CUT-homeodomain転写因子のDNA結合におけるドメイン間相違と協同性

• 研究課題/領域番号: 20570119
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 山崎 和彦 独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 主任研究員 (00358243)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2008年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: DNA結合タンパク質 / 協同性と競合性 / 転写制御 / 免疫細胞分化 / NMR分光解析 / 等温滴定熱量分析 / 認識コンセンサス配列 / X線結晶解析 / 表面プラズモン共鳴

研究概要

CUT-homeodomain転写因子の複数のDNA結合ドメインによるDNA結合の機構について、構造生物学、物理化学の手法を用いて解析した。転写因子SATB1のCUTr1ドメインとhomeodomainは、両方が協同的にTAATA配列に結合することが、NMR解析および等温滴定熱量測定によって明らかになった。また、SELEX解析により、配列特異性の発現にはCUTr1が主導的な役割を果たすことが示された。

研究成果

• [雑誌論文] The combination of sequence-specific and nonspecific binding modes of transcription factor SATB1 (2016)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiko Yamasaki and Tomoko Yamasaki
  • 雑誌名: Biochemical Journal 巻: 473 号: 19 ページ: 3321-3339
  • DOI: 10.1042/bcj20160236
  • 査読あり
• [学会発表] 転写因子SATBIのDNA認識における弱い配列特異的結合と強い非特異的結合の組み合わせ (2014)
  • 著者名/発表者名: 山崎 和彦, 山崎 智子
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2014-10-16
• [学会発表] 転写因子SATBIの複数のDNA結合ドメインによるDNA, 認識のNMR解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山崎和彦, 山崎智子
  • 学会等名: BMB2008
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] 転写因子SATB1の複数のDNA結合ドメインによるDNA認識のNMR解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山崎和彦、山崎智子
  • 学会等名: BMB2008
  • 発表場所: 神戸