細胞分裂と分化を制御する機能ネットワークの解析

• 研究課題/領域番号: 20380055
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 東京農業大学
• 研究代表者: 吉川 博文 東京農業大学, 応用生物科学部, 教授 (50175676)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円); 2010年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円); 2009年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円); 2008年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
• キーワード: 遺伝子発現 / 細胞分裂 / 脂質合成 / 細胞分化 / クエン酸回路 / 機能ネットワーク / 微生物 / 遺伝子 / 発現制御 / 胞子形成

研究概要

栄養増殖期を抜け定常期にある微生物細胞の生命活動の解析は、細胞の持つ新たな生理機能や遺伝的制御機構を解き明かすことに繋がると考える。脂肪酸合成系の必須酵素が細胞分裂装置と相互作用することを見出し、分裂隔壁形成に関与していることを明らかにした。一方、クエン酸回路の一酵素の完全破壊株は正常に栄養増殖するが、胞子形成能を完全に欠いており、細胞のエネルギー状態を感知して分化を進行させる運命決定因子であることを示唆した。

研究成果

• [雑誌論文] Sequence-specific error profile of Illumina sequencers (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakamura K., Yoshikawa, H., Kanaya S., 他
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of Genome-wide DNA Polymorphisms by Whole-genome Sequencing of an Ancestral Japonica Rice Cultivar (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Arai-Kichise, Y.Shiwa, H.Nagasaki, H.Yoshikawa, K.Wakasa
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 巻: 52 ページ: 274-282
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome resequencing shows numerous genes with nonsynonymous SNPs in the Japanese native cattle Kuchinoshima-Ushi (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Kawahara-Miki, Y.Shiwa, Y.Kichise, H.Yoshikawa, T.Kono
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome of Bacillus subtilis phage SP 10 : comparative analysis with phage SPO1. (2011)
  • 著者名/発表者名: L.M.Yee, T.Matsumoto, K.Yano, K.Asai, H.Yoshikawa, 他
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem 巻: (in press)
  • NAID: 10028272756
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative Studies of Genome-Wide Maps of Nucleosomes between Deletion Mutants of elp3 and hos2 Genes of Saccharomyces cerevisiae. (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Matsumoto, C-S.Yun, H.Yoshikawa, H.Nishida
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of nitrate assimilation in cyanobacteria (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Ohashi, S.Watanabe, H.Yoshikawa, T.Omata, 他
  • 雑誌名: J.Exp.Botany 巻: 62(4) ページ: 1411-1424
  • 査読あり
• [雑誌論文] 枯草菌の環境ストレス応答機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 雑誌名: 日本乳酸菌学会誌 21巻、No.1(総説) ページ: 16-26
  • NAID: 10029752187
• [雑誌論文] Novel antibacterial compounds specifically targeting the essential WalR response regulator. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro G., Yoshikawa, H., Msadek T., Utsumi R.
  • 雑誌名: J.Antibiotics 63 ページ: 127-134
  • NAID: 10030707938
  • 査読あり
• [雑誌論文] 枯草菌の環境ストレス応答機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 雑誌名: Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria 巻: 21 ページ: 16-26
  • NAID: 10029752187
• [雑誌論文] Novel antibacterial compounds specifically targeting the essential WalR response regulator. (2010)
  • 著者名/発表者名: Gotoh, Y., Furuta, E., Dubrac, S., YoshikaNa, H., Utsumi, R., 他
  • 雑誌名: J.Antibiotics 63 ページ: 127-134
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mesurements of transposition frequency of insertion sequence IS1 by GFP hop-on assay. (2010)
  • 著者名/発表者名: Saito, T., Chibazakura, T., Tkahashi, K., Yoshikawa, H., Sekine, Y.
  • 雑誌名: J.Gen.Appl.Microbiol. 56 ページ: 187-192
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of bacterial transformation efficiency using Plasmid Artificial Modification (PAM). (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasui K., Kano Y., Tanaka K., Watanabe K., Shimizu-Kadota M., Yoshikawa H., Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37(1)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of bacterial transformation efficiencyusing Plasmid Artificial Modification (PAM). (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasu i, K., Kano, Y., Tanaka, k., Yoshikawa, H., Suzuki, T., 他
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37
  • 査読あり
• [雑誌論文] NbIR Is a Novel One-Component Response Regulator in the Cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Kato, Taku Chibazakura, Hirofumi Yoshikawa.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 72 ページ: 1072-1079
  • 査読あり
• [学会発表] 枯草菌における脂質代謝と細胞分裂間の新規ネットワーク解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高田啓
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年大会
  • 発表場所: 京都(発表は中止)
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] 脂質代謝と細胞分裂を共役させるネットワークの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高田啓
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台(発表は中止)
  • 年月日: 2011-03-14
• [学会発表] 次世代シーケンサーのための微生物ゲノム変異解析パイプラインの構築 (2010)
  • 著者名/発表者名: 志波優、兼崎友、松本貴嗣、矢嶋俊介、吉川博文
  • 学会等名: 日本分子生物学会第33回年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Geobacillus kaustophilus HTA426の3種のイノシトール脱水素酵素オルソログの発現と機能の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三本木あずさ、森永哲郎、志波優、古川博文、吉田健一, 他
  • 学会等名: 日本分子生物学会第33回年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Analysis of novel heat shock response mechanism mediated by the Initial nucleotide of transcription. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, S.Ogawa, M., Matsumoto, M.Yoshikawa, H., 他
  • 学会等名: The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription.
  • 発表場所: Nakijin, Okinawa
  • 年月日: 2010-07-03
• [学会発表] Fundamental heat shock response is generated by intrinsic mechanism of transcription initiation. (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 学会等名: The 11th Asian and Oceanian Conference on Transcription.
  • 発表場所: Nakijin,(Okinawa)
  • 年月日: 2010-07-02
• [学会発表] Fundamental heat shock response is generated by intrinsic mechanism of transcription intiation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, S., Ogawa, M., Chibazakura, T.Yoshikawa, H., 他
  • 学会等名: The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription.
  • 発表場所: Nakijin, Okinawa
  • 年月日: 2010-07-02
• [学会発表] Genome resequencing and emerging issues in bacteria, rice and cattle. (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 学会等名: Illumina User symposium
  • 発表場所: プーケット(タイ)(招待講演)
  • 年月日: 2010-04-13
• [学会発表] Genome resequencing and emerging issues in bacteria, rice and cattle. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshikawa, H., Shiwa, Y., 他
  • 学会等名: Illumina User symposium
  • 発表場所: Phuket, Thailand(招待講演)
  • 年月日: 2010-04-13
• [学会発表] Analysis workflows and experiences at NODAI genome research center (2010)
  • 著者名/発表者名: Shiwa, Y.Yoshikawa, H., 他
  • 学会等名: Illumina User symposium, Asia Pacific & Japan
  • 発表場所: Phuket, Thailand
  • 年月日: 2010-04-13
• [学会発表] 枯草菌のRNAポリメラーゼに結合する小蛋白質(ω)の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 朝井計、松本貴嗣、佐久間萌里佳、矢野晃一、吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] 次世代シーケンサーによるSynechococcus elongatus PCC 7942のリシーケンス解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 兼崎友、渡辺智、志波優、吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] Lactococcus lactis IO-1株におけるキシロース代謝関連遺伝子の転写解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木成人、千葉櫻拓、園元謙二、門多真理子、吉川博文, 他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] 枯草菌ゲノムベクターシステムを利用したミニセルロソームの構築 (2010)
  • 著者名/発表者名: 原裕一、中山薫、松岡聡、吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] 細胞分裂から胞子形成開始への移行に関与する新規ネットワークの探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 横川朋美
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] 枯草菌に見出されたdksAオルソログ機能未知遺伝子群の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田麻衣、渡辺智、吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942株における複製開始点の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 渡辺智、兼崎友、大林龍胆、志波優、千葉櫻拓、吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] 曳糸性の安定化した納豆菌の育種 (2010)
  • 著者名/発表者名: 加田茂樹、大河内悠貴、千葉櫻拓、関根靖彦、吉川博文, 他
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010年度大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたSynechococcus elongatus PCC 7942のリシーケンス解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 兼崎友、渡辺智、志波優、吉川博文
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2010-03-19
• [学会発表] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942における分子シャペロンDnaKとDnaJのパートナーシップ (2010)
  • 著者名/発表者名: 葉山綾乃、柴本理宏、小澤慎吾、渡辺智、荷村かおり、吉川博文
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2010-03-19
• [学会発表] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942株における複製開始点の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 渡辺智、兼崎友、大林龍胆、志波優、千葉櫻拓、吉川博文
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] 単細胞性紅藻Cyanidioschyzon merolaeにおけるGFPを用いた局在解析法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤淳、渡辺智、大沼みお、田中寛、吉川博文
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] バクテリアゲノムのリシーケンスによる変異解析とその問題点 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2010-03-08
• [学会発表] シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942における分子シャペロンDnaKとDnaJのパートナーシップ (2010)
  • 著者名/発表者名: 葉山綾乃、渡辺智、荷村(松根)かおり、仲本準、吉川博文, 他
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2010-03-08
• [学会発表] Characterization of xylose metabolism in pentose phosphate pathway by Lactococcus lactis IO-1. (2009)
  • 著者名/発表者名: 棚町香織、花田克浩、中東憲治、吉川博文、園元謙二, 他
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] 次世代シーケンサーによるラン藻Synechococcus elongatus PCC 7942のリシーケンス (2009)
  • 著者名/発表者名: 兼崎友、渡辺智、志波優、松本貴嗣、吉川博文, 他
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 酒米品種「雄町」のゲノム解読とSNPの検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉瀬(新井)祐子、志波優、吉川博文、矢野昌裕、若狭暁
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 日本在来野生牛(口之島牛)の全ゲノム配列解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 津田薫、川原玲香、志波優、矢嶋俊介、吉川博文、河野友宏, 他
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 枯草菌の環境ストレス応答機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 学会等名: 日本乳酸菌学会(招待講演)
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-11-27
• [学会発表] Functional analysis of the stress response mechanism in cyanobacteria----a new aspect of molecular chaperones---- (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Watanabe, M.Sato, H.Yoshikawa
  • 学会等名: Fourth International Congress on Stress Responses in Biology and Medicine(招待講演)
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2009-10-08
• [学会発表] 乳酸菌Lactococcus lactis IO-1におけるキシロース代謝の機構解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 棚町香織、中東憲治、門多真理子、園元謙二、吉川博文, 他
  • 学会等名: 日本生物工学会2009年大会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2009-09-24
• [学会発表] Involvement of G3P acyltransferase, PlsX, in the cell division machinery. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takada H.
  • 学会等名: ASM Conference on Prokaryotic development.
  • 発表場所: Cambridge, MA. USA
  • 年月日: 2009-07-02
• [学会発表] Involvement of G3P acyltransferase, PlsX, in the cell division machinery (2009)
  • 著者名/発表者名: Takada, H., Yoshikawa H.
  • 学会等名: ASM Conference on Prokaryotic development
  • 発表場所: Cambridge, MA.USA
  • 年月日: 2009-07-02
• [学会発表] Involvement of G3P acyltransferase, PlsX, in the cell division machinery. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshikawa H.
  • 学会等名: 5th International Conference on gram-positive Microorganisms.
  • 発表場所: San Diego, CA. USA
  • 年月日: 2009-06-16
• [学会発表] Involvement of G3P acyltransferase, PlsX, in the cell division machinery (2009)
  • 著者名/発表者名: Takada, H., Fukushima, S., Matsumoto, K., Yoshikawa H., 他
  • 学会等名: 5th International Conference on gram-positive Microorganisms
  • 発表場所: San Diego, CA.USA
  • 年月日: 2009-06-16
• [学会発表] 細胞分裂装置に関わる機能ネットワーク (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉川博文
  • 学会等名: 日本農芸化学会シンポジウム
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-03-29