球状蛋白質のフォールディング自由エネルギー地形と中間体構造アンサンブルの探索

• 研究課題/領域番号: 20570153
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 槇 亙介 (槙 亙介) 名古屋大学, 理学研究科, 准教授 (30361570)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: 蛋白質 / フォールディング / 速度論 / 連続フロー法 / スタフィロコッカル・ヌクレアーゼ / エネルギー地形 / トリプトファン変異体

研究概要

球状蛋白質スタフィロコッカル・ヌクレアーゼ及びウマアポミオグロビンのフォールディングを速度論的手法と変異体解析を駆使して特徴付けた。スタフィロコッカル・ヌクレアーゼはフォールディング反応初期に特にβ-バレルドメイン内で顕著な凝縮が認められた。ウマアポミオグロビンは、反応開始後100マイクロ秒以内に中間体を蓄積し、更に逐次的に少なくとも二種類の中間体を経て天然状態に至ることが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] ストップト・フロー法を用いた速度論測定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 水上琢也、槇亙介
  • 雑誌名: 蛋白質科学会アーカイブ 3
  • 査読あり
• [雑誌論文] ストップト・フロー法を用いた速度論測定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 水上琢也、槙亙介
  • 雑誌名: 蛋白質秤学会アーカイブ
  • 査読あり
• [学会発表] Multistate FoldingKinetics and Equilibrium of Horse Apomyoglobin. (2010)
  • 著者名/発表者名: 水上琢也、槇亙介
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 宮城県仙台市・東北大学
• [学会発表] pH-Induced Folding and Unfolding of Apomyoglobin in the Submillisecond Time Range. (2010)
  • 著者名/発表者名: 水上琢也、槇亙介
  • 学会等名: The 4th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: 滋賀県大津市・ピアザ近江
• [学会発表] 蛋白質のフォールディング研究:これまでの経路とこれからの地平 (2010)
  • 著者名/発表者名: 槇亙介
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会
  • 発表場所: 北海道札幌市・札幌コンベンションセンター
• [学会発表] Folding of Apomyoglobin Explored by Ultrarapid Mixing Techniques. (2010)
  • 著者名/発表者名: 槇亙介、水上琢也
  • 学会等名: 2010 Indo-Japan Joint Workshop on "New Frontiers of Molecular Spectroscopy; From Gas Phase to Proteins"
  • 発表場所: 兵庫県神戸市・ホテル北野プラザ六甲荘
• [学会発表] Folding of Apomyoglobin Explored by Ultrarapid Mixing Techniques. (2010)
  • 著者名/発表者名: 愼亙介、水上琢也
  • 学会等名: 2010 Indo-Japan Joint Workshop on "New Frontiers of Molecular Spectroscopy ; From Gas Phase to Proteins."
  • 発表場所: 兵庫県神戸市・ホテル北野プラザ六甲荘
• [学会発表] Multistate Folding Kinetics and Equilibrium of Horse Apomyoglobin. (2010)
  • 著者名/発表者名: 水上琢也、槙亙介
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 宮城県仙台市・東北大学
• [学会発表] スタフィロコッカル・ヌクレアーゼのフォールディング機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 槇亙介
  • 学会等名: 最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用プロジェクト・次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェア研究開発拠点:連続研究会「タンパク質機能(フォールディング)」
  • 発表場所: 東京都文京区・東京医科歯科大学
  • 年月日: 2009-03-30
• [学会発表] スタフィロコツカル・ヌクレアーゼのフォールディング機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 槇亙介
  • 学会等名: 最先端・局性能汎用スーパーコンピュータの開発利用プロジェクト・次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェア研究開発拠点 : 連続研究会「タンパク質機能(フォールディング)」
  • 発表場所: 東京都文京区東京医科歯科大学
  • 年月日: 2009-03-30
• [学会発表] Folding of Apomyoglobin Studied by Rapid Mixing Methods. (2009)
  • 著者名/発表者名: 水上拓也、槇亙介
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: 愛知県・名古屋大学
• [学会発表] バレル内にトリプトファンを導入したスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ変異体のフォールディング (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木精一、槇亙介
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本県・熊本全日空ホテルニュースカイ
• [学会発表] スタフィロコッカル・ヌクレアーゼの単-トリプトファン変異体(Trp66)のフォールディング (2009)
  • 著者名/発表者名: 春日康子、槇亙介
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本県・熊本全日空ホテルニュースカイ
• [学会発表] スタフィロコッカル・ヌクレアーゼの単一トリプトファン変異体(Trp66)のフォールディング (2009)
  • 著者名/発表者名: 春日康子、槇亙介
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本県・熊本全日空ホテルニュースカイ
• [学会発表] βバレル内にトリプトファンを導入したスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ変異体のフォールディング (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木精一、槇亙介
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本県・熊本全日空ホテルニュースカイ
• [学会発表] Folding of Apornyoglobin Studied by Rapid Mixing Methods. (2009)
  • 著者名/発表者名: 水上拓也、槇亙介
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: 愛知県・名古屋大学
• [備考] ホームページ等