T細胞分化機構の構造生物学的研究

• 研究課題/領域番号: 20370040
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 池水 信二 熊本大学, 大学院・生命科学研究部, 准教授 (60333522)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 20,670千円 (直接経費: 15,900千円、間接経費: 4,770千円); 2010年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2009年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円); 2008年度: 9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
• キーワード: X線結晶解析 / サイトカイン / サイトカイン受容体複合体 / 分子認識機構 / 免疫 / 分化 / 構造生物学 / 分子認識 / 受容体

研究概要

T細胞は抗原の刺激に応じて抗原に適したサブセットに分化することにより,適正な免疫応答を誘導する.T細胞分化・制御に関わるIL-23およびIL-27とこれらの受容体の認識機構の解明を構造生物学的に行うため,IL-23,IL-27およびこれらの受容体を大腸菌またはHEK293T細胞を用いて発現させた後,精製・結晶化を行った.IL-23については,X線を用いた解説実験を行い,その結晶構造を解析した.

研究成果

• [雑誌論文] Rigid-body ligand recognition drives cytotoxic T-lymphocyte antigen 4 (CTLA-4) receptor triggering. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yu, C., Sonnen, A.F.-P., George, R., Dessailly, B.H., Stagg, L.J., Evans, E.J., Orengo, C.A., Stuart, D.I., Ladbury, J.E., Ikemizu, S., Gilbert, R.J.C., Davis, S.J.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 286 ページ: 6685-6696
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rigid-body ligand recognition drives cytotoxic T-lymphocyte antigen 4 (CTLA-4) receptor triggering. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yu, C., Sonnen, A.F.-P., George, R., Dessailly, B.H., Stagg, L.J., Evans, E.J., Orengo, C.A., Stuart, D.I., Ladbury, J.E., Ikemizu, S., Gilbert, R.J.C., Davis, S.J.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 巻: 286 ページ: 6686-6696
  • 査読あり
• [雑誌論文] The crystal structure of green tea polyphenol(-) -epigallocatechingallate (EGCG)-transthyretin complex reveals novel binding site distinct from thyroxine binding site (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyata, M., Sato, T., Kugimiya, M., Sho, M., Nakamura, T., Ikemizu, S., Chirifu, M., Mizuguchi, M., Nabeshima, Y., Suwa, Y., Morioka, H., Arimori, T., Suico, M. A., Shuto, T., Sako, Y., Momohara, M., Koga, T., Morino-Koga, S., Yamagata, Y., Kai, H.
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 6104-6114
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the Glutamic Acid 54 Residue in Transthyretin Stability and Thyroxine Binding (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyata M, Sato T, Mizuguchi M, Nakamura T, Ikemizu S, Nabeshima Y, Susuki S, Suwa Y, Morioka H, Ando Y, Suico MA, Shuto T, Koga T, Yamagata Y, Kai H.
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 114-123
  • 査読あり
• [雑誌論文] Creation of lysine-deficient mutant lymphotoxin-alpha with receptor selectivity by using a phage display system (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshioka, Y., Watanabe, H., Morishige, T., Yao, X., Ikemizu, S., Nagao, C., Ahmad, S., Mizuguchi, K., Tsunoda, S., Tsutsumi, Y., Mukai, Y., Okada, N., Nakagawa, S.
  • 雑誌名: Biomaterials 31 ページ: 1935-1943
  • 査読あり
• [雑誌論文] The crystal structure of green tea polyphenol(-)-epigallocatechingallate (EGCG)-transthyretin complex reveals novel binding site distinct from thyroxine binding site (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyata, M., Sato, T., Kugimiya, M., Sho, M., Nakamura, T., Ikemizu, S., Chirifu, M., Mizuguchi, M., Nabeshima, Y., Suwa, Y., Morioka, H., Arimori, T., Suico, M.A., Shuto, T., Sako, Y., Momohara, M., Koga, T., Morino-Koga, S., Yamagata, Y., Kai, H.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 49 ページ: 6014-6114
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2010)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美, 池水信二
  • 雑誌名: 関節リウマチ(日本臨牀社) ページ: 145-148
• [雑誌論文] Structure-Function Relationship of Tumor Necrosis Factor (TNF) and Its Receptor Interaction Based on 3D Structural Analysis of a Fully Active TNFR1-Selective TNF Mutant. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mukai, Y., Shibata, H., Nakamura, T., Yoshioka, Y., Abe, Y., Nomura, T., Taniai, M., Ohta, T., Ikemizu, S., Nakagawa, S., Tsunoda, S., Kamada, H., Yamagata, Y., Tsutsumi, Y.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 285 ページ: 1221-1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-Function Relationship of Tumor Necrosis Factor(TNF)and Its Receptor Interaction Based on 3D Structural Analysis of a Fully Active TNFR1-Selective TNF Mutant (2009)
  • 著者名/発表者名: Mukai, Y., Shibata, H., Nakamura, T., Yoshioka, Y., Abe, Y., Nomura, T., Taniai, M., Ohta, T., Ikemizu, S., Nakagawa, S., Tsunoda, S., Kamada, H., Yamagata, Y., Tsutsumi, Y.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 285 ページ: 1221-1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Strue七ure-Function Relationship of Tumor Necrosis Factor (TNF) and Its Receptor Interaction Based on 3D structural Analysis of a Fully Active TNFR1-Selective TNF Mutant. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mukai, Y., et al.
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 285 ページ: 1221-1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the conformational change in the C-terminus of b2-microglobulin in dialysis- related amyloidosis (2008)
  • 著者名/発表者名: Kim, J., Motomiya, Y., Ueda, M, Nakamura, M., Misumi, Y., Saito, S., Ikemizu, S., Misumi, S., Ota, K., Shinriki, S., Kai, H., Ando, Y.
  • 雑誌名: Ann.Clin.Biochem. 45 ページ: 489-495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preparation, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the DNA-binding domain of the Ets transcription factor in complex with target DNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Suwa, Y., Nakamura, T., Toma, S., Ikemizu, S., Kai, H., Yamagata, Y.
  • 雑誌名: Acta Crysatllogr. F64 ページ: 171-174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preparation, crystallization and preliminary x-ray diffraction analysis of the DNA-binding domain of the Ets transcription factor in complex with target DNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Suwa, Y., et al.
  • 雑誌名: Acta Crysatllogr. F64 ページ: 171-174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the conformattional change in the C-terminus of β2-microglobulin in dialysis-related amyloidosis (2008)
  • 著者名/発表者名: Kim, J., et al.
  • 雑誌名: Ann. Clin. Biochem. 45 ページ: 489-495
  • 査読あり
• [学会発表] 補助刺激分子の構造生物学的研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 第34回阿蘇シンポジウム
  • 発表場所: 阿蘇リゾートグランヴィリオホテル
• [学会発表] Crystal Structure of the Glycosylated Form of Interleukin-23 (2010)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M.
  • 学会等名: 3^<rd> International Symposium on Diffraction Structural Biology
  • 発表場所: University Paris-Sud Orsay-France
• [学会発表] Structural and NMR analyses revealed unexpected mechanisms of substrate recognition and catalysis by house-cleaning enzymes (2010)
  • 著者名/発表者名: Arimori, T.
  • 学会等名: The BSR and MASR meetings, Melbourne Convention & Exhibition Centre
  • 発表場所: Melbourne, Australia
• [学会発表] Crystal Structure of the Glycosylated Form of Interleukin-23 (2010)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M., Hayashi, C., Nakamura, T., Yamagata, Y., Ikemizu, S.
  • 学会等名: 3^<rd> International Symposium on Diffraction Structural Biology
  • 発表場所: Orsay-France
• [学会発表] Structural and NMR analyses revealed unexpected mechanisms of substrate recognition and catalysis by house-cleaning enzymes (2010)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 玉置春彦, 紙谷浩之, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: The BSR and MASR meetings
  • 発表場所: Melbourne, Australia
• [学会発表] ヌクレオシド2リン酸から1リン酸に加水分解する酵素の反応リン酸部位が基質により異なる不思議とその構造的基盤の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 玉置春彦, 紙谷浩之, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 日本薬学会第130回年会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] 機能未知ヒト一回膜貫通型タンパク質のC末ドメインの立体構造に基づく機能解明の試み(1) (2010)
  • 著者名/発表者名: 石田智愛, 中村照也, 新堀晶子, 古賀由香里, 池水信二, 甲斐広文, 谷時雄, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 第26回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば
• [学会発表] IL15およびIL-23の構造生物学的研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会 ワークショップ「サイトカイン制御因子による多様な生体調節」
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] Mechanistic insight into hydrolysis of oxidized purine nucleotide diphosphates by human NUDT5 (2009)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 玉置春彦, 紙谷浩之, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 2009 Advanced Science Research Symposium at Fukuoka Dental College
  • 発表場所: Fukuoka
  • 年月日: 2009-12-07
• [学会発表] 「サイトカイン制御因子による多様な生体調節」,「IL15およびIL-23の構造生物学的研究」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会ワークショップ
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] トランスサイレチンGlu54変異体の結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 宮田将徳
  • 学会等名: 日本薬学会第129回年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館
• [学会発表] hMTH1による8-oxo-dGTPの基質認識と加水分解反応機構の構造学的基盤 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲里みゆき
  • 学会等名: 次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF2009)
  • 発表場所: 高槻市,大阪薬科大学
• [学会発表] 酸化損傷ヌクレオチド加水分解酵素hMTH1の超高分解能結晶の作製と時間分割構造解析による反応過程の追跡 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲里みゆき, 中村照也, 池水信二, 中別府雄作, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 第26回薬学会九州支部大会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 細胞内浄化酵素ヒトNUDT5の幅広い基質特異性発現機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 玉置春彦, 紙谷浩之, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 第26回薬学会九州支部大会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] IL-23の結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美・林千陽・中村照也・山縣ゆり子・池水信二
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] ヌクレオシド2リン酸を1リン酸へ加水分解する酵素が異なるリン酸部と反応する不思議とその構造基盤 (2009)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 玉置春彦, 紙谷浩之, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] ヒトNUDT5蛋白質は様々な酸化デオキシリボヌクレオシド二リン酸を分解する (2009)
  • 著者名/発表者名: 石田智愛, 中村照也, 新堀晶子, 池水信二, 甲斐広文, 谷時雄, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子構造」第5回ワークショップ
  • 発表場所: 湘南
• [学会発表] IL-23の結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美・林千陽・中村照也・山縣ゆり子・池水信二
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子構造」第5回ワークショップ
  • 発表場所: 湘南
• [学会発表] 酸化損傷ヌクレオチド加水分解酵素と新規基質の複合体結晶構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 有森貴夫, 紙谷浩之, 玉置春彦, 中村照也, 池水信二, 石橋徹, 原島秀吉, 関口睦夫, 山縣ゆり子
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] インターロイキン23のX線結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美・林千陽・中村照也・山縣ゆり子・池水信二
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] IL15とIL-15Raの分子認識機構の構造生物学的基盤 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: BMB2008シンポジウム「シグナル伝達タンパク質の分子認識機構研究の新展開」
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] IL15-IL-15Ra複合体の構造生物学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 平成20年度日本イン-ターフェロン・サイトカイン学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2008-07-12
• [学会発表] 免疫蛋白質の分子認識機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 第5回動脈硬化フォーラム
  • 発表場所: 佐賀
  • 年月日: 2008-04-28
• [学会発表] 「シグナル伝達タンパク質の分子認識機構研究の新展開」,「IL15とIL-15Raの分子認識機構の構造生物学的基盤」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: BMB2008シンポジウム
  • 発表場所: 神戸市,神戸国際会議場
• [学会発表] IL-15/IL-15Rα複合体の構造生物学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美
  • 学会等名: 日本バイオイメージング学会 平成20年度年会
  • 発表場所: 千葉市,千葉大学けやき会館
• [学会発表] IL15-IL-15Ra複合体の構造生物学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二
  • 学会等名: 平成20年度日本インーターフェロン・サイトカイン学会(奨励賞受賞講演)
  • 発表場所: 札幌市,北海道大学百年記念会館
• [学会発表] Structural basis for the molecular recognition between IL-15 and its private receptor IL-15R・ (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M.
  • 学会等名: ISICR 2008
  • 発表場所: Fairmont Queen Elizabeth Hote, Montreal
• [学会発表] Structural studies of IL-15/IL-15Rα complex (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M.
  • 学会等名: International Conference On Structural Genomics Oxford 2008
  • 発表場所: the University of Oxford Examination School, Oxford
• [学会発表] Structural studies of IL-15/IL-15Rα complex (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: Grand Cube Osaka, Osaka
• [学会発表] Structural basis for transcriptional regulation mechanisms by the transcription factor Ets2 (2008)
  • 著者名/発表者名: Suwa, Y.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography(IUCr2008)
  • 発表場所: Grand Cube Osaka, Osaka
• [学会発表] High resolution X-ray diffraction study of the hMTH1 mutant (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, T.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: Grand Cube Osaka, Osaka
• [学会発表] Purification and crystallization of C-terminal domain of a human single-pass transmembrane protein (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishida, C.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: Grand Cube Osaka, Osaka
• [学会発表] Structural insights into the substrate recognition and hydrolysis reaction mechanisms of 8-oxo-dGDPase (2008)
  • 著者名/発表者名: Arimori, T.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: Grand Cube Osaka, Osaka
• [学会発表] Structural basis for the molecular recognition between IL-15 and its private receptor IL-15Ra (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M., et al.
  • 学会等名: ISICR 2008
  • 発表場所: Montreal, Canada
• [学会発表] Structural studies of IL-15/IL-15Rα complex (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M., et al.
  • 学会等名: International Conference On Structural Genomics Oxford 2008
  • 発表場所: Oxford, UK
• [学会発表] Structural studies of IL-15/IL-15Rα complex (2008)
  • 著者名/発表者名: Chirifu, M., et al.
  • 学会等名: The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: Osaka, Japan
• [学会発表] ILL-15/IL-15Rα複合体の構造生物学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美ら
  • 学会等名: 日本バイオイメージング学会 平成20年度年会
  • 発表場所: 千葉
• [図書] 日本臨牀 関節リウマチ(第2版) (2010)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美, 池水信二
  • 出版者: 日本臨牀社
• [図書] 関節リウマチ(第2版) 寛解を目指す治療の新時代 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池鯉鮒麻美, 池水信二
  • 出版者: 日本臨林社
• [図書] 臨床薬理の進歩、28 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池水信二, 他
  • 出版者: 臨床薬理研究振興財団