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他殖性アカクローバー染色体地図のインティグレーション

研究課題

研究課題/領域番号 20580006
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関神戸大学

研究代表者

近江戸 伸子  神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (30343263)

研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2010年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2009年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードマメ科植物 / 染色体地図 / 遺伝子地図 / FISH / 画像解析 / アカクローバ / ゲノム解析
研究概要

マメ科他殖性の飼料作物アカクローバ(Trifolium pratense L.,HR;2n=2x=14,;440Mb)の体細胞分裂前中期染色体上に,26Sおよび5S ribosomal RNA gene(rDNA)と遺伝的連鎖地図上のマーカーを含むBACクローンを用いてFISH法を行った。各連鎖群は対応する染色体に位置付けられ,LG1,LG2,LG3,LG4,LG5,LG6,LG7は,第4,2,6,5,1,7,3番染色体に相当した。また,染色体画像解析プログラムCHIAS4によって,染色体長,相体長,腕比,シグナル位置を計測し,平均化を行ってイディオグラムを作成し、アカクローバの定量的染色体地図と高精細遺伝的連鎖地図を統合(インテグレーション)した。染色体統合地図は,マメ科植物のマーカー育種や分子育種研究のための有効な遺伝情報を得ることに寄与する。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (11件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Recent advances in rice genome and chromosome structure research by fluorescence in situ hybridization (FISH) The Proceedings of the Japan Academy2010

    • 著者名/発表者名
      N.Ohmido, K.Fukui, T.Kinoshita
    • 雑誌名

      Series B12. 86

      ページ: 103-116

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Physical mapping of ribosomal DNA genes on Jatropha curcas chromosomes by multicolor FISH.2010

    • 著者名/発表者名
      M.Witkowska, N.Ohmido, J.Cartagena, N.Shibagaki, S.Kajiyama, K.Fukui
    • 雑誌名

      Cytologia 74

      ページ: 133-139

    • NAID

      10025405446

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Integration of cytogenetic and genetic linkage maps of Lotus japonicus, a model plant for legumes.2010

    • 著者名/発表者名
      N.Ohmido, A.Ishimaru, S.Kato, S.Sato, S.Tabata, K.Fukui
    • 雑誌名

      Chromosome Res 18

      ページ: 287-299

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Image analysis of small plant chromosomes by using an improved system, CHIAS IV2010

    • 著者名/発表者名
      S.Kato, N.Ohmido, M.Hara, R.Kataoka, K.Fukui
    • 雑誌名

      Chromosome Sci.

      巻: 12 ページ: 43-50

    • NAID

      10026671047

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence Analysis of the Genome of an Oil-Bearing Tree, Jatropha curcas L.2010

    • 著者名/発表者名
      Sato S, Hirakawa H, Isobe S, Fukai E, Watanabe A, Kato M, Kawashima K, Minami C, Muraki A, Nakazaki N, Takahashi C, Nakayama S, Kishida Y, Kohara M, Yamada M, Tsuruoka H, Sasamoto S, Tabata S, Aizu T, Toyoda A, Shin-I T, Minakuchi Y, Kohara Y, Fujiyama A, Tsuchimoto S, Kajiyama S, Makigano E, Ohmido N, Shibagaki N, Cartagena JA, Wada N, Kohinata T, Atefeh A, Yuasa S, Matsunaga S, Fukui K.
    • 雑誌名

      DNA Res.

      ページ: 1-12

    • NAID

      120006994998

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integration of cytogenetic and genetic linkage maps of Lotus japonicus, a model plant for legumes2010

    • 著者名/発表者名
      Nobuko Ohmido, Akiko Ishimaru, Seiji Kato, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Kiichi Fukui
    • 雑誌名

      Chromosome Research 18(未定(現時点オンライン版))

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent advances in rice genome and chromosome structure research by fluorescence in situ hybridization(FISH)2010

    • 著者名/発表者名
      Nobuko Ohmido, Kiichi Fukui, Toshiro Kinoshita
    • 雑誌名

      Proc.Jpn.Acad.Ser.B Phys.Biol.Sci 86

      ページ: 101-116

    • NAID

      130000168767

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anti-peptide antibodies for examining the conformation, molecular assembly, and localization of an intracellular protein, ribosormal protein S6, in vivo.2008

    • 著者名/発表者名
      M.Nakagawa, N.Ohmido, K.Ishikawa, S.Uchiyama, K.Fukui, T.Azuma
    • 雑誌名

      J.Biochem. 143

      ページ: 325-332

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Genome structure of the legume, Lotus japonicus.2008

    • 著者名/発表者名
      S.Sato, Y.Nakamura, T.Kaneko, E.Asamizu, T.Kato, M.Nakao, S.Sasamoto, A.Watanabe, A.Ono, K.Kawashima, T.Fujishiro, M.Katoh, M.Kohara, Y.Kishida, C.Minami, S.Nakayama, N.Nakazaki, Y.Shimizu, S.Shinpo, C.Takahashi, T.Wada, M.Yamada, N.Ohmido, M.Hayashi, K.F
    • 雑誌名

      DNA Res. 15

      ページ: 227-239

    • NAID

      120006995002

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Nuclear organization analyzed by visualization.2008

    • 著者名/発表者名
      Ohmido N, Wako T, Fukui K.
    • 雑誌名

      The Nucleus 50

      ページ: 473-489

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome Structure of the Legume、Lotus japonicus.2008

    • 著者名/発表者名
      Sato S, Nakamura Y, KanekoT, Asamizu E, Kato T, Nakao M, Sasamoto S, Watanabe A, Ono A, Kawashima K, Fujishiro T, Katoh M, Kohara M, Kishida Y, Minami C, Nakayama S, Nakazaki N, Shimizu Y, Shinpo S, Takahashi C, Wada T, Yamada M, Ohmido N, HayasM M, Fukui K, Baba T, Nakamichi T, Mori H, Tabata S.
    • 雑誌名

      DNA Research 15

      ページ: 227-239

    • NAID

      120006995002

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 新規油糧植物ジャトロファの組織培養と染色体構造の解析2010

    • 著者名/発表者名
      西川岳志・牧ヶ野衣里・姫野真由美・Cartagena Joyce・Witkowska Magdalena・土本卓・福井希一・近江戸伸子
    • 学会等名
      日本育種学会第117回講演会
    • 発表場所
      京都市
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] ヨシの倍数性と栄養成長に関する変異について2010

    • 著者名/発表者名
      荒木哲朗・近江戸伸子・清水顕史・長谷川博
    • 学会等名
      日本育種学会第117回講演会
    • 発表場所
      京都市
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Characterization of Dactylis subspecies by using some classical and molecular cytogenetic methods.2010

    • 著者名/発表者名
      M.Tuna, A.Buyukbasar, E.E.Teykin, H.Budak, N.Ohmido, T.Yamada
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XVIII
    • 発表場所
      San Diego
    • 年月日
      2010-01-15
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マメ科植物のシンテニーを利用したダイズ染色体の解析2009

    • 著者名/発表者名
      近江戸伸子・佐藤修正・原田久也
    • 学会等名
      第60回染色体学会
    • 発表場所
      松江市
    • 年月日
      2009-11-14
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] マメ科植物のシンテニーを利用したダイズ染色体の解析2009

    • 著者名/発表者名
      近江戸伸子・佐藤修正・原田久也
    • 学会等名
      染色体学会2009年度年会
    • 発表場所
      くにびモチッセ(島根県)
    • 年月日
      2009-11-14
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] High-resolution FISH for gene mapping and molecular analysis of plant chromosomes2008

    • 著者名/発表者名
      Ohmido N.
    • 学会等名
      Asian Chromosome colloquium 3
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Comprehensive chromosome map of red clover (Trifolium pratense L. ).2008

    • 著者名/発表者名
      Kataoka R, Hara M, Kato S, Isobe S, Sato S, Tabata S, Ohmido N.
    • 学会等名
      Asian Chromosome colloquium 3
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-12-02
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] マメ科3植物の染色体とゲノム研究2008

    • 著者名/発表者名
      近江戸伸子
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 発表場所
      滋賀県立大学
    • 年月日
      2008-10-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] マメ科3植物の染色体とゲノム研究2008

    • 著者名/発表者名
      近江戸伸子
    • 学会等名
      日本育種学会第114回講演会シンポジュウム
    • 発表場所
      彦根市
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Comprehensive chromosome map of red clover (Trifolium pratense L.)2008

    • 著者名/発表者名
      R.Kataoka, M.Hara, S.Kato, S.Isobe, S.Sato, S.Tabata, N.Ohmido
    • 学会等名
      The 3rd Asian Chromosome Colloquium
    • 発表場所
      Osaka
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] High-resolution FISH for gene mapping and molecular analysis of plant chromosomes.2008

    • 学会等名
      The 3rd Asian Chromosome Colloquium
    • 発表場所
      Osaka
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~ohmido/Ohmido%20Lab/

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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