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シアノバクテリアゲノムの日周適応ダイナミクス

研究課題

研究課題/領域番号 20370072
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関早稲田大学

研究代表者

岩崎 秀雄  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00324393)

研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
20,670千円 (直接経費: 15,900千円、間接経費: 4,770千円)
2010年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2009年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2008年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
キーワードシアノバクテリア / 概日リズム / 明暗応答 / 環境適応 / Synechococcus / 環境応答 / シグマ因子 / kai遺伝子 / マイクロアレイ
研究概要

シアノバクテリアの概日リズム,とくに転写翻訳に依存しない翻訳後振動子によるゲノムワイドな転写制御に関する解析を行った。連続明ではゲノム上の約1/3-1/2の遺伝子群に顕著な転写レベルの蓄積リズムが観られ,その位相分布,kai 依存性などを解析した。また,連続明では殆どの遺伝子の転写が劇的に低下し,プロテオームとトランスクリプトームの相関性に著しい乖離が生じること,ごく一部の遺伝子発現は暗期に活性化され,その多くはkai依存性がみられることなどを明らかにした。これらは,あらゆる生物種において,新規の概日遺伝子発現を欠く条件での初めての概日時計依存的転写調節の観察例である。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (40件) 図書 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] バイオメディア・アート:美学的見地から観た合成生物学の可能性2010

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 雑誌名

      科学(岩波)

      巻: 7月号 ページ: 747-754

    • NAID

      40017154497

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Cyanobacterial cell lineage analysis of the spatiotemporal hetR expression profile during heterocyst pattern formation in Anabaena sp. PCC 71202009

    • 著者名/発表者名
      H.Asai, S.Iwamori, K.Kawai, S.Ehira, J.Ishihara, K.Aihara, S.Shoji, H.Iwasaki
    • 雑誌名

      PLoS ONE 4(10)

    • NAID

      10029355077

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyanobacterial daily life with Kai-based circadian and diurnal genome-wide transcriptional control in Synechococcus elongatus2009

    • 著者名/発表者名
      H.Ito, M.Mutsuda, Y.Murayama, J.Tomita, N.Hosokawa, K.Terauchi, C.Sugita, M.Sugita, T.Kondo, H.Iwasaki
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106

      ページ: 14168-14173

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] クテリアの生物時計-システム解析と構成的アプローチ2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 雑誌名

      化学と生物 7月号

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Cyanobacterial daily life with Kai-based circadian and diurnal genome-wide transcriptional control in Synechococcus elongatus2009

    • 著者名/発表者名
      Ito, Mutsuda, Murayama, Tomita, Hosokawe, (4 authors), Iwasaki
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106

      ページ: 14168-14173

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyanobacterial Cell Lineage Analysis of the Spatiotemporal hetR Expression Profile during Heterocyst Pattern Formation in Anabaena sp.PCC 71202009

    • 著者名/発表者名
      Asai, Iwamori, Kawai, Ehira, Ishihara, Aihara, Shoji, Iwasaki
    • 雑誌名

      PLoS ONE 4

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] バクテリアの生物時計-システム解析と構成的アプローチ2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 雑誌名

      化学と生物 47(7)

      ページ: 493-498

    • NAID

      10026435977

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] An attempt to reveal a role of a transcription/translation feedback loop in the cyanobacterial KaiC protein-based circadian system by using a semi-synthetic method2008

    • 著者名/発表者名
      H.Tozaki, T.Kobe, K.Aihara, H.Iwasaki
    • 雑誌名

      Int.J.Bioinform.Res.Appl. 4

      ページ: 435-444

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteins found in a CikA-interaction assay link the circadian clock, metabolism, and cell division in Synechococcus elongatus2008

    • 著者名/発表者名
      S.R.Mackey, JS.Cho, Y.Kitayama, H.Iwasaki, G.Dong, S.S.Golden
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 190

      ページ: 3738-3746

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An attempt to reveal a role of a transoription/translation feedback loop in the oyanobaoterial KaiC protein-based circadian system by using a semi-synthetic method2008

    • 著者名/発表者名
      H. Tozaki, T. Kobe, K. Aihara, H. Iwasaki
    • 雑誌名

      Int. J. Bioinform. Res. Appl 4

      ページ: 435-444

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 概日リズムの低温限界2011

    • 著者名/発表者名
      陳墨淵, 村山依子, 伊藤浩史, 郡宏, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東北大学(大震災対応として大会成立承認済み)
    • 年月日
      2011-03-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリアAnabaena sp.PCC7120が刻む概日時計のシステムとは2011

    • 著者名/発表者名
      櫛笥博子, 久下沼秀之, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東北大学(大震災対応として大会成立承認済み)
    • 年月日
      2011-03-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアのゲノムワイドな概日発現リズムの振動機構の解明2011

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      東北学院大学(大震災対応として大会成立承認済み)(招待講演 受賞講演)
    • 年月日
      2011-03-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 絶対光要求性シアノバクテリアにおけるシグマ因子を介したエネルギー飢餓条件での概日転写リズムの発見:夜間の遺伝子発現制御メカニズムの解析2011

    • 著者名/発表者名
      細川徳宗, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      東北学院大学(大震災対応として大会成立承認済み)
    • 年月日
      2011-03-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 概日リズムの低温限界2011

    • 著者名/発表者名
      陳墨淵, 村山依子, 伊藤浩史, 郡宏, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      時間生物学フォーラム東京
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2011-02-12
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] From cyanobacteria to synthetic cells : their time, shape and art2010

    • 著者名/発表者名
      H.Iwasaki
    • 学会等名
      SymbioticA Symposium "Unruly Ecology : Biodiversity and Art"
    • 発表場所
      西オーストラリア大学 パース,オーストラリア(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 単細胞性シアノバクテリアにおけるシグマ因子の概日発現に関する解析2010

    • 著者名/発表者名
      小島崇, 細川徳宗, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2010-11-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリアAnabaenaにおける発光レポーターを用いた概日時計機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      久下沼秀之, 櫛笥博子, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2010-11-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリアのコロニー・パターン形成と振動運動2010

    • 著者名/発表者名
      深澤裕貴
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2010-11-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] バクテリアの時空間パターン形成の科学とアート2010

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      医科学研究所サイアート・カフェ
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-03-06
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 紙とバクテリアの対話について:バイオメディアを用いた科学とアートの現状と課題2010

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      第4回内部観測研究会
    • 発表場所
      東京理科大学
    • 年月日
      2010-03-05
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 単細胞性シアノバクテリアにおける光周的遺伝子発現について2010

    • 著者名/発表者名
      畠山哲央, 細川徳宗, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      時間生物学フォーラム東京
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-02-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] From cyanobacteria to synthetic cells : their time, shape and art2010

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      SymbioticA Symposium "Unruly Ecology : Biodiversity and Art"
    • 発表場所
      西オーストラリア大学,パース
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Expression of life in contemporary biomedia art : an alternative 'synthetic' approach2010

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      UK-Japan Synthetic Biology Workshop
    • 発表場所
      イギリス大使館
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Circadian transcription in the dark without cyclic kai gene expression II : Damped oscillation in expression of a dark-induced gene.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Hatakeyama, N.Hosokawa, H.Iwasaki
    • 学会等名
      Society for Research on Biological Rhythms (SRBR)
    • 発表場所
      アメリカ合衆国,フロリダ
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Circadian transcription in the dark without cyclic kai gene expression I : Clock-gating of dark-induced transcription in Synechococcus2010

    • 著者名/発表者名
      N.Hosokawa, T.Hatakeyama, H.Iwasaki
    • 学会等名
      Society for Research on Biological Rhythms (SRBR)
    • 発表場所
      アメリカ合衆国,フロリダ
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Global circadian transcription rhythms without robust kai-gene cycling in the heterocyst-forming multicellular cyanobacterium, Anabaena sp.PCC 71202010

    • 著者名/発表者名
      H.Kushige, M.Matsuoka, H.Kugenuma, H.Iwasaki
    • 学会等名
      Society for Research on Biological Rhythms (SRBR)
    • 発表場所
      アメリカ合衆国,フロリダ
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 原核生物の光周的遺伝子発現誘導の発見:kai 遺伝子の転写翻訳フィードバックを欠く暗期中でのシアノバクテリアの概日転写制御2009

    • 著者名/発表者名
      細川徳宗, 畠山哲央, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2009-10-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリア Anabaena sp.PCC 7120における概日リズム2009

    • 著者名/発表者名
      櫛笥博子, 久下沼正之, 松岡正城, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2009-10-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Photoperiodic gene expression in cyanobacteria : circadian gene expression in the dark without transcriptional feedback of kai genes2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      シンポジウム(神戸)
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Photoperiodic gene expression in cyanobacteria : circadian gene expression in the dark without transcriptional feedback of kai genes2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本生化学会シンポジウム
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの概日転写リズムに関する新知見2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      ラン藻ゲノム研究会
    • 年月日
      2009-07-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの概日転写リズムに関する新知見2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      藍藻ゲノム研究会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2009-07-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 体内時計から細胞創成へ?:構成生物学の社会・文化的含意について2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間学会創立シンポジウム
    • 発表場所
      山口大学
    • 年月日
      2009-06-13
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 体内時計から細胞創成へ?:構成生物学の社会・文化的含意について2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間学会
    • 発表場所
      山口大学
    • 年月日
      2009-06-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] マイクロ流体デバイスを使用した多細胞性シアノバクテリアのパターン形成の観察2009

    • 著者名/発表者名
      石原潤一, 川合健太郎, 庄子習一, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本発生生物学会
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2009-05-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] バイオリズム・ブームとは何だったのか:生命リズムの科学・文化誌2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      科学言説研究会
    • 発表場所
      工学院大学
    • 年月日
      2009-02-14
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 生命リズムのメタファーとイメジャリー2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      リズム現象の研究会IV
    • 発表場所
      お茶の水女子大学
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 生命リズムのメタファーとイメジヤリー2009

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      リズム現象の研究会IV
    • 発表場所
      お茶の水女子大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 単細胞性シアノバクテリアSynechococcus elongatusにおける暗誘導遺伝子群の解析2009

    • 著者名/発表者名
      畠山哲央, 細川徳宗, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      中央大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Systems and synthetic analysis toward understanding spatio-temporal pattern formations in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      Japan-France Plant Science Workshop
    • 発表場所
      Tsukuba
    • 年月日
      2008-10-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 環境適応に関わる周期的時空間パターンダイナミクス:シアノバクテリアを用いて2008

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      川村浩先生本間アショフ賞受賞記念シンポジウム
    • 発表場所
      三菱生命科学研究所
    • 年月日
      2008-04-18
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Spatio-temporal pattern formations in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      上原記念生命科学財団シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Systems Analyses on Cyanobacterial Spatio-Temporal Pattern Formations and Responses to Light-Dark Cycles2008

    • 著者名/発表者名
      岩崎秀雄
    • 学会等名
      AESF-EMBO Symposium
    • 発表場所
      (スペイン)招待講演を行った
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Spatio-temporal pattern formations in cyanobaoteria2008

    • 著者名/発表者名
      Hideo Iwasaki
    • 学会等名
      上原記念生命科学財団シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞性シアノバクテリアにおける空間パターン形成の解析2008

    • 著者名/発表者名
      岩森俊介, 浅井宏啓, 川合健太郎, 石原潤一, 庄子習一, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会1.0
    • 発表場所
      大阪大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリアの概日システムに関わる構成生物学的アプローチ2008

    • 著者名/発表者名
      唐牛恵理, 小部泰一郎, 青野大輔, 枝村一沙, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会1.0
    • 発表場所
      大阪大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Systems and synthetic analysis toward understanding spatio-temporal pattern formations in cyanobacteria2008

    • 著者名/発表者名
      Hideo Iwasaki
    • 学会等名
      日仏植物科学ワークショップ2008 “Genome-Wide Omics Analysis in Plant Sciences"
    • 発表場所
      筑波大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 暗期におけるシアノバクテリアの遺伝子発現制御解析2008

    • 著者名/発表者名
      細川徳宗一菊池欣之, 畠山哲央, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Anabaena sp. PCC 7120 における時計制御機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      松岡正城, 櫛笥博子, 岩崎秀雄
    • 学会等名
      日本時間生物学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] Systems Biology : The Challenge of Complexity (Eds. Nakanishi S., Kageyama R.,Watanabe D)(A posttranslational chemical circadian oscillator in cyanobacteria)2009

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki H
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [図書] Bacterial Circadian Programs (Eds. J. Ditty, S. Mackey, C.H. Johnson)(Factors involved in transcriptional output from the Kai-protein-based circadian oscillator)2009

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki H
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [図書] Systems Biology : The Challenge of Complexity(chapter : "A posttranslational chemical circadian oscillator in cyanobacteria")2009

    • 著者名/発表者名
      H.Iwasaki(Eds.Nakanishi, S., Kageyama, R., Watanabe, D)
    • 総ページ数
      246
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] Bacterial Circadian Programs2009

    • 著者名/発表者名
      H.Iwasaki(Eds.J.Ditty, S.Mackey, C.H.Johnson)
    • 総ページ数
      300
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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