上野真理子, 菊池真美, 森田英利, 服部正平, 他
    • 学会等名
      第2回 日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] メタゲノム解析技術の最前線(213)2010

    • 著者名/発表者名
      林潤一郎、近藤伸二、森田英利、小島俊男、野口俊英
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [図書] メタゲノム解析技術の最前線2010

    • 著者名/発表者名
      林潤一郎
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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