DNAータンパク構造を特異的に制御する機能性ポリアミドの開発

• 研究課題/領域番号: 20611008
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ケミカルバイオロジー
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 板東 俊和 京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (20345284)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2008年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 機能性分子 / 合成化学 / 核酸

研究概要

我々はDNA-タンパク認識や結合に関与するDNA構造の制御を可能にするピロール(Py)-イミダゾール(Im)ポリアミドの研究を進めてきた.設計・合成・機能評価を進め,様々な効率よい共有結合を形成する機能性ポリアミドを開発した.将来的に,細胞内での高い認識能を活かした機能性Py-Imポリアミドによる特定遺伝子発現制御技術としての可能性を解明する

研究成果

• [雑誌論文] Potent Activity against K562 Cells by Polyamide-seco-CBI Conjugates Targeting Histone H4 Genes. Bioorg. (2010)
  • 著者名/発表者名: Minoshima, M., Chou, J.C., Lefebvre, S., Bando, T., Shinohara, K., Gottesfeld, J.M., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Med.Chem. 18 ページ: 168-174
• [雑誌論文] Cell Permeability of Py-Im Polyamide-Fluorescein Conjugates : Influence of Molecular Size and Py/Im Content. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishijima, S., Shinohara, K., Bando,T., Minoshima, M., Kashiwazaki, G., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 18 ページ: 978-983
• [雑誌論文] Comparative Analysis of DNA Alkylation by Conjugates between Pyrrole-Imidazole Hairpin Polyamides and Chlorambucil or seco-CBI. (2010)
  • 著者名/発表者名: Minoshima,M., Bando, T., Shinohara, K., Kashiwazaki, K., Nishijima, S., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 18 ページ: 1236-1243
  • NAID: 120001887644
• [雑誌論文] A Chiral Wedge Molecule Inhibits Telomerase Activity. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shinohara, K., Sannohe, Y., Kaieda, S., Tanaka, K., Osuga, H., Tahara, H., Xu, Y., Kawase, T., Bando, T., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 132 ページ: 3778-3782
• [雑誌論文] Alkylation of a Human Telomere Sequence by Heterotrimeric Chlorambucil PI Polyamide Conjugates. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kashiwazaki, G., Bando, T., Shinohara, K., Mioshima, M., Kumamoto, H. Nishijima, S., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg med.chem. 18 ページ: 2887-2893
• [雑誌論文] Potent Activity Against K562 Cells by Polyamide-seco-CBI Conjugates Targeting Histone H4 Genes (2010)
  • 著者名/発表者名: Minoshima, M.; Bando, T.; Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 18 ページ: 168-174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative Analysis of DNA Alkylation by Conjugates between Pyrrole-Imidazole Hairpin Polyamides and Chlorambucil or seco-CBI.Bioorg (2010)
  • 著者名/発表者名: Minoshima, M.; Bando, T.; Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 18 ページ: 1236-1243
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alkylation of a Human Telomere Sequence by Heterotrimeric Chlorambucil PI Polyamide Conjugates (2010)
  • 著者名/発表者名: Kashiwazaki, G.; Bando, T.; Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 18 ページ: 2887-2893
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cooperative alkylation of double-strand human telomere repeat sequences by PI polyamides with 11-base-pair recognition based on a heterotrimeric design, Bioorg. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kashiwazaki, G., Bando, T., Shinohara, K., Minoshima, M., Nishijima, S., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Med.Chem. 17 ページ: 1393-1397
• [雑誌論文] Development of a Molecule-Recognized Promoter DNA Sequence for Inhibition of HER2 Expression. (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Asami, Y., Takahashi, T., Wang, X., Watanabe, T., Bando, T., Sugiyama, H., Fukuda, N., Nagase, H.
  • 雑誌名: J.Antibiot. 62 ページ: 339-341
  • NAID: 10030635628
• [雑誌論文] Synthesis and Properties of Polyamide-SAHA Conjugate. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki, A., Kimura, M.T., Minoshima, M., Suzuki, T., Ikeda, M., Bando, T., Nagase, H., Shinohara, K., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett. 50 ページ: 7288-7292
• [雑誌論文] Cooperative alkylation of double-strand human telomere repeat sequences by PI polyamides with 11-base-pair recognition based on a heterotrimeric design (2009)
  • 著者名/発表者名: G.Kashiwazaki, T.Bando^*, et. al.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. 17 ページ: 1393-1397
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Properties of Polyamide-SAHA Conjugate (2009)
  • 著者名/発表者名: A.Ohtsuki, T.Bando, et. al.
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett. 50 ページ: 7288-7292
  • 査読あり
• [雑誌論文] Eukaryotic DNA Polymerases α, β and ε Incorporate Guanine Opposite 2, 2, 4-Triamino-5 (2H) -oxazolone (2009)
  • 著者名/発表者名: K.Kino, T.Bando, et. al.
  • 雑誌名: ChemBioChem 10 ページ: 2613-2616
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sequence-Specific Alkylation by Y-shaped and Tandem Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamides (2008)
  • 著者名/発表者名: Sasaki, S., Bando, T., Minoshima, M., Shinohara, K., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Chem.Eur.J. 14 ページ: 864-870
• [雑誌論文] Requirement of β-alanine components in sequence-specific DNA alkylation by pyrrole-imidazole conjugates with seven-base pair recognition, Bioorg. (2008)
  • 著者名/発表者名: Bando, T., Minoshima, M., Kashiwazaki, G., Shinohara, K., Sasaki, S., Fujimoto, J., Ohtsuki, A., Murakami, M., Nakazono, S., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Med.Chem. 16 ページ: 2286-2291
• [雑誌論文] Pyrrole-Imidazole hairpin polyamides with high affinity at 5'-CGCG-3' DNA sequence; Influence of cytosine methylation on binding (2008)
  • 著者名/発表者名: Minoshima, M., Bando, T., Sasaki, S., Fujimoto, J., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36 ページ: 2889-2894
• [雑誌論文] Detection of triplet repeat sequences in double-stranded DNA using pyrene-functionalized pyrrole-imidazole polyamides with rigid linkers, Bioorg. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto, J., Bando, T., Minoshima, M., Uchida, S., Iwasaki, M., Shinohara, K., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Med.Chem. 16 ページ: 5899-5907
• [雑誌論文] Development of Pyrrole-Imidazole Polyamide for Specific Regulation of Human Aurora kinase A and B Gene Expression (2008)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, T., Asami, Y., Kitamura, E., Suzuki, T., Wang, X., Igarashi, J., Morohashi, A., Shinojima, Y., Kanou, H., Saito, K., Takasu, T., Nagase, H., Harada, Y., Kuroda, K., Watanabe, T., Kumamoto, S., Aoyama, T., Matsumoto, Y., Bando, T., Sugiyama, H., Yoshida-Noro, C., Fukuda, N., Hayashi, N.
  • 雑誌名: Chem.Biol. 15 ページ: 829-841
• [雑誌論文] Peryrene-Conjugated Pyrrole polyamides as a Sequence-specific Fluorescent Probe, Bioorg. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto, J., Bando, T., Minoshima,M., Kashiwazaki, G., Nishijima, S., Shinohara, K., Sugiyama, H.
  • 雑誌名: Med.Chem. 16 ページ: 9741-9744
• [雑誌論文] Sequence-Specific Alkylation by Y-shaped and Tandem Hairpin Pyrrole-Imidazole Polyamides (2008)
  • 著者名/発表者名: Bando, T., Sugiyama H.
  • 雑誌名: Chem. Eur. J. 18 ページ: 864-870
  • 査読あり
• [雑誌論文] Perylene-Conjugated Pyrrole Polyamide as a Sequence-Specific Fluorescent Probe (2008)
  • 著者名/発表者名: Bando, T., Sugiyama, H
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 16 ページ: 9741-9744
  • 査読あり
• [雑誌論文] Requirement of b-Alanine Components in Sequence-Specific DNA Alkylation by Pyrrole-Imidazole Conjugates with Seven-Base Pair Recognition (2008)
  • 著者名/発表者名: Bando, T., Sugiyama H.
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 16 ページ: 2286-2291
  • 査読あり
• [学会発表] Recognition of Specific DNA Sequences by Pyrrole-Imidazole Polyamides (2010)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和
  • 学会等名: 2010International Chemical Congress of Pacific Basin Societies(PACIFICHEM)
  • 発表場所: Hawaii, USA, December
• [学会発表] PIポリアミド-SAHAコンジュゲートライブラリによる細胞のリプログラミング (2010)
  • 著者名/発表者名: 篠原憲一、板東俊和、杉山弘
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 配列特異的アルキル化を可能にする光切断リンカーを導入したPy-Imポリアミド-CBIコンジュゲート (2010)
  • 著者名/発表者名: 朴昭映、板東俊和、杉山弘
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] Recognition of Specific DNA Sequences by Pyrrole-Imidazole Polyamides (2010)
  • 著者名/発表者名: Bando, T.
  • 学会等名: 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies(PACIFICHEM)
  • 発表場所: Hawaii
• [学会発表] 塩基配列特異的アルキル化能を有する機能性PIポリアミド設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和、杉山弘
  • 学会等名: 第28回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] PIポリアミドコンジュゲートによる配列特異的DNAアルキル化反応 (2009)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和、蓑島維文、篠原憲一、杉山弘
  • 学会等名: 第12回がん分子標的治療学会学術集会
  • 発表場所: 徳島
• [学会発表] 機能性PIポリアミドの合成とその機能評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和、蓑島維文、柏崎玄伍、西島茂樹、杉山弘
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会第4回年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] DNAの配列特異的アルキル化と生物化学的応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 蓑島維文、板東俊和、篠原憲一、杉山弘
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会(2009)
  • 発表場所: 船橋市
• [学会発表] 機能性PIポリアミドの合成とその機能評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会 第4回年会
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター
• [学会発表] 機能性ピロールーイミダゾールポリアミドによる特異的DNA塩基配列の検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
• [学会発表] 機能性PIポリアミドによる特異的DNA塩基配列確認 (2008)
  • 著者名/発表者名: 板東俊和
  • 学会等名: 学術フロンティア報告会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] テロメアを標的とするピロール-イミダゾールポリアミド (2008)
  • 著者名/発表者名: 篠原憲一、蓑島維文、板東俊和、杉山弘
  • 学会等名: 第12回がん分子標的治療研究会総会
  • 発表場所: 東京
• [図書] 基礎ケミカルバイオロジー (2011)
  • 著者名/発表者名: 杉山弘, 板東俊和
  • 総ページ数: 195
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 基礎ケミカルバイオロジー (2011)
  • 著者名/発表者名: 杉山弘、 板東俊和
  • 総ページ数: 195
  • 出版者: 化学同人
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/
• [備考]
  • URL: http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/publication/
• [備考]
  • URL: http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/publication/all.html#2009
• [備考] 論文リスト
  • URL: http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/chembio/Chenicalpage/publication2008.htm
• [産業財産権] 標的遺伝子特異的ヒストン修飾制御剤 (2008)
  • 発明者名: 永瀬浩喜, 板東俊和
  • 権利者名: 学校法人日本大学
  • 産業財産権番号: 2008-172795
  • 出願年月日: 2008-07-01