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シトシンバルジヘアピンループプライマーを用いた遺伝子一塩基変異の蛍光検出法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20611010
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関大阪大学

研究代表者

武井 史恵  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (30252711)

研究分担者 中谷 和彦  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (70237303)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2008年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードPCR / ヘアピンプライマー / 蛍光 / SNPタイピング / DNA / 蛍光分子 / シトシンバルジ / ヘアピン構造 / シトシンバルジ構造 / 一塩基多型
研究概要

C-バルジをPCRプライマーの5'末端に持つプライマーを設計し、C-バルジに特異的に結合する蛍光低分子を使ってSNPを検出する新たな方法について検討した。蛍光低分子はヘアピンPCRプライマーに特異的に結合でき強い蛍光を発するが、PCRが進行するとC-バルジが消失するために結合できず蛍光強度は低下する。この特徴を利用して蛍光強度変化を測定することによりPCRの進行が確認でき、すなわち一塩基多型の判定が可能であることを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2010 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (14件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Transformation of cytosine to uracil in single-stranded DNA via their oxime sulfonates.2010

    • 著者名/発表者名
      Oka, Y., Takei, F., Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem.Commun. 46

      ページ: 3378-3380

    • NAID

      130004597226

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transformation of cytosine to uracil in single-stranded DNA via theiroxime sulfonates.2010

    • 著者名/発表者名
      Oka, Y.; Takei, F.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem.Commun.

      巻: 46 ページ: 3378-3380

    • NAID

      130004597226

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Secondary Structure-Inducible Ligand Fluorescence Coupled with PCR2009

    • 著者名/発表者名
      Takei, F., Igarashi, M., Hagihara, M., Oka, Y., Soya, Y., Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Angew.Chem.Int.Ed. 48

      ページ: 7822-7824

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multifunctional Initiator with Platinum-Acetylide Dendritic Core for Living Polymerization of Isocyanides2009

    • 著者名/発表者名
      Onitsuka, K., Shimizu, A., Takei, F., Takahashi, S.
    • 雑誌名

      Journal of Inorganic and Organometallic Polymers and Materials 19

      ページ: 98-103

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書 2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis and Reaction of DNA Oligomers Containing Modified Cytosines Related to Bisulfite Sequencing2009

    • 著者名/発表者名
      Oka, Y., Peng, T., Takei, F., Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Org.Lett. 11

      ページ: 1377-1379

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Organoruthenium Dendrimers Possessing Tris (4-ethynylphenyl) amine Bridges2008

    • 著者名/発表者名
      Onitsuka, K., Ohara, N., Takei, F., Takahashi, S.
    • 雑誌名

      Organometallics 27

      ページ: 25-27

    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transformation of cytosine to uracil in single-stranded DNA via their oxime sulfonates

    • 著者名/発表者名
      Oka, Y., Takei, F., Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem.Commun. (In press)

    • NAID

      130004597226

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis and Reaction of DNA Oligomers Containing Modified Cytosines Related to Bisulfite Sequencing

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Oka, Tao Peng, Fumie Takei, Kazuhiko Nakatani
    • 雑誌名

      ORGANIC LETTERS (In press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Application for the fluorescent detection of single nucleotide difference using cytosine bulge hairpin primers and competitor primers2010

    • 著者名/発表者名
      Takei F., Nakarani, K.
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2010
    • 発表場所
      USA
    • 年月日
      2010-12-19
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Application for the fluorescent detection of single nucleotide difference using cytosine bulge hairpin primers and competitor primers2010

    • 著者名/発表者名
      Fumie Takei, Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2010
    • 発表場所
      ハワイコンベンションセンター(米国)
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Novel Fluorescent Detection of Virus Using Cytosine Bulge Hairpin Primers for PCR2010

    • 著者名/発表者名
      Takei F.
    • 学会等名
      K.Virus and Infections-2010
    • 発表場所
      Korea
    • 年月日
      2010-07-31
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel Fluorescent Detection of Virus Using Cytosine Bulge Hairpin Primers for PCR2010

    • 著者名/発表者名
      Fumie Takei
    • 学会等名
      WCVI-2010
    • 発表場所
      BEXCOコンベンションセンター(韓国)
    • 年月日
      2010-07-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ヘアピンプライマーを用いた革新的一塩基多型の蛍光検出法2010

    • 著者名/発表者名
      武井史恵、萩原正規、中谷和彦
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー研究会 第5回年会
    • 発表場所
      慶応義塾大学(横浜市)
    • 年月日
      2010-05-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ヘアピンタグを持つプライマー使った一塩基多型の蛍光検出2010

    • 著者名/発表者名
      武井史恵・松永静香・前田あゆみ・萩原正規・中谷和彦
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学 (大阪)
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DNA-Labeling by Secondary Structure Inducible Ligand Fluorescence2009

    • 著者名/発表者名
      Takei, F.Hagihara, M., Nakarani, K.
    • 学会等名
      IKCOC-11
    • 発表場所
      Japan
    • 年月日
      2009-11-09
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] ヘアピンプライマーPCR法による迅速遺伝子診断2009

    • 著者名/発表者名
      武井史恵, 中谷和彦
    • 学会等名
      Crest 第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      みらいCANホール (東京都)
    • 年月日
      2009-08-03
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 新規5-メチルシトシンシークエンシング2009

    • 著者名/発表者名
      岡芳美, 武井史恵, 中谷和彦
    • 学会等名
      Crest 第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      みらいCANホール (東京都)
    • 年月日
      2009-08-03
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DNA-Labeling by Secondary Structure Inducible Ligand Fluorescence2009

    • 著者名/発表者名
      Fumie Takei, Masako Igarashi, Masaki Hagihara, Yoshimi Oka, Yoshihiro Soya, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      IKCOC-11
    • 発表場所
      リーガロイヤルホテル (京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] The Fluorescence Detection of Single Nucleotide Difference Using Cytosine Bulge Hairpin Primers2008

    • 著者名/発表者名
      Takei F., Hagihara, M., Nakarani, K.
    • 学会等名
      XXII IUPAC SYMPOSIUM ON PHOTOCHEMISTRY 2008
    • 発表場所
      Sweden
    • 年月日
      2008-07-28
    • 関連する報告書
      2010 研究成果報告書
  • [学会発表] THE FLUORESCENT DETECTION OF SINGLE NUCLEOTIDE DIFFERENCEUSING CYTOSINE BULGE HAIRPIN PRIMERS2008

    • 著者名/発表者名
      Fumie Takei, Masaki Hagihara, Yoshimi Oka, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      XXII IUPAC SYMPOSIUM ON PHOTOCHEMISTRY2008
    • 発表場所
      SWEDEN, GOTHENBURG
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] シトシンハルジーヘアピンプライマーを使った革新的遺伝子変異の蛍光検出2008

    • 著者名/発表者名
      武井 史恵, 岡 芳美, 萩原 正規, 曽家 義博, 中谷 和彦
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー研究会 第3回年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] The reaction of cytosine with bisulfite by base flipping from the duplex2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Oka, Tao Peng, Fumie Takei, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRTXVIII)
    • 発表場所
      Kyoto
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] 一塩基多型を検出する方法および一塩基多型を検出するための試薬キット2010

    • 発明者名
      中谷和彦、武井史恵、萩原正規
    • 権利者名
      大阪大学
    • 産業財産権番号
      2010-054658
    • 出願年月日
      2010-03-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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