シロイヌナズナ無細胞転写解析法による光依存転写機構の解析

• 研究課題/領域番号: 20510188
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 名古屋市立大学
• 研究代表者: 湯川 泰 名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (70381902)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2008年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 光依存 / 転写制御 / シロイヌナズナ / 無細胞 / 遺伝子発現 / 転写 / 無細胞系 / 光依存転写 / MM2d細胞 / 培養細胞 / 液胞除去 / 光合成 / 光依存制御 / MM2d株

研究概要

シロイヌナズナ培養細胞で成長の速いMM2d株を材料に、無細胞転写解析系を確立した。MM2d細胞は通常の暗条件下での培養で黄化下細胞となるが、光を当てて培養することにより緑化した細胞を調製することができる。そこで、それぞれの細胞から細胞核を単離し、無細胞転写解析系を作成した。明培養および暗培養由来の無細胞系をもちいて、シロイヌナズナの光合成遺伝子であるリブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼ(rbcS)遺伝子の光依存転写制御を解析することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] A common sequence motif involved in selection of transcription start sites of Arabidopsis and budding yeast tRNA genes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasushi Yukawa, Giorgio Dieci, Mircko Alzapiedi, Asako Hiraga, Katsuaki Hirai, Yoshiharu Yamamoto, Masahiro Sugiura.
  • 雑誌名: Genomics 97 ページ: 166-172
  • 査読あり
• [雑誌論文] A common sequence motif involved in selection of transcription start sites of Arabidopsis and budding yeast tRNA genes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasushi Yukawa, Giorgio Dieci, Mircko Alzapiedi, Asako Hiraga, Katsuaki Hirai, Yoshiharu Yamamoto, Masahiro Sugiura.
  • 雑誌名: Genomics 巻: 97 ページ: 166-172
  • 査読あり
• [学会発表] シロイヌナズナにおけるUSE結合タンパク質複合体の単離解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 町田瑠璃子、柴田恵利、大谷美沙都、杉山宗隆、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Requirements for translation initiation of rps2 mRNA in tobaccochloroplast. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Kuroda, Yuka Adachi, Shin-ichiro Ozawa, Yuichiro Takahashi, Yasushi Yukawa, Masahiro Sugiura
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: 呉娟, 岡田敏浩, 杉浦昌弘, 湯川泰
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: Kobe
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] シロイヌナズナ光合成遺伝子の光依存転写制御の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 宮崎綾香、岩田真也、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: Juan Wu, Toshihiro Okada, Masahiro Sugiura, Yasushi Yukawa
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: 呉娟, 岡田敏浩, 杉浦昌弘, 湯川泰
  • 学会等名: 21st International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2010-06-08
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: Juan Wu, Toshihiro Okada, Masahiro Sugiura, Yasushi Yukawa
  • 学会等名: 21st International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2010-06-08
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: 呉娟, 岡田敏浩, 杉浦昌弘, 湯川泰
  • 学会等名: International Symposium on Biodiversity Sciences "Genome, Evolution and Environment"
  • 発表場所: Nagoya
• [学会発表] Functional analysis of novel small RNA in Arabidopsis thaliana (2010)
  • 著者名/発表者名: Juan Wu.Toshihiro Okada, Masahiro Sugiura, Yasushi Yukawa
  • 学会等名: International Symposium on Biodiversity Sciences "Genome, Evolution and Environment"
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 高等植物mRNAスプライシングのin vitro解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 岩田有加、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 葉緑体mRNAの5'非翻訳領域とタンパク質コード領域の適合性検証 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大羽由衣、湯川眞希、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] シロイヌナズナにおけるUSE結合転写因子複合体の単離解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 柴田恵利、大谷美沙都、杉山宗隆、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 高等植物mRNAスプライシングの in vitro 解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 岩田有加, 杉浦昌弘, 湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] シロイヌナズナ新規低分子RNA欠損株のオーキシン応答性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 二村博、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] シロイヌナズナの新規低分子RNAの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 呉娟、岡田敏浩、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] タバコ培養細胞由来細胞質in vitro翻訳系の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本裕子、湯川眞希、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] タバコ培養細胞由来細胞質 in vitro 翻訳系の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本裕子, 湯川眞希, 杉浦昌弘, 湯川泰
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] シロイヌナズナの新規低分子RNAの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 呉娟、岡田敏浩、湯川泰
  • 学会等名: 第73回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-05-23
• [学会発表] 葉緑体mRNAの5'翻訳領域の切断と翻訳効率 (2009)
  • 著者名/発表者名: 黒田洋詩、足達由佳、湯川泰、杉浦昌弘
  • 学会等名: 日本植物生理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-22
• [学会発表] タバコ葉緑体翻訳反応における5'非翻訳領域とコード領域の適合性検証 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大羽由衣、湯川眞希、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 日本植物生理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-22
• [学会発表] タバコ葉緑体翻訳反応における 5'非翻訳領域とコード領域の適合性検証 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大羽 由衣, 湯川 眞希, 杉浦昌弘, 湯川 泰
  • 学会等名: 日本植物生理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-22
• [学会発表] 葉緑体psbD-psbC 翻訳開始機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 足達由佳、黒田洋詩、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] 葉緑体psbD-psbC翻訳開始機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 足達 由佳, 黒田 洋詩, 杉浦昌弘, 湯川 泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来のin vitro 転写系の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 岩田真也、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] イネ新規non-coding RNAの探索 (2008)
  • 著者名/発表者名: 西田満帆、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] イネ新規non-coding RNA の探索 (2008)
  • 著者名/発表者名: 西田 満帆, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 葉緑体 in vitro翻訳系を用いた翻訳機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 黒田 洋詩, 湯川 眞希, 鈴木晴香, 湯川 泰, 杉浦 昌弘
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー国際シンポジウム「葉緑体のすべてに迫る」
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-10-14
• [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来のin vitro 転写系の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 岩田真也、杉浦昌弘、湯川泰
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-09-05
• [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-09-05
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~yyuk/