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スギ雄花着花量を制御する遺伝子の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20380096
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 森林科学
研究機関独立行政法人森林総合研究所

研究代表者

伊原 徳子  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員 (40353594)

研究分担者 岩田 洋佳  東京大学, 農学生命科学研究科, 准教授 (00355489)
坪村 美代子  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 研究員 (70415040)
渡辺 敦史 (渡邊 敦史)  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 室長 (10360471)
河崎 久男  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 育種第二課長 (50370846)
研究期間 (年度) 2008 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
22,230千円 (直接経費: 17,100千円、間接経費: 5,130千円)
2012年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2011年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2010年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2009年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2008年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
キーワードスギ雄花 / 遺伝解析 / QTL / アソシーエーション解析 / 花成 / スギ / 雄花着生量 / QTL解析 / DNAマーカー
研究概要

雄花の多いスギに由来する交配家系の277 個体を用い、複数年に渡ってゲノム上の遺伝子塩 基配列の違い(多型)と雄花着生量との関連を調べ、調査年の違いに関わらず雄花着生量と 多型との高い関連が検出されるゲノム領域を複数明らかにした。これらのゲノム領域内の遺 伝子多型と雄花着生量との関連について、さらに関東精英樹150 個体に対象を広げて調べ、 雄花着生量を制御する主要な遺伝子がある可能性の高い領域を絞り込み、該当のゲノム領域 断片を単離した。

報告書

(6件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 自己評価報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2013 2012 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (9件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Identification of QTLs associated with male strobilus abundance in Cryptomeria japonica.2013

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Iwata H, Taguchi Y and Tsumura Y
    • 雑誌名

      TREE GENETICS & GENOMES

      巻: 8 ページ: 1319-1329

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The construction of a high-density linkage map for identifying SNP markers that are tightly linked to a nuclear-recessive major gene for male sterility in Cryptomeria japonica D. Don.2013

    • 著者名/発表者名
      Moriguchi Y, Ujino-Ihara T
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 13:95

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of QTLs associated with male strobilus abundance in Cryptomeria japonica.2012

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Taguchi Y, Moriguchi Y, Tsumura Y
    • 雑誌名

      TREE GENETICS & GENOMES

      巻: 8 号: 6 ページ: 1319-1329

    • DOI

      10.1007/s11295-012-0518-3

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The construction of a high-density linkage map for identifying SNP markers that are tightly linked to a nuclear-recessive major gene for male sterility in Cryptomeria japonica D.Don2012

    • 著者名/発表者名
      森口喜成、伊原徳子、内山憲太郎、二村典宏、斎藤真己、上野真義、松本麻子、谷尚樹、平英彰、篠原健司、津村義彦
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1186/1471-2164-13-95

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prospects for genomic selection in conifer breeding: a simulation study of Cryptomeria japonica2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes. Tree Genetics and Genomes

      巻: 7 ページ: 747-758

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prospects for genomic selection in conifer breeding : a simulation study of Cryptomeria japonica.2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes. On-line first.

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An efficient method for developing SNP markers based on EST data combined with high resolution melting (HRM) analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Taguchi Y, Moriguchi Y, Tsumura Y
    • 雑誌名

      BMC Research Notes

      巻: 3:51

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An efficient method for developing SNP markers based on EST data combined with high resolution melting (HRM) analysis.2010

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Taguchi Y, Moriguchi Y, Tsumura Y.
    • 雑誌名

      BMC Research Notes. 3

      ページ: 51-51

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An efficient method for developing SNP markers based on EST data combined with high resolution melting(HRM)analysis2010

    • 著者名/発表者名
      伊原徳子、田口由利子、森口喜成、津村義彦
    • 雑誌名

      BMC Research Notes 3

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening for genes specific to coniferous species2008

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Tree Physiology

      巻: 28 ページ: 1325-1330

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening for genes specific to coniferous species.2008

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Tsumura Y.
    • 雑誌名

      Tree Physiology 28

      ページ: 1325-1330

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening for genes specific to coniferous species2008

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara T, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Tree Physiology 28

      ページ: 1325-1330

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] スギ雄花着生量に関与する遺伝子座の遺伝解析2012

    • 著者名/発表者名
      伊原 徳子、 森口 喜成、 内山 憲太郎、 坪 村 美代子、 岩田 洋佳、 渡辺 敦史、 津村 義彦
    • 学会等名
      日本森林学会第123回大会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] スギ雄花着生量に関与する遺伝子座の遺伝解析2012

    • 著者名/発表者名
      伊原徳子、森口喜成、内山憲太郎、坪村美代子、岩田洋佳、渡辺敦史、津村義彦
    • 学会等名
      日本森林学会第123回大会
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮)
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ゲノミックセレクションが林木育種に変革をもたらすか?2010

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、林武司、津村義彦
    • 学会等名
      日本森林学会第121回大会
    • 発表場所
      筑波大学(発表予定)
    • 年月日
      2010-04-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Prospect for genomic selection in forest tree breeding2009

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Tsumura Y
    • 学会等名
      Eucarpia XIV meeting of the Biometrics in Plant Breeding Section
    • 発表場所
      Dundee, UK
    • 年月日
      2009-09-02
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Prospect for genomic selection in forest tree breeding.2009

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Tsumura Y.
    • 学会等名
      Eucarpia XIV meeting of the Biometrics in Plant Breeding Section.
    • 発表場所
      Dundee, UK.
    • 年月日
      2009-09-02
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] スギ雄花着生量を制御する遺伝 子を探る.遺伝子型から表現型へ・ゲノム育 種の林木における可能性2009

    • 著者名/発表者名
      伊原徳子
    • 学会等名
      第120回日本森林学会大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2009-03-27
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] スギ雄花着生量を制御する遺伝子を探る~遺伝子型から表現型へ・ゲノム育種の林木における可能性~2009

    • 著者名/発表者名
      伊原徳子
    • 学会等名
      第120回日本森林学会大会
    • 年月日
      2009-03-27
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Prospects for genomic selection of forest tree breeding : Simulation study for genetic improvement of conifer, Cryptomeria japonica2009

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、林武司、津村義彦
    • 学会等名
      Eucarpia Biometrics
    • 発表場所
      Dundee, UK
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] スギ雄花着生量を制御する遺伝子を探る2009

    • 著者名/発表者名
      伊原徳子
    • 学会等名
      第120回日本森林学会大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.ffpri.affrc.go.jp/labs/cjgenome/indexj.html

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考] スギゲノムデータベース

    • URL

      http://www.ffpri.affrc.go.jp/labs/cjgenome/indexj.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2019-07-29  

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