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大腸菌染色体複製関連タンパク質における相互作用解析

研究課題

研究課題/領域番号 20570110
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関九州大学

研究代表者

阿部 義人  九州大学, 薬学研究院, 准教授 (60315091)

研究分担者 片山 勉  九州大学, 薬学研究院, 教授 (70264059)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2010年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2008年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード分子認識および相互作用 / 複製 / NMR / DNA複製 / 蛋白質構造 / 蛋白質間相互作用 / 蛋白質複合体
研究概要

タンパク質には単体で機能するものもあるが、他のタンパク質と複合体を形成したり、相互作用することによって分子機能を持つものが多い。本研究では、そのような分子間相互作用が機能につながっていると考えられるCedA、HSPQ、PriB、PriC、DnaTなどの大腸菌染色体複製に関与する蛋白質の構造および相互作用をNMR解析および変異体解析を用いて調べ、その機能との相関を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (25件) (うち査読あり 23件) 学会発表 (29件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Evidence for the binding of phosphate ion to the C-terminus region in A β 1-40 using heteronuclear NMR analyses2010

    • 著者名/発表者名
      Nagata-Uchiyama M, Abe Y, Monji A, Kanba S, Ueda T
    • 雑誌名

      Protein Peptide lett. 17

      ページ: 176-180

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of protein concentration and pH on the chitinase activity of Tapes japonica lysozyme2010

    • 著者名/発表者名
      Goto T, Abe Y, Imoto T, Ueda T
    • 雑誌名

      Protein Peptide lett. 17

      ページ: 172-175

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of membrane domain of human erythrocyte anion exchanger 1 revealed by electron crystallography2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi T, Ikeda Y, Abe Y, Kuma H, Kang D, Hamasaki N, Hirai T
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 397,1

      ページ: 179-189

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutation of His 834 in human anion exchanger 1 affects substrate binding2010

    • 著者名/発表者名
      Takazaki S, Abe Y, Yamaguchi T, Yagi M, Ueda T, Kang D, Hamasaki N
    • 雑誌名

      BBA -Biomembranes 1798,5

      ページ: 903-908

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the conformational equilibrium of reduced hen egg lysozyme by antibodies to the native form2010

    • 著者名/発表者名
      Oda M, Kitai A, Murakami A, Nishimura M, Ohkuri T, Abe Y, Ueda T, Nakamura H, Azuma T
    • 雑誌名

      Arch Biochem Biophys 494,2

      ページ: 145-150

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helical image reconstruction of the outward-open human erythrocyte band 3 membrane domain in tubular crystals2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi T, Fujii T, Abe Y, Hirai T, Kang D, Namba K, Hamasaki N, Mitsuoka K
    • 雑誌名

      J. Struc. Biol. 169,3

      ページ: 406-412

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of His mutations on the fibrillation of amyloidogenic Vλ 6 protein Wil under acidic and physiological conditions2010

    • 著者名/発表者名
      Mishima T, Ohkuri T, Monji A, Kanemaru T, Abe Y, Ueda T
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 391,1

      ページ: 615-620

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helical image reconstruction of the outward-open human erythrocyte band 3 membrane domain in tubular crystals2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, et al.
    • 雑誌名

      Journal of structural biology 169

      ページ: 406-412

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the conformational equilibrium of reduced hen egglysozyme by antibodies to the native form2010

    • 著者名/発表者名
      Oda, et al.
    • 雑誌名

      Archives of biochemistry and biophysics 494

      ページ: 145-150

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of His mutations on the fibrillation of amyloidogenic Vλ6 protein Wil under acidic and physiological conditions2010

    • 著者名/発表者名
      Mishima, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and biophysical research communication 391

      ページ: 615-620

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of membrane domain of human erythrocyte anion exchanger 1 revealed by electron crystallography2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, et al.
    • 雑誌名

      Journal of molecular biology 397

      ページ: 179-189

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutation of His 834 in human anion exchanger 1 affects substrate binding2010

    • 著者名/発表者名
      Takazaki, et al.
    • 雑誌名

      BBA- biomembrane 1710

      ページ: 903-968

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evidence for the binding of phosphate ion to the C-terminus region in Ass1-40 using heteronuclear NMR analyses2010

    • 著者名/発表者名
      Nagata-Uchiyama, et al.
    • 雑誌名

      Protein and peptide letters 17

      ページ: 172-175

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of protein concentration and pH on the chitinase activity of Tapes japonica lysozyme2010

    • 著者名/発表者名
      Goto, et al.
    • 雑誌名

      Protein and peptide letters 17

      ページ: 176-180

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Residual Structures in the Acid-Unfolded States of Vlambda6 Proteins Affect Amyloid Fibrillation.2009

    • 著者名/発表者名
      Mishima T, Ohkuri T, Monji A, Kanemaru T, Abe Y, Ueda T
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 392

      ページ: 1033-1043

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DiaA dynamics are coupled with changes in initial origin complexes leading to helicase loading.2009

    • 著者名/発表者名
      Keyamura K, Abe Y, Higashi M, Ueda T, Katayama T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 284

      ページ: 25038-25050

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Factor G Utilizes a Carbohydrate-Binding Cleft That Is Conserved between Horseshoe Crab and Bacteria for the Recognition of {β}-1,3-d-Glucans.2009

    • 著者名/発表者名
      Ueda Y, Ohwada S, Abe Y, Shibata T, Iijima M, Yoshimitsu Y, Koshiba T, Nakata M, Ueda T, Kawabata SI.
    • 雑誌名

      J. Immunol. 183

      ページ: 3810-3818

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アサリ貝リゾチームの構造と機能2009

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 植田正
    • 雑誌名

      生化学 81

      ページ: 314-319

    • NAID

      10024916502

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DiaA dynamics are coupled with changes in initial origin complexes leading to helicase loading2009

    • 著者名/発表者名
      Keyamura, et al
    • 雑誌名

      Journal of biological chemistry 284

      ページ: 25038-25050

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Residual Structures in the Acid-Unfolded States of Vlambda6 Proteins Affect Amyloid Fibrillation2009

    • 著者名/発表者名
      Mishima, et al
    • 雑誌名

      Journal of molecular biology 392

      ページ: 1033-1043

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Factor G Utilizes a Carbohydrate-Binding Cleft That Is Conserved between Horseshoe Crab and Bacteria for the Recognition of {beta}-1, 3-d-Glucans2009

    • 著者名/発表者名
      Ueda, et al.
    • 雑誌名

      Journal of immunology 183

      ページ: 3810-3818

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アサリ貝リゾチームの構造と機能2009

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 他
    • 雑誌名

      生化学 81

      ページ: 314-319

    • NAID

      10024916502

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] アサリ貝リゾチームの構造と機能2009

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人, 他
    • 雑誌名

      生化学 (In press)

    • NAID

      10024916502

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structures of K33 mutant hen lysozymes with enhanced activities.2008

    • 著者名/発表者名
      Goto T, Ohkuri T, Shioi S, Abe Y, Imoto T, Ueda T
    • 雑誌名

      J. Biochem. 144

      ページ: 619-623

    • NAID

      10024913411

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of K33 mutant hen lysozymes with enhanced activities.2008

    • 著者名/発表者名
      Goto, et al.
    • 雑誌名

      J. Biochemistry 144

      ページ: 619-623

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 大腸菌の複製再開始蛋白質の構造と-本鎖DNA認識2011

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 他
    • 学会等名
      平成23年度 九大P&P拡大研究会「超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト」
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2011-01-12
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌の複製再開始蛋白質の構造と一本鎖DNA認識2011

    • 著者名/発表者名
      阿部義人、片山勉、植田正
    • 学会等名
      平成23年度九大P&P拡大研究会「超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト」
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA複製再開始におけるプライモソーム構成因子PriCの構造機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 他
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] NMRを用いた大腸菌複製再開始因子PriBの相互作用解析2010

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 他
    • 学会等名
      第10回日本タンパク質科学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能2010

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 他
    • 学会等名
      第10回日本タンパク質科学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製再開始におけるプライモソーム構成因子PriCの構造機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、植田正
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] NMRを用いた大腸菌複製再開始因子PriBの相互作用解析2010

    • 著者名/発表者名
      阿部義人、竹縄太一、塩井誠次郎、片山勉、植田正
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能2010

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、三島朋徳、片山勉、植田正
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能について2009

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 他
    • 学会等名
      P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-12-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 構造生物学アプローチによる大腸菌細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 他
    • 学会等名
      P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-12-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌熱ショック蛋白質HSPQの機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      中田光, 他
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      2009-12-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌プライモソーム構成因子PriC N末ドメインのNMR構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 他
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-05-16
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製再開に関わるプライモソーム構成因子 DnaT のドメイン化及びNMRに よる構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      谷純也, 他
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-05-16
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 構造生物学アプローチによる大腸菌細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      阿部義人、三好孝法、渡邊典子、片山勉、植田正
    • 学会等名
      P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能について2009

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、三島朋徳、片山勉、植田正
    • 学会等名
      P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌熱ショック蛋白質HSPQの機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      中田光、阿部義人、塩井誠次郎、片山勉、植田正
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA複製再開に関わるプライモソーム構成因子DnaTのドメイン化及びNMRによる構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      谷純也、阿部義人、佐藤健治、片山勉、植田正
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌プライモソーム構成因子PriC N末ドメインのNMR構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      荒牧峻彦, 阿部義人, 大栗誉敏, 三島朋徳, 片山勉
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      三好孝法, 他
    • 学会等名
      日本分子生物学会・生化学会合同年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌熱ショックタンパク質HSPQの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      中田光, 他
    • 学会等名
      日本薬学会九州支部大会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2008-12-07
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ラットATP受容体細胞外ドメインの大腸菌発現系構築2008

    • 著者名/発表者名
      東 貞行, 他
    • 学会等名
      日本薬学会九州支部大会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2008-12-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 変性条件下における抗体λ6鎖の残存構造がアミロイド繊維形成に及ぼす影響2008

    • 著者名/発表者名
      三島朋徳, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-12-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ヒト赤血球膜蛋白質バンド3膜貫通ドメインの電子線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      山口知宏, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-12-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Effect of the phosphate ion on the A-beta amyloidogenesis using heteronuclear NMR2008

    • 著者名/発表者名
      Uchiyama M, et al.
    • 学会等名
      20th FAOBMB Taipei Conference
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2008-10-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ヒト赤血球膜蛋白質Band3膜貫通ドメインの極低温電子顕微鏡構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      山口知宏, 他
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2008-05-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 構造生物学的アプローチによる大腸菌複製開始因子DnaAの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      阿部義人, 他
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部例会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-05-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      三好孝法、阿部義人、渡辺典子、片山勉、植田正
    • 学会等名
      第31日本分子生物学会・第83回生化学会合同年会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌熱ショックタンパク質HSPQの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      中田光、阿部義人、塩井誠次郎、片山勉、植田正
    • 学会等名
      日本薬学会九州支部大会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 構造生物学的アプローチによる大腸菌複製開始因子DnaAの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      阿部義人、大栗誉敏、片山勉、植田正
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部例会
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考] ホームページ等

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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