フォルニケータ生物群の分子系統進化

• 研究課題/領域番号: 20570219
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 橋本 哲男 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (50208451)
• 研究分担者: 稲垣 祐司 筑波大学, 計算科学研究センター, 准教授 (50387958)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 系統進化 / 真核生物 / 複数遺伝子分子系統解析 / フォルニケータ / カルペディエモナス様生物 / ミトコンドリア関連オルガネラ / Dysnectes brevis / Giardia intestinalis / 分子系統樹 / カルペデイエモナス様生物 / チューブリン / ペプチド鎖伸長因子 / HSP90

研究概要

典型的なミトコンドリアをもたないもののみから構成される鞭毛虫の分類群であるフォルニケータの系統関係を明らかにすることを目的として、自由生活性のフォルニケータ生物を対象に系統マーカー遺伝子の配列解析を行い、既存のデータを含めて複数遺伝子分子系統解析を実施した。その結果、フォルニケータ生物群内部の系統関係を明確にすることができ、ミトコンドリア関連オルガネラの進化を研究するための基盤を構築した。

研究成果

• [雑誌論文] Splintrons in Giardia intestinalis: Spliceosomal introns in a split form (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Inagaki Y, Roger AJ, Hashimoto T
  • 雑誌名: Communicative and Integrative Biology (in press)
• [雑誌論文] Split introns in the genome of a divergent eukaryote Giardia intestinalis are excised by spliceosome-mediated trans-splicing (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Inagaki Y, Tokoro M, Roger AJ, Hashimoto T
  • 雑誌名: Current Biology 21(4) ページ: 311-315
  • 査読あり
• [雑誌論文] Split introns in the genome of Giardia intestinalis are excised by spliceosome-mediated trans-splicing (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Inagaki Y, Tokoro M, Roger AJ, Hashimoto T
  • 雑誌名: Cum Biol. 巻: 21 ページ: 1-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive SSU rRNA phylogeny of Eukaryota (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishida K-I, Inagaki Y, Sakaguchi M, Oiwa A, Kai A, Suzuki M, Nakayama T, Chikuni T, Yabuki A, Yamaguchi H, Yubuki N, Yoshida M, Nakayama T, Inouye I, Hashimoto T
  • 雑誌名: J.Endocytobiosis Cell Res. 巻: 20 ページ: 81-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive SSU rRNA phylogeny of Eukaryota (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishida K, Inagaki Y, Sakaguchi M, Oiwa A, Kai A, Suzuki M, Nakayama T, Chikuni T, Yabuki A, Yamaguchi H, Yubuki N, Yoshida M, Nakayama T, Inouye I, Hashimoto T
  • 雑誌名: 【Joint 1st authors】Journal of Endocytobiosis and Cell Research 20 ページ: 81-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] A wide diversity of previously undetected relatives of diplomonads isolated from marine/saline habitats (2010)
  • 著者名/発表者名: Kolisko M, Silberman JD, Cepicka I, Yubuki N, Takishita K, Yabuki A, Leander BS, Inouye I, Inagaki Y, Roger AJ, Simpson AGB
  • 雑誌名: Environmental Microbiology 12(19) ページ: 2700-2710
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny of Asian primate malaria parasites inferred from apicoplast genome-encoded genes with special emphasis on the positions of Plasmodium vivax and P. fraglie (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsui H, Arisue N, Sakihama N, Inagaki Y, Horii T, Hasegawa M, Tanabe K, Hashimoto T
  • 雑誌名: Gene 450(1) ページ: 32-38
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny of Asian primate malaria parasites inferred from apicoplast genome-encoded genes with special emphasis on the positions of Plasmodium vivax and P.fragile. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsui, H., Arisue, N., Sakihama, N., Inagaki, Y., Horii, T., Hasegawa, M., Tanabe, K., Hashimoto, T.
  • 雑誌名: Gene 450 ページ: 32-38
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences: the relationship between red algae and green plants as the case study (2009)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y, Nakajima Y, Sato M, Sakaguchi M, Hashimoto T
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 26(5) ページ: 1171-1178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences: the relationships between red algae and green plants as a case study (2009)
  • 著者名/発表者名: Inagaki, Y., Nakajima, Y., Sato, M., Sakaguchi, M, Hashimoto, T.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 26 ページ: 1171-1178
  • 査読あり
• [雑誌論文] 複数遺伝子の連結データに基づく分子系統樹の推定-真核生物の大系統の解析を例として (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男,有末伸子,坂口美亜子,稲垣祐司
  • 雑誌名: 統計数理 56 ページ: 145-164
  • 査読あり
• [雑誌論文] 複数遺伝子の結合データに基づく分子系統樹の推測-真核生物の大系統の解析を例として- (2008)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男,有末伸子,坂口美亜子,稲垣祐司
  • 雑誌名: 統計数理 56 ページ: 145-164
  • NAID: 120006019006
  • 査読あり
• [学会発表] 寄生性真核微生物Giardiaの縮退ゲノムにおける複雑な遺伝子発現 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、稲垣祐司、Andrew J Roger、橋本哲男
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大学
• [学会発表] 真核生物の系統進化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男
  • 学会等名: 33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(ワークショップ3W21p)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Trans-splicing in the intron-poor eukaryotic parasite Giardia intestinalis (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Masaharu Tokoro, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto
  • 学会等名: 2010 Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology
  • 発表場所: 茨城・つくば・国際会議場
• [学会発表] Spliceosome-mediated trans-splicing produces the complete mRNA for heat shock protein 90 in Giardia intestinalis (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Masaharu Tokoro, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto
  • 学会等名: 2010 ISEP XVIII
  • 発表場所: 石川・金沢・県立美術館
• [学会発表] 202万樹形に対する網羅的探索結果に基づく発見的樹形探索法の効率評価 (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司、辻美和子、Laurent Choy、佐藤三久、橋本哲男
  • 学会等名: 第11回日本進化学会
  • 発表場所: 北海道・札幌・北海道大
• [学会発表] 複数遺伝子解析による Fornicata 生物群の系統進化の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小松崎洋志、稲垣祐司、瀧下清貴、古我友樹、 矢吹彬憲、松本拓也、神川龍馬、雪吹直史、Martin Kolisko、Alastair Simpson、Andrew Roger、橋本哲男
  • 学会等名: 第11回日本進化学会
  • 発表場所: 北海道・札幌・北海道大
• [学会発表] 真核生物の系統進化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男
  • 学会等名: 日本微生物系統分類研究会第29回年次大会
  • 発表場所: 木更津
  • 年月日: 2009-11-13
• [学会発表] 複数遺伝子解析によるFornicata生物群の系統進化の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小松崎洋志、稲垣祐司、瀧下清貴、古我友樹、矢吹彬憲、松本拓也、神川龍馬、雪吹直史、Martin Kolisko、Alastair Simpson、Andrew Roger、橋本哲男
  • 学会等名: 第4回日本進化原生生物研究会
  • 発表場所: 宮城・仙台・宮城教育大