"生物学的等価性"に重点をおいた新規4'-セレノRNAの合成と性質・機能解析

• 研究課題/領域番号: 20611001
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ケミカルバイオロジー
• 研究機関: 徳島大学
• 研究代表者: 南川 典昭 徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (40209820)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: ヌクレオシド / RNA / 4'-セレノRNA / 生物学的等価性 / セレン

研究概要

本研究では天然型RNAと"生物学的等価性"を維持し、且つヌクレアーゼ抵抗性や熱的安定性などの機能が付与された化学修飾核酸分子の創製とその機能評価を目的とした。具体的には、酸素原子と同族元素であるセレン原子を糖部4'位に導入した4'-セレノRNAならびに2'-OMe-4'-セレノRNAを合成した。これら化学修飾RNAは高い二本鎖形成能とヌクレアーゼ抵抗性を示した。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis and characterization of oligodeoxynucleotides containing a novel tetraazabenso[cd]azulene ; naphthyridine base pair (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Hirama, et al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 19 ページ: 352-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] A convenient RNA synthesis using a phosphoramidite possessing a biotinylated photocleavable group. (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Tomaya, M.Takahashi, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 雑誌名: Org.Lett. 131 ページ: 3836-3839
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and properties of a novel nucleoside derivative possessing a 2,3,5,6-tetraazabenzo[cd]azulene skelton. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Hirama, H.Abe, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 雑誌名: Tetrahedron 66 ページ: 8402-8406
  • 査読あり
• [雑誌論文] Convenient RNA Synthesis Using a Phosphoramidite Possessing a Biotinylated Photocleavable Group (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Tomaya, et al.
  • 雑誌名: Org.Lett. 巻: 12 ページ: 3836-3839
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and properties of a novel nucleoside derivative possessing a 2,3,5,6-tetraazabenso[cd]azulene skelton (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Hirama, et al.
  • 雑誌名: Tetrahedron 巻: 66 ページ: 8402-8406
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective recognition of unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs consisting of four hydrogen bonds by the Klenow fragment. (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, S.Ogata, M.Takahashi, A.Matsuda
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 131 ページ: 1644-1645
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and characterization of 2'-modified-4'-thioRNA : a comprehensive comparison of nuclease stability. (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 1353-1362
  • NAID: 120003260045
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective recognition of unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs consisting of four hydrogen bonds by the Klenow fragment (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, et al.
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 131 ページ: 1644-1645
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and characterization of 2'-modified-4'-thioRNA : a comprehensive comparison of nuclease stability (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, et al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 1805-1812
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs : selective incorporation and extension reaction by Deep Vent (exo^-) DNA polymerase (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Ogata, et al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 5602-5609
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs : selective incorporation and extension reaction by DNA polymerase (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, et al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp.Ser. 53 ページ: 125-126
• [雑誌論文] Unxepected A-form formation of 4'-thioDNA in solution, revealed by NMR, and the implications as to the mechanism of nuclease-resistance. (2008)
  • 著者名/発表者名: A.Matsugami, T.Ohyama, M.Inada, N.Inoue, N.Minakawa, A.Matsuda, M.Katahira
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36 ページ: 1805-1812
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oligodeoxynucleotides containing 3-bromo-3-deazaadenine and 7-bromo-7-deazaadenine nucleosides as chemical probes to investigate DNA-protein interaction. (2008)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, Y.Kawano, S.Murata, N.Inoue, A.Matsuda
  • 雑誌名: ChemBioChem 9 ページ: 464-470
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Crystal Structure of 2'-Deoxy-2'-fluoro-4'-thionucleosides : Substrates for the Synthesis on Novel Modified RNAs (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Takahashi, et.al.
  • 雑誌名: Tetrahedron 64 ページ: 4313-4324
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and properties of oligonucleotides containing 4'-selenoribonu cleosides (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Inagaki, et.al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser 52 ページ: 329-330
• [学会発表] Convenient RNA synthesis using a phosphoramidite possessing a photocleavable group (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa
  • 学会等名: 日韓合同シンポジウム
  • 発表場所: 淡路市
  • 年月日: 2010-12-22
• [学会発表] Synthesis of 4'-selenoribonucleosides using hypervalent iodine (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Taniike, et al.
  • 学会等名: 日韓合同シンポジウム
  • 発表場所: 淡路市
  • 年月日: 2010-12-22
• [学会発表] Synthesis of 4'-selenoribonucleosides using hypervalent iodine (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Taniike, et al.
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議PACIFICHEM2010
  • 発表場所: ホノルル(アメリカ)
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] Synthesis and properties of 2'-O-MOE-4'-thioRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Saito, et al.
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議PACIFICHEM2010
  • 発表場所: ホノルル(アメリカ)
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] Enzymatic recognition of unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pair, ImN^<N>:NaO^<o> by DNA polymerase (2010)
  • 著者名/発表者名: N.Tarashima, et al.
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議PACIFICHEM2010
  • 発表場所: ホノルル(アメリカ)
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] Evaluation of potency and duration of gene silencing activity by siRNAs containing 2'-O-methyl-4'-thioribonucleosides (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, et al.
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議PACIFICHEM2010
  • 発表場所: ホノルル(アメリカ)
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] 新規抗がん剤候補化合物探索を目指した構造活性相関研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳田美幸, ら
  • 学会等名: 日本生化学会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 光解離性保護基を利用した高純度RNAの簡便合成法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 苫谷晃太, ら
  • 学会等名: アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2010-12-04
• [学会発表] 4'-thioDNA修飾によるヌクレアーゼ抵抗性ベクターの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丸山豪斗, ら
  • 学会等名: アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2010-12-04
• [学会発表] 4'-thioDNA修飾型ベクターの創製研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丸山豪斗, ら
  • 学会等名: 日本薬学会北海道支部例会
  • 発表場所: 札幌市
  • 年月日: 2010-11-27
• [学会発表] NMR study of the DNA duplex containing a thermally stable base-pairing motif (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Furuita, et al.
  • 学会等名: 国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Synthesis of 4'-selenoribonucleosides using hypervalent iodine (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Taniike, Y.Inagaki, A.Matsuda, N.Minakawa
  • 学会等名: 2010環太平洋国際化学会議PACIFICHEM2010
  • 発表場所: ホノルル
• [学会発表] Evaluation of potency and duration of gene silencing activity by siRNAs containing hybrid type of chemically modified nucleotides (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, C.Nagai, H.Hatakeyama, N.Minakawa, H.Harashima, A.Matsuda
  • 学会等名: International Round Table
  • 発表場所: France
• [学会発表] Investigation of Gene-silencing Effect Using siRNAs Modified with 2'-O-Methyl-4'-thioribonucleosides (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, et al.
  • 学会等名: 国際核酸医薬シンポジウム(第5回OTS年会、第19回アンチセンスシンポジウム)
  • 発表場所: 福岡市
  • 年月日: 2009-11-04
• [学会発表] Development od Chemical Probes to Investigate the Molecular Mechanism of RNAi (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Ide, et al.
  • 学会等名: 国際核酸医薬シンポジウム(第5回OTS年会、第19回アンチセンスシンポジウム)
  • 発表場所: 福岡市
  • 年月日: 2009-11-04
• [学会発表] Unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs : selective incorporation and extension reaction by DNA polymerase (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, et al.
  • 学会等名: The 6^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Takayama, Gifu
  • 年月日: 2009-09-29
• [学会発表] ブロモデアザアデニンリボヌクレオシド類を含むRNAの合成とその性質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 井手志穂, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第129年会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2009-03-26
• [学会発表] 2'-O-メチル-4'-セレノリボヌクレオシドを含むRNAの合成と性質解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲垣勇典, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第129年会
  • 発表場所: 日本薬学会第129年会
  • 年月日: 2009-03-26
• [学会発表] 2'-置換-4'-チオ核酸の酵素的合成 (2009)
  • 著者名/発表者名: 高橋真由美, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第129年会
  • 発表場所: 日本薬学会第129年会
  • 年月日: 2009-03-26
• [学会発表] 核酸医薬品創製を志向する糖部修飾型人工核酸:apioNAの酵素合成 (2009)
  • 著者名/発表者名: 片岡真由美, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第129年会
  • 発表場所: 日本薬学会第129年会
  • 年月日: 2009-03-26
• [学会発表] Development od Chemical Probes to Investigate the Molecular Mechanism of RNAi (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Ide, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 学会等名: 国際核酸医薬シンポジウム
  • 発表場所: Fukuoka
• [学会発表] Unnatural imidazopyridopyrimidine : naphthyridine base pairs : selective incorporation and extension reaction by DNA polymerase. (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Minakawa, S.Ogata, M.Takahashi, A.Matsuda
  • 学会等名: The 6^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Takayama Gifu
• [学会発表] Synthesis and properties of oligonucleotides containing 4'-selenoribonu cleosides (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Inagaki, ら
  • 学会等名: Joint Symposium of the 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids and the 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2008-09-11
• [学会発表] Synthesis and properties of 2'-modified-4'-thioRNA. (2008)
  • 著者名/発表者名: M.Takahashi, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 学会等名: Joint Symposium of the 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids and the 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Synthesis and properties of oligonucleotides containing 4'-selenoribonucleosides. (2008)
  • 著者名/発表者名: Y.Inagaki, N.Minakawa, A.Matsuda
  • 学会等名: Joint Symposium of the 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids and the 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.
  • 発表場所: Kyoto, Japan
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.ph.tokushima-u.ac.jp/article/0018464.html