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リソソーム病の網羅的変異体立体構造データベースの構築

研究課題

研究課題/領域番号 20659166
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 小児科学
研究機関明治薬科大学

研究代表者

櫻庭 均  明治薬科大学, 薬学部, 教授 (60114493)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2009年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2008年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードリソソーム病 / 立体構造 / データベース / ファブリー病 / ポンペ病 / GM1ガングリオシドーシス / モルキオB病 / ムコ多糖症I型 / テイーサックス病
研究概要

一群のリソソーム病の原因となる疾患遺伝子変異により、その発現蛋白質の立体構造にどんな変化が起こり、それが分子病態や臨床表現型にどんな影響を与えるかについて解析した。そして、その解析により得られた情報をリソソーム病の診断や治療に役立てるためのデータベースを構築することを目的に研究を行った。
昨年度に行ったファブリー病、テイ-サックス病およびムコ多糖症I型における疾患関連酵素の立体構造解析に引き続き、今年度は、ポンペ病(酸性α-グルコシダーゼ欠損症)とGM1ガングリオシドーシスおよびモルキオB病(B-ガラクトシダーゼ欠損症)の疾患関連酵素について、まず野性型酵素の立体構造モデルをin silicoで構築した後に、病因となるアミノ酸置換による立体構造変化の領域と強さとを推定した。
また、発生頻度が高く、酵素補充治療が可能であるため臨床的重要性が高いファブリー病に対しては、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化の解析データから、病患の臨床表現型を推定するための方法を開発した。本法は、root meandeviation, the differences in hydropathy between the wild type and mutantやthe size of an amino acid in the mutantなどの計算値を基に、フローチャートに従って行うもので、その正確度は86%であった。
さらに、これまで報告されたファブリー病の病因遺伝子変異の種類、臨床表現型や文献の他、α-ガラクトシダーゼの立体構造変化について詳細に知ることが出来るデータベースを作成して、これを公開した(http://www.fabry-database/org/)。これらの情報は、ファブリー病の病態を理解し、適切な治療法を策定するために有用であると期待される。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (2件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Prediction of the clinical phenotype of Fabry disease based on protein sequential and structural information2010

    • 著者名/発表者名
      Saito S, et al.
    • 雑誌名

      J.Hum.Genet. 55

      ページ: 175-178

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural modeling of mutant α-glucosidases resulting in a processing/transport defect in Pompe disease2009

    • 著者名/発表者名
      Sugawara K, et al.
    • 雑誌名

      J.Hum.Genet. 54

      ページ: 324-330

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of GM1 gangliosidosis and Morquio B disease2009

    • 著者名/発表者名
      Morita M, et al.
    • 雑誌名

      J.Hum.Genet. 54

      ページ: 510-515

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 酸性α-グルコシダーゼとポンペ病2009

    • 著者名/発表者名
      櫻庭均
    • 雑誌名

      ポンペ病(衛藤義勝 監修), 診断と治療社(東京)

      ページ: 18-24

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural study on mutant α-L-iduronidase : Insight into mucopolysaccharidosis type I.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugawara K., et al.
    • 雑誌名

      J. Hum. Genet. 53

      ページ: 467-474

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural cosequences of amino acid substitutions causing Tay-Sachs disease.2008

    • 著者名/発表者名
      Ohno K., et al.
    • 雑誌名

      Mol. Genet. Metab. 94

      ページ: 462-468

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural characterization of mutant a-galactosidases causing Fabry disease.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugawara K., et al.
    • 雑誌名

      J. Hum. Genet. 53

      ページ: 812-824

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ファブリー病:分子病態の解明から診断と治療へ2009

    • 著者名/発表者名
      櫻庭均
    • 学会等名
      第73回日本循環器学会総会学術集会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪)
    • 年月日
      2009-03-20
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ティーサックス病 : ヘキソサミニダーゼAにおける構造変化と臨床表現型との関連性.2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 均
    • 学会等名
      第50回日本小児神経学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] 小児科学, 第3版(大関武彦, 近藤直実/総編集)2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 均
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      医学書院
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.fabry-database.org/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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