網羅的統合ゲノム解析による神経芽腫の病態関連遺伝子の探索

• 研究課題/領域番号: 20591269
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 千葉県がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 大平 美紀 千葉県がんセンター(研究所), がんゲノムセンター・がんゲノム研究室, 室長 (20311384)
• 連携研究者: 李 元元 千葉県がんセンター(研究所), がん治療開発グループ・がん先進治療開発研究室, 特別研究員 (00392259) ; 中川原 章 千葉県がんセンター, センター長 (50117181)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2010年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 神経芽腫 / マイクロアレイ / 遺伝子 / ゲノム

研究概要

小児の代表的な腹部固形腫瘍である神経芽腫には、しばしば自然退縮を起こす予後良好タイプがある一方で、1歳以降に生じ、非常に予後不良な難治例も存在する。本研究では、神経芽腫の網羅的ゲノムコピー数異常解析と遺伝子発現解析のデータを基礎に、エピゲノム解析とマイクロRNA 発現解析を組み合わせ、予後に強く関連するゲノムパターンの抽出と新規神経芽腫関連遺伝子の検索を行った。これらの分子情報は腫瘍リスク分類システムの構築と、難治性神経芽腫の早期診断、治療法開発のための標的遺伝子の同定につながると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Global genomic and RNA profiles for novel risk stratification of neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohira M, Nakagawara A
  • 雑誌名: Cancer Sci. Vol.101, No.11 ページ: 2295-2301
  • NAID: 10027832987
  • 査読あり
• [雑誌論文] Concordance for neuroblastoma in monozygotic twins : case report and review of the literature. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tajiri T, Souzaki R, Kinoshita Y, Tanaka S, Koga Y, Suminoe A, Hara T, Kohashi K, Oda Y, Masumoto K, Ohira M, Nakagawara A, Taguchi T
  • 雑誌名: J Pediatr Surg Vol.45, No.12 ページ: 2312-2316
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of neuroblastomas reveals a skewed ALK mutation spectrum in tumors with MYCN amplification. (2010)
  • 著者名/発表者名: De Brouwer S, De Preter K, Kumps C, Zabrocki P, Porcu M, Westerhout EM, Lakeman A, Vandesompele J, Hoebeeck J, Van Maerken T, De Paepe A, Laureys G, Schulte JH, Schramm A, Van Den Broecke C, Vermeulen J, Van Roy N, Beiske K, Renard M, Noguera R, Delattre O, Janouiex-Lerosey I, Kogner P, Martinsson T, Nakagawara A, Ohira M, Caron H, Eggert A, Cools J, Versteeg R, Speleman F
  • 雑誌名: Clin Cancer Res Vol.16, No.17 ページ: 4353-4362
  • 査読あり
• [雑誌論文] HDM2 impairs Noxa transcription and affects apoptotic cell death in a p53/p73-dependent manner in neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shi Y, Takenobu H, Kurata K, Yamaguchi Y, Yanagisawa R, Ohira M, Koike K, Nakagawara A, Jiang LL, Kamijo T
  • 雑誌名: Eur J Cancer Vol.46, No.12 ページ: 2324-2334
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bmi1 is a MYCN target gene and regulates tumorigenesis via repression of KIF1Bβ and TSLC1 in neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ochiai H, Takenobu H, Nakagawa A, Yamaguchi Y, Kimura M, Ohira M, Okimoto Y, Fujimura Y, koseki H, Kohno Y, Nakagawara A, Kamijo T
  • 雑誌名: Oncogene Vol.29, No.18 ページ: 2681-2690
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accurate outcome prediction in neuroblastoma across independent datasets using a multi-gene signature. (2010)
  • 著者名/発表者名: De Preter K, Vermeulen J, Brors B, Delattre O, Eggert A, Fischer M, Janoueix-Lerosey I, Lavarino C, Maris J, Mora J, Nakagawara A, Oberthuer A, Ohira M, Schleiermacher G, Schramm A, Schute J, Wang Q, Westermann F, Speleman F, Vandesompele J
  • 雑誌名: Clin Cancer Res Vol.16, No.5 ページ: 1532-1541
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global genomic and RNA profiles for novel risk stratification ofneuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohira M, Nakagawara A.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 101 ページ: 2295-2301
  • 査読あり
• [雑誌論文] Concordance for neuroblastoma in monozygotic twins. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tajiri T, Ohira M, 他11名, 11番目
  • 雑誌名: J.Pediatr Surg. 巻: 45 ページ: 2312-2316
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of neuroblastomas reveals a skewed ALK mutation spectrum intumors with MYCN amplification. (2010)
  • 著者名/発表者名: De Brouwer S, Ohira M, 他29名, 26番目
  • 雑誌名: Clin.Cancer Res. 巻: 16 ページ: 4353-4362
  • 査読あり
• [雑誌論文] HDM2 impairs Noxa transcription and affects apoptotic cell death in a p53/p73-dependent manner in neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shi Y, Ohira M, 他8名, 6番目
  • 雑誌名: Eur.J.Cancer 巻: 46 ページ: 2324-2334
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bmi is a MYCN target gene and regulates tumorigenesis via repression of KIF1Bβ and TSLC1 in neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ochiai H, Ohira M, 他10名, 6番目
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 29 ページ: 2681-2690
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accurate outcome prediction in neuroblastoma across independent datasetsusing a multi-gene signature. (2010)
  • 著者名/発表者名: De Preter K, Ohira M, 他18名, 13番目
  • 雑誌名: Clin.Cancer Res. 巻: 16 ページ: 1532-1541
  • 査読あり
• [雑誌論文] Robust model selection for classification of microarrays. (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki I, Takenouchi T, Ohira M, Oba S, Ishii S
  • 雑誌名: Cancer Inform Vol.7, No.25 ページ: 141-157
  • 査読あり
• [雑誌論文] High expression of ncRAN, a novel non-coding RNA mapped to 17q25.1, is associated with poor prognosis in neuroblastoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yu M, Ohira M, Li Y, Niizuma H, Oo ML, Zhu Y, Ozaki T, Isogai E, Kamijo T, Nakamura Y, Koda T, Oba S, Yu B, Nakagawara A
  • 雑誌名: Int J Oncol Vol.34, No.4 ページ: 931-938
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distinct role of ShcC docking protein in the differentiation of neuroblastoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: Miyake I, Ohira M, Nakagawara A, Sakai R
  • 雑誌名: Oncogene Vol.28, No.5 ページ: 662-673
  • 査読あり
• [雑誌論文] Robust model selection for classification of microarrays (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki I, Takenouchi T, Ohira M, Oba S, Ishii S.
  • 雑誌名: Cancer Informatics 7 ページ: 141-157
  • 査読あり
• [雑誌論文] High expression of ncRAN, a novel non-coding RNA mapped to 17q25.1, is associated with poor prognosis in neuroblastoma (2009)
  • 著者名/発表者名: Yu M, Ohira M, 他12名, 2番目
  • 雑誌名: Int.J.Oncol. 34 ページ: 931-938
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distinct role of ShcC docking protein in the differentiation of neuroblastoma (2009)
  • 著者名/発表者名: Miyake I, Ohira M, Nakagawara A, Sakai R.
  • 雑誌名: Oncogene 28 ページ: 662-673
  • 査読あり
• [雑誌論文] High expression of ncRAN, a novel non-coding RNA mapped to chromosome 17q25. 1, is associated with poor prognosis in neuroblastoma (2009)
  • 著者名/発表者名: Yu M, Ohira M, 他14名, 2番目
  • 雑誌名: Int. J. Oncol. 34 ページ: 931-938
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel risk stratification of patients with neuroblastoma by genomic signature which is independent of molecular signature. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomioka N, Oba S, Ohira M, Misra A, Fridlyand J, Ishii S, Nakamura Y, Isogai E, Hirata T, Yoshida Y, Todo S, Kaneko Y, Albertson D, Pinkel D, Feuerstein B, Nakagawara A
  • 雑誌名: Oncogene Vol.27, No.4 ページ: 441-449
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel HECT-type E3 ubiquitin protein ligase NEDL1 enhances the p53-mediated apoptotic cell death in its catalytic activity-independent manner. (2008)
  • 著者名/発表者名: Li Y, Ozaki T, Kikuchi H, Yamamoto H, Ohira M, Nakagawara A
  • 雑誌名: Oncogene Vol.27, No.26 ページ: 3700-3709
  • 査読あり
• [雑誌論文] ERAP140/Nbla10993 is a novel favorable prognostic indicator for neuroblastoma induced in response to retinoic acid. (2008)
  • 著者名/発表者名: Arai H, Ozaki T, Niizuma H, Nakamura Y, Ohira M, Takano K, Matsumoto M, Nakagawara A
  • 雑誌名: Oncology Rep, Vol.19, No.6 ページ: 1381-1388
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of imprinting of IGF2 correlates with hypermethylation of the H19 differentially methylated region in hepatoblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Arai Y, Haruta M, Sasaki F, Ohira M, Yamaoka H, Horie H, Nakagawara A, Hiyama E, Todo S, Kaneko Y
  • 雑誌名: Br J Cancer Vol.99, No.11 ページ: 1891-1899
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression of TSLC1, a candidate tumor suppressor gene mapped to chromosome 11q23, is down-regulated in unfavorable neuroblastoma without promoter hypermethylation. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ando K, Ohira M, Ozaki T, Nakagawa A, Akazawa K, Suenaga Y, Nakamura Y, Koda T, Kamijo T, Murakami Y, Nakagawara A
  • 雑誌名: Int J Cancer Vol.123, No.9 ページ: 2087-2094
  • 査読あり
• [雑誌論文] N-MYC promotes cell proliferation through a direct transactivation of neuronal leucine-rich repeat protein-1 (NLRR1) gene in neuroblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hossain S, Ozaki T, Wang H, Nakagawa A, Takenobu H, Ohira M, Kamijo T, Nakagawara A
  • 雑誌名: Oncogene Vol.27, No.46 ページ: 6075-6082
  • 査読あり
• [雑誌論文] KIF1Bbeta functions as a haploidinsufficient tumor suppressor gene mapped to chromosome 1p36.2 by inducing apoptotic cell death. (2008)
  • 著者名/発表者名: Munirajan AK, Ando K, Mukai A, Takahashi M, Suenaga Y, Ohira M, Koda T, Hirota T, Ozaki T, Nakagawara A
  • 雑誌名: J Biol Chem Vol.283, No.36 ページ: 24426-24434
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel oncogenic mutations of ALK kinase in neuroblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Chen Y, Takita J, Choi YL, Kato M, Ohira M, Sanada M, Wang L, Soda M, Kikuchi A, Igarashi T, Nakagawara A, Hayashi Y, Mano H, Ogawa A
  • 雑誌名: Nature Vol.455, No.7215 ページ: 971-974
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plasma midkine level is a prognostic factor for human neuroblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikematsu S, Nakagawara A, Nakamura Y, Ohira M, Shinjo M, Kishida S, Kadomatsu K
  • 雑誌名: Cancer Sci Vol.99, No.10 ページ: 2070-2074
  • NAID: 110007130545
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of genes targeted by CpG island methylator phenotype in neuroblastomas, and their possible integrative involvement in poor prognosis. (2008)
  • 著者名/発表者名: Abe M, Watanabe N, McDonell N, Takato T,Ohira M, Nakagawara A, Ushijima T
  • 雑誌名: Oncology Vol.74, No.1-2 ページ: 50-60
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel risk stratification of patients with neuroblastoma by genomic signature which is independent of molecular signature (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomioka N, Ohira M, 他14名, 3番目
  • 雑誌名: Oncogene 27 ページ: 441-449
  • 査読あり
• [雑誌論文] ERAP140/Nbla10993 is a novel favorable prognostic indicator for neuroblastoma and induced in response to retinoic acid (2008)
  • 著者名/発表者名: Arai H, Ohira M, 他10名, 5番目
  • 雑誌名: Oncology Rep. 19 ページ: 1381-1388
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel HECT-type E3 ubiquitin protein ligase NEDL1 enhances the p53-mediated apoptotic cell death in its catalytic activity-independent manner (2008)
  • 著者名/発表者名: Li Y, Ohira M, 他4名, 5番目
  • 雑誌名: Oncogene 27 ページ: 3700-3709
  • 査読あり
• [雑誌論文] The methylation status of RASSF1 promoter predicts responsiveness to chemotherapy and eventual cure in hepatoblastoma patients (2008)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Ohira M, 他11名, 5番目
  • 雑誌名: Int. J. Cancer 123 ページ: 1117-1125
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression of TSLC1, a candidate tumor suppressor gene mapped to chromosome 11q23, is down-regulated in unfavorable neuroblastoma without promoter hypermethylation (2008)
  • 著者名/発表者名: Ando K, Ohira M, 他9名, 2番目
  • 雑誌名: Int. J. Cancer 123 ページ: 2087-2094
  • 査読あり
• [雑誌論文] N-MYC promotes cell proliferation through a direct transactivation of neuronal leucine-rich repeat protein-1 (NLRR1) gene in neuroblastoma (2008)
  • 著者名/発表者名: Hossain S, Ohira M, 他6名, 6番目
  • 雑誌名: Oncogene 27 ページ: 6075-6082
  • 査読あり
• [雑誌論文] KIF1Bbeta functions as a haploidinsufficient tumor suppressor gene mapped to chromosome 1p36. 2 by inducing apoptotic cell death (2008)
  • 著者名/発表者名: Munirajan A, Ohira M, 他8名, 6番目
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 24426-24434
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oncogenic mutations of ALK kinase in neuroblastoma (2008)
  • 著者名/発表者名: Chen Y, Ohira M, 他12名, 5番目
  • 雑誌名: Nature 455 ページ: 971-974
  • 査読あり
• [学会発表] 神経芽腫のカスタム化遺伝子発現ミニチップのclinical validationと腫瘍リスク分類構築における意義の検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会合同開催
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-12-18
• [学会発表] Genomic and expression profiles specifically characterize therapy-resistant aggressive neuroblastomas. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] Genomic and expression profiles specifically charactedze therapy-resistant aggressive neuroblastomas. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他5名
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] Risk stratification of neuroblastoma by genomic signature including ALK abnormality. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 国際神経芽腫学会2010(ANR2010)
  • 発表場所: スウェーデン・ストックホルム
  • 年月日: 2010-06-24
• [学会発表] Risk stratification of neuroblastoma by genomic signature including ALKabnormality. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他10名
  • 学会等名: 国際神経芽腫学会2010(ANR2010)
  • 発表場所: スウェーデン・ストックホルム
  • 年月日: 2010-06-24
• [学会発表] Clinical application of genomic signature including ALK mutation to the new tumor risk classification for neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 米国癌学会総会(AACR)2010
  • 発表場所: 米国・ワシントンDC
  • 年月日: 2010-04-18
• [学会発表] Clinical application of genomic signature including ALK mutation to the newtumor risk classification for neuroblastoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他10名
  • 学会等名: 米国癌学会総会(AACR)2010
  • 発表場所: 米国・ワシントンDC
  • 年月日: 2010-04-18
• [学会発表] ゲノム異常パターンに基づく神経芽腫の新規リスク分類の構築-ALK遺伝子異常とゲノムコピー数異常の統合解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第51回日本小児血液学会総会・第25回日本小児がん学会学術集会合同開催
  • 発表場所: 千葉・舞浜
  • 年月日: 2009-11-27
• [学会発表] ゲノム異常パターンに基づく神経芽腫の新規リスク分類の構築-ALK遺伝子異常とゲノムコピー数異常の統合解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他10名
  • 学会等名: 第51回日本小児血液学会総会・第25回日本小児がん学会学術集会 合同開催
  • 発表場所: 千葉・舞浜
  • 年月日: 2009-11-27
• [学会発表] Clinical application of genomic signature including ALK mutation to the new tumor risk classification system for neuroblastoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-10-02
• [学会発表] Clinical application of genomic signature including ALK mutation to the new tumor risk classification system for neuroblastoma (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他8名
  • 学会等名: 第68回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-10-02
• [学会発表] 遺伝子発現プロファイルに基づく神経芽腫の予後予測ミニチップシステム (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 東京・品川
  • 年月日: 2009-09-26
• [学会発表] マイクロアレイに基づく神経芽腫のリスク分類システムの構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第16回日本遺伝子診療学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2009-08-01
• [学会発表] High expression of ncRAN, a long non-coding RNA mapped to 17q25, is associated with aggressiveness and poor prognosis of neuroblastoma. (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 米国癌学会総会(AACR)2009
  • 発表場所: 米国・デンバー
  • 年月日: 2009-04-20
• [学会発表] High expression of ncRAN, a long non-coding RNA mapped to 17q25, is associated with aggressiveness and poor prognosis of neuroblastoma (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他10名
  • 学会等名: 米国癌学会総会(AACR)2009
  • 発表場所: 米国・デンバー
  • 年月日: 2009-04-20
• [学会発表] Integrated analysis of genome copy number aberrations and its application for risk stratification for neuroblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第67回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] Integrated analysis of genome copy number aberrations and its application for risk stratification for neuroblastoma (2008)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他10名
  • 学会等名: 第67回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] Practical application and validation of a customized expression microarray-based diagnostic system toward the new risk classification of neuroblastoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他
  • 学会等名: 第13回国際神経芽腫学会 Advances in Neuroblastoma Research (ANR)2008
  • 発表場所: 千葉・幕張
  • 年月日: 2008-05-23
• [学会発表] Practical Application and Validation of a Customized Expression Microarray-based Diagnostic System toward the New Risk Classification of Neuroblastoma (2008)
  • 著者名/発表者名: 大平美紀, 他16名
  • 学会等名: 第13回国際神経芽腫学会 Advances in Neurobiastoma Research (ANR) 2008
  • 発表場所: 千葉・幕張
  • 年月日: 2008-05-23
• [備考]
  • URL: http://www.chiba-cc.jp/inst/jp/index.html