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細菌から出芽酵母へのドメイン間水平遺伝子伝達に働く正と負の因子

研究課題

研究課題/領域番号 20570221
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関広島大学

研究代表者

鈴木 克周  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (50221320)

研究分担者 守口 和基  広島大学, 大学院・理学研究科, 講師 (30294523)
田中 克幸  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (10363045)
連携研究者 守口 和基  広島大学, 大学院・理学研究科, 講師 (30294523)
研究協力者 田中 克幸  株式会社建設環境研究所 (10363045)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード水平遺伝子伝達 / 生物界間接合 / T-DNA輸送 / 細菌 / アグロバクテリア / 酵母 / 真核生物 / 接合遺伝子 / vir遺伝子
研究概要

アグロバクテリウムが真核生物にT-DNAを注入する現象と大腸菌が酵母にプラスミドを注入する生物界間接合現象は、原核生物がtype 4分泌系に依存して能動的に真核生物へDNAを注入する興味深い現象である。本研究で出芽酵母が受容細胞として高い能力を発揮するのに重要な遺伝子を探索した結果、vATPase酵素サブユニット遺伝子を中心とした遺伝子が生物界間接合能力に重要であること、DNA修復組換え遺伝子RAD52、遺伝子を抑制する遺伝子SRS2等の遺伝子がT-DNA輸送での形質転換に重要であることを明らかにした。2つの現象の両方が低下する変異体がみられないことから、上記遺伝子は受容機構の中で共通部分とは異なり互いに特化した部位で機能しているものと考えられた。これらの現象の研究に必要なプラスミドならびに供与菌株と操作技術開発を行い、高頻度かつ容易な形質転換ならびに高精度かつ容易な加工を可能にした。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2012 2011 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (27件) 図書 (2件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Development of a reinforced Ti-evictionplasmid useful for construction of Tiplasmid-free Agrobacterium strains.2012

    • 著者名/発表者名
      S. Yamamoto, K. Suzuki
    • 雑誌名

      J. Microbiol. Meth

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Yeasttrans for mation mediated by Agrobacteriumstrains harboring an Ri plasmid : comparativestudy between GALLS of an Ri plasmid andvirE of a Ti plasmid.2012

    • 著者名/発表者名
      K. Kiyokawa, S. Yamamoto, Y. Sato, N. Momota, K. Tanaka, K. Moriguchi and K. Suzuki
    • 雑誌名

      Genes Cells

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening foryeast mutants defective in recipient ability for transkingdom conjugation with Escherichia colirevealed importance of vacuolar ATPase activityin the horizontal DNA transfer phenomenon.2011

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuta, E. Satoh, C. Katoh, K. Tanaka, K. Moriguchi, K. Suzuki
    • 雑誌名

      Microbiol Res.

      ページ: 1-6

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening for yeast mutants defective in recipient ability for transkingdom conjugation with Escherichia coli revealed importance of vacuolar ATP ase activity in the horizontal DNA transfer phenomenon2011

    • 著者名/発表者名
      M.Mizuta, E.Satoh, C.Katoh, K.Tanaka, K.Moriguchi, K.Suzuki
    • 雑誌名

      Microbiol Res.doi : 10.1016/j.micres.2011.10.001

      ページ: 1-6

    • NAID

      120006551781

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] transferable between Escherichia coli andAgrobacterium species.2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kiyokawa, S. Yamamoto, K. Sakuma, K. Tanaka, K. Moriguchi, and K. Suzuki
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbiol.

      巻: 75 ページ: 1845-1851

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noveltoxin-antitoxin system composed of serineprotease and AAA-ATPase homologuesdetermines the high stability andincompatibility of the tumor-inducing plasmidpTiC58.2009

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, S., Kiyokawa, K., Tanaka, K., Moriguchi, K, , Suzuki, K.
    • 雑誌名

      J. Bacteriol.

      巻: 191 ページ: 4656-4666

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variation of 16S-23S internally transcribed spacer sequenceand intervening sequence in rDNA among the three major Agrobacterium species. Microbiol.2009

    • 著者名/発表者名
      J. Bautista-Zapanta, H. H. Arafat, K. Tanaka, H. Sawada, K. Suzuki
    • 雑誌名

      Res

      巻: 164 ページ: 604-612

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A bility of Agrobacteriumtumefaciens and A. rhizogenes strains2009

    • 著者名/発表者名
      K. Tanaka, H. H. Arafat, H. Urbanczyk, S. Yamamoto, K. Moriguchi, H. Sawada, and K. Suzuki
    • 雑誌名

      inability of A. vitis and A. rubi strains to adapt tosalt-insufficient environment, and taxonomicsignificance of a simple salt requirement test inthe pathogenic Agrobacterium speciesJ. Gen. Appl. Microbiol.

      巻: 55 ページ: 35-41

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel toxin-antitoxin system composed of serine protease and AAA-AT Pase homologues determines the high stability and incompatibility of the tumor-inducing plasmid pTiC582009

    • 著者名/発表者名
      S.Yamamoto, K.Kiyokawa, K.Tanaka, K.Moriguchi, K.Suzuki
    • 雑誌名

      J.Bacteriol 191

      ページ: 4656-4666

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variation of 16S-23S internally transcribed spacer sequence and interve ning sequence in rDNA among the three major Agrobacterium species2009

    • 著者名/発表者名
      J.Bautista-Zapanta, H.H.Araf at, K.Tanaka, H.Sawada, K.Suzuki
    • 雑誌名

      Microbiol.Res 164

      ページ: 604-612

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Construction of disarmed Ti plasmids transferable between Escherichia coli and Agrobacterium species2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kiyokawa, S. Yamamoto, K. Sakuma, K. Tanaka, K. Moriguchi, K. Suzuki
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbiol. 75

      ページ: 1845-1851

    • NAID

      120001700428

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ability of Agrobacterium tumefaciens and A. rhizogenes strains, inability of A. vitis and A. rubi strains to adapt to salt-insufficient environment, and taxonomic significance of a simple salt requirement test in the pathogenic Agrobacterium species2009

    • 著者名/発表者名
      K. ranaka, H. H. Arafat, H. Urbanczyk, S. Yamamoto, K. Moriguchi, H. Sawada, K. Suzuki
    • 雑誌名

      J. Gen. Appl. Microbiol. 55

      ページ: 35-41

    • NAID

      130004802121

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variation of lipopolysaccharide among the three major Agrobacterium species and the effect of environmental stress on the lipopolysaccharide profile2009

    • 著者名/発表者名
      H. H. Arafat, K. Tanaka, H. Sawada, K. Suzuki
    • 雑誌名

      Plant Pathol. J. 8

      ページ: 1-8

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] IV型分泌系を応用した新規遺伝子導入法の確立2012

    • 著者名/発表者名
      守口和基, 枝廣憲孝池ヶ谷洋佑白木田中克幸、倉田のり、鈴木克周
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Yeasttrans for mation mediated by Agrobacteriumstrains harboring an Ri plasmid.2011

    • 著者名/発表者名
      K. Kiyokawa, S. Yamamoto, K. Tanaka, K. Moriguchi, K. Suzuki
    • 学会等名
      32nd International Crown Gall Conference
    • 発表場所
      HiltonGarden Inn, Middleton, Wisconsin, USA
    • 年月日
      2011-10-29
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Stabilityenhancing genes of Ti plasmids and itsapplication.2011

    • 著者名/発表者名
      S. Yamamoto, K. Kiyokawa, K. Tanaka, K. Moriguchi, K. Suzuki
    • 学会等名
      32nd International Crown Gall Conference
    • 発表場所
      Hilton Garden Inn, Middleton, Wisconsin, USA
    • 年月日
      2011-10-29
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Yeast transformation mediated by Agrobacterium strains harboring an Riplasmid2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kiyokawa, S.Yamamoto, K.Tanaka, K.Moriguchi, K.Suzuki
    • 学会等名
      32nd International Crown Gall Conference
    • 発表場所
      Hilton Garden Inn (Middleton, Wisconsin, USA)
    • 年月日
      2011-10-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Stability enhancing genes of Ti plasmids and its application2011

    • 著者名/発表者名
      S.Yamamoto, K.Kiyokawa, K.Tanaka, K.Moriguchi, K.Suzuki
    • 学会等名
      32nd International Crown Gall Conference
    • 発表場所
      Hilton Garden Inn (Middleton, Wisconsin, USA)(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Riプラスミドをもつアグロバクテリア株の出芽酵母に対する低形質転換能の解析2011

    • 著者名/発表者名
      清川一矢、山本真司、佐藤由香里、田中克幸、守口和基、鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中四国支部香川大会
    • 発表場所
      香川大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Riプラスミドをもつアグロバクテリア株の出芽酵母に対する低形質転換能の解析2011

    • 著者名/発表者名
      清川一矢、山本真司、佐藤由香里、田中克幸、守口和基、鈴木克周
    • 学会等名
      生物系三学会中四国支部香川大会
    • 発表場所
      香川大学幸町キャンパス
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Diversity among strains inAgrobacterium species.2010

    • 著者名/発表者名
      S. Yamamoto, K. Tanaka, H. H. Arafat, J. Bautista-Zapanta, H. Urbanczyk, K. Suzuki
    • 学会等名
      ISBDS2010International Symposium of BiodiversitySciences" Genome, Evolution and Environment
    • 発表場所
      名古屋市ルブラ王山
    • 年月日
      2010-08-01
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Diversity among strains in Agrobacterium species2010

    • 著者名/発表者名
      S.Yamamoto, K.Tanaka, H.H.Arafat, J.Bautista-Zapanta, H.Urbanczyk, K.Suzuki
    • 学会等名
      ISBDS2010 International Symposium of Biodiversity Sciences "Genome, Evolution and Environment"
    • 発表場所
      ルブラ王山(名古屋市)
    • 年月日
      2010-08-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] TiプラスミドpTiC58上に見出された新しいタイプのトキシン-アンチトキシンシステムietASの研究2010

    • 著者名/発表者名
      山本真司、清川一矢、田中克幸、守口和基、鈴木克周
    • 学会等名
      農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] TiプラスミドvirEとRiプラスミドGALLSの比較:出芽酵母に対する形質転換能.2009

    • 著者名/発表者名
      清川一矢, 山本真司, 佐藤由香里, 百田直人, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-09-12
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌から出芽酵母への生物界間接合を利用した高効率かつ安定な新規遺伝子導入法の検討2009

    • 著者名/発表者名
      枝廣憲孝, 守口和基, 池ヶ谷洋佑, 藤原慎哉, 田中克幸, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] T-DNA輸送システムによる出芽酵母の形質転換に関与する遺伝子の網羅的スクリーニング法の確立2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤由香里, 清川一矢, 山本真司, 百田直人, 高松詩穂理, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] TiプラスミドvirEとRiプラスミドGALLSの比較:出芽酵母に対する形質転換能2009

    • 著者名/発表者名
      清川一矢, 山本真司, 佐藤由香里, 百田直人, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] TiプラスミドvirEとRiプラスミドGALLSの比較 : 出芽酵母に対する形質転換能2009

    • 著者名/発表者名
      清川一矢, 山本真司, 佐藤由香里, 百田直人, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] IV型分泌系を応用した新規遺伝子導入法の確立2009

    • 著者名/発表者名
      守口和基, 枝廣憲孝, 池ヶ谷洋佑, 白木英介, 田中克幸, 倉田のり, 鈴木克周
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌から出芽酵母への生物界間接合を利用した高効率かつ安定な新規遺伝子導入法の検討2009

    • 著者名/発表者名
      枝廣憲孝, 守口和基, 池ヶ谷洋佑, 藤原慎哉, 田中克幸, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部会第66回大会
    • 発表場所
      高知大学 朝倉キャンパス(高知市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] T-DNA輸送システムによる出芽酵母の形質転換に関与する遺伝子の網羅的スクリーニング法の確立2009

    • 著者名/発表者名
      佐藤由香里, 清川一矢, 山本真司, 百田直人, 高松詩穂理, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部会第66回大会
    • 発表場所
      高知大学 朝倉キャンパス(高知市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Tiプラスミド virE とRiプラスミド virE/GALLSの比較:出芽酵母に対する形質転換能2009

    • 著者名/発表者名
      清川一矢, 山本真司, 佐藤由香里, 百田直人, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部会第66回大会
    • 発表場所
      高知大学 朝倉キャンパス(高知市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] vir 遺伝子を構成的に発現するアグロバクテリア株の発見2009

    • 著者名/発表者名
      田中克幸, 清川一矢, 山本真司, 守日和基, 澤田宏之, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本植物学会中国四国支部会第66回大会
    • 発表場所
      高知大学 朝倉キャンパス(高知市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 生物界間接合-その分子メカニズムの解析と遺伝子導入系としての応用(II)2008

    • 著者名/発表者名
      藤原慎哉, 池ヶ谷洋佑, 影居聡子, 守口和基, 田中克幸, 鈴木克周
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 植物病原菌Agrobacteriumbiovar 2(Rhizobium rhizogenes)の染色体バックグランドの違いによる植物形質転換能の比較.2008

    • 著者名/発表者名
      田中克幸, 清川一矢, 山本桃子, 寺田良介, 山本真司, 守口和基, 澤田宏之, 鈴木克周
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Noveltoxin-antitoxin genes on pTiC58 determine thestability and high incompatibility of theplasmid2008

    • 著者名/発表者名
      S. Yamamoto, K Kiyokawa, K Tanaka, KMoriguchi, K Suzuki
    • 学会等名
      Annual Crown Gall Conference
    • 発表場所
      University of Michigan, USA
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Construction of disarmed Ti plasmidstrasferable between Escherichia coli andAgrobacterium2008

    • 著者名/発表者名
      K Kiyokawa, S Yamamoto, K Tanaka, KMoriguchi, K Suzuki
    • 学会等名
      Annual Crown Gall Conference
    • 発表場所
      University of Michigan, USA
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Agrobacterium rhizogenes(biovar 2)の染色体側バックグランドに基づいた植物形質転換能の比較2008

    • 著者名/発表者名
      山本桃子, 田中克幸, 清川一矢, 山本真司, 守口和基, 澤田宏之, 鈴木克周
    • 学会等名
      第65回日本植物学会中国四国支部大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] pTiC58の不和合性・安定性増大遺伝子.2008

    • 著者名/発表者名
      山本真司, 田中克幸, 守口和基, 鈴木克周
    • 学会等名
      第65回日本植物学会中国四国支部大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] 生物界間接合-その分子メカニズムの解析と遺伝子導入系としての応用(II)2008

    • 著者名/発表者名
      藤原慎哉, 池ヶ谷洋佑, 影居聡子, 守口和基, 田中克幸, 鈴木克周
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] Tiand Ri plasmids. In : Microbial Megaplasmids. E. Schwartz(ed.) in Microbiology Monographseries.2009

    • 著者名/発表者名
      K. Suzuki, K. Tanaka, S. Yamamoto, K. Kiyokawa, K. Moriguchi, K. Yoshida
    • 出版者
      Springer Verlag, Heidelberg
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [図書] Ti and Ri plasmids. In : Microbial Megaplasmids. E. Schwartz (ed. ) in Microbiology Monograph series2009

    • 著者名/発表者名
      K. Suzuki, K. Tanaka, S. Yamamoto, K. Kiyokawa, K. Moriguchi, K. Yoshida
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      springer Verlag, Heidelberg
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] :プラスミド除去用組み換えプラスミドおよびその利用2011

    • 発明者名
      山本真司、鈴木克周
    • 権利者名
      国立大学法人広島大学
    • 出願年月日
      2011-07-13
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [産業財産権] プラスミド除去用組み換えプラスミドおよびその利用2011

    • 発明者名
      山本真司、鈴木克周
    • 権利者名
      広島大学
    • 出願年月日
      2011-07-13
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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