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ポリコム群によるES細胞維持と分化の分子メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 20390088
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 医化学一般
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

古関 明彦  独立行政法人理化学研究所, 免疫器官形成研究グループ, グループディレクター (40225446)

連携研究者 遠藤 高帆  独立行政法人理化学研究所, 生命情報基盤研究部門, 研究員 (40384862)
遠藤 充浩  独立行政法人理化学研究所, 免疫器官形成研究グループ, 研究員 (40391883)
信賀 順  独立行政法人理化学研究所, 免疫器官形成研究グループ, 研究員 (20334211)
藤村 雄一  独立行政法人理化学研究所, 免疫器官形成研究グループ, 研究員 (60392099)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
19,630千円 (直接経費: 15,100千円、間接経費: 4,530千円)
2010年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2009年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2008年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
キーワードポリコーム群 / ES細胞 / 転写制御 / CpGアイランド / マウス / PRC1 / PRC2 / ヒストン / Oct3 / 4 / ユビキチン
研究概要

ポリコーム群は、ヒストンH3K27をメチル化するタンパク複合体(PRC2)とH2Aをモノユビキチン化するPRC1のふたつの複合体の共同を介して、多くの発生関連遺伝子群に結合し、転写抑制に寄与する。しかしながら、ポリコーム群がどのように標的遺伝子群を認識し、それらの転写抑制に寄与するのか明らかにされていない。本研究では、H2Aモノユビキチン化が、転写抑制に必須であるものの、十分ではないことを実験的に示した。すなわち、いくつかの抑制メカニズムを相補的に用いて安定な抑制をひき起こしている可能性が示された。一方、標的遺伝子の認識についても、PRC2によって媒介されるヒストンH3K27トリメチル化に依存するメカニズムに加えて、依存しない経路が存在することを明らかにした。このような多様性があることにより、ポリコム群は様々な一次構造を持つゲノムに一様に対応することが可能になっていると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (58件)

すべて 2011 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (40件) (うち査読あり 40件) 学会発表 (16件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Mammalian Polycomblike Pcl2/Mtf2 is a novel regulatory component of PRC2 that can differentially modulate Polycomb activity at both the Hox gene cluster and at Cdkn2a genes2011

    • 著者名/発表者名
      Li X, Isono KI, Yamada D, Endo TA, Endoh M, Shinga J, Mizutani-Koseki Y, Otte AP, Casanova M, Kitamura H, Kamijo T, Sharif J, Ohara O, Toyada T, Bernstein BE, Brockdorff N, Koseki H
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol.

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Irxl1 mutant mice show reduced tendon differentiation and no patterning defects in musculoskeletal system development.2011

    • 著者名/発表者名
      Kimura W
    • 雑誌名

      Genesis

      巻: 49 ページ: 2-9

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mammalian Polycomblike Pcl2/Mtf2 is a novel regulatory component of PRC2 that can differentially modulate Polycomb activity at both the Hox gene cluster and at Cdkn2a genes.2011

    • 著者名/発表者名
      Li X
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol

      巻: 31 ページ: 351-364

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ESCs require PRC2 to direct the successful reprogramming of differentiated cells toward pluripotency2010

    • 著者名/発表者名
      Pereira CF, Piccolo FM, Tsubouchi T, Sauer S, Ryan NK, Bruno L, Landeira D, Santos J, Banito A, Gil J, Koseki H, Merkenschlager M, Fisher AG
    • 雑誌名

      Cell Stem Cell. 6

      ページ: 547-556

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel zinc finger protein Zfp277 mediates transcriptional repression of the Ink4a/arf locus through polycomb repressive complex 1.2010

    • 著者名/発表者名
      Negishi M
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 5

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective ablation of basophils in mice reveals their nonredundant role in acquired immunity against ticks.2010

    • 著者名/発表者名
      Wada T
    • 雑誌名

      J Clin Invest.

      巻: 120 ページ: 2867-2875

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spermatogenic Disruptions at Three Meiotic Stages in Hybrid Males Between House Mouse Subspecies or Species.2010

    • 著者名/発表者名
      Oka A
    • 雑誌名

      Genetics

      巻: 186 ページ: 339-351

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ESCs require PRC2 to direct the successful reprogramming of differentiated cells toward pluripotency2010

    • 著者名/発表者名
      Pereira CF
    • 雑誌名

      Cell Stem Cell.

      巻: 6 ページ: 547-556

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Murine induced pluripotent stem cells can be derived from and differentiate into natural killer T cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Watarai H
    • 雑誌名

      J Clin Invest.

      巻: 120 ページ: 2610-2618

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycomb group molecule PHC3 regulates polycomb complex composition and prognosis of osteosarcoma.2010

    • 著者名/発表者名
      Iwata S
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: 101 ページ: 1646-1652

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Opposing roles of polycomb repressive complexes in hematopoietic stem and progenitor cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Majewski IJ
    • 雑誌名

      Blood.

      巻: 116 ページ: 731-739

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycomb group gene product Ring1B regulates Th2-driven airway inflammation through the inhibition of Bim-mediated apoptosis of effector Th2 cells in the lung.2010

    • 著者名/発表者名
      Suzuki A
    • 雑誌名

      J Immunol.

      巻: 184 ページ: 4510-4520

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bmi1 is a MYCN target gene that regulates tumorigenesis through repression of KIF1Bbeta and TSLC1 in neuroblastoma.2010

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 29 ページ: 2681-2690

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A unique expression pattern of Tbx10 in the hindbrain as revealed by Tbx10(lacZ) allele.2010

    • 著者名/発表者名
      Xue X
    • 雑誌名

      Genesis

      巻: 48 ページ: 295-302

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CCN3 Inhibits Neointimal Hyperplasia Through Modulation of Smooth Muscle Cell Growth and Migration.2010

    • 著者名/発表者名
      Shimoyama T
    • 雑誌名

      Arterioscler Thromb Vasc Biol.

      巻: 30 ページ: 675-682

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CCN3 Inhibits Neointimal Hyperplasia Through Modulation of Smooth Muscle Cell Growth and Migration2010

    • 著者名/発表者名
      Shimoyama T
    • 雑誌名

      Arterioscler Thromb Vase Biol. (In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A unique expression pattern of Tbx10 in the hindbrain as revealed by Tbx10(lacZ)allele2010

    • 著者名/発表者名
      Xue X
    • 雑誌名

      Blood. (In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bmi1 is a MYCN target gene that regulates tumorigenesis through repression of KIF1Bbeta and TSLC1 in neuroblastoma2010

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H
    • 雑誌名

      Oncogene (In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] all4 is essential for stabilization, but not for pluripotency, of embryonic stem cells by repressing aberrant trophectoderm gene expression2009

    • 著者名/発表者名
      Yuri S
    • 雑誌名

      Stem Cells. 27

      ページ: 796-805

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MAPKAP kinase MK2 maintains self-renewal capacity of haematopoietic stem cells2009

    • 著者名/発表者名
      Schwermann J
    • 雑誌名

      EMBO J. 28

      ページ: 1392-406

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Induction of Wnt5a-expressing mesenchymal cells adjacent to the cloacal plate is an essential process for its proximodistal elongation and subsequent anorectal development2009

    • 著者名/発表者名
      Nakata M
    • 雑誌名

      Pediatr Res. 66

      ページ: 149-54

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of loss-of-function mutations of SLC35D1 in patients with Schneckenbecken dysplasia, but not with other severe spondylodysplastic dysplasias group diseases2009

    • 著者名/発表者名
      Furuichi T
    • 雑誌名

      J Med Genet. 46

      ページ: 562-8

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Maintenance of undifferentiated state and self-renewal of embryonic neural stem cells by Polycomb protein Ring1B2009

    • 著者名/発表者名
      Roman-Trufero M
    • 雑誌名

      Stem Cells. 27

      ページ: 1559-70

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel gene essential for the development of single positive thymocytes2009

    • 著者名/発表者名
      Kakugawa K
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol. 29

      ページ: 5128-35

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CRTAM confers late-stage activation of CD8+ T cells to regulate retention within lymph node2009

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi A
    • 雑誌名

      J Immunol. 183

      ページ: 4220-8

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycomb limits the neurogenic competence of neural precursor cells to promote astrogenic fate transition2009

    • 著者名/発表者名
      Hirabayashi Y
    • 雑誌名

      Neuron 63

      ページ: 600-13

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhanced Th2 cell differentiation and allergen-induced airway inflammation in Zfp35-deficient mice2009

    • 著者名/発表者名
      Kitajima M
    • 雑誌名

      J Immunol. 183

      ページ: 5388-96

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Generation of functional NKT cells in vitro from embryonic stem cells bearing rearranged invariant Valpha14-Jalpha18 TCRalpha gene2009

    • 著者名/発表者名
      Watarai H
    • 雑誌名

      Blood. 115

      ページ: 230-7

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomewide analysis of PRC1 and PRC2 occupancy identifies two classes of bivalent domains2008

    • 著者名/発表者名
      Ku M, Koche RP, Rheinbay E, Mendenhall EM, Endoh M, Mikkelsen TS, Presser A, Nusbaum C, Xie X, Chi AS, Adli M, Kasif S, Ptaszek LM, Cowan CA, Lander ES, Koseki H, Bernstein BE
    • 雑誌名

      PLoS Genet. 4

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycomb group proteins Ring1A/B are functionally linked to the core transcriptional regulatory circuitry to maintain ES cell identity2008

    • 著者名/発表者名
      Endoh M., Endo T.A., Endoh T., Fujimura Y., Ohara O., Toyoda T., Otte A.P., Okano M., Brockdorff N., Vidal M., Koseki H.
    • 雑誌名

      Development 135

      ページ: 1513-1524

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Altered quality control in the endoplasmic reticulum causes cortical dysplasia in knock-in mice expressing a mutant BiP2008

    • 著者名/発表者名
      Mimura N
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol. 28

      ページ: 293-301

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inactivation of the polycomb group protein Ring1B unveils an antiproliferative role in hematopoietic cell expansion and cooperation with tumorigenesis associated with Ink4a deletion2008

    • 著者名/発表者名
      Cales C
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol. 28

      ページ: 1018-28

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PRC1 and Suv39h specify parental asymmetry at constitutive heterochromatin in early mouse embryos2008

    • 著者名/発表者名
      Puschendorf M
    • 雑誌名

      Nat Genet 40

      ページ: 411-20

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycomb group proteins Ring1A/B are functionally linked to the core transcriptional regulatory circuitry to maintain ES cell identity2008

    • 著者名/発表者名
      Endoh M
    • 雑誌名

      Development 135

      ページ: 1513-24

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A polycomb group protein, PHF1, is involved in the response to DNA double-strand breaks in human cell2008

    • 著者名/発表者名
      Hong Z
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

      ページ: 2939-2947

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A lysosomal protein negatively regulates surface T cell antigen receptor expression by promoting CD3zeta-chain degradation2008

    • 著者名/発表者名
      Ouchida R
    • 雑誌名

      Immunity 29

      ページ: 33-43

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Repressor of GATA regulates T(H)2-driven allergic airway inflammation and airway hyperresponsiveness2008

    • 著者名/発表者名
      Hirahara K
    • 雑誌名

      J Allergy Clin Immunol 122

      ページ: 512-20

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The zinc transporter SLC39A13/ZIP13 is required for connective tissue development ; its involvement in BMP/TGF-beta signaling pathways2008

    • 著者名/発表者名
      Fukada T
    • 雑誌名

      PLoS ONE 3

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomewide analysis of PRC1 and PRC2 occupancy identifies two classes of bivalent domains2008

    • 著者名/発表者名
      Ku M
    • 雑誌名

      PLoS Genet. 4

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear Inhibitor of Protein Phosphatase-1 (NIPP1) Directs Protein Phosphatase-1 (PP1) to Dephosphorylate the U2 Small Nuclear Ribonucleoprotein Particle (snRNP) Component, Spliceosome-associated Protein 155 (Sap155)2008

    • 著者名/発表者名
      Tanuma N
    • 雑誌名

      J Biol Chem 19

      ページ: 35805-35814

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Polycomb-dependent regulation for differentiation programs of stem cells and progenitors2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第16回国際分化学会国際会議
    • 発表場所
      奈良、日本
    • 年月日
      2010-11-16
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Polycomb-dependent regulation for differentiation programs of stem cells and progenitors2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第16回国際分化学会国際会議
    • 発表場所
      日本、奈良市
    • 年月日
      2010-11-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] The role of Polycomb body to mediate Hox repression2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      東京大学分子細胞生物学研究所 核内情報研究分野 シンポジウム
    • 発表場所
      東京、日本
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] The role of Polycomb body to mediate Hox repression2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      東京大学分子細胞生物学研究所 核内情報研究分野
    • 発表場所
      日本、東京都(シンポジウム)
    • 年月日
      2010-11-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] プロモーターアレイを用いたポリコーム群によるES細胞維持メカニズムの解析2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      日本エピジェネティクス研究会第4回年会
    • 発表場所
      米子,日本
    • 年月日
      2010-05-22
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] プロモーターアレイを用いたポリコーム群によるES細胞維持メカニズムの解析2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      日本エピジェネティクス研究会第4回年会
    • 発表場所
      日本、米子市
    • 年月日
      2010-05-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝現象におけるエピジェネティック制御とリプログラミング2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第62回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      大阪,日本
    • 年月日
      2010-05-19
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝現象におけるエピジェネティック制御とリプログラミング2010

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第62回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      日本、大阪市
    • 年月日
      2010-05-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] HP1g links histone H3K9 methylation to homologus chromosome pairing during melotic prophase2009

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      he Epigenetics 2009 Australian Scientific Conference@Epigenetics and Development
    • 発表場所
      Brisbane, Australia
    • 年月日
      2009-12-02
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] HP1g links histone H3K9 methylation to homologus chromosome pairing during melotic prophase2009

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      The Epigenetics 2009 Australian Scientific Conference@Epigenetics and Development
    • 発表場所
      ブリスベン、豪州
    • 年月日
      2009-12-02
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ES細胞におけるポリコーム群の動き2009

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第42回日本発生生物学会年会
    • 発表場所
      京都、日本
    • 年月日
      2009-05-29
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] Histone H2A ubiquitinylation subdivides bivalent genes into PRC1-dependent and -independent domains in ES cells2008

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会、合同大会
    • 発表場所
      神戸,日本
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Polycom repression mediates pluripotency of ES cells2008

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory
    • 発表場所
      New York, U.S.A.
    • 年月日
      2008-10-31
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] Mouse development : embryogenesis2008

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      EMBO Practical Course on Anatomy and Embryology of the Mouse
    • 発表場所
      Zagreb, Croatia
    • 年月日
      2008-09-06
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] Polycomb group proteins Ring1A/B are functionally linked to the coretranscriptional regulatory circuitry to maintain ES cell identity2008

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      Shanghai Cancer Institute
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 年月日
      2008-07-03
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] Histone H2A ubiquitinylation subdivides bivalent genes into PRC1-dependent and-independent domains in ES cells2008

    • 著者名/発表者名
      Koseki H
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会、合同大会
    • 発表場所
      神戸,日本
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] ES細胞の製造方法2011

    • 発明者名
      古関明彦
    • 権利者名
      独立行政法人理化学研究所
    • 出願年月日
      2011-04-01
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 外国
  • [産業財産権] 変異体FGF2008

    • 発明者名
      古関明彦
    • 権利者名
      国立大学法人千葉大学、独立行政法人理化学研究所
    • 産業財産権番号
      2008-081826
    • 出願年月日
      2008-03-26
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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