大腸菌内膜ストレス応答機構の解析

• 研究課題/領域番号: 20370078
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 細胞生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 秋山 芳展 京都大学, ウイルス研究所, 教授 (10192460)
• 研究分担者: 森 博幸 京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (10243271)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 20,280千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 4,680千円); 2010年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円); 2009年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円); 2008年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
• キーワード: 生体膜 / 膜タンパク質 / 表層ストレス応答 / タンパク質分解 / RIP / プロテアーゼ / RseP / PDZドメイン / シグマE / 品質管理 / 分子シャペロン / シグナルペプチ / 枯草菌 / 大腸菌 / 分解 / シャペロン / SecY / 膜組み込み

研究概要

大腸菌における異常膜タンパク質による表層ストレス応答(膜ストレス応答)活性化の機構を明らかにするするために、(1)膜層ストレス応答を引き起こすsecY変異に対するサプレッサー変異を分離し解析した。(2) DegS非依存的シグマEストレス応答を活性化させるRseP PDZドメインの変異を分離・解析して、リガンド結合による機能制御の可能性を示唆した。

研究成果

• [雑誌論文] Recruitment of a species-specific afrest module to monitor different cellular processes (2011)
  • 著者名/発表者名: Chiba. S., Kanamori, T., Ueda, T., Akiyama, Y., Pogliano K., Ito, K
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci, USA 巻: 108 ページ: 6073-6078
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quality control of cytoplasmic membrane proteins in Escherichia coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 46 ページ: 449-454
  • NAID: 10026303602
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Sec protein secretion system (2009)
  • 著者名/発表者名: Ito, K. and Mori, H.
  • 雑誌名: Bacterial Secreted Proteins ページ: 3-22
• [雑誌論文] Quality control of cytoplasmic membrane proteins in Escherichia coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J.Biochem. 46 ページ: 449-454
  • NAID: 10026303602
  • 査読あり
• [雑誌論文] Substrate recognition and binding by RseP, an Escherichia coli intramembrane protease (2008)
  • 著者名/発表者名: Koide, K., Ito. K., and Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 283 ページ: 9562-9570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, T., Mori, H., Fukai, S., Ishitani, R., Mori, T., Dohmae, N., Perederina, A., Sugita, Y., Vassylyev, D. G., Ito, K. andNureki O.
  • 雑誌名: These authors contributed equally to thiswork 巻: 455 ページ: 988-991
  • NAID: 10025975982
  • 査読あり
• [雑誌論文] A pair of circularly permutated PDZ domains control RseP, the S2P family intramembrane protease of E. coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Inaba, K., Suzuki, M., Maegawa, K., Akiyama, S., Ito, K., and Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 283 ページ: 35042-35052
  • 査読あり
• [雑誌論文] Substrate recognition and binding by RseP, an Escherichia coli intramembrane protease. (2008)
  • 著者名/発表者名: Koide, K., Ito. K., Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 9562-9570
  • 査読あり
• [雑誌論文] A pair of circularly permutated PDZ domains control RseP, the S2P family intramembrane protease of E. coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Inaba, K., Suzuki, M., Maegawa, K., Akiyama, S., Ito, K., Akiyama, Y.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 35042-35052
  • 査読あり
• [学会発表] New function of RseP, the E.coli S2P family protease (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, Y.
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Proteolytic enzymes & their inhibitors
  • 発表場所: Lucca, Italy(招待講演)
  • 年月日: 2010-05-05
• [学会発表] New function of RseP, the E. coli S2P family protease (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, Y.
  • 学会等名: New function of RseP, the E. coli S2P family protease. Gordon Research Conference on Proteolytic enzymes & the irinhibitors
  • 発表場所: Lucca, Italy
• [学会発表] Roles of the two PDZ domains of RseP, the S2P family intramembrane protease of Escherichia coli, in regulation of its protease function (2010)
  • 著者名/発表者名: Hizukuri, Y. and Akiyama, Y.
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Protein Community, Nara
  • 発表場所: Japan
• [学会発表] 大腸菌表層ストレス応答に関わるS2P膜内プロテアーゼRsePのPDZドメイン機能の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 檜作洋平、秋山芳展
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] A pair of circularly permutated PDZ domains control RseP, the S2P family intramembrane protease of E. coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Akiyama, Y.
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] A pair of circularly permutated PDZ domains control RsePRse, the S2P family intramembrane protease of E. coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Inaba, K., Suzuki, M., Maegawa, K.-i., Akiyama, S., Ito, K. and Akiyama, Y.
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 大腸菌RIPプロテアーゼの機能と制御.ワークショップ「直接性、不可逆性を特徴とする新しいシグナル伝達のメカニズム」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 秋山芳展
  • 学会等名: 第31回日本神経科学大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-07-11
• [学会発表] 大腸菌Ripプロテアーゼの機能と制御. (2008)
  • 著者名/発表者名: 秋山芳展
  • 学会等名: ワークショップ「直接性、不可逆性を特徴とする新しいシグナル伝達のメカニズム」第31回日本神経科学大会
  • 発表場所: 東京(東京国際フォーラム)
  • 年月日: 2008-07-10
• [学会発表] 大腸菌S2PプロテアーゼRsePの膜タンパク質品質管理における新たな役割 (2008)
  • 著者名/発表者名: 斎藤啓、秋山芳展
  • 学会等名: 第5回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 藤枝
• [備考]
  • URL: http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/akiyama/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/akiyama/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/akiyama/ronbun.html