| 研究課題/領域番号 |
20700263
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 北海道大学 |
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研究代表者 |
上野 恵介 北海道大学, 大学院・情報科学研究科, 博士研究員 (90435983)
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| 研究期間 (年度) |
2008 – 2010
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| 研究課題ステータス |
完了 (2010年度)
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| 配分額 *注記 |
2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2010年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2009年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2008年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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| キーワード | 酵素機能予測 / 動径分布関数 / 自己組織化写像 / 分子間相互作用 |
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| 研究概要 |
本研究では、酵素活性部位の動径分布関数と自己組織化写像に基づく機能予測手法を開発した。動径分布関数は酵素活性部位の構造上の僅かな違いを反映し、自己組織化写像と組み合わせることにより、酵素活性部位の類似性を示した。酵素活性部位の類似性に基づく本手法により、アミノ酸配列や立体構造の類似性では検出できない酵素の機能を予測することができた。また、酵素活性部位の類似性は酵素の立体構造よりも基質反応の類似性をよく反映していることがわかった。
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