結晶中における生体高分子ダイナミクスの精密計測

• 研究課題/領域番号: 20510199
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 竹田 一旗 京都大学, 大学院・理学研究科, 講師 (30332290)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2010年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2009年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2008年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: タンパク質 / 結晶 / スペクトル

研究概要

タンパク質結晶中での構造変化を溶液中のものに対応させて機能に密接に関連した構造変化として議論するために、光学密度の高い結晶試料のスペクトル測定が可能な顕微分光装置を製作した。加えて、各種の色素含有タンパク質について分光測定に都合が良い平板状の結晶作成条件を確立し、可視吸収スペクトルを測定した。これらのタンパク質結晶のX線結晶構造解析においては、X線損傷の影響を低減することで詳細な構造変化を捉えることができた。また、光合成に関与する新規な色素含有タンパク質の結晶構造を決定することができた。

研究成果

• [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archeal small heat shock protein. (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Takeda, T.Hayashi, T.Abe, Y.Hirano, Y.Hanazono, M.Yohda, K.Miki
  • 雑誌名: J.Struct. Biol. 174 ページ: 92-99
  • 査読あり
• [雑誌論文] 超高分解能・超高精度のタンパク質結晶構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗、三木邦夫
  • 雑誌名: 生物物理 51 ページ: 96-99
  • NAID: 10028105855
• [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archeal small heat shock protein (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Takeda, T.Hayashi, T.Abe, Y.Hirano, Y.Hanazono, M.Yohda, K.Miki
  • 雑誌名: J.Struct.Biol. 巻: 174 ページ: 92-99
  • 査読あり
• [雑誌論文] 超高分解能・超高精度のタンパク質結晶構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗, 三木邦夫
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 51 ページ: 96-99
  • NAID: 10028105855
• [雑誌論文] Detailed assessment of X-ray induced structural perturbation in a crystalline state protein. (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Takeda, K.Kusumoto, Y.Hirano, K.Miki
  • 雑誌名: J.Struct. Biol. 169 ページ: 135-144
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質における超高分解能X線結晶構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗、平野優、三木邦夫
  • 雑誌名: 日本結晶学会誌 52 ページ: 14-18
  • NAID: 10026107733
• [雑誌論文] Detailed assessment of X-ray induced structural perturbation in a crystalline state protein. (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Takeda, K.Kusumoto, Y.Hirano, K.Miki
  • 雑誌名: J.Struct.Biol. 169 ページ: 135-144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of a periplasmic substrate-binding protein in complex with calcium lactate. (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Akiyama, K.Takeda, K.Miki
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 192 ページ: 559-565
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of a periplasmic substrate-binding protein in complex with calcium lactate. (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Akiyama, K.Takeda, K.Miki
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 392 ページ: 559-565
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質研究を躍進させたX線結晶構造解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗, 三木邦夫
  • 雑誌名: 化学 63 ページ: 25-28
• [学会発表] タンパク質の価電子を見る (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌市
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] タンパク質の価電子を見る (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗
  • 学会等名: 第10回 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌市(招待講演)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 超高分解能構造解析---タンパク質における電子軌道形状の可視化をめざして (2009)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本市
  • 年月日: 2009-05-29
• [学会発表] 超高分解能構造解析---タンパク質における電子軌道形状の可視化をめざして (2009)
  • 著者名/発表者名: 竹田一旗
  • 学会等名: 第9回 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本市
  • 年月日: 2009-05-20
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.kuchem.kyoto-u.ac.jp/organization/member/ktakeda.html
• [備考]
  • URL: http://www.kuchem.kyoto-u.ac.jp/organization/member/ktakeda.html
• [備考]
  • URL: http://www.kuchem.kyoto-u.ac.jp/organization/member/ktakeda.html