| 研究課題/領域番号 |
20310116
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
基礎ゲノム科学
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| 研究機関 | 宮崎大学 |
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研究代表者 |
林 哲也 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
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| 研究分担者 |
小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (40363585)
大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助教 (50363594)
黒川 顕 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (20343246)
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| 研究期間 (年度) |
2008 – 2010
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| 研究課題ステータス |
完了 (2010年度)
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| 配分額 *注記 |
19,630千円 (直接経費: 15,100千円、間接経費: 4,530千円)
2010年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2009年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2008年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
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| キーワード | ゲノム / 微生物 / 細菌 / 進化 / 感染症 |
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| 研究概要 |
様々な病原型あるいは由来をもった大腸菌株を多数収集し、新型シーケンサーを用いた大規模全ゲノム配列決定とゲノム比較解析を行った。その結果、大腸菌のpan-genome情報を取得するとともに、腸管出血性大腸菌(EHEC)などの病原型に特徴的な遺伝子レパートリーとその獲得メカニズムを解明した。また、EHECや腸管病原性大腸菌(EPEC)として分離されている菌株の中にE.arbertiiが多数含まれていることを見出し、代表菌株の概要配列を取得した。
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