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赤外振動スペクトルと量子化学計算による核酸塩基高次構造の決定

研究課題

研究課題/領域番号 20350012
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

三枝 洋之  横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 教授 (90162180)

研究分担者 立川 仁典  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (00267410)
大場 正志  横浜薬科大学, 薬学部, 教授 (60115219)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
14,300千円 (直接経費: 11,000千円、間接経費: 3,300千円)
2010年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2008年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
キーワードクラスター / 核酸塩基 / 赤外振動スペクトル / 塩基ヌクレオチド / レーザー脱離 / 非調和振動計算 / 修飾塩基 / 量子化学計算 / 化学修飾
研究概要

新規レーザー脱離法を開発することにより、核酸塩基対や塩基に糖の結合したヌクレオシド、及びこれらの水和物を中性状態で気相孤立化し、その微細構造を紫外及び赤外振動分光法と量子化学計算を駆使して決定することを行った。更に、塩基に糖‐リン酸基バックボーンの結合したヌクレオチドを化学修飾することにより、レーザー脱離法により非破壊的に気化し、その高次構造を決定することに成功した。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (57件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (16件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (37件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Mass Spectrometry for Nonvolatile Functional Molecules by Laser Desorption/Vacuum-Ultraviolet Photoionization Method2011

    • 著者名/発表者名
      R. Kikkawa, Y. Inokuchi, T. Ebata, H.Saigusa
    • 雑誌名

      BECKNIK(ロシアオレンブルグ大学紀要)

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] レーザー脱離法による核酸塩基ヌクレオチドの気相孤立化-リン酸基のエステル化による非破壊性向上2011

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 雑誌名

      横浜市立大学叢書 61巻

      ページ: 91-100

    • NAID

      120005670481

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mass Spectrometry for Nonvolatile Functional Molecules by Laser Desorption/Vacuum-Ultraviolet Photoionization Method2011

    • 著者名/発表者名
      R.Kikkawa, Y.Inokuchi, T.Ebata, H.Saigusa
    • 雑誌名

      BECKNIK (ロシアオレンブルグ大学紀要)

      巻: 4 ページ: 111-113

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mass Spectrometry for Nonvolatile Functional Molecules by Laser Desorption/Nacuum-Ultraviolet Photoionization Method2011

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 雑誌名

      横浜市立大学叢書

      巻: 61 ページ: 91-100

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Gas-phase Isolation of Diethylguanosine 5'-monophosphate and Its Conformational Assignment2010

    • 著者名/発表者名
      H. Asami, M. Tsukamoto, Y. Hayakawa, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Phys.Chem.Chem.Phys.(communication) 12

      ページ: 13918-13921

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microhydration of the Guanine-guanine and Guanine-cytosine Base Pairs2010

    • 著者名/発表者名
      S. Urashima, H. Asami, M. Ohba, H.Saigusa
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem A (invited article) 114(Most Read Articles)

      ページ: 11231-11237

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microhydration of the guanine-guanine and guanine-cytosine base pairs2010

    • 著者名/発表者名
      S.Urashima, H.Asami, M.Ohba, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A

      巻: 114 ページ: 11231-11237

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gas-phase isolation of diethyl guanosine 5'-monophosphate and its conformational assignment2010

    • 著者名/発表者名
      H.Asami, M.Tsukamoto, Y.Hayakawa, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 12 ページ: 13918-13921

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microhydration of the guanine-guanine and guanine-cytosine base pairs2010

    • 著者名/発表者名
      S.Urashima, H.Asami, М.Ohba, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A (accepted for publication)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydration Structures of 2'-Deoxyguanosine Studied by IR-UV Double Resonance Spectroscopy : Comparison with Guanosine2009

    • 著者名/発表者名
      H. Asami, S. Urashima, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Phys.Chem.Chem.Phys. 11

      ページ: 10466-10472

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] IR-UV Double Resonance Spectroscopy of the Hydrated Clusters of Guanosine and 9-Methylguanine : Evidence for Hydration Structures Involving the Sugar Group2009

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa, S. Urashima, H. Asami
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.A. 113

      ページ: 3455-3462

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydration structures of 2'-deoxyguanosine studied by IR-UV double resonance spectroscopy : Comparison with guanosine2009

    • 著者名/発表者名
      H.Asami, S.Urashima, H.Saigusa
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics 11

      ページ: 10466-10472

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] IR-UV double resonance spectroscopy of the hydrated clusters of guanosine and 9-methylguanine : Evidence for hydration structures involving the sugar group2009

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa, S.Urashima, H.Asami
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A 113

      ページ: 3455-3462

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] IR-UV double resonance spectroscopy of the hydrated clusters of guanosine and 9-methylguanine : Evidence for hydration structures involving the sugar group2009

    • 著者名/発表者名
      H. Saigusa, S. Urashima, H. Asami
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A 113

      ページ: 3455-3462

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ultraviolet Spectroscopy and Theoretical Investigations of Mono-and Dihydrated Clusters of the Guanine Nucleosides. Different Hydration Structures for Guanosine and 2'-Deoxyguanosine2008

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa, N. Mizuno, H. Asami, K. Takahashi, M. Tachikawa
    • 雑誌名

      Bull.Chem.Soc.Jpn. 81

      ページ: 1274-1281

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ultraviolet spectroscopy and theoretical calculations of mono- and dihydrated clusters of the guanine nucleosides : Possibility of different hydration structures for guanosine and 2'-deoxyguanosine2008

    • 著者名/発表者名
      H. Saigusa, N. Mizuno, H. Asami, K. Takahashi, M. Tachikawa
    • 雑誌名

      Bulletin of Chemical Society of Japan 81

      ページ: 1274-1281

    • NAID

      10024330971

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Conformational analysis of the guanine nucleosides based on ab initio anharmonic vibrational calculation2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, H.Asami, H.Saigusa, K.Yagi
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (865220)[日本化学会のハイライト講演に採択]
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii
    • 年月日
      2010-12-18
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Effects of hydration on the base pair structures of guanine-Stacked vs. planar base pairing2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, H.Asami, H.Saigusa
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (872314)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Radiationless decay of thymine and uracil : Difference in lifetimes between the two systems2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, Y.Ito, A. Yamaguchi, S. Koseki, Y. Fujimura, H. Kono, N.Shimakura, H.Saigusa
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (656)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Effects of hydration on the base pair structures of guanine-Stacked vs.planar base pairing2010

    • 著者名/発表者名
      H.Asami, H.Saigusa
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (872314)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawai
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Conformational analysis of the guanine nucleosides based on ab initio anharmonic vibrational calculation2010

    • 著者名/発表者名
      H.Asami, H.Saigusa, K.Yagi
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (865220)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawai
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Microhydration of the guanine nucleosides and base pairs2010

    • 著者名/発表者名
      Contributed talk, H.Saigusa
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (842124)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii
    • 年月日
      2010-12-16
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Microhydration of the guanine nucleosides and base pairs2010

    • 著者名/発表者名
      H.Saigusa
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress (842124)
    • 発表場所
      Honolulu, Hawai
    • 年月日
      2010-12-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 不揮発性分子のレーザー蒸発/レーザー分光の装置開発2010

    • 著者名/発表者名
      吉川竜一, 片桐勇志, 江幡孝之, 井口佳哉, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(4A16)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 揮発性分子のレーザー蒸発/レーザー分光の装置開発2010

    • 著者名/発表者名
      吉川竜一, 片桐勇志, 江幡孝之, 井口佳哉, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(4A16)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] グアニンヌクレオチドのリン酸基エステル化による非破壊的気化と赤外振動分光2010

    • 著者名/発表者名
      浅見祐也, 元田彩香, 塚本眞幸, 早川芳宏, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(3A01)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 赤外-紫外二重共鳴分光法によるグアニン-シトシン及びグアニン-グアニン塩基対の微細水和構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      浦島周平, 浅見祐也, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(3A02)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 9-メチルグアニン一水和物の電子状態とその性質2010

    • 著者名/発表者名
      伊藤悠太, 浅見祐也, 三枝洋之, 小関史朗, 河野裕彦, 島倉紀之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(3P097)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 9-メチルグアニン-水和物の電子状態とその性質2010

    • 著者名/発表者名
      伊藤悠太, 浅見祐也, 三枝洋之, 小関史朗, 河野裕彦, 島倉紀之
    • 学会等名
      分子科学討論会2010(3P097)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Microscopic hydration of guanine nucleosides and base pairs2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, H.Saigusa
    • 学会等名
      The 2010 Molecular and Ionic Clusters Conference
    • 発表場所
      Niigata, Japan
    • 年月日
      2010-09-07
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Intact laser desorption of guanosine 5'-monophosphate facilitated by the phosphoesterification : Conformational analysis by infrared vibrational spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, H.Asami, A.Motoda, M.Tsukamoto, Y.Hayakawa, H.Saigusa
    • 学会等名
      The 2010 Molecular and Ionic Clusters Conference
    • 発表場所
      Niigata, Japan
    • 年月日
      2010-09-07
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Infrared Spectra of Hydrated Clusters of Guanine Nucleosides Observed by IR-UV Double Resonance Spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Oral, S.Urashima, H.Asami, H.Saigusa
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Spectroscopy 65th Meeting (TB05)
    • 発表場所
      Columbus, Ohio
    • 年月日
      2010-06-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Infrared Spectra of Hydrated Clusters of Guanine Nucleossides Observed by IR-UV Double Resonance Spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      S.Urashima, H., Asami, H.Saigusa
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Spectroscopy 65th Meeting (TB05)
    • 発表場所
      Columbus, Ohio
    • 年月日
      2010-06-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Microscopic hydration structure of biological molecules-In connection with their functions2010

    • 著者名/発表者名
      Invited talk, H.Saigusa
    • 学会等名
      Symposium on Hydration Dynamics and Molecular Processes
    • 発表場所
      Riken, Japan
    • 年月日
      2010-03-16
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Non-destructive vaporization of GMP enabled by the phosphoesterification : Conformational preference in the gas phase2010

    • 著者名/発表者名
      Poster, H.Asami, A.Motoda, M.Tsukamoto, Y.Hayakawa, H.Saigusa
    • 学会等名
      37th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA塩基グアニンの電子励起ダイナミクスに及ぼす水和の影響2009

    • 著者名/発表者名
      浅見祐也, 浦島周平, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2009(4P010)
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-24
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA塩基グアニンの電子励起ダイナミクスに及ぼす水和の影響2009

    • 著者名/発表者名
      浅見裕也, 浦島周平, 三枝洋之
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] レーザー蒸発/真空紫外イオン化を用いた不揮発分の質量分析法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      吉川竜一, 江幡孝之, 井口佳哉, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2009(2P017)
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 赤外振動スペクトルとab initio非調和振動計算によるグアニンヌクレオシドの構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      浅見祐也, 三枝洋之, 八木清
    • 学会等名
      分子科学討論会2009(1A18)
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-21
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 紫外-赤外二重共鳴法による2'-デオキシグアノシンの微細水和構造の決定:グアノシンとの比較2009

    • 著者名/発表者名
      浦島周平, 浅見祐也, 三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2009(1A19)
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-21
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 赤外振動スペクトルと ab initio 非調和振動計算によるグアニンヌクレオシドの構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      浅見祐也, 三枝洋之, 八木清
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 紫外-赤外二重共鳴法による2'-デオキシグアノシンの微細水和構造の決定 : グアノシンとの比較2009

    • 著者名/発表者名
      浦島周平, 浅見祐也, 三枝洋之
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Intact vaporization of biological molecules by laser desorption and its applications to laser spectroscopic studies2009

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 学会等名
      特定領域「高次系分子科学」国際シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学(大岡山)
    • 年月日
      2009-06-05
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Excited-state dynamics of nucleic acid bases-Bright and dark sides2009

    • 著者名/発表者名
      Contributed talk, H.Saigusa
    • 学会等名
      25^<th> Conference on Chemical Reaction Dynamics(2E09)
    • 発表場所
      Ohmiya, Japan
    • 年月日
      2009-06-02
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Excited-state dynamics of nucleic acid bases -Bright and dark sides (Invited talk)2009

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 学会等名
      第25回化学反応討論会
    • 発表場所
      大宮ソニックシティ
    • 年月日
      2009-06-02
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] グアニンヌクレオシド水和クラスターの電子スペクトルにみられる異性体構造2008

    • 著者名/発表者名
      浅見裕也、浦島周平、三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2008(3B02)
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-26
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 4つの核酸塩基ヌクレオシドに対する安定水和構造の比較2008

    • 著者名/発表者名
      浦島周平、浅見裕也、三枝洋之
    • 学会等名
      分子科学討論会2008(1P061)
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-26
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] グアニンヌクレオシド水和クラスターの電子スペクトルにみられる異性体構造2008

    • 著者名/発表者名
      浅見裕也, 浦島周平, 三枝洋之
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 4つの核酸塩基ヌクレオシドに対する安定水和構造の比較2008

    • 著者名/発表者名
      浦島周平, 浅見裕也, 三枝洋之
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 核酸塩基ヌクレオシドの微視的水和構造の理論的解明2008

    • 著者名/発表者名
      浅見裕也、浦島周平、三枝洋之
    • 学会等名
      理論化学討論会2008(1P26)
    • 発表場所
      慶応大学
    • 年月日
      2008-05-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 核酸塩基ヌクレオシドの微視的水和構造の理論的解明2008

    • 著者名/発表者名
      浅見裕也, 浦島周平, 三枝洋之
    • 学会等名
      第11回理論化学討論会
    • 発表場所
      慶応大学
    • 年月日
      2008-05-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 生体分子及びそのクラスターのレーザー脱離-超音速分子線分光2008

    • 著者名/発表者名
      三枝洋之
    • 学会等名
      第8回分子分光研究会
    • 発表場所
      神戸大学(招待講演)
    • 年月日
      2008-05-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 生体分子及びそのクラスターのレーザー脱離-超音速分子線分光2008

    • 著者名/発表者名
      三枝 洋之
    • 学会等名
      第8回分子分光研究会(招待講演)
    • 発表場所
      神戸大学
    • 年月日
      2008-05-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://laser.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://laser.sci.yokoharna-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://laser.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://laser.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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