| 研究課題/領域番号 |
20570223
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
進化生物学
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| 研究機関 | 高知大学 |
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研究代表者 |
渡部 輝明 高知大学, 教育研究部・医療学系, 講師 (90325415)
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| 研究分担者 |
岸野 洋久 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (00141987)
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| 連携研究者 |
岸野 洋久 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (00141987)
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| 研究期間 (年度) |
2008 – 2010
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| 研究課題ステータス |
完了 (2010年度)
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| 配分額 *注記 |
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
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| キーワード | 分子進化 / タンパク質複合体結合能 / ウイルス / 変異株 / 固定確率 / タンパク質構造 / 結合能 / アミノ酸置換 / 数理生物学 / 集団遺伝学 / ウィルス |
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| 研究概要 |
ウイルス変異は免疫回避を促す一方で宿主受容体への結合能力低下(またはその逆)といった対立した効果をもたらすことがある。この宿主内における多面的な変異が如何に宿主集団における免疫回避に影響を与えるかを調べた。ウイルスゲノムに生じた変異と適応進化との因果関係を調べるために数理モデルを開発し、集団遺伝学の理論を用いて変異の宿主集団における固定確率を求めた。高い確率で定着する変異はワクチンがどれくらいの期間有効であるかを決定づけるものである。SARSコロナウイルスの適応進化をシミュレートし、ワクチン接種を受けた宿主集団に高い確率で定着し得る変異が起こり得ることを示した。
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