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DNAシーケンシングに向けたナノポア内部・近傍における蛍光分子の発光制御

研究課題

研究課題/領域番号 20651035
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 ナノ材料・ナノバイオサイエンス
研究機関慶應義塾大学 (2009)
(財)神奈川科学技術アカデミー (2008)

研究代表者

斎木 敏治  慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70261196)

研究分担者 三木 則尚  慶應義塾大学, 理工学部, 専任講師 (70383982)
研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2009年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2008年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
キーワードDNA / ナノポア / シリコン / 紫外光 / ナノスリット / アブレーション / 蛍光 / プラズモン / エネルギー移動
研究概要

DNAシーケンシングへ向けたナノ構造として、シリコン薄膜中のナノスリットに着目し、性能確認のための計算機シミュレーションと実際の作製を試みた。シリコンは波長200~350nmの紫外光に対して、屈折率、吸収係数がともに非常に大きな値を持つ。その結果、表面での反射率が高く、また裏面への光の透過が小さいため、膜表面・裏面での電場強度が非常に弱くなる。したがって、相対的にスリット内には、その上部・下部とのコントラストの高いナノ局在光が発生するので、これをDNAシーケンシングのための蛍光励起光源として利用する。厚さ5nmのシリコン薄膜内に幅2~5nm、長さ100nmのスリットを設定し、波長287nmの紫外光に対して、局在光の空間分布をFDTD法により計算した。厚さ方法にほぼ、薄膜の厚さと同程度(6nm)の局在光が発生し、上部・下部に対して20:1のコントラストをもつことを確認した。蛍光体の検出にあたっては、この波長域で励起をおこない、可視域の蛍光を測定することを想定しているので、シリコンによる蛍光信号の損失もほとんどない。シミュレーションと並行して、ナノスリットの作製も試みた。まずシリコン基板上にカーボンナノチューブを分散させ、これをテンプレートにフェムト秒レーザによるアブレーションをおこなった。シリコン単体のアブレーションしきい値よりも低いフルエンスにて、レーザパルス照射位置ではナノチューブが飛散し、ナノスケール溝が形成されていることを確認した。続いて厚さ20nmのナノメンブレンに対して同様の実験を試みたが、数nmのナノスリットの形成には至らなかった。計算機シミュレーションで示した5nmという空間分解能は、ポリマー化されたDNAの塩基配列の読み出しには十分な値であり、またナノスリット作製にも展望が得られたことは大きな成果である。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Numerical simulation of near-field fluorescence correlation spectroscopy using a fiber probe2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kasahara, T.Saiki
    • 雑誌名

      Journal of Nanophotonics 4

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Near-Field Fluorescence Correlation Spectroscopy Using a Fiber Probe2009

    • 著者名/発表者名
      M.Suzuki, T.Saiki
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics 48

    • NAID

      40016664126

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文]2009

    • 著者名/発表者名
      斎木敏治(分担執筆)
    • 雑誌名

      走査プローブ顕微鏡(共立出版)

      ページ: 364-370

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] High Spatial Resolution Fluorescence Correlation Spectroscopy Using a Near-Field Optical Fiber Probe2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Ohshima
    • 学会等名
      平成20年度日本分光学会年次講演会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 近接場光ファイバープローブによる蛍光相関分光法の高分解能化2008

    • 著者名/発表者名
      大嶋雄二
    • 学会等名
      第69回応用物理学会学術講演会
    • 発表場所
      中部大学
    • 年月日
      2008-09-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 近接場光学ファイバプローブを用いた蛍光相関分光法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      斎木敏治
    • 学会等名
      第47回生体医工学会大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2008-05-08
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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