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常染色体STRマーカーを用いた日本国内及びその周辺のヒト集団の同定法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 20370099
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用人類学
研究機関名古屋大学

研究代表者

山本 敏充  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (50260592)

研究分担者 斎藤 成也 (齋藤 成也)  国立遺伝泊研究所, 集団遺伝学系, 教授 (30192587)
打樋 利英子  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (20223571)
研究期間 (年度) 2008 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
19,500千円 (直接経費: 15,000千円、間接経費: 4,500千円)
2011年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2010年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2009年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2008年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワードSTR / 常染色体 / 東アジア / 集団遺伝 / 同定法 / 遺伝子プール / 遺伝的異質性 / 祖先集団
研究概要

日本国内の地域集団及び日本周辺諸国の地域集団から採取されたDNA試料について、多数のほぼ均等に常染色上分布する4塩基リピートのSTRs(short tandem repeats)マーカーが型判定された。そのうち、105座位のSTRsが、日本人5地域(秋田・名古屋・大分・沖縄)、中国人(漢民族) 5地域(北京・陝西・湖南・福建・広東)、タイ人(バンコク)、ミャンマー人(ヤンゴン)、モンゴル人2地域(オラーゴン・ダランザドガド)、韓国人(ソウル)及び中国人(朝鮮族)(瀋陽)のDNA試料が型判定され、系統遺伝学的、構造遺伝学的、3次元的分布などの集団遺伝学的解析が行われた。その結果、日本人と中国人とが統計学的に区別できる可能性が示唆された。そこで、各座位のアレルごとの中国人に対する日本人らしさの割合を算出し、その割合を各個人ごとに積算した分布を正規分布に補正したところ、ある程度日本人と中国人とを確率的に区別できる方法が確立できた。
また、同様に250以上のSTRs座位を型判定できるマルチプレックスシステムを構築した。このシステムを利用することにより、日本人と韓国人、あるいは日本人国内の地域差を調べることができる可能性が考えられた。

報告書

(6件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書   自己評価報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (41件)

すべて 2011 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (19件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (22件)

  • [雑誌論文] Family selection study among DNA samples collected from Amerindian ethnic group(Wayuu) in northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      T. Yamamoto, T. Gomyoda, et al(他4名, 1番目)
    • 雑誌名

      Forensic Sci. Int. Genet

      巻: Supple. Ser. 3

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Family selection study among DNA samples collected from Amerindian ethnic group (Wayuu)in northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics Supplement Series

      巻: 3 号: 1 ページ: e234-e235

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2011.08.116

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The distribution of H19HP haplotypes in Asian populations2011

    • 著者名/発表者名
      Nori Nakayashiki
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics Supplement Series

      巻: 3 号: 1 ページ: e341-e342

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2011.09.033

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 小麦品種判別への超高速PCRの応用2011

    • 著者名/発表者名
      井上真紀
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 97-100

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] H19インプリント遺伝子のハプロタイプ分析~22011

    • 著者名/発表者名
      中屋敷徳
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 151-154

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] 高速PCRのSTRマルチプレックスタイピングシステムへの応用2011

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 214-217

    • NAID

      10029668898

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] Frequency data for 12 mini STR loci in Argentina2010

    • 著者名/発表者名
      C. Vullo, A. Borosky, T. Yamamoto, et al(他2名, 5番目)
    • 雑誌名

      Forensic Sci. Int. Genet

      巻: 4

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency data for 12 mini STR loci in Argentina.2010

    • 著者名/発表者名
      Carlos Vullo, Alicia Borosky, Carola Romanini, Laura Catelli, Toshimichi Yamamoto
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics 4

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] FLNA p.V528M substitution is neither associated with bilateral periventicular nodular heterotopias nor with macrothrombocytopenia.2010

    • 著者名/発表者名
      Shinji Kunishima, Yoshimi Ito-Yamamura, Akira Hayakawa, Toshimichi Yamamoto, Hidehiko Saito.
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics 55

      ページ: 844-846

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アルゼンチンにおける"Midi-6"STRマルチプレックスシステムと他のヒト集団との比較2010

    • 著者名/発表者名
      山本敏充、打樋利英子、吉本高士、勝又義直
    • 雑誌名

      DNA多型 18

      ページ: 274-276

    • NAID

      10029668276

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency data for 12 mini STR loci in Argentina2010

    • 著者名/発表者名
      Carlos Vullo
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics

      巻: 4

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] FLNA p.V528M substitution is neither associated with bilateral periventicular nodular heterotonias nor with macrothrombocvtonenia2010

    • 著者名/発表者名
      Shinji Kunishima
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 55 ページ: 844-846

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アルゼンチンにおける“Midi-6”STRマルチプレックスシステムと他のヒト集団との比較2010

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 18 ページ: 274-276

    • NAID

      10029668276

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] Minisatellite MS32 alleles show population specificity among Thai, Chinese, and Japanese2009

    • 著者名/発表者名
      Q-H. Yuan, A. Tanaka, T. Yamamoto, K. Tamaki, et al(他5名, 7番目)
    • 雑誌名

      J. Mol. Evol.

      巻: 172 ページ: 208-10

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Usefulness of a hundred of autosomal tetranucleotide STR markers for genetic analysis among geographically close human regional populations in East Asia2009

    • 著者名/発表者名
      T. Yamamoto, M. Fukami, N. Saitou, et al(他4名, 1番目)
    • 雑誌名

      Forensic Sci. Int. Genet

      巻: Suppl Ser 2 ページ: 376-377

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Minisatellite MS32 alleles show population specificity among Thai, Chinese, and Japanese2009

    • 著者名/発表者名
      Q.-H.Yuan
    • 雑誌名

      J.Mol.Evol. 68

      ページ: 126-133

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] モンゴルの5地域ヒト集団及び日本人集団における17Y-STRsの比較2009

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 雑誌名

      DNA多型 17

      ページ: 274-276

    • NAID

      10025754599

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Frequency data for 12 mini STR loci in Argentina2009

    • 著者名/発表者名
      Carlos Vullo
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics (In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Minisatellite MS32 alleles show population specificity among Thai, Chinese, and Japanese2009

    • 著者名/発表者名
      Q. -H. Yuan
    • 雑誌名

      J. Mol. Evol. (in press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 南米コロンビアのWayu族から採取されたDNAにおける家系調査2011

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第20回学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2011-12-01
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 自然脱落毛からのSTR型検出の試み2011

    • 著者名/発表者名
      廣重優二
    • 学会等名
      日本法科学技術学会第17回学術集会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2011-11-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] マイクロサテライトからみた南米少数民族間の遺伝的関係2011

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
    • 年月日
      2011-11-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Family selection study amoung DNA samples collected from an Ameriindian ethnic group(Wayuu) in Northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      12th International Congress of Human Genetics and the 61st ASHG Annual Meeting
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Family selection study amoung DNA samples collected from an Ameriindian ethnic eroup (Wayuu) in Northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      12th International Congress of Human Genetics and the 61st ASHG Annual Meeting
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of H19HP Haplotypes in Asian populations2011

    • 著者名/発表者名
      Nori Nakayashiki
    • 学会等名
      24th World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-09-02
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Family selection study amoung DNA samples collected from an Ameriindian ethnic group(Wayuu) in Northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      24th World Congress of the International Society for Forensic Genetics(ISFG)
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-09-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Family selection study amoung DNA samples collected from an Ameriindian ethnic group (Wayuu) in Northern Colombia2011

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      24th World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-09-01
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 南米に移住した男性が共通の祖父であるか否についての血縁鑑定例2011

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第95次日本法医学会全国学術集会
    • 発表場所
      福島
    • 年月日
      2011-06-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 超高速PCR装置による小麦品種判別法(第1報)2010

    • 著者名/発表者名
      井上真紀
    • 学会等名
      DNA鑑定学会第3回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-12-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 高速PCRのSTRマルチプレックスタイピングシステムへの応用2010

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第19回学術集会
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2010-11-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] H19インプリント遺伝子上流のSNPハプロタイプ分析~22010

    • 著者名/発表者名
      中屋敷徳
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第19回学術集会
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2010-11-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 小麦品種判別への超高速PCRの応用2010

    • 著者名/発表者名
      井上真紀
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第19回学術集会
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2010-11-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] アレル特異的PCRによる日本及びモンゴル男性のYハプログループの比較2010

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第64回日本人類学会大会
    • 発表場所
      伊達
    • 年月日
      2010-10-03
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] ドライクリーニング後の精液斑からDNA型を検出した事例2010

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第94次日本法医学会全国学術集会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-06-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] H19インプリント遺伝子上流のSNPハプロタイプ分析2010

    • 著者名/発表者名
      中屋敷徳
    • 学会等名
      第94次日本法医学会全国学術集会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-06-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] アルゼンチンにおける "Midi-6" STRマルチプレックスシステムと他のヒト集団との比較2009

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第18回学術集会
    • 発表場所
      久留米
    • 年月日
      2009-11-21
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] 21種類の法科学用マイクロサテライト多型マーカーから見た日本人とモンゴル人の遺伝的異質性2009

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第63回日本人類学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-10-03
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] Usefulness of a hundred of autosomal tetranucleotide STR markers for genetic analysis among geographically close human regional populations in East Asia2009

    • 著者名/発表者名
      Toshimichi Yamamoto
    • 学会等名
      23rd World Congress of the International Society for Forensic Genetics(ISFG)
    • 発表場所
      Buenos Aires, Argentina
    • 年月日
      2009-09-18
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Usefulness of a hundred of autosomal tetranucleotide STR markers for genetic analysis among geographically close human regional populations in East Asia2009

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      23^<rd> World Congress International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Buenos Aires (Argentina)
    • 年月日
      2009-09-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] モンゴルの5地域ヒト集団及び日本人集団における17 Y-STRsの比較2008

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第17回学術集会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] 105ローカスのマイクロサテライト多型による日本及びその周辺諸国のヒト地域集団の遺伝学的解析2008

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 学会等名
      第62回日本人類学会大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-11-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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