メタボローム法を基盤とした概日計中枢由来細胞の位相シフトと細胞間同調機構の解析

• 研究課題/領域番号: 20310119
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 金沢大学 (2009-2011); 株式会社三菱化学生命科学研究所 (2008)
• 研究代表者: 程 肇 金沢大学, 自然システム学系, 教授 (00242115)
• 研究分担者: 曽我 朋義 慶應義塾大学, 環境情報学部, 教授 (60338217)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円); 2009年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2008年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円)
• キーワード: 概日リズム / 視交叉上核 / 時計遺伝子 / メタボローム / データベース / CE-MS / メクボローム

研究概要

本研究では概日リズム位相シフト及び細胞間同調機構に着目する。そこで、細胞の位相シフトに及び細胞間同調機構を司る分子を明らかにするために、主にメタボローム解析にプロテオーム解析を組み合わせた包括的データベースを構築した。その結果、細胞の位相シフトには、細胞のエネルギー状態、脂質代謝系、アミノ酸生合成系に含まれる分子が、さらに、細胞間同調には薬物代謝系酵素群による代謝物中間体、核酸生合成代謝物が関与している可能性を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Positive Autoregulation Delays the Expression Phase of Mammalian Clock Gene Per2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogawa, Y., Koike, N., Kurosawa, G., Soga, T., Tomita, M., Tei, H.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positive Autoregulation Delays the Expression Phase of Mammalian Clock Gene Per2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogawa Y, Koike N, Kurosawa G, Soga T, Tomita M, Tei H
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positive Autoregulation Delays the Expression Phase of Mammalian Clock Gene Per2. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogawa Y, Koike N, Kurosawa G, Soga T, Tomita M, Tei H.
  • 雑誌名: PLoS One. 6
• [雑誌論文] Positive Autoregulation Delays the Expression Phase of Mammalian Clock Gene Per2. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogawa Y, Koike N, Kurosawa G, Soga T, Tomita M, Tei H
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] The uterus sustains stable biological clock during pregnancy (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, S., Ohta, H., Watanabe, S., Moriya, T., Hariu, A., Nakahata, N., Chisaka, H., Matsuda, T., Kimura, Y., Tsuchiya, S., Tei, H., Okamura, K., Yaegashi, N.
  • 雑誌名: Tohoku J. Exp. Med 巻: 221 ページ: 287-298
  • NAID: 10027085356
  • 査読あり
• [雑誌論文] The uterus sustains stable biological clock during pregnancy. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, S., Ohta, H., Watanabe, S., Moriya, T., Hariu, A., Nakahata, N.,Chisaka, H., Matsuda, T., Kimura, Y.,Tsuchiya, S., Tei, H., Okamura, K.,Yaegashi, N.
  • 雑誌名: Tohoku J. Exp. Med. 221 ページ: 287-298
  • NAID: 10027085356
• [雑誌論文] The uterus sustains stable biological clock during pregnancy. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akivama S, Ohta H, Watanabe S, Mori ya T, Hariu A, Nakahata N, Chisaka H, Matsuda T, Kimura Y.Tsuchlva S, Tei_H.Okamura K, Yaedashi N.
  • 雑誌名: Tohoku J Exp Med. 巻: 221 ページ: 287-298
  • NAID: 10027085356
  • 査読あり
• [雑誌論文] Period-phase map : two-dimensional selection of circadian rhythm-related genes (2009)
  • 著者名/発表者名: Morioka, R., Arita, M., Sakamoto, K., Kawaguchi, S., Tei, H., Horimoto, K.
  • 雑誌名: IET Syst Biol 巻: 3 ページ: 487-495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic and Molecular Analysis of Wild-Derived Arrhythmic Mice (2009)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Suzuki, T., Ishikawa, A., Yokota, Y., Ueda, H. R., Yamada, R. G., Tei, H., Imai, S., Tomida, S., Kobayashi, J., Naito, E., Yasuo, S., Nakao, N., Namikawa, T., Yoshimura, T., Ebihara, S.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ontogeny of circadian organization in the rat (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki, S., Yoshikawa, T., Biscoe, E. W., Numano, R., Gallaspy, L. M., Soulsby, S., Papadimas, E., Pezuk, P., Doyle, S. E., Tei, H., Sakaki, Y., Block, G. D., Menaker, M.
  • 雑誌名: J Biol Rhythms 巻: 24 ページ: 55-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] Period-phase map : two-dimensional selection of circadian rhythm-related genes. (2009)
  • 著者名/発表者名: Morioka, R., Arita, M., Sakamoto, K., Kawaguchi, S., Tei, H., Horimoto, K.
  • 雑誌名: IET Syst Biol. 3 ページ: 487-495
• [雑誌論文] Genetic and Molecular Analysis of Wild-Derived Arrhythmic Mice. (2009)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Suzuki, T., Ishikawa, A., Yokota, Y., Ueda, H.R., Yamada, R.G., Tei, H., Imai, S., Tomida, S., Kobayashi, J., Naito, E., Yasuo, S., Nakao, N., Namikawa, T., Yoshimura, T., Ebihara, S.
  • 雑誌名: PLoS ONE. 4
• [雑誌論文] Ontogeny of circadian organization in the rat. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki, S., Yoshikawa, T., Biscoe, E.W., Numano, R., Gallaspy, L.M., Soulsby, S., Papadimas, E., Pezuk, P., Doyle, S.E., Tei, H., Sakaki, Y., Block, G.D., Menaker, M.
  • 雑誌名: J Biol Rhythms. 24 ページ: 55-63
• [雑誌論文] Period-phase map: two-dimensional selection of circadian rhythm-related genes (2009)
  • 著者名/発表者名: Morioka R, Arita M, Sakamoto K, Kawaguchi S, Tei H, Horimoto K.
  • 雑誌名: IET Syst.Biol. 3 ページ: 487-495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic and molecular analysis of wild-derived arrhythmic mice. (2009)
  • 著者名/発表者名: Watanabe T, Suzuki T, Ishikawa A, Yokota Y, Ueda HR, Yamada RG, Tei H, Imai S, Tomida S, Kobayashi J, Naito E, Yasuo S, Nakao N, Namikawa T, Yoshimura T, Ebihara S.
  • 雑誌名: PLoS One 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ontogeny of circadian organization in the rat. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S, Yoshikawa T, Biscoe EW, Numano R, Gallaspy LM, Soulsby S, Papadimas E, Pezuk P, Doyle SE, Tei H, Sakaki Y, Block GD, Menaker M.
  • 雑誌名: J.Biol.Rhythms 24 ページ: 55-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ontogeny of circadian organization in the rat (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S, Yoshikawa T, Biscoe EW, Numano R, Gallaspy LM, Soulsby S, Papadimas E, Pezuk P, Doyle SE, Tei H, Sakaki Y, Block GD, Menaker M.
  • 雑誌名: J Biol Rhythms 24 ページ: 55-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic and Molecular Analysis of Wild-Derived Arrhythmic Mice (2009)
  • 著者名/発表者名: Watanabe T., Suzuki T., Ishikawa A., Yokota Y., Ueda HR., Yamada RG., Tei H., Imai S., Tomida S., Kobayashi J., Naito E., Yasuo S., Nakao N., Namikawa T., Yoshimura T., Ebihara S.
  • 雑誌名: PLoS ONE 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative Metabolome Profiling of Colon and Stomach Cancer Microenvironment by Capillary Electrophoresis Time-of-flight Mass Spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirayama, A., Kami, K., Sugimoto, M., Sugawara, M., Toki, N., Onozuka, H., Kinoshita, T., Saito, N., Ochiai, A., Tomita, M., Esumi, H., Soga, T.
  • 雑誌名: Cancer Res. 69 ページ: 4918-4925
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cystathionine β-synthase as a Carbon Monoxide-sensitive Regulator of Bile Excretion. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shintani, T., Iwabuchi, T., Soga, T., Kato, Y., Yamamoto, T., Takano, N., Hishiki, T., Ueno, Y., Ikeda, S., Sakurakawa, T., Ishikawa, K., Goda, N., Yitagawa, Y., Kajiyama, M., Matsumoto, K., Suematsu, M.
  • 雑誌名: Hepatology 49 ページ: 141-150
  • 査読あり
• [雑誌論文] Degradation of ppGpp by nudix pyrophosphatase modulates the transition of growth phase in the bacterium thermos thermophilus (2009)
  • 著者名/発表者名: Ooga, T., Ohashi, Y., Kuramitsu, S., Koyama, Y., Tomita, M., Soga, T., Masui, R.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolite profiling reveals YihU as a novel hydroxybutyrate dehydrogenase for alternative succinic semialdehyde metabolism in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Saito, N., Robert, M., Kochi, H., Matsuo, G., Kakazu, Y., Soga, T., Tomita, M.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Maternal feeding controls fetal biological clock (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohta, H., Xu, S., Moriya, T., Iigo, M., Watanabe, T., Nakahata, N., Chisaka, H., Hanita, T., Matsuda, T., Ohura, T., Kimura, Y., Yaegashi, N., Tsuchiya, S., Tei, H., Okamura, K.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Maternal feeding controls fetal biological clock. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohta, H., Xu, S., Moriya, T., Iigo, M., Watanabe, T., Nakahata, N., Chisaka, H., Hanita, T., Matsuda, T., Ohura, T., Kimura, Y., Yaegashi, N., Tsuchiya, S., Tei, H., Okamura, K.
  • 雑誌名: PLoS ONE. 3
• [雑誌論文] Circadian mPer1 gene expression in mesencephalic trigeminal nucleus cultures. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiler, DJ., Bhattacherjee, A., Yamazaki, S., Tei, H, Geusz, ME.
  • 雑誌名: Brain Res. 1214 ページ: 84-93
• [雑誌論文] Reorganization of the suprachiasmatic nucleus coding for day length. (2008)
  • 著者名/発表者名: Naito, E., Watanabe, T., Tei, H., Yoshimura, T., Ebihara, S.
  • 雑誌名: J. Biol. Rhythms. 23 ページ: 140-149
• [雑誌論文] Reorganization of the suprachiasmatic nucleus coding for day length (2008)
  • 著者名/発表者名: Naito E., Watanabe T., Tei, H., Yoshimura T., Ebihara, S.
  • 雑誌名: J. Biol. Rhythms. 23 ページ: 140-149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Circadian mPer1 gene expression in mesencephalic trigeminal nucleus cultures (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiler, DJ., Bhattacherjee, A., Yamazaki, S., Tei, H, Geusz, ME.
  • 雑誌名: Brain Res. 1214 ページ: 84-93
  • 査読あり
• [雑誌論文] Maternal feeding controls fetal biological clock (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohta, H., Xu, S., Moriya, T., Iigo, M., Watanabe, T., Nakahata, N., Chisaka, H., Hanita, T., Matsuda, T., Ohura, T., Kimura, Y., Yaegashi, N., Tsuchiya, S., Tei. H., Okamura, K.
  • 雑誌名: PLoS ONE 3
  • 査読あり