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日本人を特定する新たな連鎖不平衡領域の探索

研究課題

研究課題/領域番号 20657045
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 応用人類学
研究機関東京大学

研究代表者

石田 貴文  東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (20184533)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2009年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2008年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード日本人 / アジア / 遺伝子 / 多型 / ハプロタイプ / 人類学 / 連鎖不平衡
研究概要

これまでの民族識別へのアプローチは、個人識別のために求められていた多型標識の頻度分布をベースに、民族毎に比較するものであった。近年の解析技術の長足の進歩は、一度に何十万という一塩基多型(SNP)の解析を可能とした。2008年に日本人について14万SNPの解析結果が報告されたこと、汎アジアコンソーシアムによりアジアの75集団のSNP解析が済んだとの情報をえたことから、研究内容に重複の無いよう、本研究も軌道修正をおこなった。
汎アジアコンソーシアムで扱われなかったアジア集団、フローレス・セラム人の遺伝的多型解析をおこなった。また、比較のため、スンバ人も検索に加えた。ミトコンドリアDNA超可変領域、Y染色体STR、常染色体STRを調べた。地理的に近く、オーストロネシア語を使っているにもかかわらず、予想に反しフローレス人はノンオーストロネシアとクラスターすることがわかった。フローレス島は、小型人類の発掘でも注目されている場所であり、今後近隣集団の解析を加えることで、人類の移動、特にオーストロネシアンの移動と混交へ知見をもたらすと期待される。また、日本人の成立に関する南方からの寄与にも、オーストロネシアンの解析は必要である。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件)

  • [雑誌論文] 集団内JCウイルスゲノム型の解析による伝播動態の検討2010

    • 著者名/発表者名
      石原祥子, 石田貴文, 清水華
    • 雑誌名

      DNA多型 18

      ページ: 202-204

    • NAID

      10029668299

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] The Q223R polymorphism in LEPR is associated with obesity in Pacific Islanders2010

    • 著者名/発表者名
      Furusawa, et al.
    • 雑誌名

      Human Genetics 127

      ページ: 287-294

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] FGFR2, but not EDA, is associated with hair thickness in Asian populations2009

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics 54

      ページ: 461-465

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Pacific Lineage (2E) of JC Polyomavirus is Prevalent in Sumba Island, Eastern Indonesia.2008

    • 著者名/発表者名
      Ikegaya, et al
    • 雑誌名

      Anthropolpgical Science 116

      ページ: 183-186

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association between EBNA2 and LMP1 subtypes of Epstein-Barrvirus and nasopharyngeal carcinoma in Thais.2008

    • 著者名/発表者名
      Tiwawech, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Virology 42

      ページ: 1-6

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Natural selection in the TRL-related genes in the course of primate evolution.2008

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, et al.
    • 雑誌名

      Immunogenetics 60

      ページ: 727-735

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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