転写・RNAプロセシング・輸送の機能的連携と統合による遺伝子発現調節機構の解明

• 研究課題/領域番号: 20370070
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 谷 時雄 熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 教授 (80197516)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 20,280千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 4,680千円); 2010年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円); 2009年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円); 2008年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: スプライシング / 転写 / mRNA輸送 / 分裂酵母 / 遺伝子発現制御 / RNAプロセシング / 核 / mRNA3'末形成 / mRNA 3'末形成 / 翻訳 / 核膜孔複合体

研究概要

遺伝子の転写・pre-mRNAスプライシング・mRNA核外輸送など、従来は個別に研究されてきた諸反応が、生体内では互いに連携もしくは共役しながら進行していることが近年明らかになりつつある。しかし、その分子機構には未だ謎が多いのが現状である。本研究において、スプライシングやmRNA核外輸送の分裂酵母変異株の原因遺伝子の機能及び相互作用解析を行い、真核生物における遺伝子発現を統合的に制御する機構の一部を解明した。

研究成果

• [雑誌論文] A novel ER J-protein DNAJB12 accelerates ER-associated degradation of membrane proteins including CFTR. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yo-hei Yamamoto, Taiji Kimura, Shuku Momohara, Masato Takeuchi, Tokio Tani, Yukio Kimata, Hiroshi Kadokura, Kenji Kohno.
  • 雑誌名: Cell Structure and Function 35 ページ: 107-116
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of the spliceosomal U4 snRNA in heterochromatic gene silencing at fission yeast centromeres. (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen, Misato Morita, Kazuhiro Fukumura, Tokio Tani.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 285 ページ: 5630-5638
  • 査読あり
• [雑誌論文] Critical role of Pcid2 in B cell survival through the regulation of MAD2 expression. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teruo Nakaya, Kazuhiko Kuwahara, Kazutaka Ohta, Masahiro Kitabatake, Teppei Toda, Naoki Takeda, Tokio Tani, Eisaku Kondo, Nobuo Sakaguchi.
  • 雑誌名: J.Immunol. 185 ページ: 5180-5187
  • 査読あり
• [雑誌論文] Critical role of Pcid2 in B cell survival through the regulation of MAD2 expression (2010)
  • 著者名/発表者名: Teruo Nakaya
  • 雑誌名: J.Immunology 巻: 185 ページ: 5180-5187
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel ER J-protein DNAJB12 accelerates ER-associated degradation of membrane proteins including CFTR (2010)
  • 著者名/発表者名: Yo-hei Yamamoto
  • 雑誌名: Cell Structure and Function 巻: 35 ページ: 107-116
  • 査読あり
• [雑誌論文] Real time monitoring of endgenous cytoplasmic mRNA usinglinear 2'-O-methyl RNA probes in living cells. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohki Okabe
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 39(オンライン)
  • 査読あり
• [雑誌論文] EGD1(β-NAC)mRNA is localized in a novel cytoplasmic granule in Saccharomyces cerevisiae (2010)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 16 ページ: 316-329
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of the spliceosomal U4 small nuclear RNA in heterochromatic gene silencing at fission yeast centromeres (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 285 ページ: 5630-5638
  • 査読あり
• [雑誌論文] RAD18 promotes DNA double-strand break repair during G1 phase through chromatin retention of 53BP1. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kenji Watanabe, Kuniyoshi Iwabuchi, Jinghua Sun, Yuri Tsuji, Tokio Tani, Kazuaki Tokunaga, Takayasu Date, Mitsumasa Hashimoto, Masaru Yamaizumi, Satoshi Tateishi.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 2176-2193
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分裂酵母における構成的スプライシング制御機構の分子遺伝学的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 原口典子、谷時雄
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 増刊号「mRNAプログラム」 54(16) ページ: 2038-2043
• [雑誌論文] 酵母の遺伝学的解析から見えてきたmRNA核外輸送の素過程と連携 (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 増刊号「mRNAプログラム」 54(16) ページ: 2102-2108
• [雑誌論文] mRNAのスプライシングと核外輸送のダイナミクス (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 雑誌名: 実験医学 27 ページ: 131-138
• [雑誌論文] RAD18 promotes DNA double-strand break repair during G1 phase through chromatin retention of 53BP1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Kenji Watanabe
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 37 ページ: 2176-2193
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分裂酵母における構成的スプライシング制御機構の分子遺伝学的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 原口典子
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 54 ページ: 2038-2043
• [雑誌論文] 酵母の遺伝学的解析から見えてきたmRNA核外輸送の素過程と連携 (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷時雄
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 54 ページ: 2102-2108
• [雑誌論文] Monitoring of mRNA export. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kazuaki Tokunaga, Tokio Tani.
  • 雑誌名: Current Protocols in Cell Biology Chapter 22, Unit 22-13 ページ: 1-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] S1-1 nuclear domains : characterization and dynamics as a function of transcriptional activity. (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira Inoue, Katsuji Tsugawa, Kazuaki Tokunaga, KeniChiP. Takahashi, Shigehiko Uni, Masatsugu Kimura, Koji Nishio, Naoki Yamamoto, Ken-ichi Honda, Takanori Watanabe, Hideo Yamane, Tokio Tani.
  • 雑誌名: Biology of the Cell 100 ページ: 523-535
  • 査読あり
• [雑誌論文] The dynamics of pre-mRNAs and poly (A)^+ RNA at speckles in living cells revealed by iFRAP studies. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yo Ishihama, Hisashi Tadakuma, Tokio Tani, Takashi Funatsu.
  • 雑誌名: Exp.Cell Res. 314 ページ: 748-762
  • 査読あり
• [雑誌論文] Monitoring of mRNA export (2008)
  • 著者名/発表者名: Kazuaki Tokunaga
  • 雑誌名: Current Protocols in Cell Biology 3
  • 査読あり
• [雑誌論文] S1-1 nuclear domains : characterization and dynamics as a function of transcriptional activity (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira Inoue
  • 雑誌名: Biology of the cell 100 ページ: 523-535
  • 査読あり
• [学会発表] RNAi機構を介したセントロメアヘテロクロマチン形成への分裂酵母基本転写因子複合体TFIIH構成因子Ptr8pの関与 (2010)
  • 著者名/発表者名: 水谷文哉
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] バイオプローブを用いた核スペックルの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 核スペックルへのpoly(A)^+RNA局在に影響を与える化合物のスクリーニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 三原由揮
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 分裂酵母RNA結合タンパク質spRNPS1の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大越慶太
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] RNAi機構を介したセントロメアヘテロクロマチン形成への分裂酵母基本転写因子複合体TFIIH構成因子Ptr8pの関与 (2010)
  • 著者名/発表者名: 水谷文哉
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] バイオプローブを用いた核スペックルの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 分裂酵母RNA結合タンパク質spRNPS1の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大越慶太
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 核スペックルへのpoly(A)+RNA局在に影響を与える化合物のスクリーニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 三原由揮
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 膜結合タンパク質Ptr10pはTREX-2複合体を介してmRNA核外輸送に関与する (2010)
  • 著者名/発表者名: 齋藤希
  • 学会等名: 第12回日本RNAミーティング
  • 発表場所: 学術総合センター
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] 膜結合タンパク質Ptr10pはTREX-2複合体を介してmRNA核外輸送に関与する (2010)
  • 著者名/発表者名: 齋藤希
  • 学会等名: 第12回日本RNAミーティング
  • 発表場所: 一橋記念講堂(東京)
  • 年月日: 2010-07-27
• [学会発表] Involvement of the splicing machinery in heterochrom atic gene silencing at fission ye ast centromere (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 発表場所: 米国Salve Regina University
  • 年月日: 2010-07-18
• [学会発表] EGD1 (β-NAC) mRNA localizes in a novel cytoplasmic structure in Saccharomyces cere visiae (2010)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 発表場所: 米国Salve Regina University
  • 年月日: 2010-07-18
• [学会発表] Involvement of the splicing machinery in heterochromatic gene silencing at fission yeast centromere (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 発表場所: Newport, USA
  • 年月日: 2010-07-18
• [学会発表] EGD1 (β-NAC) mRNA localizes in a novel cytoplasmic structure in Saccharomyces cerevisiae (2010)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 発表場所: Newport, USA
  • 年月日: 2010-07-18
• [学会発表] 分裂酵母スプライシング変異株が示すセントロメアヘテロクロマチン形成異常 (2010)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺
  • 年月日: 2010-05-27
• [学会発表] 分裂酵母スプライシング変異株が示すセントロメアヘテロクロマチン形成異常 (2010)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺(伊豆市)
  • 年月日: 2010-05-27
• [学会発表] 核内構造体(核スペックル)形成阻害化合物のスクリーニングと転写後遺伝子発現制御機構解析への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 慶應義塾大学
  • 年月日: 2010-05-18
• [学会発表] 核内構造体(核スペックル)形成阻害化合物のスクリーニングと転写後遺伝子発現制御機構解析への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 慶應義塾大学協生館(東京)
  • 年月日: 2010-05-18
• [学会発表] Localization of EGD1 (β-NAC) mRNAs in a cytoplasmic aggresome-like granule in S.cerevisiae (2010)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 理化学研究所
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] Involvement of the spliceosomal U4 snRNA in heterochromatic gene silencing at fission yeast centromeres (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 理化学研究所
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] Membrane-bound Protein Ptr10p is Involved in the Nuclear mRNA Export Through the TREX2 Complex in Fission Yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozomi Saitoh
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 理化学研究所
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] Localization of EGD1(β-NAC)mRNAs in a cytoplasmic aggresome-like granule in S.cerevisiae (2010)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] Involvement of the spliceosomal U4 snRNA in hetero-chromatic gene silencing at fission yeast centromeres (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] Membrane-bound Protein Ptr10p is Involved in the Nuclear mRNA Export Through the TREX2 Complex in Fission Yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozomi Saitoh
  • 学会等名: 第19回CDBミーティング
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-05-10
• [学会発表] 分裂酵母スプライシング因子Prp14pはRNAiを介したヘテロクロマチン形成に必要である (2009)
  • 著者名/発表者名: 森田京
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] 分裂酵母スプライシング因子Prp14pはRNAiを介したヘテロクロマチン形成に必要である (2009)
  • 著者名/発表者名: 森田京
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] A mutation in U4 snRNA causes defective centromeric silencing in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: National Olympics Memorial Youth Center
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] Functional a nalysis of the ptr5^+/nup85^+ gene involvedin nuclear mRNA export (2009)
  • 著者名/発表者名: Nobuyoshi Watanabe
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: National Olympics Memorial Youth Center
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] Involvement of the pre-mRNA splicing machinery in the RNAi-mediatedheterochromatic silencing in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: Tokio Tani
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: National Olympics Memorial Youth Center
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] A mutation in U4 snRNA causes defective centromeric silencing in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] Functional analysis of the ptr5^+/nup85^+ gene involved in nuclear mRNA export (2009)
  • 著者名/発表者名: Nobuyoshi Watanabe
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] Involvement of the pre-mRNA splicing machinery in the RNAi-mediated heterochromatic silencing in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: Tokio Tani
  • 学会等名: The 5^<th> fission yeast meeting
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] 分裂酵母U4snRNA変異株が示すセントロメアヘテロクロマチンの形成異常 (2009)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか
  • 学会等名: 第11回RNAミーティング
  • 発表場所: 新潟コンベンションセンター
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 分裂酵母U4snRNA変異株が示すセントロメアヘテロクロマチンの形成異常 (2009)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか
  • 学会等名: 第11回RNAミーティング
  • 発表場所: 新潟市
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] セントロメアヘテロクロマチン形成における分裂酵母スプライシング因子Prp14pの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森田京
  • 学会等名: 第8回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺
  • 年月日: 2009-06-18
• [学会発表] セントロメアヘテロクロマチン形成における分裂酵母スプライシング因子Prp14pの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森田京
  • 学会等名: 第8回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 伊豆市
  • 年月日: 2009-06-18
• [学会発表] mRNAの3'形成とmRNA核外輸送の連携 (2008)
  • 著者名/発表者名: 永目尚子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド国際会議場
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] mRNAの3'形成とmRNA核外輸送の連携 (2008)
  • 著者名/発表者名: 永目尚子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm
• [備考]
  • URL: http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm
• [備考]
  • URL: http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm
• [備考]
  • URL: http://aster.sci.kumamoto-u.ac.jp/~biohome/staff/tani/index.htm