シグナル依存的に制御される転写仲介因子の研究

• 研究課題/領域番号: 20370074
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 石井 俊輔 独立行政法人理化学研究所, 石井分子遺伝学研究室, 主任研究員 (00124785)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 20,410千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 4,710千円); 2010年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円); 2009年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円); 2008年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
• キーワード: コリプレッサー / コアクティベーター / アダプター / Ski / Shn-2 / ヒストンアセチル化 / 複合体 / ヒストンメチル化 / 転写抑制 / Sno

研究概要

コリプレッサーSkiの複合体がSmad2/3/4、ヒストンデアセチラーゼHDAC3、ヒストンアルギニンメチル化酵素PRMT5 を含むことを見出した。この結果は、Ski複合体が、Smad2/3/4を介して、TGF-βやBMP の標的遺伝子上に存在し、そのbasalレベルをHDAC3とPRMT5を介して、低く保っていることを示唆している。また転写アダプターShn-2が、T細胞分化過程において、アポトーシスを抑制することにより、細胞を生存させる役割を持つことが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Dampening of death pathways by Schnurri-2 is essential for T cell development (2011)
  • 著者名/発表者名: Staton TL, Lazarevic V, Jones DC, Lanser AJ, Takagi T, Ishii S, Glimcher LH
  • 雑誌名: Nature 472 ページ: 105-109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Schnurri-2 deficiency counteracts against bone loss induced by ovariectomy (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagao M, Saita Y, Hanyu R, Hemmi H, Notomi T, Hayata T, Nakamoto T, Kaneko K, Kurosawa H, Ishii S, Ezura Y, Noda M
  • 雑誌名: J Cell Physiol. 226 ページ: 573-578
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conditional knockdown of target gene expression by tetracycline regulated transcription of double strand RNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Hou X, Omi M, Harada H, Ishii S, Takahashi Y, Nakamura H
  • 雑誌名: Dev Growth Differ. 53 ページ: 69-75
  • NAID: 10027899337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Schnurri-2 deficiency counteracts against bone loss induced by ovariectomy. (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagao M, et al.
  • 雑誌名: J Cell Physiol 巻: 226 ページ: 573-578
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conditional knockdown of target gene expression by tetracycline regulated transcription of double strand RNA. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hou, X., et al.
  • 雑誌名: Dev Growth Differ. 巻: 53 ページ: 69-75
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dampening of death pathways by Schnurri-2 is essential for T cell development. (2011)
  • 著者名/発表者名: Staton, T.L., et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Social isolation stress induces ATF-7 phosphorylation and impairs silencing of the 5-HT 5B receptor gene (2010)
  • 著者名/発表者名: Maekawa T, Kim S, Nakai D, Makino C, Takagi T, Ogura H, Yamada K, Chatton B, Ishii S
  • 雑誌名: EMBO J. 29 ページ: 196-208
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of ATF-2 family transcription factors in adipocyte differentiation : anti-obesity effects of p38 inhibitors (2010)
  • 著者名/発表者名: Maekawa T, Jin W, Ishii S
  • 雑誌名: Mol.Cell.Biol. 30 ページ: 613-625
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosomal protein L4 positively regulates activity of a c-myb proto-oncogene product (2010)
  • 著者名/発表者名: Egoh A, Kanesashi S, Kanei-Ishii C, Nomura T, Ishii S
  • 雑誌名: Genes Cells 15 ページ: 829-841
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of the nuclear import of cubitus interruptus by roadkill in the presence of strong hedgehog signal (2010)
  • 著者名/発表者名: Seong KH, Akimaru H, Dai P, Nomura T, Okada M, Ishii S
  • 雑誌名: PLOS One 5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Uncoupling of growth plate maturation and bone formation in mice lacking both Schnurri-2 and Schnurri-3 (2010)
  • 著者名/発表者名: Jones DC, Schweitzer MN, Wein M, Sigrist K, Takagi T, Ishii S, Glimcher LH
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 107 ページ: 8254-8258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Uncoupling of growth plate maturation and bone formation in mice lacking both Schnurri-2 and Schnurri-3. (2010)
  • 著者名/発表者名: Jones, D.C., et al.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 巻: 107 ページ: 8254-8258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of the nuclear import of cubitus interruptus by roadkill in the presence of strong hedgehog signal. (2010)
  • 著者名/発表者名: Seong, K.H., et al.
  • 雑誌名: PLOS One 巻: 5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Social isolation stress induces ATF-7 phosphorylation and impairs silencing of the 5-HT 5B receptor gene (2010)
  • 著者名/発表者名: Maekawa, T., et al.
  • 雑誌名: EMBO J. 29 ページ: 196-208
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of ATF-2 family transcription factors in adipocyte differentiation : anti-obesity effects of p38 inhibitors (2010)
  • 著者名/発表者名: Maekawa, T., et al.
  • 雑誌名: Mol.Cell.Biol. 30 ページ: 613-625
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ski co-repressor complexes maintain the basal repressed state of the TGF-beta target gene, SMAD7, via HDAC3 and PRMT5 (2009)
  • 著者名/発表者名: Tabata T, Kokura K, Ten Dijke P, Ishii S
  • 雑誌名: Genes Cells 14 ページ: 17-28
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATF-2 regulates lipopolysaccharide-induced transcription in macrophage cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirose N, Maekawa T, Shinagawa T, Ishii S
  • 雑誌名: Biochem.Biophys.Res.Commun. 385 ページ: 72-77
  • 査読あり
• [雑誌論文] SKI knockdown inhibits human melanoma tumor growth in vivo (2009)
  • 著者名/発表者名: Chen D, Lin Q, Box N, Roop D, Ishii S, Matsuzaki K, Fan T, Hornyak TJ, Reed JA, Stavnezer E, Timchenko NA, Medrano EE
  • 雑誌名: Pigment Cell Melanoma Res. 22 ページ: 761-772
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in multiple domains of c-Myb disrupt interaction with CBP/p300 and abrogate myeloid transforming ability (2009)
  • 著者名/発表者名: Pattabiraman DR, Sun J, Dowhan DH, Ishii S, Gonda TJ
  • 雑誌名: Mol Cancer Res. 7 ページ: 1477-1486
  • 査読あり
• [雑誌論文] Knock-down of PQBP1 impairs anxiety-related cognition in mouse (2009)
  • 著者名/発表者名: Ito H, Yoshimura N, Kurosawa M, Ishii S, Nukina N, Okazawa H
  • 雑誌名: Hum Mol Genet. 18 ページ: 4239-4254
  • 査読あり
• [雑誌論文] Knock-down of PQBP1 impairs anxiety-related cognition in mouse (2009)
  • 著者名/発表者名: Ito, H., et al.
  • 雑誌名: Hum.Mol.Genet. 18 ページ: 4239-4254
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in multiple domains of c-Myb disrupt interaction with CBP/p300 and abrogate myeloid transforming ability (2009)
  • 著者名/発表者名: Pattabiraman, D.R., et al.
  • 雑誌名: Mol Cancer Res. 7 ページ: 1477-1486
  • 査読あり
• [雑誌論文] SKI knockdown inhibits human melanoma tumor growth in vivo (2009)
  • 著者名/発表者名: Chen, D., et al.
  • 雑誌名: Pigment Cell Melanoma Res. 22 ページ: 761-772
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATF-2 regulates lipopolysaccharide-induced transcription in macrophage cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirose, N., et al.
  • 雑誌名: Biochem.Biophys.Res.Commun. 385 ページ: 72-77
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ski co-repressor complexes maintain the basal repressed state of the TGF-beta target gene, SMAD7, via HDAC3 and PRMT5 (2009)
  • 著者名/発表者名: Tabata T
  • 雑誌名: Genes to Cells 14 ページ: 17-28
  • 査読あり
• [雑誌論文] A B-Myb complex containing clathrin and filamin is required for mitotic spindle function (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi T, Ishidao T, Nomura T, Shinagawa T, Tanaka Y, Yonemura S, Ishii S
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 1852-1862
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATF-2 controls transcription of Maspin and GADD45 genes independently from p53 to suppress mammary tumors (2008)
  • 著者名/発表者名: Maekawa T, Sano Y, Shinagawa T, Sakuma T, Nomura S, Licht JD, Ishii S
  • 雑誌名: Oncogene 27 ページ: 1045-1054
  • 査読あり
• [雑誌論文] Drosophila ATF-2 regulates sleep and locomotor activity in pacemaker neurons (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimizu H, Shimoda M, Yamaguchi T, Seong KH, Ishii S
  • 雑誌名: Mol.Cell.Biol. 28 ページ: 6278-6289
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fbxw7 acts as an E3 ubiquitin ligase that targets c-Myb for nemo-like kinase (NLK)-induced degradation (2008)
  • 著者名/発表者名: Kanei-Ishii C, Nomura T, Takagi T, Watanabe N, Nakayama KI, Ishii S
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 283 ページ: 30540-30548
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosomal stress induces processing of Mybbp1a and its translocation from the nucleolus to the nucleoplasm (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi T, Keough RA, Gonda TJ, Ishii S
  • 雑誌名: Genes Cells 13 ページ: 27-39
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modulation of M2-type pyruvate kinase activity by the cytoplasmic PML tumor suppressor protein (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada N, Shinagawa T, Ishii S
  • 雑誌名: Genes Cells 13 ページ: 245-254
  • 査読あり
• [雑誌論文] Increased expression of tyrosine hydroxylase and anomalous neurites in catecholaminergic neurons of ATF-2 null mice (2008)
  • 著者名/発表者名: Kojima M, Suzuki T, Maekawa T, Ishii S, Sumi-Ichinose C, Nomura T, Ichinose H
  • 雑誌名: J. Neurosci.Res. 86 ページ: 544-552
  • 査読あり
• [雑誌論文] A B-Myb complex containing clathrin and filamin is required for mitotic spindle function (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi, T., et al.
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 1852-1862
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fbxw7 acts as an E3 ubiquitin ligase that targets c-Myb for nemo-like kinase (NLK)-induced degradation (2008)
  • 著者名/発表者名: Kanei-Ishii C
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 30540-30548
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATF-2 controls transcription of Maspin and GADD45α genes independently from p53 to suppress mammary tumors (2008)
  • 著者名/発表者名: Maekawa T
  • 雑誌名: Oncogene 27 ページ: 1045-1054
  • 査読あり
• [雑誌論文] Drosophila ATF-2 regulates sleep and locomotor activity in pacemaker neurons (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimizu H
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 28 ページ: 6278-6289
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosomal stress induces processing of Mybbpla and its translocation from the nucleolus to the nucleoplasm (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi T
  • 雑誌名: Genes to Cells 13 ページ: 27-39
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modulation of M2-type pyruvate kinase activity by the cytoplasmic PML tumor suppressor protin (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada N
  • 雑誌名: Genes to Cells 13 ページ: 245-254
  • 査読あり
• [学会発表] ATF-2ファミリー転写因子を介したストレス依存的なエピジェネティック制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石井俊輔、成耆鉉,志水英之,季棟,前川利男
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-14
• [学会発表] ATF-7依存的なヒストンH3メチル化を介したストレスによる転写制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 前川利男、中井大助、金昇準、吉田圭介、小倉博雄、山田一之、石井俊輔
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-14
• [学会発表] Analysis of relationship between TRIM27 and USP7 through ubiquitiion aeubiqunation (2010)
  • 著者名/発表者名: 野村照明、Zaman Md Mahabub-Uz、石井俊輔
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-14
• [学会発表] Positive selectionに必要なSchnurr-2のchip on chip法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高木豪,石井俊輔
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-14
• [学会発表] A possible involvement of Drosophila ATF-2 in epigenetic of Drosophila ATF-2 in epigenetic regulation of innate immune response (2010)
  • 著者名/発表者名: 中邑亮一,成耆鉉,李棟,石井俊輔
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-14
• [学会発表] Positive selectionに必要な転写因子Schnurr-2のchip on chip法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高木豪, 石井俊輔
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] ATF-2ファミリー転写因子とエピジェネティック制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 阪大蛋白研セミナー「ゲノム機能の記憶の成立機序とその制御」
  • 学会等名: 石井俊輔
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-11-20
• [学会発表] Inheritance of stress-induced epigenetic change (2010)
  • 著者名/発表者名: 石井俊輔
  • 学会等名: 第15回分生研シンポジウム「エピゲノム研究の最先端」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-11-12
• [学会発表] Epigenetic regulation by ATF-2 family of transcription factors in response to various stresses Symposium on "Epigenetic inheritance and genome reprogramming" (2010)
  • 著者名/発表者名: 石井俊輔
  • 学会等名: The 62nd Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2010-05-11
• [学会発表] TRIM27タンパク質複合体の精製と解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 野村照明、石井俊輔
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] ショウジョウバエATF-2はストレス依存的なエピジエネティック変化の遺伝に関与する (2009)
  • 著者名/発表者名: 成耆鉉、志水英之、野村照明、石井俊輔
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] マウスDP細胞からのSchnurri-2複合体の精製と解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 高木豪、石井俊輔
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] リボソームタンパク質L4によるc-Myb活性の制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 江郷彩進之介、石井知恵、石井俊輔
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] ATF-7依存的なヒストンH3メチル化を介したストレスによる転写制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 川利男,金昇準,小倉博雄,山田一之、中井大助,石井俊輔
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] PQBP1ノックダウンマウスにおける認知記憶機能の低下 (2009)
  • 著者名/発表者名: 奈津江,黒澤大,石井俊輔,貫名信行,岡澤均
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-15
• [学会発表] Epigenetic regulation by ATF-2 mily of transcription factors in response to various stresses (2009)
  • 著者名/発表者名: Shunsuke Ishii,Ki-Hyeon Seong, Toshio Maekawa, Hideyuki Shimizu, Seungjoon Kim, Daisuke Nakai
  • 学会等名: The 4th International Workshop on Cell Regulation in Division and Arrest
  • 発表場所: Okinawa, Japan
  • 年月日: 2009-12-04
• [学会発表] Role of ATF-2 in epigenetic regulation (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishii, S., et al.
  • 学会等名: The 24th Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA[II]
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 2009-06-24
• [学会発表] Social isolation stress induces ATF-7 phosphorylation and impairs silencing of the 5-HT 5B receptor gene (2009)
  • 著者名/発表者名: Toshio Maekawa, Seungjoon Kim, Daisuke Nakai, Chieko Makino, Tsuyoshi Takagi, Hiroo Ogura, Kazuyuki Yamada, Bruno Chatton,Shunsuke Ishii
  • 学会等名: The 24th Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA [II]
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2009-06-07
• [学会発表] Drosophila ATF-2 controls the transge stress-induced epigenetic change (2009)
  • 著者名/発表者名: Ki-Hyeon Seong, Hideyuki Shimizu, Teruaki Nomura,Shunsuke Ishii
  • 学会等名: The 24th Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA [II]
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2009-06-07
• [学会発表] Role of ATF-2 in epigenetic regulation (2009)
  • 著者名/発表者名: Shunsuke Ishii,Ki-Hyeon Seong, Toshio Maekawa, Hideyuki Shimizu, Seungjoon Kim, Daisuke Nakai
  • 学会等名: The 24th Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA [II]
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2009-06-06
• [学会発表] TRIM27結合タンパク質の同定と解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 野村照明、堂元沙織、高木豪、石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-14
• [学会発表] ショウジョウバエRdxは2つのメカニズムによってHhシグナルを制御する (2008)
  • 著者名/発表者名: 成耆鉉、野村照明、秋丸裕司、戴平、岡田聖裕、石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-14
• [学会発表] Ski/Sno複合体による転写制御メカニズムの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田畑考統、古倉健嗣、石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-14
• [学会発表] リボソームタンパク質L4によるc-Myb性の制御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 江郷彩子、野村照明、進之介、石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-14
• [学会発表] ATF-7依存的なヒストンH3メチル化を介したストレスによる転写制御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 前川利男,金昇準,小倉博雄,中井大助,石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-14
• [学会発表] Regulation of cell cycle by Myb family transcription factors (2008)
  • 著者名/発表者名: 石井俊輔
  • 学会等名: The 21^<st> Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA [I]
  • 発表場所: Yamanashi, Japan
  • 年月日: 2008-06-20
• [学会発表] A B-Myb complex containing clathrin and filamin is required for mitotic spindle function (2008)
  • 著者名/発表者名: 石井俊輔
  • 学会等名: The 3^<rd> International Workshop on Cell Regulation in Division and Arrest Under Stress
  • 発表場所: Okinawa, Japan
  • 年月日: 2008-04-10
• [学会発表] Zn-finger型転写因子Schnurri-2をむ含複合体の精製と解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高木豪、石井俊輔
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [備考] ホームページ
  • URL: http://rtcweb.rtc.riken.jp/lab/mg/mg.html