ゲノム情報に基づくビフィズス菌の革新的遺伝子操作技術の開発

• 研究課題/領域番号: 20510189
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 岐阜大学
• 研究代表者: 鈴木 徹 岐阜大学, 連合農学研究科, 教授 (20235972)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2009年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: 形質転換 / プラスミド人工修飾法 / PAM / 遺伝子破壊 / Bifidobacterium adolescentis / 相同組換え / 逆遺伝学 / Bifidobacterium longum / 温度感受性プラスミド / ビフィズス菌 / プロバイオティクス / テーラーメードプロバイオティクス / ゲノム解析 / ゲノミクス / 腸内細菌 / 遺伝子操作 / 制限修飾系 / ゲノム情報 / PAM法 / エレクトロポレーション / Plasmid Artificial Modification

研究概要

ビフィズス菌は、ヒトの健康にとって重要な役割をはたしていると考えられているが、そのエビデンスは必ずしも多くない。これは、本菌の遺伝子操作技術が開発されていない事に起因する。本研究では、ビフィズスのゲノム解析の結果に基づき新規形質転換系、新規選択マーカー、及び遺伝子破壊系の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Bifidobacteria can protect from enteropathogenic infection through production of acetate. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, S., H.Toh, K.Hase, K.Oshima, Y.Nakanishi, K.Yoshimura, T.Tobe, J.M.Clarke, D.L.Topping, T.Suzuki, T.D.Taylor, K.Itch, J.Kikuchi, H.Morita, M.Hattori, H.Ohno.
  • 雑誌名: Nature 469 ページ: 543-547
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bifidobacteria can protect from enteropathogenic infection through production of acetate. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, S., H.Toh, K.Hase, K.Oshima, Y.Nakanishi, K.Yoshimura, T.Tobe, J.M.Clarke, D.L.Topping, T.Suzuki, T.D.Taylor, K.Itoh, J.Kikuchi, H.Morita, M.Hattori, H.Ohno.
  • 雑誌名: Nature 巻: 469 ページ: 543-547
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of an O-desmethylangolensin-producing bacterium isolated from human feces. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S., T.Niwa, T.Osawa, T.Suzuki.
  • 雑誌名: Arch.Microbial.(DOI 10.1007/s00203- 009-0524-5) 192 ページ: 15-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of an O-desmethylangolensin-producing bacterium isolated from human feces. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S., T.Niwa, T.Osawa, T.Suzuki.
  • 雑誌名: Arch.Microbiol. 巻: 192 ページ: 15-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] The multiplicity of N-glycan structures of bovine milk 18 kDa lactophorin (miGlyCAM-1). (2010)
  • 著者名/発表者名: Inagaki, M., S.Nakaya, D.Nohara, T.Yabe, Y.Kanamaru, T.Suzuki.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem. 巻: 74 ページ: 447-450
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of an O-desmethylangolensin-producing bacterium isolated from human feces (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.-i., T.Niwa, T.Osawa, T.Suzuki
  • 雑誌名: Arch.Microbiol 192(●)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intra-species Diversity Between Seven Bifidobacterium adolescentis Strains Identified by Genome-wide Tiling Array Analysis. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasui, K., M.Tabata, S.Yamada, T.Abe, T.Ikemura, R.Osawa, T.Suzuki.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol. Biochem. 73 ページ: 1422-1424
  • NAID: 10027542817
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of bacterial transformation efficiency using plasmid artificial modification. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasui, K., Y.Kano, K.Tanaka, K.Watanabe, M.Shimizu-Kadota, H.Yoshikawa, T.Suzuki.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res doi:10.1093/nar/gkn884 ページ: 37-37
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improvement of bacterial transformation efficiency using plasmid arti ficial modifi cation. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasui K, Kano Y, Tanaka K, Watanabe K, Shimizu-Kadota M, Yoshikawa H, Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37(e3. Epub)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intra-species diversity between seven Bifidobacterium adolescentis strains identified by genome-wide tiling array analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasui, Kazumasa., Tabata Mototsugu., Yamada, Satoki., Osawa, Ro., Suzuki, Tohru
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry (In Press)
  • NAID: 10027542817
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a novel equol-producing bacterium from human feces. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.-I., T.Suzuki.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem. 72 ページ: 2660-2666
  • NAID: 10027533138
  • 査読あり
• [学会発表] Expression of catalase gene affords toleranceto oxygen in Bifidobacterium longum 105 A. (2010)
  • 著者名/発表者名: Jianlong, H., T.Suzuki
  • 学会等名: in 3rd Intnatinal Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria.
  • 発表場所: Oviedo, Spain.
• [学会発表] Construction and molecular characterization of the temperature sensitive plasmid for Bifidobacterium longum. (2010)
  • 著者名/発表者名: 坂口広太, 鈴木徹
  • 学会等名: in 3rd Intnatinal Symposium on Propionibac teria and Bifidobacteria.
  • 発表場所: Oviedo, Spain.
• [学会発表] ダイズイソフラボンをEquolに変換するEggerthella sp.YY7918のゲノム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 横山慎一郎, 大島健志朗, 野村泉, 鈴木徹
  • 学会等名: in農芸化学会大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キヤンパス
• [学会発表] ダイズイソフラボンをO-DMAに変換するヒト腸内由来の新規Clostridium Cluster XIVa細菌SY8519株のゲノム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 横山慎一郎, 野村泉, 鈴木徹, 大島健志朗, 服部正平
  • 学会等名: in日本乳酸菌学会2010年度大会
  • 発表場所: フォレスト仙台
• [学会発表] 牛乳ラクトフォリン(milk Glycam-1)のN型糖鎖構造の多様性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲垣瑞穂, 中家修一, 野原大輔, 矢部富雄, 金丸義敬, 鈴木徹
  • 学会等名: in農芸化学会大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス
• [学会発表] Bifidobacterium longumで機能するプロモーターの活性比較 (2010)
  • 著者名/発表者名: 賀建龍, 鈴木徹
  • 学会等名: in農芸化学会大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス
• [学会発表] Construction and molecular characterization of the temperature sensitive plasmid for Buidobacterium longum. (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Sakaguchi, T.Suzuki
  • 学会等名: 3^<rd> Intnatinal Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria
  • 発表場所: Oviedo, Spain
• [学会発表] Expression of catalase gene affords toleranceto oxygen in Buidobacterium longum 105-A (2010)
  • 著者名/発表者名: HE Jianlong, T.Suzuki
  • 学会等名: 3^<rd> Intnatinal Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria
  • 発表場所: Oviedo, Spain
• [学会発表] プラスミ人工修飾法(PAM)によるビフィズス菌の遺伝子導入系の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 安井一将, 坂口広太, 加納康正, 門多真理子, 吉川博文, 鈴木徹
  • 学会等名: in第13回腸内細菌学会
  • 発表場所: 北里大学薬学部,東京.
• [学会発表] Aspergillus oryzae のキシリトール代謝関連遺伝子削除株によるキシリトール生産 (2009)
  • 著者名/発表者名: 榊原由佳, 渥美元規, 中村浩平, 北本則行, 鈴木徹, 高見澤一裕
  • 学会等名: in生物工学会61回大会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス
• [学会発表] 枯草菌を用いたPAM(Plasmid Artificial Modification)法による乳酸球菌Lactococcus lactis IO-1株の形質転換頻度の改善 (2009)
  • 著者名/発表者名: 渡辺寛, 廣崎辰也, 東崎正, 鈴木徹, 園元謙二, 門多真理子, 吉川博文.
  • 学会等名: in日本乳酸菌学会2009年度大会
  • 発表場所: ベルクラシック甲府
• [学会発表] A repeatable gene disruption method for Bifidobacterium longum 105-A (2008)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi K., N.Funaoka, Y.Kano, T.Suzuki
  • 学会等名: in 9th Symposoum on Lactic Acid Bacteria
  • 発表場所: Egmond, Netherlands : FEMS.
• [学会発表] Complete genome structure of Bifidobacterium adolescentis ATCC15703 and inter strain genome-wide polymorphism between 7 B.adolescentis strains using tilling array analyses. (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T., H.Tabata, K.Suganuma, K.Yasui, K.Tanaka, K.Watanabe, K.Sakaguchi, T.Abe, T.Ikemura, R.Osawa
  • 学会等名: in 9th Symposoum on Lactic Acid Bacteria.
  • 発表場所: Egmond, Netherlands : FEMS.
• [学会発表] Plasmid artificial modification (PAM) : a genomic information-based method to improve transformation efficiency in Bifidobacterium adolescentis ATCC15703. (2008)
  • 著者名/発表者名: 安井一将, 加納康正, 鈴木徹
  • 学会等名: in 9th Symposoum on Lactic Acid Bacteria.
  • 発表場所: Egmond Netherlands : FEMS.
• [学会発表] プラスミド人工的メチル化(PAM)によるBifidobacterium adolescentis ATCC15703の形質転換効率の向上 (2008)
  • 著者名/発表者名: 安井一将, 鈴木徹, 加納康正
  • 学会等名: in日本乳酸菌学会2008年度大会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] ヒト糞便由来の新規Equol産生菌の単離と諸性質について (2008)
  • 著者名/発表者名: 横山慎一郎, 鈴木徹
  • 学会等名: in生物工学会60回大会
  • 発表場所: 東北学院大学土樋キャンパス
• [学会発表] タイリングアレイと自己組織化マップを用いたBifidobacterium adolescentis 菌株間のゲノム多型の網羅的解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木徹, 田端大嗣, 菅沼宏美, 安井一将, 田中香お里, 渡邉邦友, 池村淑道, 阿部貴志, 大澤朗.
  • 学会等名: in第12回腸内細菌学会
  • 発表場所: 東京大学弥生講堂
• [図書] 染色体 DNA の遺伝解析.世紀を超えるビフィズス菌の研究 その基礎と臨床応用から 製品開発へー (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木徹
  • 出版者: 日本ビフィズス菌センタ ー
• [図書] Strain Engineering : Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology(Plasmid Artificial Modification: A Novel Method for Efficient DNA Transfer into Bacteria.)(In J.A.Williams (ed.)) (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T, K.Yasui
  • 出版者: A Humana Press.
• [図書] Plasmid Artificial Modification : A Novel Method for Efficient DNA Transfer into Bacteria.(J.A.Williams (ed.)), Strain Engineering : Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., K.Yasui.
  • 総ページ数: 21
  • 出版者: A Humana Press, Springer
• [図書] Lactic Acid Bacteria : Sophisticated Progress(Current status of Bifidobacterium gene maniplation technology.)(In K.Sonomoto and A.Yokota (ed.)) (2010)
  • 著者名/発表者名: Fukiya, S., Suzuki T, Y.Kano, A.Yokota.
  • 出版者: Hrizon Scientific Press, UK.
• [図書] Current status of Bifidobacterium gene maniplation technology.(K.Sonomoto and A(ed.)), Lactic Acid Bacteria : Sophisticated Progress (2010)
  • 著者名/発表者名: Fukiya, S., T.Suzuki, Y.Kano, Yokota.
  • 総ページ数: 20
  • 出版者: Hrizon Scientific Press, UK.
• [備考] ホームページ等