水田生態系保全に向けての国内外産ドジョウのDNA判別手法の開発

• 研究課題/領域番号: 20580270
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 農業土木学・農村計画学
• 研究機関: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構・農村工学研究所
• 研究代表者: 小出水 規行 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構・農村工学研究所, 農村環境部・生態工学研究室, 主任研究員 (60301222)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2008年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: ドジョウ / カラドジョウ / ミトコンドリアDNA / 核DNA / 判別式 / 生きもの調査 / Misgurnus anguillicaudatus / シトクロームb遺伝子 / 系統解析 / 種判別式 / 栃木県 / 水田生態系 / 農村環境 / 農業水路 / 集団遺伝解析

研究概要

ミトコンドリアと核DNAを利用して,水田水域のドジョウとカラドジョウを判別できることを明示した.ミトコンドリアDNAにより,ドジョウはヨーロッパ系,中国系,韓国系,在来系,カラドジョウは単一のカラドジョウ系に分けられた.核DNAにより,ドジョウとカラドジョウの交雑個体は確認されなかった.髭長と体高による種判別式を利用すれば,DNA分析に用いる検体数を減らせることを指摘した.

研究成果

• [雑誌論文] 栃木県南東部におけるホトケドジョウのミトコンドリアDNAハプロタイプ (2010)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,渡部恵司,高振麗, 他
  • 雑誌名: 農業農村工学会論文集 265 ページ: 61-62
  • NAID: 10026349361
  • 査読あり
• [雑誌論文] 谷津田域におけるドジョウ集団の遺伝構造の解明-マイクロサテライトDNAを利用した千葉県下田川流域の事例- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,竹村武士,森淳, 他
  • 雑誌名: 農業農村工学会論文集 261 ページ: 21-29
  • 査読あり
• [雑誌論文] ミトコンドリアDNAによるドジョウの遺伝特性-チトクロームb遺伝子の塩基配列による系統解析- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,竹村武士,渡部恵司, 他
  • 雑誌名: 農業農村工学会論文集 259 ページ: 7-16
  • NAID: 10025640803
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of 19 polymorphic microsatellite DNA markers in the Japanese brown frog (Rana japonica) (2009)
  • 著者名/発表者名: Koizumi N., Watabe K., Mori A., 他
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 9 ページ: 248-250
  • 査読あり
• [雑誌論文] マイクロサテライトDNAを用いた栃木県小貝川上流域のホトケドジョウ集団の予備遺伝解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,渡部恵司,高振麗, 他
  • 雑誌名: 農業農村工学会論文集 256 ページ: 55-61
  • NAID: 10025640504
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reassessment of the taxonomy of Mesopodopsis orientalis (Tattersall, 1908) (Crustacea, Mysida) and proposal of a new species for the genus with an appendix on M. zeylanica Nouvel, 1954 (2008)
  • 著者名/発表者名: Hanamura, Y.
  • 雑誌名: Journal of Natural History 42 ページ: 2461-2500
  • 査読あり
• [雑誌論文] Occurrence of the non-indigenous freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii (De Man, 1879) (Decapoda, Caridea, Palaemonidae) in Madagasca (2008)
  • 著者名/発表者名: Hanamura, Y.
  • 雑誌名: Crustaceana 81 ページ: 1143-149
  • 査読あり
• [学会発表] 栃木県におけるドジョウの遺伝的クレードの解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,森淳,中茎元一, 他
  • 学会等名: 平成22年度農業農村工学会大会講演会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2010-09-02
• [学会発表] 栃木県内のドジョウのDNA分析結果報告 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行
  • 学会等名: 平成22年度メダカ里親の会総会
  • 発表場所: 宇都宮市平石市民センター
  • 年月日: 2010-04-24
• [学会発表] ホトケドジョウの遺伝的多様性I-生息地内に存在する障壁物が遺伝的多様性に与える影響- (2010)
  • 著者名/発表者名: 相木寛史・間野伸宏・小出水規行・小牧弘・廣瀬一美
  • 学会等名: 平成22年度日本水産学会春季大会
  • 発表場所: 東京海洋大学(東京都)
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] Introduction of genetic structure analysis for freshwater fish around paddy fields, Japan (2009)
  • 著者名/発表者名: Koizumi, N.
  • 学会等名: Seminar of USGS Fort Collins
  • 発表場所: USGS Fort Collins, USA
  • 年月日: 2009-08-17
• [学会発表] Genetic structure analysis of populations of freshwater fish around paddy fields in Japan using microsatellite DNA : case study of Japanese endangered species (2009)
  • 著者名/発表者名: Koizumi N., Watabe K., Mizutani M., 他
  • 学会等名: the Japanese eight-barbel loach, Lefua echigonia, 33rd IAHR Congress
  • 発表場所: Vancouver
  • 年月日: 2009-08-13
• [学会発表] Genetic structure analysis of populations of freshwater fish around paddy fields in Japan using microsatellite DNA : case study of Japanese endangered species, the Japanese eight-barbel loach, Lefua echigonia (2009)
  • 著者名/発表者名: Koizumi, N., Watabe, K., Mizutani, M., Takemura, T., Mori, A.
  • 学会等名: 33rd IAHR Congress
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 2009-08-13
• [学会発表] マイクロサテライトDNAによる栃木県小貝川上流域におけるホトケドジョウ集団の遺伝構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,渡部恵司,水谷正一, 他
  • 学会等名: 平成21年度農業農村工学会大会講演会
  • 発表場所: 筑波大学
  • 年月日: 2009-08-06
• [学会発表] Introduction of genetic analysis for freshwater fish in paddy fields, Japan (2008)
  • 著者名/発表者名: Koizumi, N.
  • 学会等名: Joint Seminar on Fisheries Research Institute, Penang, Malaysia and Japan International Research Center for Agricultural Sciences, Japan
  • 発表場所: Fisheries Research Institute, Penang, Malaysia
  • 年月日: 2008-11-20
• [学会発表] 小貝川上流域におけるホトケドジョウの遺伝的構造の解明:マイクロサテライトDNAマーカーを用いた予備解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行,渡部恵司,竹村武士, 他
  • 学会等名: 平成20年度農業農村工学会大会講演会
  • 発表場所: 秋田県立大学
  • 年月日: 2008-08-28
• [図書] 春の小川の淡水魚-その生息場と保全- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小出水規行
  • 出版者: 学報社