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マイクロRNA遺伝子族の分子進化

研究課題

研究課題/領域番号 20570222
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関香川大学

研究代表者

岩間 久和  香川大学, 総合生命科学研究センター, 准教授 (20398035)

研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2009年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2008年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワードマイクロRNA / 遺伝子族 / ターゲット配列 / 遺伝子制御網 / オルソログ / 冗長性 / 協調的遺伝子制御 / フィードフォワード回路 / UTR / フィードフォーワード / マイクロRNAプレカーサー / シミュレーション / ゲノム
研究概要

マイクロRNA遺伝子族は、進化の過程で、そのターゲットとなる遺伝子制御の冗長性を高める一方、顕著にターゲットとなる遺伝子数が減少したことを明らかにした。マイクロRNA遺伝子族は、既に確立した転写因子による遺伝子制御網を攪乱しないという主に消極的な役割において結果として遺伝子制御網の冗長性が増加したと考えられ、この遺伝子制御網の冗長性の増加は、頑健性、微細調節などの適応的役割に必ずしも帰着しないことが示唆された。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (10件) 備考 (5件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] MicroRNA networks alter to conform to transcription factor networks adding redundancy and reducing the repertoire of target genes for coordinated regulation.2011

    • 著者名/発表者名
      Iwama H, Murao K, Imachi H, Ishida T
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution. Vol28(1)

      ページ: 639-646

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptional double-autorepression feedforward circuits act for multicellularity and nervous system development.2011

    • 著者名/発表者名
      Iwama H, Murao K, Imachi H, Ishida T
    • 雑誌名

      BMC Genomics. 12(1)

      ページ: 228-228

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] MicroRNA Networks Alter to Conform to Transcription Factor Networks Adding Redundancy and Reducing the Repertoire of Target Genes for Coordinated Regulation.2011

    • 著者名/発表者名
      Hisakazu Iwama
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: Vol 28 ページ: 639-648

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptional double-autorepression feedforward circuits act for multicellularity and nervous system development2011

    • 著者名/発表者名
      Hisakazu Iwama
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: (掲載確定)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マイクロRNA遺伝子族による遺伝子制御網の変化の特性2010

    • 著者名/発表者名
      岩間久和, 他
    • 学会等名
      日本遺伝学会第82回大会(口演、査読有)
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロRNA遺伝子族による遺伝子制御網の変化の特性2010

    • 著者名/発表者名
      岩間久和
    • 学会等名
      日本遺伝学会・第82回大会
    • 発表場所
      北海道大学・高等昨日開発総合センター(北海道)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] マイクロRNA遺伝子族による遺伝子制御網構成の特質2010

    • 著者名/発表者名
      岩間久和, 他
    • 学会等名
      日本進化学会第12回大会(口演、査読有)
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-08-04
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロRNA遺伝子族による遺伝子制御網構成の特質2010

    • 著者名/発表者名
      岩間久和
    • 学会等名
      日本進化学会・第12回大会
    • 発表場所
      東京工業大学・大岡山キャンパス(東京)
    • 年月日
      2010-08-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] マイクロRNA及び転写因子により構成される自己制御組み込み型フィードフォワード回路のヒトゲノムにおけるin silico解析2009

    • 著者名/発表者名
      岩間久和, 他
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第54回大会(口演、査読有)
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-09-26
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロRNA及び転写因子により構成される自己制御組み込み型フィードフォワード回路のヒトゲノムにおける in silico 解析2009

    • 著者名/発表者名
      岩間久和
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第54回大会
    • 発表場所
      東京・グランドプリンスホテル高輪
    • 年月日
      2009-09-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] マイクロRNAと転写因子の遺伝子制御ネットワークにおける役割の差異に関する比較ゲノム解析2009

    • 著者名/発表者名
      岩間久和, 他
    • 学会等名
      第81回日本遺伝学会大会(口演、査読有)
    • 発表場所
      長野
    • 年月日
      2009-09-17
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロRNAと転写因子の遺伝子制御ネットワークにおける役割の差異に関する比較ゲノム解析2009

    • 著者名/発表者名
      岩間久和
    • 学会等名
      第81回日本遺伝学会大会
    • 発表場所
      松本・信州大学理学部
    • 年月日
      2009-09-17
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] マイクロRNAと転写因子による協調的制御のヒトゲノムにおける網羅的in silico解析2008

    • 著者名/発表者名
      岩間久和, 他
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第53回大会(口演、査読有)
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2008-09-28
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロRNAと転写因子による協調的制御のヒトゲノムにおける網羅的 in silico 解析2008

    • 著者名/発表者名
      岩間久和
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-09-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] ホームページ等

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考] 開発したプログラムの公開

    • URL

      http://genet.med.kagawa-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考] 開発データの公開

    • URL

      http://genet.med.kagawa-u.ac.jp/pub/HMO_5169/List.htm

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://genet.med.kagawa-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://genet.med.kagawa-u.ac.jp/pub/HMO_5169/List.htm

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [産業財産権] ReAlignerVR(プログラム)2010

    • 発明者名
      Hisakazu Iwama
    • 権利者名
      Hisakazu Iwama
    • 取得年月日
      2010-06-20
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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